Menée à l'aide de lignées cellulaires, de modèles murins et d'échantillons tumoraux issus de patients, cette étude met en évidence un mécanisme par lequel les cellules sénescentes favorisent la progression tumorale via la surexpression de la kinase PDK4 et la production de lactate

PDK4-dependent hypercatabolism and lactate production of senescent cells promotes cancer malignancy

Dou, Xuefeng ; Fu, Qiang ; Long, Qilai ; Liu, Shuning ; Zou, Yejun ; Fu, Da ; Xu, Qixia ; Jiang, Zhirui ; Ren, Xiaohui ; Zhang, Guilong ; Wei, Xiaoling ; Li, Qingfeng ; Campisi, Judith ; Zhao, Yuzheng ; Sun, Yu

Senescent cells remain metabolically active, but their metabolic landscape and resulting implications remain underexplored. Here, we report upregulation of pyruvate dehydrogenase kinase 4 (PDK4) upon senescence, particularly in some stromal cell lines. Senescent cells display a PDK4-dependent increase in aerobic glycolysis and enhanced lactate production but maintain mitochondrial respiration and redox activity, thus adopting a special form of metabolic reprogramming. Medium from PDK4+ stromal [...]

Cet article examine le rôle de la kinase CDK1 dans les processus biologiques et son implication dans la progression tumorale et la résistance thérapeutique

The Cyclin-dependent kinase 1: more than a cell cycle regulator

Massacci, Giorgia ; Perfetto, Livia ; Sacco, Francesca

The Cyclin-dependent kinase 1, as a serine/threonine protein kinase, is more than a cell cycle regulator as it was originally identified. During the last decade, it has been shown to carry out versatile functions during the last decade. From cell cycle control to gene expression regulation and apoptosis, CDK1 is intimately involved in many cellular events that are vital for cell survival. Here, we provide a comprehensive catalogue of the CDK1 upstream regulators and substrates, describing how [...]

Menée à l'aide de lignées cellulaires et de sphéroïdes, cette étude met en évidence un mécanisme par lequel l'interaction entre cavéoles et invadosomes, deux structures cellulaires mécanosensibles, modifie la matrice extracellulaire pour favoriser la dissémination des cellules cancéreuses

A mechanosensitive caveolae–invadosome interplay drives matrix remodelling for cancer cell invasion

Monteiro, Pedro ; Remy, David ; Lemerle, Eline ; Routet, Fiona ; Macé, Anne-Sophie ; Guedj, Chloé ; Ladoux, Benoit ; Vassilopoulos, Stéphane ; Lamaze, Christophe ; Chavrier, Philippe

Invadosomes and caveolae are mechanosensitive structures that are implicated in metastasis. Here, we describe a unique juxtaposition of caveola clusters and matrix degradative invadosomes at contact sites between the plasma membrane of cancer cells and constricting fibrils both in 2D and 3D type I collagen matrix environments. Preferential association between caveolae and straight segments of the fibrils, and between invadosomes and bent segments of the fibrils, was observed along with matrix [...]

Menée in vitro et à l'aide de xénogreffes de glioblastomes et de gliomes infiltrants du tronc cérébral sur des modèles murins, cette étude met en évidence un mécanisme par lequel la signalisation du facteur BDNF et du récepteur TrkB, en favorisant la plasticité des synapses formées entre les cellules cancéreuses et les neurones, augmente la progression tumorale

Glioma synapses recruit mechanisms of adaptive plasticity

Taylor, Kathryn R. ; Barron, Tara ; Hui, Alexa ; Spitzer, Avishay ; Yalçın, Belgin ; Ivec, Alexis E. ; Geraghty, Anna C. ; Hartmann, Griffin G. ; Arzt, Marlene ; Gillespie, Shawn M. ; Kim, Yoon Seok ; Maleki Jahan, Samin ; Zhang, Helena ; Shamardani, Kiarash ; Su, Minhui ; Ni, Lijun ; Du, Peter P. ; Woo, Pamelyn J. ; Silva-Torres, Arianna ; Venkatesh, Humsa S. ; Mancusi, Rebecca ; Ponnuswami, Anitha ; Mulinyawe, Sara ; Keough, Michael B. ; Chau, Isabelle ; Aziz-Bose, Razina ; Tirosh, Itay ; Suvà, Mario L. ; Monje, Michelle

The role of the nervous system in the regulation of cancer is increasingly appreciated. In gliomas, neuronal activity drives tumour progression through paracrine signalling factors such as neuroligin-3 and brain-derived neurotrophic factor1–3 (BDNF), and also through electrophysiologically functional neuron-to-glioma synapses mediated by AMPA (α-amino-3-hydroxy-5-methyl-4-isoxazole propionic acid) receptors4,5. The consequent glioma cell membrane depolarization drives tumour proliferation4,6. [...]

Cet article présente les approches computationnelles actuellement utilisées pour analyser les données immunogénomiques et décrit la façon de sélectionner l'outil le plus approprié pour répondre à diverses questions cliniques

Computational immunogenomic approaches to predict response to cancer immunotherapies

Addala, Venkateswar ; Newell, Felicity ; Pearson, John V. ; Redwood, Alec ; Robinson, Bruce W. ; Creaney, Jenette ; Waddell, Nicola

Cancer immunogenomics is an emerging field that bridges genomics and immunology. The establishment of large-scale genomic collaborative efforts along with the development of new single-cell transcriptomic techniques and multi-omics approaches have enabled characterization of the mutational and transcriptional profiles of many cancer types and helped to identify clinically actionable alterations as well as predictive and prognostic biomarkers. Researchers have developed computational approaches [...]

Cet article présente le développement d'un atlas multi-omique à partir de l'analyse de 225 échantillons tissulaires couvrant 11 types tumoraux puis identifie des facteurs épigénétiques associés aux états transitoires des cellules cancéreuses

Epigenetic regulation during cancer transitions across 11 tumour types

Terekhanova, Nadezhda V. ; Karpova, Alla ; Liang, Wen-Wei ; Strzalkowski, Alexander ; Chen, Siqi ; Li, Yize ; Southard-Smith, Austin N. ; Iglesia, Michael D. ; Wendl, Michael C. ; Jayasinghe, Reyka G. ; Liu, Jingxian ; Song, Yizhe ; Cao, Song ; Houston, Andrew ; Liu, Xiuting ; Wyczalkowski, Matthew A. ; Lu, Rita Jui-Hsien ; Caravan, Wagma ; Shinkle, Andrew ; Naser Al Deen, Nataly ; Herndon, John M. ; Mudd, Jacqueline ; Ma, Cong ; Sarkar, Hirak ; Sato, Kazuhito ; Ibrahim, Omar M. ; Mo, Chia-Kuei ; Chasnoff, Sara E. ; Porta-Pardo, Eduard ; Held, Jason M. ; Pachynski, Russell ; Schwarz, Julie K. ; Gillanders, William E. ; Kim, Albert H. ; Vij, Ravi ; DiPersio, John F. ; Puram, Sidharth V. ; Chheda, Milan G. ; Fuh, Katherine C. ; DeNardo, David G. ; Fields, Ryan C. ; Chen, Feng ; Raphael, Benjamin J. ; Ding, Li

Chromatin accessibility is essential in regulating gene expression and cellular identity, and alterations in accessibility have been implicated in driving cancer initiation, progression and metastasis1–4. Although the genetic contributions to oncogenic transitions have been investigated, epigenetic drivers remain less understood. Here we constructed a pan-cancer epigenetic and transcriptomic atlas using single-nucleus chromatin accessibility data (using single-nucleus assay for [...]

Cet article présente une plateforme de 30 organoïdes de mélanomes muqueux permettant de modéliser l'hétérogénéité tumorale et de tester des combinaisons d'immunothérapies

A human mucosal melanoma organoid platform for modeling tumor heterogeneity and exploring immunotherapy combination options

Sun, Lulu ; Kang, Xindan ; Ju, Houyu ; Wang, Chong ; Yang, Guizhu ; Wang, Rui ; Sun, Shuyang

Mucosal melanoma (MM), an aggressive rare subtype of melanoma, is distinct from cutaneous melanoma and has poor prognoses. We addressed the lack of cell models for MM by establishing 30 organoids of human oral MM (OMM), which retained major histopathological and functional features of parental tumors. Organoid groups derived from chronologically or intratumorally distinct lesions within the same individual displayed heterogeneous genetics, expression profiles, and drug responses, indicating [...]

Menée à l'aide de lignées cellulaires, de modèles murins ainsi que d'échantillons tumoraux et d'échantillons sanguins prélevés sur des patients atteints d'un adénocarcinome canalaire du pancréas, cette étude met en évidence un mécanisme par lequel les macrophages associés à la tumeur et exprimant l'interleukine IL-1 bêta favorisent le processus inflammatoire et l'acquisition de propriétés pathogènes par une sous-population de cellules cancéreuses

IL-1β+ macrophages fuel pathogenic inflammation in pancreatic cancer

Caronni, Nicoletta ; La Terza, Federica ; Vittoria, Francesco M. ; Barbiera, Giulia ; Mezzanzanica, Luca ; Cuzzola, Vincenzo ; Barresi, Simona ; Pellegatta, Marta ; Canevazzi, Paolo ; Dunsmore, Garett ; Leonardi, Carlo ; Montaldo, Elisa ; Lusito, Eleonora ; Dugnani, Erica ; Citro, Antonio ; Ng, Melissa S. F. ; Schiavo Lena, Marco ; Drago, Denise ; Andolfo, Annapaola ; Brugiapaglia, Silvia ; Scagliotti, Alessandro ; Mortellaro, Alessandra ; Corbo, Vincenzo ; Liu, Zhaoyuan ; Mondino, Anna ; Dellabona, Paolo ; Piemonti, Lorenzo ; Taveggia, Carla ; Doglioni, Claudio ; Cappello, Paola ; Novelli, Francesco ; Iannacone, Matteo ; Ng, Lai Guan ; Ginhoux, Florent ; Crippa, Stefano ; Falconi, Massimo ; Bonini, Chiara ; Naldini, Luigi ; Genua, Marco ; Ostuni, Renato

Pancreatic ductal adenocarcinoma (PDAC) is a lethal disease with high resistance to therapies1. Inflammatory and immunomodulatory signals co-exist in the pancreatic tumour microenvironment, leading to dysregulated repair and cytotoxic responses. Tumour-associated macrophages (TAMs) have key roles in PDAC2, but their diversity has prevented therapeutic exploitation. Here we combined single-cell and spatial genomics with functional experiments to unravel macrophage functions in pancreatic cancer. [...]

Menée à l'aide de lignées cellulaires, de modèles murins de glioblastome et d'échantillons tumoraux issus de patients, cette étude met en évidence le rôle de la guanosine triphosphate dans la régulation du processus de réparation de l'ADN et la protection des cellules contre le stress génotoxique

GTP signaling links metabolism, DNA repair, and responses to genotoxic stress

Zhou, Weihua ; Zhao, Zitong ; Lin, Angelica ; Yang, John Z. ; Xu, Jie ; Wilder-Romans, Kari ; Yang, Annabel ; Li, Jing ; Solanki, Sumeet ; Speth, Jennifer M. ; Walker, Natalie ; Scott, Andrew J. ; Wang, Lu ; Wen, Bo ; Andren, Anthony ; Zhang, Li ; Kothari, Ayesha U. ; Yao, Yangyang ; Peterson, Erik R. ; Korimerla, Navyateja ; Werner, Christian K. ; Ullrich, Alexander ; Liang, Jessica ; Jacobson, Janna ; Palavalasa, Sravya ; O’Brien, Alexandra M. ; Elaimy, Ameer L. ; Ferris, Sean P. ; Zhao, Shuang G. ; Sarkaria, Jann N. ; Gyorffy, Balázs ; Zhang, Shuqun ; Al-Holou, Wajd N. ; Umemura, Yoshie ; Morgan, Meredith A. ; Lawrence, Theodore S. ; Lyssiotis, Costas A. ; Peters-Golden, Marc ; Shah, Yatrik M. ; Wahl, Daniel R.

How cell metabolism regulates DNA repair is incompletely understood. Here, we define a GTP-mediated signaling cascade that links metabolism to DNA repair and has significant therapeutic implications. GTP, but not other nucleotides, regulates the activity of Rac1, a guanine nucleotide-binding protein, that promotes the dephosphorylation of serine 323 on Abl-interactor 1 (Abi-1) by protein phosphatase 5 (PP5). Dephosphorylated Abi-1, a protein previously not known to activate DNA repair, promotes [...]