Menée à l'aide de données de séquençage du projet "The Cancer Genome Atlas", de lignées cellulaires ainsi que d'échantillons biopsiques fixés au formaldéhyde et inclus en paraffine après prélèvement sur des patients atteints d'un carcinome hépatocellulaire, cette étude met en évidence le rôle de la protéine ORF1p du rétrotransposon L1 dans l'hépatocarcinogenèse induite par la peptidyl-prolyl cis-trans isomérase PIN1

Impact of retrotransposon protein L1 ORF1p expression on oncogenic pathways in hepatocellular carcinoma: the role of cytoplasmic PIN1 upregulation

Zadran, Bassier ; Sudhindar, Praveen Dhondurao ; Wainwright, Daniel ; Bury, Yvonne ; Luli, Saimir ; Howarth, Rachel ; McCain, Misti Vanette ; Watson, Robyn ; Huet, Hannah ; Palinkas, Fanni ; Palmini, Rolando Berlinguer ; Casement, John ; Mann, Derek A. ; Oakley, Fiona ; Lunec, John ; Reeves, Helen ; Faulkner, Geoffrey J. ; Shukla, Ruchi

Background : Molecular characterisation of hepatocellular carcinoma (HCC) is central to the development of novel therapeutic strategies for the disease. We have previously demonstrated mutagenic consequences of Long-Interspersed Nuclear Element-1 (LINE1s/L1) retrotransposition. However, the role of L1 in HCC, besides somatic mutagenesis, is not well understood. Methods : We analysed L1 expression in the TCGA-HCC RNAseq dataset (n = 372) and explored potential relationships between L1 expression [...]

Menée à l'aide de modèles murins et d'échantillons tumoraux issus de patients atteints d'un cancer du pancréas, cette étude met en évidence un mécanisme par lequel le long ARN non codant PVT1, exprimé par les cellules de Schwann non-myélinisantes associées à la tumeur, favorise la croissance tumorale via la voie de transformation du tryptophane en kynurénine

Tumor-associated nonmyelinating Schwann cell–expressed PVT1 promotes pancreatic cancer kynurenine pathway and tumor immune exclusion

Sun, Chengcao ; Ye, Youqiong ; Tan, Zhi ; Liu, Yuan ; Li, Yajuan ; Hu, Wei ; Liang, Ke ; Egranov, Sergey D. ; Huang, Lisa Angela ; Zhang, Zhao ; Zhang, Yaohua ; Yao, Jun ; Nguyen, Tina K. ; Zhao, Zilong ; Wu, Andrew ; Marks, Jeffrey R. ; Caudle, Abigail S. ; Sahin, Aysegul A. ; Gao, Jianjun ; Gammon, Seth T. ; Piwnica-Worms, David ; Hu, Jian ; Chiao, Paul J. ; Yu, Dihua ; Hung, Mien-Chie ; Curran, Michael A. ; Calin, George A. ; Ying, Haoqiang ; Han, Leng ; Lin, Chunru ; Yang, Liuqing

One of the major obstacles to treating pancreatic ductal adenocarcinoma (PDAC) is its immunoresistant microenvironment. The functional importance and molecular mechanisms of Schwann cells in PDAC remains largely elusive. We characterized the gene signature of tumor-associated nonmyelinating Schwann cells (TASc) in PDAC and indicated that the abundance of TASc was correlated with immune suppressive tumor microenvironment and the unfavorable outcome of patients with PDAC. Depletion of [...]

Menée à l'aide de lignées cellulaires de cancer mammaire triple négatif et d'un modèle murin, cette étude met en évidence un mécanisme par lequel les vésicules extracellulaires des cellules souches cancéreuses augmentent le potentiel invasif des cellules cancéreuses et déclenchent la transformation des tissus pulmonaires sains en tissus permettant la croissance des métastases

Extracellular vesicles secreted by triple negative breast cancer stem cells trigger pre-metastatic niche remodeling and metastatic growth in the lungs

González-Callejo, Patricia ; Gener, Petra ; Díaz-Riascos, Zamira V. ; Conti, Sefora ; Cámara-Sánchez, Patricia ; Riera, Roger ; Mancilla, Sandra ; García-Gabilondo, Miguel ; Peg, Vicente ; Arango, Diego ; Rosell, Anna ; Labernadie, Anna ; Trepat, Xavier ; Albertazzi, Lorenzo ; Schwartz Jr, Simo ; Seras-Franzoso, Joaquin ; Abasolo, Ibane

Tumor secreted extracellular vesicles (EVs) are potent intercellular signaling platforms. They are responsible for the accommodation of the pre-metastatic niche (PMN) to support cancer cell engraftment and metastatic growth. However, complex cancer cell composition within the tumor increases also the heterogeneity among cancer secreted EVs subsets, a functional diversity that has been poorly explored. This phenomenon is particularly relevant in highly plastic and heterogenous Triple Negative [...]

Menée à partir de l'analyse de données de séquençage du génome entier de tissus tumoraux et de tissus normaux, cette étude identifie, dans certains cancers pédiatriques, des anomalies génétiques révélant des mécanismes mutationnels différents de ceux rencontrés habituellement dans les tumeurs de patients adultes

Comprehensive analysis of mutational signatures reveals distinct patterns and molecular processes across 27 pediatric cancers

Thatikonda, Venu ; Islam, S. M. Ashiqul ; Autry, Robert J. ; Jones, Barbara C. ; Gröbner, Susanne N. ; Warsow, Gregor ; Hutter, Barbara ; Huebschmann, Daniel ; Frohling, Stefan ; Kool, Marcel ; Blattner-Johnson, Mirjam ; Jones, David T. W. ; Alexandrov, Ludmil B. ; Pfister, Stefan M. ; Jager, Natalie

Analysis of mutational signatures can reveal underlying molecular mechanisms of the processes that have imprinted the somatic mutations found in cancer genomes. Here, we analyze single base substitutions and small insertions and deletions in pediatric cancers encompassing 785 whole-genome sequenced tumors from 27 molecularly defined cancer subtypes. We identified only a small number of mutational signatures active in pediatric cancers, compared with previously analyzed adult cancers. Further, [...]

Menée à partir de l'analyse transcriptomique d'un modèle cellulaire de cancer de l'ovaire résistant au carboplatine et menée in silico, cette étude identifie des gènes impliqués dans la résistance au carboplatine et/ou dans la transition épithélio-mésenchymateuse induite par cette molécule anticancéreuse

Transcriptome analysis of newly established carboplatin-resistant ovarian cancer cell model reveals genes shared by drug resistance and drug-induced EMT

Kralj, Juran ; Pernar Kovač, Margareta ; Dabelić, Sanja ; Polančec, Darija Stupin ; Wachtmeister, Thorsten ; Köhrer, Karl ; Brozovic, Anamaria

Background : In ovarian cancer (OC) therapy, even initially responsive patients develop drug resistance. Methods : Here, we present an OC cell model composed of variants with differing degrees of acquired resistance to carboplatin (CBP), cross-resistance to paclitaxel, and CBP-induced metastatic properties (migration and invasion). Transcriptome data were analysed by two approaches identifying differentially expressed genes and CBP sensitivity-correlating genes. The impact of selected genes and [...]

A partir d'échantillons tumoraux issus de patients atteints d'un adénocarcinome du poumon et de données cliniques, cette étude analyse, à l'aide de la cytométrie de masse par imagerie et de l'intelligence artificielle, les caractéristiques moléculaires, la distibution spatiale et l'état d'activation des cellules immunitaires du microenvironnement tumoral

Single-cell spatial landscapes of the lung tumour immune microenvironment

Sorin, Mark ; Rezanejad, Morteza ; Karimi, Elham ; Fiset, Benoit ; Desharnais, Lysanne ; Perus, Lucas J. M. ; Milette, Simon ; Yu, Miranda W. ; Maritan, Sarah M. ; Doré, Samuel ; Pichette, Émilie ; Enlow, William ; Gagné, Andréanne ; Wei, Yuhong ; Orain, Michèle ; Manem, Venkata S. K. ; Rayes, Roni ; Siegel, Peter M. ; Camilleri-Broet, Sophie ; Fiset, Pierre Olivier ; Desmeules, Patrice ; Spicer, Jonathan D. ; Quail, Daniela F. ; Joubert, Philippe ; Walsh, Logan A.

Single-cell technologies have revealed the complexity of the tumour immune microenvironment with unparalleled resolution1–9. Most clinical strategies rely on histopathological stratification of tumour subtypes, yet the spatial context of single-cell phenotypes within these stratified subgroups is poorly understood. Here we apply imaging mass cytometry to characterize the tumour and immunological landscape of samples from 416 patients with lung adenocarcinoma across five histological patterns. [...]

Menée à partir d'échantillons de tumeurs cérébrales primitives ou de métastases cérébrales ayant pour origine un cancer du poumon, cette étude analyse les caractéristiques moléculaires et la répartition spatiale des cellules immunitaires

Single-cell spatial immune landscapes of primary and metastatic brain tumours

Karimi, Elham ; Yu, Miranda W. ; Maritan, Sarah M. ; Perus, Lucas J. M. ; Rezanejad, Morteza ; Sorin, Mark ; Dankner, Matthew ; Fallah, Parvaneh ; Doré, Samuel ; Zuo, Dongmei ; Fiset, Benoit ; Kloosterman, Daan J. ; Ramsay, LeeAnn ; Wei, Yuhong ; Lam, Stephanie ; Alsajjan, Roa ; Watson, Ian R. ; Roldan Urgoiti, Gloria ; Park, Morag ; Brandsma, Dieta ; Senger, Donna L. ; Chan, Jennifer A. ; Akkari, Leila ; Petrecca, Kevin ; Guiot, Marie-Christine ; Siegel, Peter M. ; Quail, Daniela F. ; Walsh, Logan A.

Single-cell technologies have enabled the characterization of the tumour microenvironment at unprecedented depth and have revealed vast cellular diversity among tumour cells and their niche. Anti-tumour immunity relies on cell–cell relationships within the tumour microenvironment1,2, yet many single-cell studies lack spatial context and rely on dissociated tissues3. Here we applied imaging mass cytometry to characterize the immunological landscape of 139 high-grade glioma and 46 brain [...]