Menée en Chine à partir de 42 échantillons biopsiques de l'oesophage prélevés sur 28 patients et à partir du séquençage de l'exome et du génome de 1 275 micro-biopsies issues des échantillons biopsiques, cette étude identifie des altérations génomiques favorisant la transformation de lésions précancéreuses en lésions cancéreuses

Genomic alterations driving precancerous to cancerous lesions in esophageal cancer development

Chang, Jiang ; Zhao, Xuan ; Wang, Yichen ; Liu, Tianyuan ; Zhong, Ce ; Lao, Yueqiong ; Zhang, Shaosen ; Liao, Han ; Bai, Fan ; Lin, Dongxin ; Wu, Chen

Esophageal squamous cell carcinoma (ESCC) develops through a series of increasingly abnormal precancerous lesions. Previous studies have revealed the striking differences between normal esophageal epithelium and ESCC in copy number alterations (CNAs) and mutations in genes driving clonal expansion. However, due to limited data on early precancerous lesions, the timing of these transitions and which among them are prerequisites for malignant transformation remained unclear. Here, we analyze [...]

Menée à l'aide de modèles murins et d'échantillons sanguins prélevés sur des patients atteints d'un cancer du poumon non à petites cellules, cette étude met en évidence un mécanisme par lequel l'axe de signalisation de l'interleukine IL-4 issue des basophiles et éosinophiles de la moelle osseuse favorise la myélopoïèse pro-tumorigène

An IL-4 signalling axis in bone marrow drives pro-tumorigenic myelopoiesis

LaMarche, Nelson M. ; Hegde, Samarth ; Park, Matthew D. ; Maier, Barbara B. ; Troncoso, Leanna ; Le Berichel, Jessica ; Hamon, Pauline ; Belabed, Meriem ; Mattiuz, Raphaël ; Hennequin, Clotilde ; Chin, Theodore ; Reid, Amanda M. ; Reyes-Torres, Iván ; Nemeth, Erika ; Zhang, Ruiyuan ; Olson, Oakley C. ; Doroshow, Deborah B. ; Rohs, Nicholas C. ; Gomez, Jorge E. ; Veluswamy, Rajwanth ; Hall, Nicole ; Venturini, Nicholas ; Ginhoux, Florent ; Liu, Zhaoyuan ; Buckup, Mark ; Figueiredo, Igor ; Roudko, Vladimir ; Miyake, Kensuke ; Karasuyama, Hajime ; Gonzalez-Kozlova, Edgar ; Gnjatic, Sacha ; Passegué, Emmanuelle ; Kim-Schulze, Seunghee ; Brown, Brian D. ; Hirsch, Fred R. ; Kim, Brian S. ; Marron, Thomas U. ; Merad, Miriam

Myeloid cells are known to suppress antitumour immunity1. However, the molecular drivers of immunosuppressive myeloid cell states are not well defined. Here we used single-cell RNA sequencing of human and mouse non-small cell lung cancer (NSCLC) lesions, and found that in both species the type 2 cytokine interleukin-4 (IL-4) was predicted to be the primary driver of the tumour-infiltrating monocyte-derived macrophage phenotype. Using a panel of conditional knockout mice, we found that only [...]

Menée à l'aide de lignées cellulaires et de modèles murins de carcinome hépatocellulaire, cette étude met en évidence un mécanisme par lequel la palmitylation de la cystéine 108 du facteur STAT3 déclenche une boucle de rétroaction positive qui favorise la prolifération des cellules cancéreuses

STAT3 palmitoylation initiates a positive feedback loop that promotes the malignancy of hepatocellular carcinoma cells in mice

Jiang, Yi ; Xu, Yuejie ; Zhu, Chengliang ; Xu, Guifang ; Xu, Lei ; Rao, Zijian ; Zhou, Lixing ; Jiang, Ping ; Malik, Sara ; Fang, Jingyuan ; Lin, Hening ; Zhang, Mingming

Constitutive activation of the transcription factor STAT3 (signal transducer and activator of transcription 3) contributes to the malignancy of many cancers such as hepatocellular carcinoma (HCC) and is associated with poor prognosis. STAT3 activity is increased by the reversible palmitoylation of Cys108 by the palmitoyltransferase DHHC7 (encoded by ZDHHC7). Here, we investigated the consequences of S-palmitoylation of STAT3 in HCC. Increased ZDHHC7 abundance in HCC cases was associated with [...]

Cet article passe en revue les mécanismes impliqués dans l'évolution des cellules cancéreuses

Cancer Evolution: A Multifaceted Affair

Ciriello, Giovanni ; Magnani, Luca ; Aitken, Sarah J. ; Akkari, Leila ; Behjati, Sam ; Hanahan, Douglas ; Landau, Dan A. ; Lopez-Bigas, Nuria ; Lupiáñez, Darío G. ; Marine, Jean-Christophe ; Martin-Villalba, Ana ; Natoli, Gioacchino ; Obenauf, Anna C. ; Oricchio, Elisa ; Scaffidi, Paola ; Sottoriva, Andrea ; Swarbrick, Alexander ; Tonon, Giovanni ; Vanharanta, Sakari ; Zuber, Johannes

Cancer cells adapt and survive through the acquisition and selection of molecular modifications. This process defines cancer evolution. Building on a theoretical framework based on heritable genetic changes has provided insights into the mechanisms supporting cancer evolution. However, cancer hallmarks also emerge via heritable nongenetic mechanisms, including epigenetic and chromatin topological changes, and interactions between tumor cells and the tumor microenvironment. Recent findings on [...]

Menée à l'aide de lignées cellulaires, d'échantillons tumoraux issus de patients et de modèles murins de cancer du poumon non à petites cellules avec mutation du récepteur EGFR, cette étude met en évidence le rôle de l'apolipoprotéine APOBEC3B dans l'évolution tumorale et la résistance aux thérapies ciblées

The role of APOBEC3B in lung tumor evolution and targeted cancer therapy resistance

Caswell, Deborah R. ; Gui, Philippe ; Mayekar, Manasi K. ; Law, Emily K. ; Pich, Oriol ; Bailey, Chris ; Boumelha, Jesse ; Kerr, D. Lucas ; Blakely, Collin M. ; Manabe, Tadashi ; Martínez-Ruiz, Carlos ; Bakker, Bjorn ; De Dios Palomino Villcas, Juan ; I. Vokes, Natalie ; Dietzen, Michelle ; Angelova, Mihaela ; Gini, Beatrice ; Tamaki, Whitney ; Allegakoen, Paul ; Wu, Wei ; Humpton, Timothy J. ; Hill, William ; Tomaschko, Mona ; Lu, Wei-Ting ; Haderk, Franziska ; Al Bakir, Maise ; Nagano, Ai ; Gimeno-Valiente, Francisco ; de Carné Trécesson, Sophie ; Vendramin, Roberto ; Barbè, Vittorio ; Mugabo, Miriam ; Weeden, Clare E. ; Rowan, Andrew ; McCoach, Caroline E. ; Almeida, Bruna ; Green, Mary ; Gomez, Carlos ; Nanjo, Shigeki ; Barbosa, Dora ; Moore, Chris ; Przewrocka, Joanna ; Black, James R. M. ; Grönroos, Eva ; Suárez-Bonnet, Alejandro ; Priestnall, Simon L. ; Zverev, Caroline ; Lighterness, Scott ; Cormack, James ; Olivas, Victor ; Cech, Lauren ; Andrews, Trisha ; Rule, Brandon ; Jiao, Yuwei ; Zhang, Xinzhu ; Ashford, Paul ; Durfee, Cameron ; Venkatesan, Subramanian ; Temiz, Nuri Alpay ; Tan, Lisa ; Larson, Lindsay K. ; Argyris, Prokopios P. ; Brown, William L. ; Yu, Elizabeth A. ; Rotow, Julia K. ; Guha, Udayan ; Roper, Nitin ; Yu, Johnny ; Vogel, Rachel I. ; Thomas, Nicholas J. ; Marra, Antonio ; Selenica, Pier ; Yu, Helena ; Bakhoum, Samuel F. ; Chew, Su Kit ; Reis-Filho, Jorge S. ; Jamal-Hanjani, Mariam ; Vousden, Karen H. ; McGranahan, Nicholas ; Van Allen, Eliezer M. ; Kanu, Nnennaya ; Harris, Reuben S. ; Downward, Julian ; Bivona, Trever G. ; Swanton, Charles

In this study, the impact of the apolipoprotein B mRNA-editing catalytic subunit-like (APOBEC) enzyme APOBEC3B (A3B) on epidermal growth factor receptor (EGFR)-driven lung cancer was assessed. A3B expression in EGFR mutant (EGFRmut) non-small-cell lung cancer (NSCLC) mouse models constrained tumorigenesis, while A3B expression in tumors treated with EGFR-targeted cancer therapy was associated with treatment resistance. Analyses of human NSCLC models treated with EGFR-targeted therapy showed [...]

Menée à l'aide de modèles murins, cette étude met en évidence le rôle de la protéine tyrosine phosphatase PTMT1 dans l'utilisation des carbohydrates par la mitochondrie et démontre que l'immunité antitumorale liée aux lymphocytes T CD8+ dépend de la flexibilité métabolique des mitochondries

Mitochondrial metabolic flexibility is critical for CD8+ T cell antitumor immunity

Chen, Chao ; Zheng, Hong ; Horwitz, Edwin M. ; Ando, Satomi ; Araki, Koichi ; Zhao, Peng ; Li, Zhiguo ; Ford, Mandy L. ; Ahmed, Rafi ; Qu, Cheng-Kui

Mitochondria use different substrates for energy production and intermediatory metabolism according to the availability of nutrients and oxygen levels. The role of mitochondrial metabolic flexibility for CD8+ T cell immune response is poorly understood. Here, we report that the deletion or pharmacological inhibition of protein tyrosine phosphatase, mitochondrial 1 (PTPMT1) significantly decreased CD8+ effector T cell development and clonal expansion. In addition, PTPMT1 deletion impaired [...]

Cet article présente une approche méthodologique exploitant les antigènes circulants associés à la tumeur, les lymphocytes T "épuisés" et la trogocytose pour isoler le récepteur TCR spécifique de la tumeur

Harnessing T cell exhaustion and trogocytosis to isolate patient-derived tumor-specific TCR

Manfredi, Francesco ; Stasi, Lorena ; Buonanno, Silvia ; Marzuttini, Francesca ; Noviello, Maddalena ; Mastaglio, Sara ; Abbati, Danilo ; Potenza, Alessia ; Balestrieri, Chiara ; Cianciotti, Beatrice Claudia ; Tassi, Elena ; Feola, Sara ; Toffalori, Cristina ; Punta, Marco ; Magnani, Zulma ; Camisa, Barbara ; Tiziano, Elena ; Lupo-Stanghellini, Maria Teresa ; Branca, Rui Mamede ; Lehtiö, Janne ; Sikanen, Tiina M. ; Haapala, Markus J. ; Cerullo, Vincenzo ; Casucci, Monica ; Vago, Luca ; Ciceri, Fabio ; Bonini, Chiara ; Ruggiero, Eliana

To study and then harness the tumor-specific T cell dynamics after allogeneic hematopoietic stem cell transplant, we typed the frequency, phenotype, and function of lymphocytes directed against tumor-associated antigens (TAAs) in 39 consecutive transplanted patients, for 1 year after transplant. We showed that TAA-specific T cells circulated in 90% of patients but display a limited effector function associated to an exhaustion phenotype, particularly in the subgroup of patients deemed to [...]

Menée à partir de données d'études protéomiques et d'études d'association sur le génome entier, cette étude met en évidence une association entre 39 protéines circulantes et 7 localisations de cancer puis identifie, parmi ces protéines, 11 ayant des effets croisés sur le cancer, 5 présentant un intérêt thérapeutique et 8 dont l'expression peut-être régulée par le mode de vie

Exploring the cross-cancer effect of circulating proteins and discovering potential intervention targets for 13 site-specific cancers

Sun, Jing ; Luo, Jia ; Jiang, Fangyuan ; Zhao, Jianhui ; Zhou, Siyun ; Wang, Lijuan ; Zhang, Dongfeng ; Ding, Yuan ; Li, Xue

The proteome is a significant reservoir of potential therapeutic targets for cancer. This study aimed to examine the causal associations between plasma proteins and cancer risk and to identify proteins with cross-cancer effects.Genetic instruments for 3,991 plasma proteins were extracted from a large-scale proteomic study. Summary-level data of 13 site-specific cancers were derived from publicly available datasets. Proteome-wide Mendelian randomization (MR) and colocalization analyses were used [...]

Menée in vitro et à partir de données cliniques, démographiques, génomiques et transcriptomiques portant sur 342 patients pédiatriques atteints d'une leucémie lymphoblastique aiguë, cette étude identifie des altérations moléculaires au niveau du récepteur FLT3

Characterisation of FLT3 alterations in childhood acute lymphoblastic leukaemia

Gutierrez-Camino, Angela ; Richer, Chantal ; Ouimet, Manon ; Fuchs, Claire ; Langlois, Sylvie ; Khater, Fida ; Caron, Maxime ; Beaulieu, Patrick ; St-Onge, Pascal ; Bataille, Alain R. ; Sinnett, Daniel

Background : Alterations of FLT3 are among the most common driver events in acute leukaemia with important clinical implications, since it allows patient classification into prognostic groups and the possibility of personalising therapy thanks to the availability of FLT3 inhibitors. Most of the knowledge on FLT3 implications comes from the study of acute myeloid leukaemia and so far, few studies have been performed in other leukaemias. Methods : A comprehensive genomic (DNA-seq in 267 patients) [...]

Menée à partir de l'analyse génomique d'échantillons de lymphomes médiastinaux primitifs à grandes cellules B, cette étude identifie des altérations génétiques associées au pronostic ainsi que de nouvelles cibles thérapeutiques

Genetic Characterization of Primary Mediastinal B-Cell Lymphoma: Pathogenesis and Patient Outcomes

Daniel Noerenberg ; Franziska Briest ; Cornelius Hennch ; Kenichi Yoshida ; Raphael Hablesreiter ; Yasuhide Takeuchi ; Hiroo Ueno ; Annette M. Staiger ; Marita Ziepert ; Fazila Asmar ; Benjamin N. Locher ; Erika Toth ; Thomas Weber ; Rose-Marie Amini ; Wolfram Klapper ; Maria Bouzani ; Viola Poeschel ; Andreas Rosenwald ; Gerhard Held ; Elias Campo ; Naveed Ishaque ; Kostas Stamatopoulos ; George Kanellis ; Ioannis Anagnostopoulos ; Lars Bullinger ; Neta Goldschmidt ; Pier Luigi Zinzani ; Csaba Bödör ; Richard Rosenquist ; Theodoros P. Vassilakopoulos ; German Ott ; Seishi Ogawa ; Frederik Damm

PURPOSE : Primary mediastinal large B-cell lymphoma (PMBCL) is a rare aggressive lymphoma predominantly affecting young female patients. Large-scale genomic investigations and genetic markers for risk stratification are lacking. PATIENTS AND METHODS : To elucidate the full spectrum of genomic alterations, samples from 340 patients with previously untreated PMBCL were investigated by whole-genome (n = 20), whole-exome (n = 78), and targeted (n = 308) sequencing. Statistically significant [...]

Menée à l'aide d'une technique d'immunohistochimie multiplexe, d'une technique d'imagerie multispectrale, d'échantillons tumoraux et d'échantillons fécaux provenant de patients atteints d'un cancer colorectal, cette étude démontre que les mutations du gène KRAS, contrairement aux mutations du gène BRAF, sont associées à une baisse de l'infiltration de la tumeur par les cellules immunitaires

Opposing roles by KRAS and BRAF mutation on immune cell infiltration in colorectal cancer – possible implications for immunotherapy

Edin, Sofia ; Gylling, Björn ; Li, Xingru ; Stenberg, Åsa ; Löfgren-Burström, Anna ; Zingmark, Carl ; Van Guelpen, Bethany ; Ljuslinder, Ingrid ; Ling, Agnes ; Palmqvist, Richard

Background : The immune response has important clinical value in colorectal cancer (CRC) in both prognosis and response to immunotherapy. This study aims to explore tumour immune cell infiltration in relation to clinically well-established molecular markers of CRC. Methods : Multiplex immunohistochemistry and multispectral imaging was used to evaluate tumour infiltration of cytotoxic T cells (CD8+), Th1 cells (T-bet+), T regulatory cells (FoxP3+), B cells (CD20+), and macrophages (CD68+) in a [...]