Menée à partir notamment de données portant sur 55 234 patients ayant survécu à un sepsis et sur 87 164 patients ayant présenté une inflammation aseptique, cette étude met en évidence l'effet protecteur d'un sepsis contre le développement tumoral et identifie son mécanisme biologique

Sepsis-trained macrophages promote antitumoral tissue-resident T cells

Broquet, Alexis ; Gourain, Victor ; Goronflot, Thomas ; Le Mabecque, Virginie ; Sinha, Debajyoti ; Ashayeripanah, Mitra ; Jacqueline, Cédric ; Martin, Pierre ; Davieau, Marion ; Boutin, Lea ; Poulain, Cecile ; Martin, Florian P. ; Fourgeux, Cynthia ; Petrier, Melanie ; Cannevet, Manon ; Leclercq, Thomas ; Guillonneau, Maeva ; Chaumette, Tanguy ; Laurent, Thomas ; Harly, Christelle ; Scotet, Emmanuel ; Legentil, Laurent ; Ferrières, Vincent ; Corgnac, Stephanie ; Mami-Chouaib, Fathia ; Mosnier, Jean Francois ; Mauduit, Nicolas ; McWilliam, Hamish E. G. ; Villadangos, Jose A. ; Gourraud, Pierre Antoine ; Asehnoune, Karim ; Poschmann, Jeremie ; Roquilly, Antoine

Sepsis induces immune alterations, which last for months after the resolution of illness. The effect of this immunological reprogramming on the risk of developing cancer is unclear. Here we use a national claims database to show that sepsis survivors had a lower cumulative incidence of cancers than matched nonsevere infection survivors. We identify a chemokine network released from sepsis-trained resident macrophages that triggers tissue residency of T cells via CCR2 and CXCR6 stimulations as [...]

Cet article passe en revue les connaissances concernant l'évolution et les mécanismes d'échappement immunitaire des carcinomes hépatocellulaires puis propose des stratégies thérapeutiques pour contrer ces mécanismes

The association between tumour heterogeneity and immune evasion mechanisms in hepatocellular carcinoma and its clinical implications

Chen, Kaina ; Shuen, Timothy W. H. ; Chow, Pierce K. H.

Hepatocellular carcinoma (HCC) is the third leading cause of cancer-related mortality worldwide. The emergence of combination therapy, atezolizumab (anti-PDL1, immune checkpoint inhibitor) and bevacizumab (anti-VEGF) has revolutionised the management of HCC. Despite this breakthrough, the best overall response rate with first-line systemic therapy is only about 30%, owing to intra-tumoural heterogeneity, complex tumour microenvironment and the lack of predictive biomarkers. Many groups have [...]

Cet article examine comment, dans les cancers, les interactions entre les programmes métaboliques et les signaux immunitaires orchestrent la différenciation et l'épuisement des lymphocytes T cytotoxiques

Immunometabolism of CD8+ T cell differentiation in cancer

Shi, Hao ; Chen, Sidi ; Chi, Hongbo

CD8+ cytotoxic T lymphocytes (CTLs) are central mediators of tumor immunity and immunotherapies. Upon tumor antigen recognition, CTLs differentiate from naive/memory-like toward terminally exhausted populations with more limited function against tumors. Such differentiation is regulated by both immune signals, including T cell receptors (TCRs), co-stimulation, and cytokines, and metabolism-associated processes. These immune signals shape the metabolic landscape via signaling, transcriptional [...]

Menée à l'aide notamment de lignées cellulaires et d'échantillons tumoraux issus de patients atteints d'un mélanome acral in situ ou invasif, cette étude met en évidence un mécanisme par lequel les macrophages APOE+ CD163+ favorisent la transition épithélio-mésenchymateuse via l'interaction entre le facteur de croissance IGF1 et son récepteur IGF1R

Integrative molecular and spatial analysis reveals evolutionary dynamics and tumor-immune interplay of in situ and invasive acral melanoma

Liu, Hengkang ; Gao, Jiawen ; Feng, Mei ; Cheng, Jinghui ; Tang, Yuchen ; Cao, Qi ; Zhao, Ziji ; Meng, Ziqiao ; Zhang, Jiarui ; Zhang, Guohong ; Zhang, Chong ; Zhao, Mingming ; Yan, Yicen ; Wang, Yang ; Xue, Ruidong ; Zhang, Ning ; Li, Hang

In acral melanoma (AM), progression from in situ (AMis) to invasive AM (iAM) leads to significantly reduced survival. However, evolutionary dynamics during this process remain elusive. Here, we report integrative molecular and spatial characterization of 147 AMs using genomics, bulk and single-cell transcriptomics, and spatial transcriptomics and proteomics. Vertical invasion from AMis to iAM displays an early and monoclonal seeding pattern. The subsequent regional expansion of iAM exhibits two [...]

Menée à l'aide de lignées cellulaires et d'un modèle murin de cancer du pancréas, cette étude met en évidence un mécanisme par lequel la protéine de reconnaissance du peptidoglycane PGLYRP1 confère aux cellules souches cancéreuses des propriétés d'échappement immunitaire

The Peptidoglycan Recognition Protein 1 confers immune evasive properties on pancreatic cancer stem cells

López-Gil, Juan Carlos ; García-Silva, Susana ; Ruiz-Cañas, Laura ; Navarro, Diego ; Palencia-Campos, Adrián ; Giráldez-Trujillo, Antonio ; Earl, Julie ; Dorado, Jorge ; Gómez-López, Gonzalo ; Monfort-Vengut, Ana ; Alcalá, Sonia ; Gaida, Matthias M. ; García-Mulero, Sandra ; Cabezas-Sainz, Pablo ; Batres-Ramos, Sandra ; Barreto, Emma ; Sánchez-Tomero, Patricia ; Vallespinós, Mireia ; Ambler, Leah ; Lin, Meng-Lay ; Aicher, Alexandra ; García García de Paredes, Ana ; de la Pinta, Carolina ; Sanjuanbenito, Alfonso ; Ruz-Caracuel, Ignacio ; Rodríguez-Garrote, Mercedes ; Guerra, Carmen ; Carrato, Alfredo ; de Cárcer, Guillermo ; Sanchez, Laura ; Nombela-Arrieta, César ; Espinet, Elisa ; Sanchez-Arevalo Lobo, Víctor Javier ; Heeschen, Christopher ; Sainz, Bruno

Objective : Pancreatic ductal adenocarcinoma (PDAC) has limited therapeutic options, particularly with immune checkpoint inhibitors. Highly chemoresistant ‘stem-like’ cells, known as cancer stem cells (CSCs), are implicated in PDAC aggressiveness. Thus, comprehending how this subset of cells evades the immune system is crucial for advancing novel therapies. Design : We used the KPC mouse model (LSL-KrasG12D/+; LSL-Trp53R172H/+; Pdx-1-Cre) and primary tumour cell lines to investigate putative [...]

Menée à partir d'échantillons tumoraux prélevés sur des patients atteints d'un méningiome de grade I ou d'un méningiome agressif, cette étude identifie des mécanismes cellulaires, biochimiques et génomiques impliqués dans l'hétérogénéité et l'évolution moléculaire de la tumeur

Spatial genomic, biochemical and cellular mechanisms underlying meningioma heterogeneity and evolution

Lucas, Calixto-Hope G. ; Mirchia, Kanish ; Seo, Kyounghee ; Najem, Hinda ; Chen, William C. ; Zakimi, Naomi ; Foster, Kyla ; Eaton, Charlotte D. ; Cady, Martha A. ; Choudhury, Abrar ; Liu, S. John ; Phillips, Joanna J. ; Magill, Stephen T. ; Horbinski, Craig M. ; Solomon, David A. ; Perry, Arie ; Vasudevan, Harish N. ; Heimberger, Amy B. ; Raleigh, David R.

Intratumor heterogeneity underlies cancer evolution and treatment resistance, but targetable mechanisms driving intratumor heterogeneity are poorly understood. Meningiomas are the most common primary intracranial tumors and are resistant to all medical therapies, and high-grade meningiomas have significant intratumor heterogeneity. Here we use spatial approaches to identify genomic, biochemical and cellular mechanisms linking intratumor heterogeneity to the molecular, temporal and spatial [...]

Cet article passe en revue les mécanismes de régulation de la protéine p53, analyse les fonctions de cette dernière et ses différents rôles dans des conditions physiologiques normales ou en présence de certaines pathologies (en particulier les cancers) puis examine les stratégies thérapeutiques permettant d'augmenter ou de restaurer sa fonction de suppresseur de tumeur

Understanding the complexity of p53 in a new era of tumor suppression

Liu, Yanqing ; Su, Zhenyi ; Tavana, Omid ; Gu, Wei

p53 was discovered 45 years ago as an SV40 large T antigen binding protein, coded by the most frequently mutated TP53 gene in human cancers. As a transcription factor, p53 is tightly regulated by a rich network of post-translational modifications to execute its diverse functions in tumor suppression. Although early studies established p53-mediated cell-cycle arrest, apoptosis, and senescence as the classic barriers in cancer development, a growing number of new functions of p53 have been [...]

Cet article passe en revue les études utilisant des algorithmes d'apprentissage automatique capables d'analyser des données multi-omiques représentées sous forme de graphes

Graph machine learning for integrated multi-omics analysis

Valous, Nektarios A. ; Popp, Ferdinand ; Zörnig, Inka ; Jäger, Dirk ; Charoentong, Pornpimol

Multi-omics experiments at bulk or single-cell resolution facilitate the discovery of hypothesis-generating biomarkers for predicting response to therapy, as well as aid in uncovering mechanistic insights into cellular and microenvironmental processes. Many methods for data integration have been developed for the identification of key elements that explain or predict disease risk or other biological outcomes. The heterogeneous graph representation of multi-omics data provides an advantage for [...]

Menée à partir d'échantillons tumoraux prélevés sur des patients atteints d'un glioblastome, cette étude met en évidence le rôle de l'hypoxie dans l'organisation spatiale des cellules myéloïdes du microenvironnement tumoral et démontre que cette organisation affecte la survie

Hypoxia coordinates the spatial landscape of myeloid cells within glioblastoma to affect survival

Haley, Michael J. ; Bere, Leoma ; Minshull, James ; Georgaka, Sokratia ; Garcia-Martin, Natalia ; Howell, Gareth ; Coope, David J. ; Roncaroli, Federico ; King, Andrew ; Wedge, David C. ; Allan, Stuart M. ; Pathmanaban, Omar N. ; Brough, David ; Couper, Kevin N.

Myeloid cells are highly prevalent in glioblastoma (GBM), existing in a spectrum of phenotypic and activation states. We now have limited knowledge of the tumor microenvironment (TME) determinants that influence the localization and the functions of the diverse myeloid cell populations in GBM. Here, we have utilized orthogonal imaging mass cytometry with single-cell and spatial transcriptomic approaches to identify and map the various myeloid populations in the human GBM tumor microenvironment [...]

Cet article analyse le rôle de l'autophagie dans la progression des glioblastomes

Autophagy in glioblastoma: A mechanistic perspective

Meena, Durgesh ; Jha, Sushmita

Glioblastoma (GBM) is one of the most lethal malignancies in humans. Even after surgical resection and aggressive radio- or chemotherapies, patients with GBM can survive for less than 14 months. Extreme inter-tumor and intra-tumor heterogeneity of GBM poses a challenge for resolving recalcitrant GBM pathophysiology. GBM tumor microenvironment (TME) exhibits diverse heterogeneity in cellular composition and processes contributing to tumor progression and therapeutic resistance. Autophagy is such [...]

Menée à l'aide de lignées cellulaires, de xénogreffes sur des modèles murins et d'échantillons de gliomes issus de patients pédiatriques, cette étude met en évidence, dans les gliomes infiltrants du tronc cérébral présentant une mutation H3.1K27M, un mécanisme par lequel la protéine CHD2, en se coordonnant avec le facteur de transcription FOSL1, contrôle l'expression de gènes associés au guidage axonal ou aux protéines synaptiques

CHD2 Regulates Neuron-glioma Interactions in Pediatric Glioma

Zhang, Xu ; Duan, Shoufu ; Apostolou, Panagiota E. ; Wu, XiaoPing ; Watanabe, Jun ; Gallitto, Matthew ; Barron, Tara ; Taylor, Kathryn R. ; Woo, Pamelyn J. ; Hua, Xu ; Zhou, Hui ; Wei, Hong-Jian ; McQuillan, Nicholas ; Kang, Kyung-Don ; Friedman, Gregory K. ; Canoll, Peter D. ; Chang, Kenneth ; Wu, Cheng-Chia ; Hashizume, Rintaro ; Vakoc, Christopher R. ; Monje, Michelle ; McKhann, Guy M. ; Gogos, Joseph A. ; Zhang, Zhiguo

High-grade gliomas (HGG) are deadly diseases for both adult and pediatric patients. Recently, it has been shown that neuronal activity promotes progression of multiple subgroups of HGG. However, epigenetic mechanisms that govern this process remain elusive. Here we report that the chromatin remodeler CHD2 regulates neuron-glioma interactions in diffuse midline glioma (DMG) characterized by onco-histone H3.1K27M. Depletion of CHD2 in H3.1K27M DMG cells compromises cell viability and [...]