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Sommaire du n° 595 du 16 février 2024
Oncogènes et suppresseurs de tumeurs (3)
Menée à partir notamment d'échantillons sanguins d'origine humaine, cette étude française démontre que le tabagisme modifie les réponses immunitaires adaptatives et que ces modifications persistent après le sevrage tabagique
Smoking changes adaptive immunity with persistent effects
Menée à partir notamment d'échantillons sanguins d'origine humaine, cette étude française démontre que le tabagisme modifie les réponses immunitaires adaptatives et que ces modifications persistent après le sevrage tabagique
Smoking changes adaptive immunity with persistent effects
Saint-André, Violaine ; Charbit, Bruno ; Biton, Anne ; Rouilly, Vincent ; Possémé, Céline ; Bertrand, Anthony ; Rotival, Maxime ; Bergstedt, Jacob ; Patin, Etienne ; Albert, Matthew L. ; Quintana-Murci, Lluis ; Duffy, Darragh ; Abel, Laurent ; Alcover, Andrés ; Aschard, Hugues ; Bousso, Philippe ; Bourke, Nollaig ; Brodin, Petter ; Bruhns, Pierre ; Cerf-Bensussan, Nadine ; Cumano, Ana ; D’Enfert, Christophe ; Demangel, Caroline ; Deriano, Ludovic ; Dillies, Marie-Agnès ; Santo, James Di ; Eberl, Gerard ; Enninga, Jost ; Fellay, Jacques ; Gomperts-Boneca, Ivo ; Hasan, Milena ; Hedestam, Gunilla Karlsson ; Hercberg, Serge ; Ingersoll, Molly A. ; Lantz, Olivier ; Kenny, Rose Anne ; Ménager, Mickaël ; Michel, Frédérique ; Mouquet, Hugo ; O’Farrelly, Cliona ; Rausell, Antonio ; Rieux-Laucat, Frederic ; Rogge, Lars ; Fontes, Magnus ; Sakuntabhai, Anavaj ; Schwartz, Olivier ; Schwikowski, Benno ; Shorte, Spencer ; Tangy, Frederic ; Toubert, Antoine ; Touvier, Mathilde ; Ungeheuer, Marie-Noëlle ; Zimmer, Christophe ; The Milieu Intérieur, Consortium
Individuals differ widely in their immune responses, with age, sex and genetic factors having major roles in this inherent variability1–6. However, the variables that drive such differences in cytokine secretion—a crucial component of the host response to immune challenges—remain poorly defined. Here we investigated 136 variables and identified smoking, cytomegalovirus latent infection and body mass index as major contributors to variability in cytokine response, with effects of comparable [...]
Menée notamment à l'aide de modèles murins, de séries de données portant sur des patients ainsi que d'analyses histologiques et immunohistochimiques d'échantillons coliques, cette étude met en évidence un mécanisme par lequel les neutrophiles induisent une protection contre l'inflammation intestinale et la carcinogenèse en contrôlant l'invasion bactérienne et la production d'interleukines IL-22 par les lymphocytes T gamma delta
Neutrophils mediate protection against colitis and carcinogenesis by controlling bacterial invasion and IL-22 production by gamma delta T cells
Menée notamment à l'aide de modèles murins, de séries de données portant sur des patients ainsi que d'analyses histologiques et immunohistochimiques d'échantillons coliques, cette étude met en évidence un mécanisme par lequel les neutrophiles induisent une protection contre l'inflammation intestinale et la carcinogenèse en contrôlant l'invasion bactérienne et la production d'interleukines IL-22 par les lymphocytes T gamma delta
Neutrophils mediate protection against colitis and carcinogenesis by controlling bacterial invasion and IL-22 production by gamma delta T cells
Carnevale, Silvia ; Ponzetta, Andrea ; Rigatelli, Anna ; Carriero, Roberta ; Puccio, Simone ; Supino, Domenico ; Grieco, Giovanna ; Molisso, Piera ; Di Ceglie, Irene ; Scavello, Francesco ; Perucchini, Chiara ; Pasqualini, Fabio ; Recordati, Camilla ; Tripodo, Claudio ; Belmonte, Beatrice ; Mariancini, Andrea ; Kunderfranco, Paolo ; Sciumè, Giuseppe ; Lugli, Enrico ; Bonavita, Eduardo ; Magrini, Elena ; Garlanda, Cecilia ; Mantovani, Alberto ; Jaillon, Sébastien
Neutrophils are the most abundant leukocytes in human blood and play a primary role in resistance against invading microorganisms and in the acute inflammatory response. However, their role in colitis and colitis-associated colorectal cancer is still under debate. This study aims to dissect the role of neutrophils in these pathological contexts by using a rigorous genetic approach. Neutrophil-deficient mice (Csf3r-/- mice) were used in classic models of colitis and colitis-associated colorectal [...]
Menée in vitro, in silico et à l'aide d'une xénogreffe de glioblastome sur un modèle murin, cette étude met en évidence un mécanisme par lequel la protéine ABCC4, en réprimant la voie de signalisation cGMP-PKG, supprime la progression et la récidive de la tumeur
ABCC4 suppresses glioblastoma progression and recurrence by restraining cGMP-PKG signalling
Menée in vitro, in silico et à l'aide d'une xénogreffe de glioblastome sur un modèle murin, cette étude met en évidence un mécanisme par lequel la protéine ABCC4, en réprimant la voie de signalisation cGMP-PKG, supprime la progression et la récidive de la tumeur
ABCC4 suppresses glioblastoma progression and recurrence by restraining cGMP-PKG signalling
Chiang, Jung-Ying ; Wei, Sung-Tai ; Chang, Huan-Jui ; Chen, Der-Cherng ; Wang, Hwai-Lee ; Lei, Fu-Ju ; Wei, Kai-Yu ; Huang, Yen‐Chih ; Wang, Chi-Chung ; Hsieh, Chia-Hung
Background : Cyclic nucleotides are critical mediators of cellular signalling in glioblastoma. However, the clinical relevance and mechanisms of regulating cyclic nucleotides in glioblastoma progression and recurrence have yet to be thoroughly explored. Methods : In silico, mRNA, and protein level analyses identified the primary regulator of cyclic nucleotides in recurrent human glioblastoma. Lentiviral and pharmacological manipulations examined the functional impact of cyclic nucleotide [...]
Progression et métastases (3)
Menée à l'aide de lignées cellulaires et de modèles murins de cancer du pancréas, cette étude met en évidence un mécanisme par lequel l'efférocytose, en modifiant le microenvironnement tumoral, favorise le développement de métastases hépatiques
Efferocytosis reprograms the tumor microenvironment to promote pancreatic cancer liver metastasis
Menée à l'aide de lignées cellulaires et de modèles murins de cancer du pancréas, cette étude met en évidence un mécanisme par lequel l'efférocytose, en modifiant le microenvironnement tumoral, favorise le développement de métastases hépatiques
Efferocytosis reprograms the tumor microenvironment to promote pancreatic cancer liver metastasis
Astuti, Yuliana ; Raymant, Meirion ; Quaranta, Valeria ; Clarke, Kim ; Abudula, Maidinaimu ; Smith, Olivia ; Bellomo, Gaia ; Chandran-Gorner, Vatshala ; Nourse, Craig ; Halloran, Christopher ; Ghaneh, Paula ; Palmer, Daniel ; Jones, Robert P. ; Campbell, Fiona ; Pollard, Jeffrey W. ; Morton, Jennifer P. ; Mielgo, Ainhoa ; Schmid, Michael C.
Pancreatic ductal adenocarcinoma is a highly metastatic disease and macrophages support liver metastases. Efferocytosis, or engulfment of apoptotic cells by macrophages, is an essential process in tissue homeostasis and wound healing, but its role in metastasis is less well understood. Here, we found that the colonization of the hepatic metastatic site is accompanied by low-grade tissue injury and that efferocytosis-mediated clearance of parenchymal dead cells promotes macrophage reprogramming [...]
Menée à l'aide de lignées cellulaires, de modèles murins et de 79 échantillons de tumeurs neuroendocrines pancréatiques, cette étude examine le rôle, dans le développement de métastases et la croissance tumorale, des fibroblastes associés au cancer
Unraveling the impact of cancer-associated fibroblasts on hypovascular pancreatic neuroendocrine tumors
Menée à l'aide de lignées cellulaires, de modèles murins et de 79 échantillons de tumeurs neuroendocrines pancréatiques, cette étude examine le rôle, dans le développement de métastases et la croissance tumorale, des fibroblastes associés au cancer
Unraveling the impact of cancer-associated fibroblasts on hypovascular pancreatic neuroendocrine tumors
Lai, Ting-Yu ; Chiang, Tsai-Chen ; Lee, Chih-Yuan ; Kuo, Ting-Chun ; Wu, Chien-Hui ; Chen, Yi-Ing ; Hu, Chun-Mei ; Maskey, Manjit ; Tang, Shiue-Cheng ; Jeng, Yung-Ming ; Tien, Yu-Wen ; Lee, Eva Y. H. P. ; Lee, Wen-Hwa
Background : Pancreatic neuroendocrine tumors (PNETs) with low microvessel density and fibrosis often exhibit clinical aggressiveness. Given the contribution of cancer-associated fibroblasts (CAFs) to the hypovascular fibrotic stroma in pancreatic ductal adenocarcinoma, investigating whether CAFs play a similar role in PNETs becomes imperative. In this study, we investigated the involvement of CAFs in PNETs and their effects on clinical outcomes. Methods : We examined 79 clinical PNET specimens [...]
Menée notamment à l'aide d'un modèle murin de cancer de la prostate, cette étude met en évidence un mécanisme par lequel la monoamine oxydase B du microenvironnement tumoral favorise la croissance et la progression de la tumeur
Stromal-derived MAOB promotes prostate cancer growth and progression
Menée notamment à l'aide d'un modèle murin de cancer de la prostate, cette étude met en évidence un mécanisme par lequel la monoamine oxydase B du microenvironnement tumoral favorise la croissance et la progression de la tumeur
Stromal-derived MAOB promotes prostate cancer growth and progression
Pu, Tianjie ; Wang, Jing ; Wei, Jing ; Zeng, Alan ; Zhang, Jinglong ; Chen, Jingrui ; Yin, Lijuan ; Li, Jingjing ; Lin, Tzu-Ping ; Melamed, Jonathan ; Corey, Eva ; Gao, Allen C. ; Wu, Boyang Jason
Prostate cancer (PC) develops in a microenvironment where the stromal cells modulate adjacent tumor growth and progression. Here, we demonstrated elevated levels of monoamine oxidase B (MAOB), a mitochondrial enzyme that degrades biogenic and dietary monoamines, in human PC stroma, which was associated with poor clinical outcomes of PC patients. Knockdown or overexpression of MAOB in human prostate stromal fibroblasts indicated that MAOB promotes cocultured PC cell proliferation, migration, and [...]
Ressources et infrastructures (Biologie) (4)
Menée en Chine à partir du séquençage profond du génome entier de 494 carcinomes hépatocellulaires, cette étude identifie les caractéristiques génomiques de ces tumeurs ainsi que les mécanismes qui régulent leur développement
Deep whole-genome analysis of 494 hepatocellular carcinomas
Menée en Chine à partir du séquençage profond du génome entier de 494 carcinomes hépatocellulaires, cette étude identifie les caractéristiques génomiques de ces tumeurs ainsi que les mécanismes qui régulent leur développement
Deep whole-genome analysis of 494 hepatocellular carcinomas
Chen, Lei ; Zhang, Chong ; Xue, Ruidong ; Liu, Mo ; Bai, Jian ; Bao, Jinxia ; Wang, Yin ; Jiang, Nanhai ; Li, Zhixuan ; Wang, Wenwen ; Wang, Ruiru ; Zheng, Bo ; Yang, Airong ; Hu, Ji ; Liu, Ke ; Shen, Siyun ; Zhang, Yangqianwen ; Bai, Mixue ; Wang, Yan ; Zhu, Yanjing ; Yang, Shuai ; Gao, Qiang ; Gu, Jin ; Gao, Dong ; Wang, Xin Wei ; Nakagawa, Hidewaki ; Zhang, Ning ; Wu, Lin ; Rozen, Steven G. ; Bai, Fan ; Wang, Hongyang
Over half of hepatocellular carcinoma (HCC) cases diagnosed worldwide are in China1,2,3. However, whole-genome analysis of hepatitis B virus (HBV)-associated HCC in Chinese individuals is limited4,5,6,7,8, with current analyses of HCC mainly from non-HBV-enriched populations9,10. Here we initiated the Chinese Liver Cancer Atlas (CLCA) project and performed deep whole-genome sequencing (average depth, 120×) of 494 HCC tumours. We identified 6 coding and 28 non-coding previously undescribed [...]
Menée à partir de données protéogénomiques portant sur plus de 1 000 tumeurs couvrant 10 types de cancers, cette étude identifie les caractéristiques immunitaires de ces tumeurs
Pan-cancer proteogenomics characterization of tumor immunity
Menée à partir de données protéogénomiques portant sur plus de 1 000 tumeurs couvrant 10 types de cancers, cette étude identifie les caractéristiques immunitaires de ces tumeurs
Pan-cancer proteogenomics characterization of tumor immunity
Petralia, Francesca ; Ma, Weiping ; Yaron, Tomer M. ; Caruso, Francesca Pia ; Tignor, Nicole ; Wang, Joshua M. ; Charytonowicz, Daniel ; Johnson, Jared L. ; Huntsman, Emily M. ; Marino, Giacomo B. ; Calinawan, Anna ; Evangelista, John Erol ; Selvan, Myvizhi Esai ; Chowdhury, Shrabanti ; Rykunov, Dmitry ; Krek, Azra ; Song, Xiaoyu ; Turhan, Berk ; Christianson, Karen E. ; Lewis, David A. ; Deng, Eden Z. ; Clarke, Daniel J. B. ; Whiteaker, Jeffrey R. ; Kennedy, Jacob J. ; Zhao, Lei ; Segura, Rossana Lazcano ; Batra, Harsh ; Raso, Maria Gabriela ; Parra, Edwin Roger ; Soundararajan, Rama ; Tang, Ximing ; Li, Yize ; Yi, Xinpei ; Satpathy, Shankha ; Wang, Ying ; Wiznerowicz, Maciej ; González-Robles, Tania J. ; Iavarone, Antonio ; Gosline, Sara J. C. ; Reva, Boris ; Robles, Ana I. ; Nesvizhskii, Alexey I. ; Mani, D. R. ; Gillette, Michael A. ; Klein, Robert J. ; Cieslik, Marcin ; Zhang, Bing ; Paulovich, Amanda G. ; Sebra, Robert ; Gümüş, Zeynep H. ; Hostetter, Galen ; Fenyö, David ; Omenn, Gilbert S. ; Cantley, Lewis C. ; Ma'ayan, Avi ; Lazar, Alexander J. ; Ceccarelli, Michele ; Wang, Pei ; Abelin, Jennifer ; Aguet, François ; Akiyama, Yo ; An, Eunkyung ; Anand, Shankara ; Anurag, Meenakshi ; Babur, Özgün ; Bavarva, Jasmin ; Birger, Chet ; Birrer, Michael J. ; Cao, Song ; Carr, Steven A. ; Chan, Daniel W. ; Chinnaiyan, Arul M. ; Cho, Hanbyul ; Clauser, Karl ; Colaprico, Antonio ; Zhou, Daniel Cui ; da Veiga Leprevost, Felipe ; Day, Corbin ; Dhanasekaran, Saravana M. ; Ding, Li ; Domagalski, Marcin J. ; Dou, Yongchao ; Druker, Brian J. ; Edwards, Nathan ; Ellis, Matthew J. ; Foltz, Steven M. ; Francis, Alicia ; Geffen, Yifat ; Getz, Gad ; Heiman, David I. ; Hong, Runyu ; Hu, Yingwei ; Huang, Chen ; Jaehnig, Eric J. ; Jewell, Scott D. ; Ji, Jiayi ; Jiang, Wen ; Katsnelson, Lizabeth ; Ketchum, Karen A. ; Kolodziejczak, Iga ; Krug, Karsten ; Kumar-Sinha, Chandan ; Lei, Jonathan T. ; Liang, Wen-Wei ; Liao, Yuxing ; Lindgren, Caleb M. ; Liu, Tao ; Liu, Wenke ; McDermott, Jason ; McKerrow, Wilson ; Mesri, Mehdi ; Mumphrey, Michael Brodie ; Newton, Chelsea J. ; Oldroyd, Robert ; Payne, Samuel H. ; Pugliese, Pietro ; Rodland, Karin D. ; Rodrigues, Fernanda Martins ; Ruggles, Kelly V. ; Savage, Sara R. ; Schadt, Eric E. ; Schnaubelt, Michael ; Schraink, Tobias ; Schürer, Stephan ; Shi, Zhiao ; Smith, Richard D. ; Song, Feng ; Song, Yizhe ; Stathias, Vasileios ; Storrs, Erik P. ; Tan, Jimin ; Terekhanova, Nadezhda V. ; Thangudu, Ratna R. ; Thiagarajan, Mathangi ; Wang, Liang-Bo ; Wen, Bo ; Wu, Yige ; Wyczalkowski, Matthew A. ; Yao, Lijun ; Li, Qing Kay ; Zhang, Hui ; Zhang, Qing ; Zhang, Xu ; Zhang, Zhen
Despite the successes of immunotherapy in cancer treatment over recent decades, less than <10%–20% cancer cases have demonstrated durable responses from immune checkpoint blockade. To enhance the efficacy of immunotherapies, combination therapies suppressing multiple immune evasion mechanisms are increasingly contemplated. To better understand immune cell surveillance and diverse immune evasion responses in tumor tissues, we comprehensively characterized the immune landscape of more than 1,000 [...]
Menée à partir de l'analyse d'échantillons de tumeurs colorectales primitives et d'échantillons de métastases cérébrales issus de 22 patients, cette étude compare les caractéristiques moléculaires de ces 2 types tumoraux
HER2 expression and genOmic characterization of rESected brain metastases from colorectal cancer: the HEROES study
Menée à partir de l'analyse d'échantillons de tumeurs colorectales primitives et d'échantillons de métastases cérébrales issus de 22 patients, cette étude compare les caractéristiques moléculaires de ces 2 types tumoraux
HER2 expression and genOmic characterization of rESected brain metastases from colorectal cancer: the HEROES study
Prete, Alessandra Anna ; Angerilli, Valentina ; Bergamo, Francesca ; Vettore, Valentina ; De Toni, Chiara ; Intini, Rossana ; Cerma, Krisida ; Ricagno, Gianmarco ; Cerantola, Riccardo ; Perissinotto, Eleonora ; De Rosa, Antonio ; Ceccon, Carlotta ; Gasparello, Jessica ; Denaro, Luca ; D’Amico, Alberto ; Chioffi, Franco ; Carcea, Elena ; Fassan, Matteo ; Lonardi, Sara
Background : Little is known about prognostic factors of brain metastases (BM) from colorectal cancer (CRC). HER2 amplification/overexpression (HER2+) was previously described; its impact on prognosis remains uncertain. Methods : In the translational study HEROES, extensive molecular analysis was performed on primary CRC (prCRC) and their matched resected BM by means of NGS comprehensive genomic profiling and HER2 status as assessed by immunohistochemical/ in situ hybridization. Count of [...]
Menée à l'aide d'un modèle murin ainsi que d'échantillons de carcinomes à cellules rénales et d'échantillons tissulaires sains, cette étude met en évidence un mécanisme par lequel l'inhibition de MYC dans les cellules cancéreuses avec gène von Hippel Lindau déficient induit, via l'augmentation de l'expression de protéines HILPDA, l'accumulation de gouttelettes lipidiques d'une manière dépendante de la glutamine
Targeting MYC induces lipid droplet accumulation by upregulation of HILPDA in clear cell renal cell carcinoma
Menée à l'aide d'un modèle murin ainsi que d'échantillons de carcinomes à cellules rénales et d'échantillons tissulaires sains, cette étude met en évidence un mécanisme par lequel l'inhibition de MYC dans les cellules cancéreuses avec gène von Hippel Lindau déficient induit, via l'augmentation de l'expression de protéines HILPDA, l'accumulation de gouttelettes lipidiques d'une manière dépendante de la glutamine
Targeting MYC induces lipid droplet accumulation by upregulation of HILPDA in clear cell renal cell carcinoma
Sainero-Alcolado, Lourdes ; Garde-Lapido, Elisa ; Snaebjörnsson, Marteinn Thor ; Schoch, Sarah ; Stevens, Irene ; Ruiz-Pérez, María Victoria ; Dyrager, Christine ; Pelechano, Vicent ; Axelson, Håkan ; Schulze, Almut ; Arsenian-Henriksson, Marie
Metabolic reprogramming is critical during clear cell renal cell carcinoma (ccRCC) tumorigenesis, manifested by accumulation of lipid droplets (LDs), organelles that have emerged as new hallmarks of cancer. Yet, regulation of their biogenesis is still poorly understood. Here, we demonstrate that MYC inhibition in ccRCC cells lacking the von Hippel Lindau (VHL) gene leads to increased triglyceride content potentiating LD formation in a glutamine-dependent manner. Importantly, the concurrent [...]