Menée à partir du séquençage du génome entier de 99 échantillons de tumeurs primitives et 99 échantillons de métastases issus de 15 patients atteints d'un cancer métastatique de l'estomac traité par gastrectomie et métastasectomie, cette étude analyse les caractéristiques génomiques et évolutives de la maladie

Genomic and evolutionary characteristics of metastatic gastric cancer by routes

Lee, Jae Eun ; Kim, Ki Tae ; Shin, Su-Jin ; Cheong, Jae-Ho ; Choi, Yoon Young

Background : In gastric cancer (GC) patients, metastatic progression through the lymphatic, hematogenous, peritoneal, and ovarian routes, is the ultimate cause of death. However, the genomic and evolutionary characteristics of metastatic GC have not been widely evaluated. Methods : Whole-exome sequencing data were analyzed for 99 primary and paired metastatic gastric cancers from 15 patients who underwent gastrectomy and metastasectomy. Results : Hematogenous metastatic tumors were associated [...]

Menée à partir de l'analyse à l'échelle cellulaire d'échantillons sanguins, d'échantillons de lésions précancéreuses, de tissus cancéreux, de tissus adjacents sains ou de métastases prélevés sur des patients atteints d'un adénocarcinome gastrique, cette étude examine l'évolution des cellules stromales et immunitaires lors de la progression tumorale

Evolution of immune and stromal cell states and ecotypes during gastric adenocarcinoma progression

Wang, Ruiping ; Song, Shumei ; Qin, Jiangjiang ; Yoshimura, Katsuhiro ; Peng, Fuduan ; Chu, Yanshuo ; Li, Yuan ; Fan, Yibo ; Jin, Jiankang ; Dang, Minghao ; Dai, Enyu ; Pei, Guangsheng ; Han, Guangchun ; Hao, Dapeng ; Li, Yating ; Chatterjee, Deyali ; Harada, Kazuto ; Pizzi, Melissa Pool ; Scott, Ailing W. ; Tatlonghari, Ghia ; Yan, Xinmiao ; Xu, Zhiyuan ; Hu, Can ; Mo, Shaowei ; Shanbhag, Namita ; Lu, Yang ; Sewastjanow-Silva, Matheus ; Fouad Abdelhakeem, Ahmed Adel ; Peng, Guang ; Hanash, Samir M. ; Calin, George A. ; Yee, Cassian ; Mazur, Pawel ; Marsden, Autumn N. ; Futreal, Andrew ; Wang, Zhenning ; Cheng, Xiangdong ; Ajani, Jaffer A. ; Wang, Linghua

Understanding tumor microenvironment (TME) reprogramming in gastric adenocarcinoma (GAC) progression may uncover novel therapeutic targets. Here, we performed single-cell profiling of precancerous lesions, localized and metastatic GACs, identifying alterations in TME cell states and compositions as GAC progresses. Abundant IgA+ plasma cells exist in the premalignant microenvironment, whereas immunosuppressive myeloid and stromal subsets dominate late-stage GACs. We identified six TME ecotypes [...]

Menée in vitro et à l'aide de modèles murins de carcinome hépatocellulaire ainsi que de données protéomiques, cette étude met en évidence une association entre le niveau d'expression du lysosyme dans les cellules cancéreuses et le pronostic puis identifie un mécanisme par lequel le lysozyme favorise la progression tumorale

Aberrant LYZ expression in tumor cells serves as the potential biomarker and target for HCC and promotes tumor progression via csGRP78

Gu, Zhiwen ; Wang, Lei ; Dong, Qian ; Xu, Kaikun ; Ye, Jingnan ; Shao, Xianfeng ; Yang, Songpeng ; Lu, Cuixiu ; Chang, Cheng ; Hou, Yushan ; Zhai, Yuanjun ; Wang, Xinxin ; He, Fuchu ; Sun, Aihua

Hepatocellular carcinoma (HCC) takes the predominant malignancy of hepatocytes with bleak outcomes owing to high heterogeneity among patients. Personalized treatments based on molecular profiles will better improve patients’ prognosis. Lysozyme (LYZ), a secretory protein with antibacterial function generally expressed in monocytes/macrophages, has been observed for the prognostic implications in different types of tumors. However, studies about the explicit applicative scenarios and mechanisms [...]

Menée à l'aide de lignées cellulaires et à partir de l'analyse génomique de mélanomes et de tumeurs mammaires, cette étude met en évidence un mécanisme par lequel le gain de la région chromosomique 1q dans les cellules cancéreuses favorise la croissance tumorale

Oncogene-like addiction to aneuploidy in human cancers

Girish, Vishruth ; Lakhani, Asad A. ; Thompson, Sarah L. ; Scaduto, Christine M. ; Brown, Leanne M. ; Hagenson, Ryan A. ; Sausville, Erin L. ; Mendelson, Brianna E. ; Kandikuppa, Pranav K. ; Lukow, Devon A. ; Yuan, Monet Lou ; Stevens, Eric C. ; Lee, Sophia N. ; Schukken, Klaske M. ; Akalu, Saron M. ; Vasudevan, Anand ; Zou, Charles ; Salovska, Barbora ; Li, Wenxue ; Smith, Joan C. ; Taylor, Alison M. ; Martienssen, Robert A. ; Liu, Yansheng ; Sun, Ruping ; Sheltzer, Jason M.

Most cancers exhibit aneuploidy, but its functional significance in tumor development is controversial. Here, we describe ReDACT (Restoring Disomy in Aneuploid cells using CRISPR Targeting), a set of chromosome engineering tools that allow us to eliminate specific aneuploidies from cancer genomes. Using ReDACT, we created a panel of isogenic cells that have or lack common aneuploidies, and we demonstrate that trisomy of chromosome 1q is required for malignant growth in cancers harboring this [...]

Menée in vitro et à l'aide de modèles murins, cette étude met en évidence un mécanisme par lequel le transporteur d'acides aminés SLC38A2 et la signalisation de la glutamine dans les cellules dentritiques de type 1 favorisent l'immunité antitumorale

SLC38A2 and glutamine signalling in cDC1s dictate anti-tumour immunity

Guo, Chuansheng ; You, Zhiyuan ; Shi, Hao ; Sun, Yu ; Du, Xingrong ; Palacios, Gustavo ; Guy, Cliff ; Yuan, Sujing ; Chapman, Nicole M. ; Lim, Seon Ah ; Sun, Xiang ; Saravia, Jordy ; Rankin, Sherri ; Dhungana, Yogesh ; Chi, Hongbo

Cancer cells evade T cell-mediated killing through tumour–immune interactions whose mechanisms are not well understood1,2. Dendritic cells (DCs), especially type-1 conventional DCs (cDC1s), mediate T cell priming and therapeutic efficacy against tumours3. DC functions are orchestrated by pattern recognition receptors3–5, although other signals involved remain incompletely defined. Nutrients are emerging mediators of adaptive immunity6–8, but whether nutrients affect DC function or communication [...]

Menée à partir d'échantillons urinaires prélevés sur 716 patients atteints d'un cancer colorectal, oeso-gastrique, mammaire ou prostatique (âge médian : 61 ans), cette étude évalue l'effet inhibiteur de l'aspirine sur la biosynthèse du thromboxane, une substance impliquée dans la progression tumorale via l'activation des plaquettes sanguines

Thromboxane biosynthesis in cancer patients and its inhibition by aspirin: a sub-study of the Add-Aspirin trial

Joharatnam-Hogan, Nalinie ; Hatem, Duaa ; Cafferty, Fay H. ; Petrucci, Giovanna ; Cameron, David A. ; Ring, Alistair ; Kynaston, Howard G. ; Gilbert, Duncan C. ; Wilson, Richard H. ; Hubner, Richard A. ; Swinson, Daniel E. B. ; Cleary, Siobhan ; Robbins, Alex ; MacKenzie, Mairead ; Scott-Brown, Martin W. G. ; Sothi, Sharmila ; Dawson, Lesley K. ; Capaldi, Lisa M. ; Churn, Mark ; Cunningham, David ; Khoo, Vincent ; Armstrong, Anne C. ; Ainsworth, Nicola L. ; Horan, Gail ; Wheatley, Duncan A. ; Mullen, Russell ; Lofts, Fiona J. ; Walther, Axel ; Herbertson, Rebecca A. ; Eaton, John D. ; O’Callaghan, Ann ; Eichholz, Andrew ; Kagzi, Mohammed M. ; Patterson, Daniel M. ; Narahari, Krishna ; Bradbury, Jennifer ; Stokes, Zuzana ; Rizvi, Azhar J. ; Walker, Georgina A. ; Kunene, Victoria L. ; Srihari, Narayanan ; Gentry-Maharaj, Aleksandra ; Meade, Angela ; Patrono, Carlo ; Rocca, Bianca ; Langley, Ruth E.

Background : Pre-clinical models demonstrate that platelet activation is involved in the spread of malignancy. Ongoing clinical trials are assessing whether aspirin, which inhibits platelet activation, can prevent or delay metastases. Methods : Urinary 11-dehydro-thromboxane B2 (U-TXM), a biomarker of in vivo platelet activation, was measured after radical cancer therapy and correlated with patient demographics, tumour type, recent treatment, and aspirin use (100 mg, 300 mg or placebo daily) [...]

Menée à l'aide de lignées cellulaires et de modèles murins de cancer pulmonaire, cette étude met en évidence un mécanisme par lequel la cytidine désaminase APOBEC3A induite par les traitements favorise l'évolution des cellules cancéreuses persistantes

Therapy-induced APOBEC3A drives evolution of persistent cancer cells

Isozaki, Hideko ; Sakhtemani, Ramin ; Abbasi, Ammal ; Nikpour, Naveed ; Stanzione, Marcello ; Oh, Sunwoo ; Langenbucher, Adam ; Monroe, Susanna ; Su, Wenjia ; Cabanos, Heidie Frisco ; Siddiqui, Faria M. ; Phan, Nicole ; Jalili, Pégah ; Timonina, Daria ; Bilton, Samantha ; Gomez-Caraballo, Maria ; Archibald, Hannah L. ; Nangia, Varuna ; Dionne, Kristin ; Riley, Amanda ; Lawlor, Matthew ; Banwait, Mandeep Kaur ; Cobb, Rosemary G. ; Zou, Lee ; Dyson, Nicholas J. ; Ott, Christopher J. ; Benes, Cyril ; Getz, Gad ; Chan, Chang S. ; Shaw, Alice T. ; Gainor, Justin F. ; Lin, Jessica J. ; Sequist, Lecia V. ; Piotrowska, Zofia ; Yeap, Beow Y. ; Engelman, Jeffrey A. ; Lee, Jake June-Koo ; Maruvka, Yosef E. ; Buisson, Rémi ; Lawrence, Michael S. ; Hata, Aaron N.

Acquired drug resistance to anticancer targeted therapies remains an unsolved clinical problem. Although many drivers of acquired drug resistance have been identified1–4, the underlying molecular mechanisms shaping tumour evolution during treatment are incompletely understood. Genomic profiling of patient tumours has implicated apolipoprotein B messenger RNA editing catalytic polypeptide-like (APOBEC) cytidine deaminases in tumour evolution; however, their role during therapy and the [...]

Menée à l'aide de lignées cellulaires et de modèles murins d'adénocarcinome du poumon, cette étude met en évidence un mécanisme par lequel la transition épithélio-mésenchymateuse coordonne le processus invasif et l'immunosuppression en favorisant le trafic des vésicules de sécrétion via le facteur de transcription ZEB1 et les protéines Rab6A et Rab8A

EMT activates exocytotic Rabs to coordinate invasion and immunosuppression in lung cancer

Xiao, Guan-Yu ; Tan, Xiaochao ; Rodriguez, Bertha L. ; Gibbons, Don L. ; Wang, Shike ; Wu, Chao ; Liu, Xin ; Yu, Jiang ; Vasquez, Mayra E. ; Tran, Hai T. ; Xu, Jun ; Russell, William K. ; Haymaker, Cara ; Lee, Younghee ; Zhang, Jianjun ; Solis, Luisa ; Wistuba, Ignacio I. ; Kurie, Jonathan M.

Epithelial-to-mesenchymal transition (EMT) underlies immunosuppression, drug resistance, and metastasis in epithelial malignancies. However, the way in which EMT orchestrates disparate biological processes remains unclear. Here, we identify an EMT-activated vesicular trafficking network that coordinates promigratory focal adhesion dynamics with an immunosuppressive secretory program in lung adenocarcinoma (LUAD). The EMT-activating transcription factor ZEB1 drives exocytotic vesicular [...]

Menée à l'aide de lignées cellulaires, d'un modèle murin de mélanome et de données du projet "The Cancer Genome Atlas", cette étude met en évidence le rôle du récepteur nucléaire

Melanoma-intrinsic NR2F6 activity regulates antitumor immunity

Kim, Hyungsoo ; Feng, Yongmei ; Murad, Rabi ; Poźniak, Joanna ; Pelz, Carl ; Chen, Yeqing ; Dalal, Bhavik ; Sears, Rosalie ; Sergienko, Eduard ; Jackson, Michael ; Ruppin, Eytan ; Herlyn, Meenhard ; Harris, Curtis ; Marine, Jean-Christophe ; Klepsch, Victoria ; Baier, Gottfried ; Ronai, Ze’ev A.

Nuclear receptors (NRs) are implicated in the regulation of tumors and immune cells. We identify a tumor-intrinsic function of the orphan NR, NR2F6, regulating antitumor immunity. NR2F6 was selected from 48 candidate NRs based on an expression pattern in melanoma patient specimens (i.e., IFN-

Menée auprès de 1 728 Afro-Américaines et à l'aide de données d'études sur l'histologie du cancer du col de l'utérus, cette étude analyse l'association entre des polymorphismes à simple nucléotide dans les gènes récepteurs supposés permettre l'entrée des cellules du papillomavirus humain (HPV) et une infection persistante par le HPV ou la survenue de lésions précancéreuses

Variations in Genes Encoding Human Papillomavirus Binding Receptors and Susceptibility to Cervical Pre-Cancer

Mukherjee, Amrita ; Ye, Yuanfan ; Wiener, Howard W. ; Kuniholm, Mark H. ; Minkoff, Howard ; Michel, Kate ; Palefsky, Joel ; D'Souza, Gypsyamber ; Rahangdale, Lisa ; Butler, Kenneth R. ; Kempf, Mirjam-Colette ; Sudenga, Staci L. ; Aouizerat, Bradley E. ; Ojesina, Akinyemi I. ; Shrestha, Sadeep

Background: Cervical cancer oncogenesis starts with human papillomavirus (HPV) cell entry after binding to host cell surface receptors; however, the mechanism is not fully known. We examined polymorphisms in receptor genes hypothesized to be necessary for HPV cell entry and assessed their associations with clinical progression to pre-cancer. Methods: African-American women (N=1728) from the MACS/WIHS Combined Cohort Study were included. Two case-control study designs were used - cases with [...]