Menée à l'aide de lignées cellulaires, d'un modèle murin et de données portant sur 53 patients présentant un syndrome myélodysplasique (SMD) ou atteints d'une leucémie myéloïde aiguë (LMA) consécutive à ce syndrome, cette étude met en évidence un mécanisme par lequel des fragments d'ARNs de transfert comportant une pseudouridine empêchent la progression d'un SMD vers une LMA en réprimant la synthèse de protéines aberrantes dans les cellules souches ou progénitrices

Pseudouridine-modified tRNA fragments repress aberrant protein synthesis and predict leukaemic progression in myelodysplastic syndrome

Guzzi, Nicola ; Muthukumar, Sowndarya ; Cieśla, Maciej ; Todisco, Gabriele ; Ngoc, Phuong Cao Thi ; Madej, Magdalena ; Munita, Roberto ; Fazio, Serena ; Ekström, Simon ; Mortera-Blanco, Teresa ; Jansson, Monika ; Nannya, Yasuhito ; Cazzola, Mario ; Ogawa, Seishi ; Malcovati, Luca ; Hellstrom-Lindberg, Eva ; Dimitriou, Marios ; Bellodi, Cristian

Transfer RNA-derived fragments (tRFs) are emerging small noncoding RNAs that, although commonly altered in cancer, have poorly defined roles in tumorigenesis1. Here we show that pseudouridylation (Ψ) of a stem cell-enriched tRF subtype2, mini tRFs containing a 5′ terminal oligoguanine (mTOG), selectively inhibits aberrant protein synthesis programmes, thereby promoting engraftment and differentiation of haematopoietic stem and progenitor cells (HSPCs) in patients with myelodysplastic syndrome [...]

Menée in vitro, in silico et à l'aide d'un modèle murin, cette étude analyse l'évolution des propriétés et de l'organisation spatiale des cellules cancéreuses au cours de leur prolifération

Temporal and spatial topography of cell proliferation in cancer

Gaglia, Giorgio ; Kabraji, Sheheryar ; Rammos, Danae ; Dai, Yang ; Verma, Ana ; Wang, Shu ; Mills, Caitlin E. ; Chung, Mirra ; Bergholz, Johann S. ; Coy, Shannon ; Lin, Jia-Ren ; Jeselsohn, Rinath ; Metzger, Otto ; Winer, Eric P. ; Dillon, Deborah A. ; Zhao, Jean J. ; Sorger, Peter K. ; Santagata, Sandro

Proliferation is a fundamental trait of cancer cells, but its properties and spatial organization in tumours are poorly characterized. Here we use highly multiplexed tissue imaging to perform single-cell quantification of cell cycle regulators and then develop robust, multivariate, proliferation metrics. Across diverse cancers, proliferative architecture is organized at two spatial scales: large domains, and smaller niches enriched for specific immune lineages. Some tumour cells express cell [...]

Menée à l'aide de lignées cellulaires de cancer du pancréas et de modèles murins, cette étude met en évidence un mécanisme par lequel la gasdermine E, une protéine porogène, induit la résistance des cellules cancéreuses à la digestion enzymatique en interagissant avec la protéine YBX1 qui, transportée dans le noyau, favorise l'expression de la mucine

Gasdermin E mediates resistance of pancreatic adenocarcinoma to enzymatic digestion through a YBX1–mucin pathway

Lv, Jiadi ; Liu, Yuying ; Mo, Siqi ; Zhou, Yabo ; Chen, Fengye ; Cheng, Feiran ; Li, Cong ; Saimi, Dilizhatai ; Liu, Mengyu ; Zhang, Huafeng ; Tang, Ke ; Ma, Jingwei ; Wang, Zhenfeng ; Zhu, Qiangqiang ; Tong, Wei-Min ; Huang, Bo

Pancreatic ductal adenocarcinoma (PDAC) originates from normal pancreatic ducts where digestive juice is regularly produced. It remains unclear how PDAC can escape autodigestion by digestive enzymes. Here we show that human PDAC tumour cells use gasdermin E (GSDME), a pore-forming protein, to mediate digestive resistance. GSDME facilitates the tumour cells to express mucin 1 and mucin 13, which form a barrier to prevent chymotrypsin-mediated destruction. Inoculation of GSDME−/− PDAC cells [...]

Cet article passe en revue les mécanismes contribuant à la réduction de l'expression de l'hepticidine (une hormone régulant le métabolisme du fer) dans les cellules des carcinomes hépatocellulaires, analyse les effets de cette réduction puis examine le rôle de l'hepticidine dans le diagnostic et le traitement de la maladie ainsi que l'établissement du pronostic

Hepcidin in hepatocellular carcinoma

Joachim, Jonathan H. ; Mehta, Kosha J.

Hepatocellular carcinoma (HCC) is one of the most common reasons for cancer-related deaths. Excess iron increases HCC risk. Inevitably, hepcidin, the iron hormone that maintains systemic iron homoeostasis is involved in HCC pathology. Distinct from other cancers that show high hepcidin expression, HCC patients can show low hepcidin levels. Thus, it is of immense clinical benefit to address the regulation and action of hepcidin in HCC as this may help in identifying molecular targets for [...]

Cet article passe en revue les connaissances concernant les relations entre "niches tumorales", inflammation chronique et développement des cancers

Cancer-inducing niche: the force of chronic inflammation

Afify, Said M. ; Hassan, Ghmkin ; Seno, Akimasa ; Seno, Masaharu

The growth of cancer tissue is thought to be considered driven by a small subpopulation of cells, so-called cancer stem cells (CSCs). CSCs are located at the apex of a hierarchy in a cancer tissue with self-renewal, differentiation and tumorigenic potential that produce the progeny in the tissue. Although CSCs are generally believed to play a critical role in the growth, metastasis, and recurrence of cancers, the origin of CSCs remains to be reconsidered. We hypothesise that, chronic diseases, [...]

Menée à partir du criblage génétique de différents types tumoraux au moyen de la technologie CRISPR, cette étude identifie des régulateurs du microenvironnement tumoral

Spatial CRISPR genomics identifies regulators of the tumor microenvironment

Dhainaut, Maxime ; Rose, Samuel A. ; Akturk, Guray ; Wroblewska, Aleksandra ; Nielsen, Sebastian R. ; Park, Eun Sook ; Buckup, Mark ; Roudko, Vladimir ; Pia, Luisanna ; Sweeney, Robert ; Le Berichel, Jessica ; Wilk, C. Matthias ; Bektesevic, Anela ; Lee, Brian H. ; Bhardwaj, Nina ; Rahman, Adeeb H. ; Baccarini, Alessia ; Gnjatic, Sacha ; Pe’er, Dana ; Merad, Miriam ; Brown, Brian D.

While CRISPR screens are helping uncover genes regulating many cell-intrinsic processes, existing approaches are suboptimal for identifying extracellular gene functions, particularly in the tissue context. Here, we developed an approach for spatial functional genomics called Perturb-map. We applied Perturb-map to knock out dozens of genes in parallel in a mouse model of lung cancer and simultaneously assessed how each knockout influenced tumor growth, histopathology, and immune composition. [...]

Menée à l'aide d'échantillons de sang et de moelle osseuse ainsi que d'une technique de séquençage de l'ARN à l'échelle d'une seule cellule, cette étude met en évidence, pour les cellules de leucémie aiguë lymphoblastique infantile avec réarrangement du gène KMT2A, un phénotype transcriptionnel plus proche de celui des cellules foetales précurseurs des lymphocytes que de celui des cellules des autres types de leucémie aiguë lymphoblastique

Single-cell transcriptomics reveals a distinct developmental state of KMT2A-rearranged infant B-cell acute lymphoblastic leukemia

Khabirova, Eleonora ; Jardine, Laura ; Coorens, Tim H. H. ; Webb, Simone ; Treger, Taryn D. ; Engelbert, Justin ; Porter, Tarryn ; Prigmore, Elena ; Collord, Grace ; Piapi, Alice ; Teichmann, Sarah A. ; Inglott, Sarah ; Williams, Owen ; Heidenreich, Olaf ; Young, Matthew D. ; Straathof, Karin ; Bomken, Simon ; Bartram, Jack ; Haniffa, Muzlifah ; Behjati, Sam

KMT2A-rearranged infant ALL is an aggressive childhood leukemia with poor prognosis. Here, we investigated the developmental state of KMT2A-rearranged infant B-cell acute lymphoblastic leukemia (B-ALL) using bulk messenger RNA (mRNA) meta-analysis and examination of single lymphoblast transcriptomes against a developing bone marrow reference. KMT2A-rearranged infant B-ALL was uniquely dominated by an early lymphocyte precursor (ELP) state, whereas less adverse NUTM1-rearranged infant ALL [...]

Menée à l'aide d'une lignée cellulaire de lymphome anaplasique à grandes cellules, cette étude met en évidence le rôle des isoformes 1 et 3 du facteur de transcription ARNT dans la régulation de l'activité du récepteur AhR

AhR promotes phosphorylation of ARNT isoform 1 in human T cell malignancies as a switch for optimal AhR activity

Luke A. Bourner ; Israel Muro ; Amy M. Cooper ; Barun K. Choudhury ; Aaron O. Bailey ; William K. Russell ; Kamil Khanipov ; George Golovko ; Casey W. Wright

The aryl hydrocarbon receptor nuclear translocator (ARNT) is a transcription factor present in immune cells as a long and short isoform, referred to as isoforms 1 and 3, respectively. However, investigation into potential ARNT isoform–specific immune functions is lacking despite the well-established heterodimerization requirement of ARNT with, and for the activity of, the aryl hydrocarbon receptor (AhR), a critical mediator of immune homeostasis. Here, using global and targeted transcriptomics [...]