Nota Bene Cancer
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Sommaire du n° 366 du 9 mars 2018
Aberrations chromosomiques (7)
Menées respectivement sur 961 échantillons tumoraux prélevés sur des patients pédiatriques, adolescents ou jeunes adultes (24 types de cancer) et sur 1 699 échantillons tumoraux prélevés sur des patients pédiatriques atteints d'une leucémie ou d'une tumeur solide (6 types différents), ces deux études identifient un ensemble d'anomalies génomiques susceptibles d'induire la prescription d'une thérapie ciblée
Pan-cancer genome and transcriptome analyses of 1,699 paediatric leukaemias and solid tumours
Menées respectivement sur 961 échantillons tumoraux prélevés sur des patients pédiatriques, adolescents ou jeunes adultes (24 types de cancer) et sur 1 699 échantillons tumoraux prélevés sur des patients pédiatriques atteints d'une leucémie ou d'une tumeur solide (6 types différents), ces deux études identifient un ensemble d'anomalies génomiques susceptibles d'induire la prescription d'une thérapie ciblée
Pan-cancer genome and transcriptome analyses of 1,699 paediatric leukaemias and solid tumours
Ma, Xiaotu ; Liu, Yu ; Liu, Yanling ; Alexandrov, Ludmil B. ; Edmonson, Michael N. ; Gawad, Charles ; Zhou, Xin ; Li, Yongjin ; Rusch, Michael C. ; Easton, John ; Huether, Robert ; Gonzalez-Pena, Veronica ; Wilkinson, Mark R. ; Hermida, Leandro C. ; Davis, Sean ; Sioson, Edgar ; Pounds, Stanley ; Cao, Xueyuan ; Ries, Rhonda E. ; Wang, Zhaoming ; Chen, Xiang ; Dong, Li ; Diskin, Sharon J. ; Smith, Malcolm A. ; Guidry Auvil, Jaime M. ; Meltzer, Paul S. ; Lau, Ching C. ; Perlman, Elizabeth J. ; Maris, John M. ; Meshinchi, Soheil ; Hunger, Stephen P. ; Gerhard, Daniela S. ; Zhang, Jinghui
Analysis of molecular aberrations across multiple cancer types, known as pan-cancer analysis, identifies commonalities and differences in key biological processes that are dysregulated in cancer cells from diverse lineages. Pan-cancer analyses have been performed for adult but not paediatric cancers, which commonly occur in developing mesodermic rather than adult epithelial tissues5. Here we present a pan-cancer study of somatic alterations, including single nucleotide variants, small [...]
The landscape of genomic alterations across childhood cancers
Menées respectivement sur 961 échantillons tumoraux prélevés sur des patients pédiatriques, adolescents ou jeunes adultes (24 types de cancer) et sur 1 699 échantillons tumoraux prélevés sur des patients pédiatriques atteints d'une leucémie ou d'une tumeur solide (6 types différents), ces deux études identifient un ensemble d'anomalies génomiques susceptibles d'induire la prescription d'une thérapie ciblée
The landscape of genomic alterations across childhood cancers
Gröbner, Susanne N. ; Worst, Barbara C. ; Weischenfeldt, Joachim ; Buchhalter, Ivo ; Kleinheinz, Kortine ; Rudneva, Vasilisa A. ; Johann, Pascal D. ; Balasubramanian, Gnana Prakash ; Segura-Wang, Maia ; Brabetz, Sebastian ; Bender, Sebastian ; Hutter, Barbara ; Sturm, Dominik ; Pfaff, Elke ; Hübschmann, Daniel ; Zipprich, Gideon ; Heinold, Michael ; Eils, Jürgen ; Lawerenz, Christian ; Erkek, Serap ; Lambo, Sander ; Waszak, Sebastian ; Blattmann, Claudia ; Borkhardt, Arndt ; Kuhlen, Michaela ; Eggert, Angelika ; Fulda, Simone ; Gessler, Manfred ; Wegert, Jenny ; Kappler, Roland ; Baumhoer, Daniel ; Burdach, Stefan ; Kirschner-Schwabe, Renate ; Kontny, Udo ; Kulozik, Andreas E. ; Lohmann, Dietmar ; Hettmer, Simone ; Eckert, Cornelia ; Bielack, Stefan ; Nathrath, Michaela ; Niemeyer, Charlotte ; Richter, Günther H. ; Schulte, Johannes ; Siebert, Reiner ; Westermann, Frank ; Molenaar, Jan J. ; Vassal, Gilles ; Witt, Hendrik ; Icgc PedBrain-Seq Project ; Icgc Mmml- Seq project ; Burkhardt, Birgit ; Kratz, Christian P. ; Witt, Olaf ; van Tilburg, Cornelis M. ; Kramm, Christof M. ; Fleischhack, Gudrun ; Dirksen, Uta ; Rutkowski, Stefan ; Frühwald, Michael ; von Hoff, Katja ; Wolf, Stephan ; Klingebiel, Thomas ; Koscielniak, Ewa ; Landgraf, Pablo ; Koster, Jan ; Resnick, Adam C. ; Zhang, Jinghui ; Liu, Yanling ; Zhou, Xin ; Waanders, Angela J. ; Zwijnenburg, Danny A. ; Raman, Pichai ; Brors, Benedikt ; Weber, Ursula D. ; Northcott, Paul A. ; Pajtler, Kristian W. ; Kool, Marcel ; Piro, Rosario M. ; Korbel, Jan O. ; Schlesner, Matthias ; Eils, Roland ; Jones, David T. W. ; Lichter, Peter ; Chavez, Lukas ; Zapatka, Marc ; Pfister, Stefan M.
Pan-cancer analyses that examine commonalities and differences among various cancer types have emerged as a powerful way to obtain novel insights into cancer biology. Here we present a comprehensive analysis of genetic alterations in a pan-cancer cohort including 961 tumours from children, adolescents, and young adults, comprising 24 distinct molecular types of cancer. Using a standardized workflow, we identified marked differences in terms of mutation frequency and significantly mutated genes [...]
Genome studies unlock childhood-cancer clues
Menées respectivement sur 961 échantillons tumoraux prélevés sur des patients pédiatriques, adolescents ou jeunes adultes (24 types de cancer) et sur 1 699 échantillons tumoraux prélevés sur des patients pédiatriques atteints d'une leucémie ou d'une tumeur solide (6 types différents), ces deux études identifient un ensemble d'anomalies génomiques susceptibles d'induire la prescription d'une thérapie ciblée
Genome studies unlock childhood-cancer clues
Heidi Ledford
Analyses across dozens of cancers reveal new potential drug targets.
Menée sur des lignées cellulaires cancéreuses et à l'aide de xénogreffes, cette étude met en évidence des mécanismes par lesquels, en fonction de diverses mutations affectant le gène MEK1, son activation favorise la prolifération cellulaire
Allele-specific mechanisms of activation of MEK1 mutants determine their properties
Menée sur des lignées cellulaires cancéreuses et à l'aide de xénogreffes, cette étude met en évidence des mécanismes par lesquels, en fonction de diverses mutations affectant le gène MEK1, son activation favorise la prolifération cellulaire
Allele-specific mechanisms of activation of MEK1 mutants determine their properties
Gao, Yijun ; Chang, Matthew T. ; McKay, Daniel ; Na, Na ; Zhou, Bing ; Yaeger, Rona D. ; Torres, Neilawattie M. ; Muniz, Keven ; Drosten, Matthias ; Barbacid, Mariano ; Caponigro, Giordano ; Stuart, Darrin ; Moebitz, Henrik ; Solit, David B. ; Abdel-Wahab, Omar I. ; Taylor, Barry S. ; Yao, Zhan ; Rosen, Neal
Mutations at multiple sites in MEK1 occur in cancer suggesting that their mechanisms of activation might be different. We analyzed 17 tumor-associated MEK1 mutants and found that they drove ERK signaling autonomously or in a RAS-RAF dependent manner. The latter are sensitive to feedback inhibition of RAF, which limits their functional output and often co-occur with RAS or RAF mutations. They act as amplifiers of RAF signaling. By contrast, another class of mutants delete a hitherto unrecognized [...]
A partir d'échantillons tumoraux prélevés sur 615 patients atteints d'une néoplasie du pancréas exocrine, cette étude identifie chez 122 patients la présence de mutations constitutionnelles de 24 gènes (BRCA1/2, ATM, PALB2, ....)
Prospective Evaluation of Germline Alterations in Patients With Exocrine Pancreatic Neoplasms
A partir d'échantillons tumoraux prélevés sur 615 patients atteints d'une néoplasie du pancréas exocrine, cette étude identifie chez 122 patients la présence de mutations constitutionnelles de 24 gènes (BRCA1/2, ATM, PALB2, ....)
Prospective Evaluation of Germline Alterations in Patients With Exocrine Pancreatic Neoplasms
Lowery, Maeve A. ; Wong, Winston ; Jordan, Emmet J. ; Lee, Jonathan W. ; Kemel, Yelena ; Vijai, Joseph ; Mandelker, Diana ; Zehir, Ahmet ; Capanu, Marinela ; Salo-Mullen, Erin ; Arnold, Angela G. ; Yu, Kenneth H. ; Varghese, Anna M. ; Kelsen, David P. ; Brenner, Robin ; Kaufmann, Erica ; Ravichandran, Vignesh ; Mukherjee, Semanti ; Berger, Michael F. ; Hyman, David M. ; Klimstra, David S. ; Abou-Alfa, Ghassan K. ; Tjan, Catherine ; Covington, Christina ; Maynard, Hannah ; Allen, Peter J. ; Askan, Gokce ; Leach, Steven D. ; Iacobuzio-Donahue, Christine A. ; Robson, Mark E. ; Offit, Kenneth ; Stadler, Zsofia K. ; O’Reilly, Eileen M.
Background : Identification of pathogenic germline alterations (PGAs) has important clinical and therapeutic implications in pancreas cancer. We performed comprehensive germline testing (GT) in an unselected prospective cohort of patients with exocrine pancreatic neoplasms with genotype and phenotype association to facilitate identification of prognostic and/or predictive biomarkers and examine potential therapeutic implications. Methods : Six hundred fifteen unselected patients with exocrine [...]
A partir de 1 211 échantillons tumoraux prélevés sur des patients atteints d'un cancer colorectal, cette étude identifie un ensemble d'anomalies génomiques impliquées dans l'échappement au système immunitaire des tumeurs présentant une forte instabilité microsatellitaire
Genetic mechanisms of immune evasion in colorectal cancer
A partir de 1 211 échantillons tumoraux prélevés sur des patients atteints d'un cancer colorectal, cette étude identifie un ensemble d'anomalies génomiques impliquées dans l'échappement au système immunitaire des tumeurs présentant une forte instabilité microsatellitaire
Genetic mechanisms of immune evasion in colorectal cancer
Grasso, Catherine S. ; Giannakis, Marios ; Wells, Daniel K. ; Hamada, Tsuyoshi ; Mu, Xinmeng Jasmine ; Quist, Michael ; Nowak, Jonathan A. ; Nishihara, Reiko ; Qian, Zhi Rong ; Inamura, Kentaro ; Morikawa, Teppei ; Nosho, Katsuhiko ; Abril-Rodriguez, Gabriel ; Connolly, Charles ; Escuin-Ordinas, Helena ; Geybels, Milan S. ; Grady, William M. ; Hsu, Li ; Hu-Lieskovan, Siwen ; Huyghe, Jeroen R. ; Kim, Yeon Joo ; Krystofinski, Paige E. ; Leiserson, Mark D. M. ; Montoya, Dennis J. ; Nadel, Brian B. ; Pellegrini, Matteo ; Pritchard, Colin C. ; Puig-Saus, Cristina ; Quist, Elleanor H. ; Raphael, Benjamin J. ; Salipante, Stephen J. ; Shin, Daniel Sanghoon ; Shinbrot, Eve ; Shirts, Brian ; Shukla, Sachet ; Stanford, Janet L. ; Sun, Wei ; Tsoi, Jennifer ; Upfill-Brown, Alexander ; Wheeler, David A. ; Wu, Catherine J. ; Yu, Ming ; Zaidi, Syed H. ; Zaretsky, Jesse M. ; Gabriel, Stacey B. ; Lander, Eric S. ; Garraway, Levi A. ; Hudson, Thomas J. ; Fuchs, Charles S. ; Ribas, Antoni ; Ogino, Shuji ; Peters, Ulrike
To understand the genetic drivers of immune recognition and evasion in colorectal cancer (CRC), we analyzed 1,211 CRC primary tumor samples, including 179 classified as microsatellite instability-high (MSI-high). This set includes The Cancer Genome Atlas CRC cohort of 592 samples, completed and analyzed here. MSI-high, a hypermutated, immunogenic subtype of CRC, had a high rate of significantly mutated genes in important immune modulating pathways and in the antigen presentation machinery, [...]
A partir d'échantillons de tumeurs primitives et de métastases prélevés sur 5 patients atteints d'une tumeur neuroendocrine de l'intestin grêle, cette étude met en évidence une hétérogénéité des anomalies génomiques (mutations, nombre de copies de gènes) entre les tumeurs primitives et les métastases
Genetic heterogeneity of primary lesion and metastasis in small intestine neuroendocrine tumors
A partir d'échantillons de tumeurs primitives et de métastases prélevés sur 5 patients atteints d'une tumeur neuroendocrine de l'intestin grêle, cette étude met en évidence une hétérogénéité des anomalies génomiques (mutations, nombre de copies de gènes) entre les tumeurs primitives et les métastases
Genetic heterogeneity of primary lesion and metastasis in small intestine neuroendocrine tumors
Walter, Dirk ; Harter, Patrick N. ; Battke, Florian ; Winkelmann, Ria ; Schneider, Markus ; Holzer, Katharina ; Koch, Christine ; Bojunga, Jörg ; Zeuzem, Stefan ; Hansmann, Martin Leo ; Peveling-Oberhag, Jan ; Waidmann, Oliver
Data on intratumoral heterogeneity of small intestine neuroendocrine tumors (SI-NETs) and related liver metastasis are limited. The aim of this study was to characterize genetic heterogeneity of 5 patients with SI-NETs. Therefore, formalin-fixed, paraffin-embedded tissue samples of primary and metastatic lesions as well as benign liver of five patients with synchronously metastasized, well differentiated SI-NETs were analyzed with whole exome sequencing. For one patient, chip based 850k whole [...]
A partir d'échantillons tumoraux prélevés sur 24 patientes atteintes d'un cancer du sein et présentant une mutation constitutionnelle du gène ATM, cette étude analyse les mutations somatiques affectant d'autres gènes et, notamment, montre que ces tumeurs n'ont pas le même phénotype que les tumeurs liées à un gène BRCA1/2 muté
The Landscape of Somatic Genetic Alterations in Breast Cancers From ATM Germline Mutation Carriers
A partir d'échantillons tumoraux prélevés sur 24 patientes atteintes d'un cancer du sein et présentant une mutation constitutionnelle du gène ATM, cette étude analyse les mutations somatiques affectant d'autres gènes et, notamment, montre que ces tumeurs n'ont pas le même phénotype que les tumeurs liées à un gène BRCA1/2 muté
The Landscape of Somatic Genetic Alterations in Breast Cancers From ATM Germline Mutation Carriers
Weigelt, Britta ; Bi, Rui ; Kumar, Rahul ; Blecua, Pedro ; Mandelker, Diana L. ; Geyer, Felipe C. ; Pareja, Fresia ; James, Paul A. ; Couch, Fergus J. ; Eccles, Diana M. ; Blows, Fiona ; Pharoah, Paul ; Li, Anqi ; Selenica, Pier ; Lim, Raymond S. ; Jayakumaran, Gowtham ; Waddell, Nic ; Shen, Ronglai ; Norton, Larry ; Wen, Hannah Y. ; Powell, Simon N. ; Riaz, Nadeem ; Robson, Mark E. ; Reis-Filho, Jorge S. ; Chenevix-Trench, Georgia
Pathogenic germline variants in ataxia-telangiectasia mutated (ATM), a gene that plays a role in DNA damage response and cell cycle checkpoints, confer an increased breast cancer (BC) risk. Here, we investigated the phenotypic characteristics and landscape of somatic genetic alterations in 24 BCs from ATM germline mutation carriers by whole-exome and targeted sequencing. ATM-associated BCs were consistently hormone receptor positive and largely displayed minimal immune infiltrate. Although [...]
Cet article passe en revue les travaux récents ayant identifé des anomalies moléculaires susceptibles d'induire la prescription d'une thérapie ciblée ou d'une immunothérapie chez des patients atteints d'un cancer de la tête et du cou
The molecular landscape of head and neck cancer
Cet article passe en revue les travaux récents ayant identifé des anomalies moléculaires susceptibles d'induire la prescription d'une thérapie ciblée ou d'une immunothérapie chez des patients atteints d'un cancer de la tête et du cou
The molecular landscape of head and neck cancer
Leemans, C. René ; Snijders, Peter J. F. ; Brakenhoff, Ruud H.
Head and neck squamous cell carcinomas (HNSCCs) arise in the mucosal linings of the upper aerodigestive tract and are unexpectedly heterogeneous in nature. Classical risk factors are smoking and excessive alcohol consumption, and in recent years, the role of human papillomavirus (HPV) has emerged, particularly in oropharyngeal tumours. HPV-induced oropharyngeal tumours are considered a separate disease entity, which recently has manifested in an adapted prognostic staging system while the [...]
Oncogènes et suppresseurs de tumeurs (3)
Menée in vitro et in vivo, cette étude met en évidence des mécanismes par lesquels, en coopération avec une activation de la signalisation JAK3/STAT, la surexpression du facteur de transcription HOXA9 favorise le développement d'une leucémie
HOXA9 cooperates with activated JAK/STAT signaling to drive leukemia development
Menée in vitro et in vivo, cette étude met en évidence des mécanismes par lesquels, en coopération avec une activation de la signalisation JAK3/STAT, la surexpression du facteur de transcription HOXA9 favorise le développement d'une leucémie
HOXA9 cooperates with activated JAK/STAT signaling to drive leukemia development
de Bock, Charles E. ; Demeyer, Sofie ; Degryse, Sandrine ; Verbeke, Delphine ; Sweron, Bram ; Gielen, Olga ; Vandepoel, Roel ; Vicente, Carmen ; Vanden Bempt, Marlies ; Dagklis, Antonis ; Geerdens, Ellen ; Bornschein, Simon ; Gijsbers, Rik ; Soulier, Jean ; Meijerink, Jules P. ; Heinäniemi, Merja ; Teppo, Susanna ; Bouvy-Liivrand, Maria ; Lohi, Olli ; Radaelli, Enrico ; Cools, Jan
Leukemia is caused by the accumulation of multiple genomic lesions in hematopoietic precursor cells. However, how these events cooperate during oncogenic transformation remains poorly understood. We studied the cooperation between activated JAK3/STAT5 signaling and HOXA9 overexpression, two events identified as significantly co-occurring in T-cell acute lymphoblastic leukemia. Expression of mutant JAK3 and HOXA9 led to a rapid development of leukemia originating from multipotent or [...]
Menée in vitro et in vivo sur des modèles de sarcome synovial, cette étude met en évidence des mécanismes par lesquels, via une histone désacétylase (KM2DB), la protéine SS18-SSX favorise la transformation maligne
The SS18-SSX Oncoprotein Hijacks KDM2B-PRC1.1 to Drive Synovial Sarcoma
Menée in vitro et in vivo sur des modèles de sarcome synovial, cette étude met en évidence des mécanismes par lesquels, via une histone désacétylase (KM2DB), la protéine SS18-SSX favorise la transformation maligne
The SS18-SSX Oncoprotein Hijacks KDM2B-PRC1.1 to Drive Synovial Sarcoma
Banito, Ana ; Li, Xiang ; Laporte, Aimée N. ; Roe, Jae-Seok ; Sanchez-Vega, Francisco ; Huang, Chun-Hao ; Dancsok, Amanda R. ; Hatzi, Katerina ; Chen, Chi-Chao ; Tschaharganeh, Darjus F. ; Chandwani, Rohit ; Tasdemir, Nilgun ; Jones, Kevin B. ; Capecchi, Mario R. ; Vakoc, Christopher R. ; Schultz, Nikolaus ; Ladanyi, Marc ; Nielsen, Torsten O. ; Lowe, Scott W.
Synovial sarcoma is an aggressive cancer invariably associated with a chromosomal translocation involving genes encoding the SWI-SNF complex component SS18 and an SSX (SSX1 or SSX2) transcriptional repressor. Using functional genomics, we identify KDM2B, a histone demethylase and component of a non-canonical polycomb repressive complex 1 (PRC1.1), as selectively required for sustaining synovial sarcoma cell transformation. SS18-SSX1 physically interacts with PRC1.1 and co-associates with [...]
Menée sur des lignées cellulaires de sarcome d'Ewing, cette étude met en évidence des mécanismes par lesquels, via une interaction avec BRCA1, la protéine issue de la fusion des gènes EWS et FLI1 bloque le processus de recombinaison homologue
EWS–FLI1 increases transcription to cause R-loops and block BRCA1 repair in Ewing sarcoma
Menée sur des lignées cellulaires de sarcome d'Ewing, cette étude met en évidence des mécanismes par lesquels, via une interaction avec BRCA1, la protéine issue de la fusion des gènes EWS et FLI1 bloque le processus de recombinaison homologue
EWS–FLI1 increases transcription to cause R-loops and block BRCA1 repair in Ewing sarcoma
Gorthi, Aparna ; Romero, July Carolina ; Loranc, Eva ; Cao, Lin ; Lawrence, Liesl A. ; Goodale, Elicia ; Iniguez, Amanda Balboni ; Bernard, Xavier ; Masamsetti, V. Pragathi ; Roston, Sydney ; Lawlor, Elizabeth R. ; Toretsky, Jeffrey A. ; Stegmaier, Kimberly ; Lessnick, Stephen L. ; Chen, Yidong ; Bishop, Alexander J. R.
Ewing sarcoma is an aggressive paediatric cancer of the bone and soft tissue. It results from a chromosomal translocation, predominantly t(11;22)(q24:q12), that fuses the N-terminal transactivation domain of the constitutively expressed EWSR1 protein with the C-terminal DNA binding domain of the rarely expressed FLI1 protein1. Ewing sarcoma is highly sensitive to genotoxic agents such as etoposide, but the underlying molecular basis of this sensitivity is unclear. Here we show that Ewing [...]
Progression et métastases (8)
A partir d'échantillons tumoraux prélevés sur 75 patients chinois atteints d'un hépatocholangiocarcinome, cette étude de séquençage du génome entier suggère que les tumeurs ont une origine monoclonale
Whole-exome sequencing reveals the origin and evolution of hepato-cholangiocarcinoma
A partir d'échantillons tumoraux prélevés sur 75 patients chinois atteints d'un hépatocholangiocarcinome, cette étude de séquençage du génome entier suggère que les tumeurs ont une origine monoclonale
Whole-exome sequencing reveals the origin and evolution of hepato-cholangiocarcinoma
Wang, Anqiang ; Wu, Liangcai ; Lin, Jianzhen ; Han, Longzhe ; Bian, Jin ; Wu, Yan ; Robson, Simon C. ; Xue, Lai ; Ge, Yunxia ; Sang, Xinting ; Wang, Wenze ; Zhao, Haitao
Hepatocellular-cholangiocarcinoma (H-ChC) is a rare subtype of liver cancer with clinicopathological features of both hepatocellular carcinoma (HCC) and intrahepatic cholangiocarcinoma (iCCA). To date, molecular mechanisms underlying the co-existence of HCC and iCCA components in a single tumor remain elusive. Here, we show that H-ChC samples contain substantial private mutations from WES analyses, ranging from 33.1 to 86.4%, indicative of substantive intratumor heterogeneity (ITH). However, on [...]
Menée in vitro et in vivo, cette étude met en évidence des mécanismes par lesquels des fibroblastes associés au cancer favorisent la suppression de lymphocytes T cytotoxiques dans le microenvironnement tumoral
Cancer-associated fibroblasts induce antigen-specific deletion of CD8 + T Cells to protect tumour cells
Menée in vitro et in vivo, cette étude met en évidence des mécanismes par lesquels des fibroblastes associés au cancer favorisent la suppression de lymphocytes T cytotoxiques dans le microenvironnement tumoral
Cancer-associated fibroblasts induce antigen-specific deletion of CD8 + T Cells to protect tumour cells
Lakins, Matthew A. ; Ghorani, Ehsan ; Munir, Hafsa ; Martins, Carla P. ; Shields, Jacqueline D.
Tumours have developed strategies to interfere with most steps required for anti-tumour immune responses. Although many populations contribute to anti-tumour responses, tumour-infiltrating cytotoxic T cells dominate, hence, many suppressive strategies act to inhibit these. Tumour-associated T cells are frequently restricted to stromal zones rather than tumour islands, raising the possibility that the tumour microenvironment, where crosstalk between malignant and “normal” stromal cells exists, [...]
Menée à l'aide de modèles murins de leucémie myléoïde chronique, cette étude met en évidence le rôle joué par le micro-ARN miR-126 dans les cellules souches leucémiques et suggère l'intérêt d'un traitement ciblant ce micro-ARN en combinaison avec un inhibiteur de la tyrosine kinase BCR-ABL
Bone marrow niche trafficking of miR-126 controls the self-renewal of leukemia stem cells in chronic myelogenous leukemia
Menée à l'aide de modèles murins de leucémie myléoïde chronique, cette étude met en évidence le rôle joué par le micro-ARN miR-126 dans les cellules souches leucémiques et suggère l'intérêt d'un traitement ciblant ce micro-ARN en combinaison avec un inhibiteur de la tyrosine kinase BCR-ABL
Bone marrow niche trafficking of miR-126 controls the self-renewal of leukemia stem cells in chronic myelogenous leukemia
Zhang, Bin ; Nguyen, Le Xuan Truong ; Li, Ling ; Zhao, Dandan ; Kumar, Bijender ; Wu, Herman ; Lin, Allen ; Pellicano, Francesca ; Hopcroft, Lisa ; Su, Yu-Lin ; Copland, Mhairi ; Holyoake, Tessa L. ; Kuo, Calvin J. ; Bhatia, Ravi ; Snyder, David S. ; Ali, Haris ; Stein, Anthony S. ; Brewer, Casey ; Wang, Huafeng ; McDonald, Tinisha ; Swiderski, Piotr ; Troadec, Estelle ; Chen, Ching-Cheng ; Dorrance, Adrienne ; Pullarkat, Vinod ; Yuan, Yate-Ching ; Perrotti, Danilo ; Carlesso, Nadia ; Forman, Stephen J. ; Kortylewski, Marcin ; Kuo, Ya-Huei ; Marcucci, Guido
Leukemia stem cells (LSCs) in individuals with chronic myelogenous leukemia (CML) (hereafter referred to as CML LSCs) are responsible for initiating and maintaining clonal hematopoiesis. These cells persist in the bone marrow (BM) despite effective inhibition of BCR–ABL kinase activity by tyrosine kinase inhibitors (TKIs). Here we show that although the microRNA (miRNA) miR-126 supported the quiescence, self-renewal and engraftment capacity of CML LSCs, miR-126 levels were lower in CML LSCs [...]
Menée à l'aide de modèles murins de cancer du poumon, cette étude met en évidence des mécanismes par lesquels, en induisant une plus grande susceptibilité des cellules cancéreuses aux lymphocytes NK, la transition épithélio-mésenchymateuse contribue à l'inefficacité du processus métastatique
Epithelial-mesenchymal transition leads to NK cell–mediated metastasis-specific immunosurveillance in lung cancer
Menée à l'aide de modèles murins de cancer du poumon, cette étude met en évidence des mécanismes par lesquels, en induisant une plus grande susceptibilité des cellules cancéreuses aux lymphocytes NK, la transition épithélio-mésenchymateuse contribue à l'inefficacité du processus métastatique
Epithelial-mesenchymal transition leads to NK cell–mediated metastasis-specific immunosurveillance in lung cancer
Chockley, Peter J. ; Chen, Jun ; Chen, Guoan ; Beer, David G. ; Standiford, Theodore J. ; Keshamouni, Venkateshwar G.
During epithelial-mesenchymal transition (EMT) epithelial cancer cells transdifferentiate into highly motile, invasive, mesenchymal-like cells, giving rise to disseminating tumor cells. Few of these disseminated cells successfully metastasize. Immune cells and inflammation in the tumor microenvironment were shown to drive EMT, but few studies investigated the consequences of EMT for tumor immunosurveillance. In addition to initiating metastasis, we demonstrate that EMT confers increased [...]
Menée à l'aide de xénogreffes de cellules cancéreuses prélevées sur des patients atteints d'un cancer neuroendocrine de la prostate, puis à l'aide de modèles murins génétiquement modifiés, cette étude met en évidence des mécanismes par lesquels, en réduisant l'expression du récepteur des androgènes et du facteur de transcription REST, la protéine HP1alpha favorise un phénotype agressif de la maladie
Heterochromatin protein 1alpha mediates development and aggressiveness of neuroendocrine prostate cancer
Menée à l'aide de xénogreffes de cellules cancéreuses prélevées sur des patients atteints d'un cancer neuroendocrine de la prostate, puis à l'aide de modèles murins génétiquement modifiés, cette étude met en évidence des mécanismes par lesquels, en réduisant l'expression du récepteur des androgènes et du facteur de transcription REST, la protéine HP1alpha favorise un phénotype agressif de la maladie
Heterochromatin protein 1alpha mediates development and aggressiveness of neuroendocrine prostate cancer
Ci, Xinpei ; Hao, Jun ; Dong, Xin ; Choi, Stephen Y.C. ; Xue, Hui ; Wu, Rebecca ; Qu, Sifeng ; Gout, Peter W. ; Zhang, Fang ; Haegert, Anne M ; Fazil, Ladan ; Crea, Francesco ; Ong, Christopher J. ; Zoubedi, Amina ; He, Housheng H. ; Gleave, Martin E. ; Collins, Colin C. ; Lin, Dong ; Wang, Yuzhuo
Neuroendocrine prostate cancer (NEPC) is a lethal subtype of prostate cancer (PCa) arising mostly from adenocarcinoma via NE transdifferentiation following androgen deprivation therapy. Mechanisms contributing to both NEPC development and its aggressiveness remain elusive. In light of the fact that hyperchromatic nuclei are a distinguishing histopathological feature of NEPC, we utilized transcriptomic analyses of our patient-derived xenograft (PDX) models, multiple clinical cohorts, and [...]
Menée in vitro et in vivo sur des modèles de cancer de la prostate, cette étude met en évidence des mécanismes par lesquels l'interleukine IL-30, produite par des cellules analogues aux cellules souches, favorise le processus métastatique
Interleukin-30/IL-27p28 shapes prostate cancer stem-like cell behavior and is critical for tumor onset and metastasization
Menée in vitro et in vivo sur des modèles de cancer de la prostate, cette étude met en évidence des mécanismes par lesquels l'interleukine IL-30, produite par des cellules analogues aux cellules souches, favorise le processus métastatique
Interleukin-30/IL-27p28 shapes prostate cancer stem-like cell behavior and is critical for tumor onset and metastasization
Sorrentino, Carlo ; Ciummo, Stefania Livia ; Cipollone, Giuseppe ; Caputo, Sara ; Bellone, Matteo ; Di Carlo, Emma
Prostate cancer (PC) stem-like cells (PCSLCs) are believed to be responsible for PC onset and metastasis. Autocrine and microenvironmental signals dictate PCSLC behavior and patient outcome. In PC patients, interleukin(IL)-30/IL-27p28 has been linked with tumor progression, but the mechanisms underlying this link remain mostly elusive. Here we asked whether IL-30 may favor PC progression by conditioning PCSLCs and assessed the value of blocking IL-30 to suppress tumor growth. IL-30 was produced [...]
Menée in vitro et in vivo sur des modèles de cancer du sein, cette étude met en évidence des mécanismes par lesquels une sous-expression de la protéine TRPM52 dans les cellules cancéreuses les protège de la cytotoxicité des neutrophiles et favorise la formation de métastases pulmonaires
TRPM2 mediates neutrophil killing of disseminated tumor cells
Menée in vitro et in vivo sur des modèles de cancer du sein, cette étude met en évidence des mécanismes par lesquels une sous-expression de la protéine TRPM52 dans les cellules cancéreuses les protège de la cytotoxicité des neutrophiles et favorise la formation de métastases pulmonaires
TRPM2 mediates neutrophil killing of disseminated tumor cells
Granot, Zvi ; Gershkovitz, Maya ; Caspi, Yaki ; Fainsod-Levi, Tanya ; Katz, Ben ; Michaeli, Janna ; Khawaled, Saleh ; Lev, Shaya ; Polyansky, Lola ; Shaul, Merav E. ; Sionov, Ronit Vogt ; Cohen-Daniel, Leonor ; Aqeilan, Rami I. ; Shaul, Yoav ; Mori, Yasuo ; Karni, Rotem ; Fridlender, Zvi G. ; Binshtok, Alexander M.
Neutrophils play a critical role in cancer, with both pro- and anti-tumor neutrophil subpopulations reported. The anti-tumor neutrophil subpopulation has the capacity to kill tumor cells and limit metastatic spread, yet not all tumor cells are equally susceptible to neutrophil cytotoxicity. Since cells that evade neutrophils have greater chances of forming metastases, we explored the mechanism neutrophils employ to kill tumor cells. Neutrophil cytotoxicity was previously shown to be mediated by [...]
A partir de 99 échantillons de tumeurs primitives et de métastases prélevés sur des patientes atteintes d'un cancer du sein, cette étude suggère que les ganglions lymphatiques axillaires ne jouent pas un rôle significatif dans la dissémination des cellules cancéreuses pour former des métastases à distance
Evolutionary history of metastatic breast cancer reveals minimal seeding from axillary lymph nodes
A partir de 99 échantillons de tumeurs primitives et de métastases prélevés sur des patientes atteintes d'un cancer du sein, cette étude suggère que les ganglions lymphatiques axillaires ne jouent pas un rôle significatif dans la dissémination des cellules cancéreuses pour former des métastases à distance
Evolutionary history of metastatic breast cancer reveals minimal seeding from axillary lymph nodes
Ullah, Ikram ; Karthik, Govindasamy-Muralidharan ; Alkodsi, Amjad ; Kjällquist, Una ; Stålhammar, Gustav ; Lövrot, John ; Martinez, Nelson-Fuentes ; Lagergren, Jens ; Hautaniemi, Sampsa ; Hartman, Johan ; Bergh, Jonas
Metastatic breast cancers are still incurable. Characterizing the evolutionary landscape of these cancers, including the role of metastatic axillary lymph nodes (ALNs) in seeding distant organ metastasis, can provide a rational basis for effective treatments. Here, we have described the genomic analyses of the primary tumors and metastatic lesions from 99 samples obtained from 20 patients with breast cancer. Our evolutionary analyses revealed diverse spreading and seeding patterns that govern [...]
Ressources et infrastructures (Biologie) (2)
A partir d'échantillons sanguins prélevés sur des éléphants, puis à l'aide de base de données génomiques portant sur un ensemble d'espèces animales, cette étude identifie des régions génomiques caractéristiques d'une évolution accélérée, suggère leur implication dans des mécanismes conférant un faible risque de cancer, puis évalue l'association entre les séquences homologues dans l'ADN humain et des phénotypes spécifiques
Accelerated Evolution in Distinctive Species Reveals Candidate Elements for Clinically Relevant Traits, Including Mutation and Cancer Resistance
A partir d'échantillons sanguins prélevés sur des éléphants, puis à l'aide de base de données génomiques portant sur un ensemble d'espèces animales, cette étude identifie des régions génomiques caractéristiques d'une évolution accélérée, suggère leur implication dans des mécanismes conférant un faible risque de cancer, puis évalue l'association entre les séquences homologues dans l'ADN humain et des phénotypes spécifiques
Accelerated Evolution in Distinctive Species Reveals Candidate Elements for Clinically Relevant Traits, Including Mutation and Cancer Resistance
Ferris, Elliott ; Abegglen, Lisa M. ; Schiffman, Joshua D. ; Gregg, Christopher
The identity of most functional elements in the mammalian genome and the phenotypes they impact are unclear. Here, we perform a genome-wide comparative analysis of patterns of accelerated evolution in species with highly distinctive traits to discover candidate functional elements for clinically important phenotypes. We identify accelerated regions (ARs) in the elephant, hibernating bat, orca, dolphin, naked mole rat, and thirteen-lined ground squirrel lineages in mammalian conserved regions, [...]
Menée à l'aide d'échantillons biopsiques et de cellules tumorales circulantes (CTC) prélevés sur des patients atteints d'un cancer du poumon à petites cellules, cette étude évalue la faisabilité et l'intérêt de réaliser des "xénogreffes dérivées de patients" à partir de biopsies et de CTCs
Genomic and functional fidelity of small cell lung cancer patient-derived xenografts
Menée à l'aide d'échantillons biopsiques et de cellules tumorales circulantes (CTC) prélevés sur des patients atteints d'un cancer du poumon à petites cellules, cette étude évalue la faisabilité et l'intérêt de réaliser des "xénogreffes dérivées de patients" à partir de biopsies et de CTCs
Genomic and functional fidelity of small cell lung cancer patient-derived xenografts
Drapkin, Benjamin J. ; George, Julie ; Christensen, Camilla L. ; Mino-Kenudson, Mari ; Dries, Ruben ; Sundaresan, Tilak ; Phat, Sarah ; Myers, David T. ; Zhong, Jun ; Igo, Peter ; Hazar-Rethinam, Mehlika H. ; LiCausi, Joseph A. ; Gomez-Caraballo, Maria ; Kem, Marina ; Jani, Kandarp N. ; Azimi, Roxana ; Abedpour, Nima ; Menon, Roopika ; Lakis, Sotirios ; Heist, Rebecca S. ; Büttner, Reinhard ; Haas, Stefan ; Sequist, Lecia V. ; Shaw, Alice T. ; Wong, Kwok-Kin ; Hata, Aaron N. ; Toner, Mehmet ; Maheswaran, Shyamala ; Haber, Daniel A. ; Peifer, Martin ; Dyson, Nicholas ; Thomas, Roman K. ; Farago, Anna F.
Small cell lung cancer (SCLC) patient-derived xenografts (PDXs) can be generated from biopsies or circulating tumor cells (CTCs), though scarcity of tissue and low efficiency of tumor growth have previously limited these approaches. Applying an established clinical-translational pipeline for tissue collection and an automated microfluidic platform for CTC-enrichment, we generated 17 biopsy-derived PDXs and 17 CTC-derived PDXs in a two-year timeframe, at 89% and 38% efficiency, respectively. [...]