Menée in vitro, cette étude met en évidence un mécanisme par lequel la désaminase APOBEC3B régule les boucles-R (R-loops) et favorise la mutagenèse associée à la transcription

APOBEC3B regulates R-loops and promotes transcription-associated mutagenesis in cancer

McCann, Jennifer L. ; Cristini, Agnese ; Law, Emily K. ; Lee, Seo Yun ; Tellier, Michael ; Carpenter, Michael A. ; Beghè, Chiara ; Kim, Jae Jin ; Sanchez, Anthony ; Jarvis, Matthew C. ; Stefanovska, Bojana ; Temiz, Nuri A. ; Bergstrom, Erik N. ; Salamango, Daniel J. ; Brown, Margaret R. ; Murphy, Shona ; Alexandrov, Ludmil B. ; Miller, Kyle M. ; Gromak, Natalia ; Harris, Reuben S.

The single-stranded DNA cytosine-to-uracil deaminase APOBEC3B is an antiviral protein implicated in cancer. However, its substrates in cells are not fully delineated. Here APOBEC3B proteomics reveal interactions with a surprising number of R-loop factors. Biochemical experiments show APOBEC3B binding to R-loops in cells and in vitro. Genetic experiments demonstrate R-loop increases in cells lacking APOBEC3B and decreases in cells overexpressing APOBEC3B. Genome-wide analyses show major changes [...]

Menée à l'aide de lignées cellulaires de cancer du poumon non à petites cellules et d'échantillons tumoraux, cette étude met en évidence un mécanisme par lequel l'interaction entre les protéines TRIM28 et TIAM1 favorise la migration des cellules cancéreuses via l'inhibition de l'expression des protocadhérines et de la E-cadhérine

A TIAM1-TRIM28 complex mediates epigenetic silencing of protocadherins to promote migration of lung cancer cells

Ginn, Lucy ; Maltas, Joe ; Baker, Martin J. ; Chaturvedi, Anshuman ; Wilson, Leah ; Guilbert, Ryan ; Amaral, Fabio M. R. ; Priest, Lynsey ; Mole, Holly ; Blackhall, Fiona ; Diamantopoulou, Zoi ; Somervaille, Tim C. P. ; Hurlstone, Adam ; Malliri, Angeliki

Lung cancer is the leading cause of cancer deaths. Its high mortality is associated with high metastatic potential. Here, we show that the RAC1-selective guanine nucleotide exchange factor T cell invasion and metastasis-inducing protein 1 (TIAM1) promotes cell migration and invasion in the most common subtype of lung cancer, non-small-cell lung cancer (NSCLC), through an unexpected nuclear function. We show that TIAM1 interacts with TRIM28, a master regulator of gene expression, in the nucleus [...]

Menée à l'aide de modèles murins de cancer du poumon ainsi que d'échantillons tumoraux et d'échantillons de tissus sains prélevés sur des patients, cette étude met en évidence un mécanisme par lequel le mycobiome intratumoral favorise la progression tumorale via les cellules myéloïdes suppressives

The intratumor mycobiome promotes lung cancer progression via myeloid-derived suppressor cells

Liu, Ning-Ning ; Yi, Cheng-Xiang ; Wei, Lu-Qi ; Zhou, Jin-An ; Jiang, Tong ; Hu, Cong-Cong ; Wang, Lu ; Wang, Yuan-Yuan ; Zou, Yun ; Zhao, Yi-Kai ; Zhang, Le-Le ; Nie, Ya-Ting ; Zhu, Yi-Jing ; Yi, Xin-Yao ; Zeng, Ling-Bing ; Li, Jing-Quan ; Huang, Xiao-Tian ; Ji, Hong-Bin ; Kozlakidis, Zisis ; Zhong, Lin ; Heeschen, Christopher ; Zheng, Xiao-Qi ; Chen, Changbin ; Zhang, Peng ; Wang, Hui

Although polymorphic microbiomes have emerged as hallmarks of cancer, far less is known about the role of the intratumor mycobiome as living microorganisms in cancer progression. Here, using fungi-enriched DNA extraction and deep shotgun metagenomic sequencing, we have identified enriched tumor-resident Aspergillus sydowii in patients with lung adenocarcinoma (LUAD). By three different syngeneic lung cancer mice models, we find that A. sydowii promotes lung tumor progression via IL-1

Menée à partir d'échantillons biopsiques prélevés sur 367 patients atteints d'un cancer de la prostate, cette étude met en évidence un mécanisme par lequel la perte de l'expression de la phosphodiestérase PDE4D7 favorise la perte de sensibilité des cellules cancéreuses aux androgènes, la différenciation neuroendocrine de la tumeur et l'altération des voies de réparation de l'ADN

Loss of PDE4D7 expression promotes androgen independence, neuroendocrine differentiation and alterations in DNA repair: implications for therapeutic strategies

Gulliver, Chloe ; Huss, Sebastian ; Semjonow, Axel ; Baillie, George S. ; Hoffmann, Ralf

Background : Androgen signalling remains the seminal therapeutic approach for the management of advanced prostate cancer. However, most tumours eventually shift towards an aggressive phenotype, characterised by androgen independence and treatment resistance. The cyclic adenosine monophosphate (cAMP) pathway plays a crucial role in regulating various cellular processes, with the phosphodiesterase PDE4D7 being a vital modulator of cAMP signalling in prostate cancer cells. Methods : Using [...]

Menée à l'aide de lignées cellulaires, de modèles murins, d'échantillons tissulaires humains ainsi que d'une cartographie spatiale et temporelle des cellules immunitaires ayant infiltré des métastases pulmonaires issues de tumeurs mammaires, cette étude met en évidence le rôle des macrophages TREM2+ dans le développement d'un environnement immunosuppresseur

Spatial and temporal mapping of breast cancer lung metastases identify TREM2 macrophages as regulators of the metastatic boundary

Yofe, Ido ; Shami, Tamar ; Cohen, Noam ; Landsberger, Tomer ; Sheban, Fadi ; Stoler-Barak, Liat ; Yalin, Adam ; Phan, Truong San ; Li, Baoguo ; Monteran, Lea ; Scharff, Ye'ela ; Giladi, Amir ; Elbaz, Miriam ; David, Eyal ; Gurevich-Shapiro, Anna ; Gur, Chamutal ; Shulman, Ziv ; Erez, Neta ; Amit, Ido

Cancer mortality primarily stems from metastatic recurrence, emphasizing the urgent need for developing effective metastasis targeted immunotherapies. To better understand the cellular and molecular events shaping metastatic niches, we used a spontaneous breast cancer lung metastasis model to create a single-cell atlas spanning different metastatic stages and regions. We found that pre-metastatic lungs are infiltrated by inflammatory neutrophils and monocytes, followed by accumulation of [...]

Menée à partir d'échantillons tumoraux prélevés sur des patients atteints d'une tumeur neuroendocrine gastroentéropancréatique bien différenciée, cette étude identifie les caractéristiques du transcriptome des tumeurs et des cellules immunitaires du microenvironnement tumoral

Intertumoral lineage diversity and immunosuppressive transcriptional programs in well-differentiated gastroenteropancreatic neuroendocrine tumors

Hoffman, Samantha E. ; Dowrey, Todd W. ; Villacorta Martin, Carlos ; Bi, Kevin ; Titchen, Breanna ; Johri, Shreya ; DelloStritto, Laura ; Patel, Miraj ; Mackichan, Colin ; Inga, Stephanie ; Chen, Judy ; Grimaldi, Grace ; Napolitano, Sara ; Wakiro, Isaac ; Wu, Jingyi ; Yeung, Jason ; Rotem, Asaf ; Sicinska, Ewa ; Shannon, Erin ; Clancy, Thomas ; WANG, JIPING ; Denning, Sarah ; Brais, Lauren ; Besson, Naomi R. ; Pfaff, Kathleen L. ; Huang, Ying ; Kao, Katrina Z. ; Rodig, Scott ; Hornick, Jason L. ; Vigneau, Sébastien ; Park, Jihye ; Kulke, Matthew H. ; Chan, Jennifer ; Van Allen, Eliezer M. ; Murphy, George J.

Neuroendocrine tumors (NETs) are rare cancers that most often arise in the gastrointestinal tract and pancreas. The fundamental mechanisms driving gastroenteropancreatic (GEP)–NET growth remain incompletely elucidated; however, the heterogeneous clinical behavior of GEP-NETs suggests that both cellular lineage dynamics and tumor microenvironment influence tumor pathophysiology. Here, we investigated the single-cell transcriptomes of tumor and immune cells from patients with [...]

Menée à partir du séquençage de l'ADN de deux espèces de chauves-souris et de données génomiques portant sur d'autres mammifères, cette étude met en évidence des adaptations génétiques qui pourraient expliquer la capacité des chauves-souris à supprimer les cellules cancéreuses

Long-Read Sequencing Reveals Rapid Evolution of Immunity- and Cancer-Related Genes in Bats

Scheben, Armin ; Mendivil Ramos, Olivia ; Kramer, Melissa ; Goodwin, Sara ; Oppenheim, Sara ; Becker, Daniel J ; Schatz, Michael C ; Simmons, Nancy B ; Siepel, Adam ; McCombie, W Richard

Bats are exceptional among mammals for their powered flight, extended lifespans, and robust immune systems and therefore have been of particular interest in comparative genomics. Using the Oxford Nanopore Technologies long-read platform, we sequenced the genomes of two bat species with key phylogenetic positions, the Jamaican fruit bat (Artibeus jamaicensis) and the Mesoamerican mustached bat (Pteronotus mesoamericanus), and carried out a comprehensive comparative genomic analysis with a [...]

Menée à l'aide de lignées cellulaires, de modèles murins de cancer et d'organoïdes de tissus adipeux d'origine humaine, cette étude met en évidence un mécanisme par lequel la voie de signalisation endothéliale Notch1 des cellules du tissu adipeux blanc favorise la cachexie

Endothelial Notch1 signaling in white adipose tissue promotes cancer cachexia

Taylor, Jacqueline ; Uhl, Leonie ; Moll, Iris ; Hasan, Sana Safatul ; Wiedmann, Lena ; Morgenstern, Jakob ; Giaimo, Benedetto Daniele ; Friedrich, Tobias ; Alsina-Sanchis, Elisenda ; De Angelis Rigotti, Francesca ; Mülfarth, Ronja ; Kaltenbach, Sarah ; Schenk, Darius ; Nickel, Felix ; Fleming, Thomas ; Sprinzak, David ; Mogler, Carolin ; Korff, Thomas ; Billeter, Adrian T. ; Müller-Stich, Beat P. ; Berriel Diaz, Mauricio ; Borggrefe, Tilman ; Herzig, Stephan ; Rohm, Maria ; Rodriguez-Vita, Juan ; Fischer, Andreas

Cachexia is a major cause of morbidity and mortality in individuals with cancer and is characterized by weight loss due to adipose and muscle tissue wasting. Hallmarks of white adipose tissue (WAT) remodeling, which often precedes weight loss, are impaired lipid storage, inflammation and eventually fibrosis. Tissue wasting occurs in response to tumor-secreted factors. Considering that the continuous endothelium in WAT is the first line of contact with circulating factors, we postulated whether [...]

Menée à l'aide de lignées cellulaires issues de tumeurs cérébrales humaines et menée à l'aide de modèles murins, cette étude examine le phénotype et les fonctions des neutrophiles dans les tissus tumoraux puis met en évidence le rôle du microenvironnement local dans leur activation

The local microenvironment drives activation of neutrophils in human brain tumors

Maas, Roeltje R. ; Soukup, Klara ; Fournier, Nadine ; Massara, Matteo ; Galland, Sabine ; Kornete, Mara ; Wischnewski, Vladimir ; Lourenco, Joao ; Croci, Davide ; Álvarez-Prado, Ángel F. ; Marie, Damien N. ; Lilja, Johanna ; Marcone, Rachel ; Calvo, Gabriel F. ; Santalla Mendez, Rui ; Aubel, Pauline ; Bejarano, Leire ; Wirapati, Pratyaksha ; Ballesteros, Iván ; Hidalgo, Andrés ; Hottinger, Andreas F. ; Brouland, Jean-Philippe ; Daniel, Roy T. ; Hegi, Monika E. ; Joyce, Johanna A.

Neutrophils are abundant immune cells in the circulation and frequently infiltrate tumors in substantial numbers. However, their precise functions in different cancer types remain incompletely understood, including in the brain microenvironment. We therefore investigated neutrophils in tumor tissue of glioma and brain metastasis patients, with matched peripheral blood, and herein describe the first in-depth analysis of neutrophil phenotypes and functions in these tissues. Orthogonal profiling [...]