Menée à l'aide de lignées cellulaires et de modèles murins de cancer du pancréas, cette étude met en évidence un mécanisme par lequel la perte de l'expression de la triméthyl transférase SETD2 dans les cellules cancéreuses augmente la progression tumorale en alimentant la phosphorylation oxydative mitochondriale via la différenciation des fibroblastes CAF vers un phénotype riche en lipides

Tumor cell-intrinsic epigenetic dysregulation shapes cancer-associated fibroblasts heterogeneity to metabolically support pancreatic cancer

Niu, Ningning ; Shen, Xuqing ; Wang, Zheng ; Chen, Yueyue ; Weng, Yawen ; Yu, Feier ; Tang, Yingying ; Lu, Ping ; Liu, Mingzhu ; Wang, Liwei ; Sun, Yongwei ; Yang, Minwei ; Shen, Baiyong ; Jin, Jiabin ; Lu, Zipeng ; Jiang, Kuirong ; Shi, Yufeng ; Xue, Jing

The tumor microenvironment (TME) in pancreatic ductal adenocarcinoma (PDAC) involves a significant accumulation of cancer-associated fibroblasts (CAFs) as part of the host response to tumor cells. The origins and functions of transcriptionally diverse CAF populations in PDAC remain poorly understood. Tumor cell-intrinsic genetic mutations and epigenetic dysregulation may reshape the TME; however, their impacts on CAF heterogeneity remain elusive. SETD2, a histone H3K36 trimethyl-transferase, [...]

Menée à partir de données cliniques et de l'analyse par cytométrie de masse de 198 échantillons fixés au formaldéhyde et inclus en paraffine après prélèvement sur 81 patients atteints d'un cancer du poumon de stade précoce, cette étude met en évidence le rôle de la distribution spatiale des cellules myéloïdes et des lymphocytes T dans l'échappement immunitaire

Spatial Architecture of Myeloid and T Cells Orchestrates Immune Evasion and Clinical Outcome in Lung Cancer

Enfield, Katey S. S. ; Colliver, Emma ; Lee, Claudia S Y. ; Magness, Alastair ; Moore, David A. ; Sivakumar, Monica ; Grigoriadis, Kristiana ; Pich, Oriol ; Karasaki, Takahiro ; Hobson, Philip S. ; Levi, Dina ; Veeriah, Selvaraju ; Puttick, Clare ; Nye, Emma L. ; Green, Mary ; Dijkstra, Krijn K. ; Shimato, Masako ; Akarca, Ayse U. ; Marafioti, Teresa ; Salgado, Roberto ; Hackshaw, Allan ; Consortium, TRACERx ; Jamal-Hanjani, Mariam ; van Maldegem, Febe ; McGranahan, Nicholas ; Glass, Benjamin ; Pulaski, Hanna ; Walk, Eric ; Reading, James L. ; Quezada, Sergio A. ; Hiley, Crispin T. ; Downward, Julian ; Sahai, Erik ; Swanton, Charles ; Angelova, Mihaela

Understanding the role of the tumour microenvironment (TME) in lung cancer is critical to improving patient outcome. We identified four histology-independent archetype TMEs in treatment-naive early-stage lung cancer using imaging mass cytometry in the TRACERx study (n=81 patients/198 samples/2.3million cells). In immune-hot adenocarcinomas, spatial niches of T cells and macrophages increased with clonal neoantigen burden, whereas such an increase was observed for niches of plasma and B cells in [...]

Menée à l'aide de lignées cellulaires, de modèles murins, d'échantillons de carcinomes épidermoïdes de l'oesophage et de données du projet "The Cancer Genome Atlas", cette étude met en évidence un mécanisme par lequel la protéine SPP1 favorise la progression tumorale en recrutant les macrophages et en orientant leur polarisation vers un profil M2 via l'activation de la signalisation CD44/PI3K/AKT

SPP1 represents a therapeutic target that promotes the progression of oesophageal squamous cell carcinoma by driving M2 macrophage infiltration

Wang, Chen ; Li, Yutong ; Wang, Linhong ; Han, Yu ; Gao, Xiaohui ; Li, Tiandong ; Liu, Man ; Dai, Liping ; Du, Renle

Background : Tumour-associated macrophages (TAMs) are an important component of the tumour microenvironment (TME). However, the crosstalk between oesophageal squamous cell carcinoma (ESCC) cells and TAMs remains largely unexplored. Methods : Clinical samples and the TCGA database were used to evaluate the relevance of SPP1 and TAM infiltration in ESCC. Mouse models were constructed to investigate the roles of macrophages educated by SPP1 in ESCC. Macrophage phenotypes were determined using [...]

Menée à partir de données métagénomiques, génomiques, transcriptomiques et cliniques portant sur 4 160 biopsies de métastases, cette étude met en évidence des communautés microbiennes qui varient selon les sites anatomiques, dépendent du type de la tumeur primitive et sont associées à l'infiltration de la tumeur par des cellules immunitaires ainsi qu'aux réponses thérapeutiques, notamment dans le cadre d'immunothérapies

A pan-cancer analysis of the microbiome in metastatic cancer

Battaglia, Thomas W. ; Mimpen, Iris L. ; Traets, Joleen J. H. ; van Hoeck, Arne ; Zeverijn, Laurien J. ; Geurts, Birgit S. ; de Wit, Gijs F. ; Noë, Michaël ; Hofland, Ingrid ; Vos, Joris L. ; Cornelissen, Sten ; Alkemade, Maartje ; Broeks, Annegien ; Zuur, Charlotte L. ; Cuppen, Edwin ; Wessels, Lodewyk ; van de Haar, Joris ; Voest, Emile

Microbial communities are resident to multiple niches of the human body and are important modulators of the host immune system and responses to anticancer therapies. Recent studies have shown that complex microbial communities are present within primary tumors. To investigate the presence and relevance of the microbiome in metastases, we integrated mapping and assembly-based metagenomics, genomics, transcriptomics, and clinical data of 4,160 metastatic tumor biopsies. We identified [...]

Cet article présente un portail partageant et analysant des séries de données cliniques et de données génomiques portant sur des patients ayant survécu à un cancer diagnostiqué durant l'enfance

St. Jude Survivorship Portal: sharing and analyzing large clinical and genomic datasets from pediatric cancer survivors

Matt, Gavriel Y. ; Sioson, Edgar ; Shelton, Kyla ; Wang, Jian ; Lu, Congyu ; Zaldivar Peraza, Airen ; Gangwani, Karishma ; Paul, Robin ; Reilly, Colleen ; Acić, Aleksandar ; Liu, Qi ; Sandor, Stephanie R. ; McLeod, Clay ; Patel, Jaimin ; Wang, Fan ; Im, Cindy ; Wang, Zhaoming ; Sapkota, Yadav ; Wilson, Carmen L. ; Bhakta, Nickhill ; Ness, Kirsten K. ; Armstrong, Gregory T. ; Hudson, Melissa M. ; Robison, Leslie L. ; Zhang, Jinghui ; Yasui, Yutaka ; Zhou, Xin

Childhood cancer survivorship studies generate comprehensive datasets comprising demographic, diagnosis, treatment, outcome, and genomic data from survivors. To broadly share this data, we created the St. Jude Survivorship Portal (https://survivorship.stjude.cloud), the first data portal for sharing, analyzing, and visualizing pediatric cancer survivorship data. Over 1,600 phenotypic variables and 400 million genetic variants from over 7,700 childhood cancer survivors can be explored on this [...]

Cet article passe en revue les connaissances concernant la biologie des cellules tumorales circulantes, analyse le rôle des technologies omiques dans la compréhension de la propagation des cellules cancéreuses puis examine le potentiel des cellules tumorales circulantes pour le diagnostic et le traitement des cancers

A Molecular Voyage: Multiomics Insights into Circulating Tumor Cells

Zhang, Yu Wei ; Gvozdenovic, Ana ; Aceto, Nicola

Circulating tumor cells (CTCs) play a pivotal role in metastasis, the leading cause of cancer-associated death. Recent improvements of CTC isolation tools, coupled with a steady development of multiomics technologies at single-cell resolution, have enabled an extensive exploration of CTC biology, unlocking insights into their molecular profiles. A detailed molecular portrait requires CTC interrogation across various levels encompassing genomic, epigenetic, transcriptomic, proteomic and [...]

Menée à partir d'échantillons tumoraux prélevés sur 97 patients pédiatriques atteints d'un lymphome lymphoblastique à cellules précurseurs B, cette étude examine les caractéristiques transcriptionnelles et mutationnelles de la maladie par rapport à une leucémie lymphoblastique à cellules précurseurs B

Mutational and transcriptional landscape of pediatric B-cell precursor lymphoblastic lymphoma

Kroeze, Emma ; Iaccarino, Ingram ; Kleisman, Michelle M ; Mondal, Mayukh ; Beder, Thomas ; Khouja, Mouhamad ; Höppner, Marc P ; Scheijde-Vermeulen, Marijn A. ; Kester, Lennart A. ; Brüggemann, Monika ; Baldus, Claudia D. ; Cario, Gunnar ; Bladergroen, Reno S. ; Garnier, Nathalie ; Attarbaschi, Andishe ; Verdu-Amoros, Jaime ; Sutton, Rosemary ; Macintyre, Elizabeth A. ; Scholten, Kenneth ; Arias Padilla, Laura ; Burkhardt, Birgit ; Beishuizen, Auke ; den Boer, Monique L ; Kuiper, Roland P. ; Loeffen, Jan L.C. ; Boer, Judith M ; Klapper, Wolfram

Pediatric B-cell precursor (BCP) lymphoblastic malignancies are neoplasms with manifestation either in bone marrow/blood (BCP acute lymphoblastic leukemia, BCP-ALL) or less common in extramedullary tissue (BCP lymphoblastic lymphoma, BCP-LBL). Although both presentations are similar in morphology and immunophenotype, molecular studies are virtually restricted to BCP-ALL so far. The lack of molecular studies on BCP-LBL is due to its rarity and the restriction to small, mostly formalin-fixed [...]

Menée à l'aide d'organoïdes, de modèles murins et de tumeurs issues de patients atteints d'un carcinome épidermoïde de la tête et du cou, cette étude met en évidence un mécanisme par lequel l'élongation mitochondriale induite par l'inhibition de la GTPase DRP1 supprime les cellules souches cancéreuses, augmente la glutaminolyse et favorise la ferroptose

DRP1 inhibition-mediated mitochondrial elongation abolishes cancer stemness, enhances glutaminolysis, and drives ferroptosis in oral squamous cell carcinoma

Wang, Zhen ; Tang, Shouyi ; Cai, Luyao ; Wang, Qing ; Pan, Dan ; Dong, Yunmei ; Zhou, Hao ; Li, Jing ; Ji, Ning ; Zeng, Xin ; Zhou, Yu ; Shen, Ying-qiang ; Chen, Qianming

Background : Mitochondrial dynamics play a fundamental role in determining stem cell fate. However, the underlying mechanisms of mitochondrial dynamics in the stemness acquisition of cancer cells are incompletely understood. Methods : Metabolomic profiling of cells were analyzed by MS/MS. The genomic distribution of H3K27me3 was measured by CUT&Tag. Oral squamous cell carcinoma (OSCC) cells depended on glucose or glutamine fueling TCA cycle were monitored by 13C-isotope tracing. Organoids and [...]