Menée à l'aide de données génomiques portant sur des patients pédiatriques atteints d'une tumeur de Wilms et menée à l'aide d'échantillons tumoraux et d'échantillons sanguins provenant de patients pédiatriques présentant à la fois une tumeur de Wilms et un syndrome de Wiedemann-Beckwith, cette étude met en évidence, pour ce syndrome, des voies de signalisation impliquées dans la prédisposition aux tumeurs de Wilms

Cancer predisposition signaling in Beckwith-Wiedemann Syndrome drives Wilms tumor development

Nirgude, Snehal ; Naveh, Natali S. Sobel ; Kavari, Sanam L. ; Traxler, Emily M. ; Kalish, Jennifer M.

Background : Wilms tumor (WT) exhibits structural and epigenetic changes at chromosome 11p15, which also cause Beckwith-Wiedemann Syndrome (BWS). Children diagnosed with BWS have increased risk for WT. The aim of this study is to identify the molecular signaling signatures in BWS driving these tumors. Methods : We performed whole exome sequencing, methylation array analysis, and gene expression analysis on BWS-WT samples. Our data were compared to publicly available nonBWS data. We categorized [...]

Menée in vitro et à l'aide de modèles murins, cette étude met en évidence un mécanisme par lequel la perte de l'expression de PTEN dans les cellules de mélanome favorise l'invasion périvasculaire et la colonisation du cerveau

PTEN-restoration abrogates brain colonisation and perivascular niche invasion by melanoma cells

Wang, Sarah ; Riedstra, Caroline P. ; Zhang, Yu ; Anandh, Swetha ; Dudley, Andrew C.

Background : Melanoma brain metastases (MBM) continue to be a significant clinical problem with limited treatment options. Highly invasive melanoma cells migrate along the vasculature and perivascular cells may contribute to residual disease and recurrence. PTEN loss and hyperactivation of AKT occur in MBM; however, a role for PTEN/AKT in perivascular invasion has not been described. Methods : We used in vivo intracranial injections of murine melanoma and bulk RNA sequencing of melanoma cells [...]

Menée à partir d'une analyse multiomique des composantes sarcomateuses et carcinomateuses d'échantillons tumoraux prélevés sur 12 patientes atteintes d'un carcinosarcome ovarien, cette étude met en évidence le rôle des gènes SRC et GNAS dans le développement d'une composante sarcomateuse via la transition épithélio-mésenchymateuse

Compartment-specific multiomic profiling identifies SRC and GNAS as candidate drivers of epithelial-to-mesenchymal transition in ovarian carcinosarcoma

Herrington, C. Simon ; Oswald, Ailsa J. ; Stillie, Lorna J. ; Croy, Ian ; Churchman, Michael ; Hollis, Robert L.

Background : Ovarian carcinosarcoma (OCS) is an exceptionally aggressive and understudied ovarian cancer type harbouring distinct carcinomatous and sarcomatous compartments. Here, we seek to identify shared and compartment-specific events that may represent potential therapeutic targets and candidate drivers of sarcomatous compartment formation through epithelial-to-mesenchymal transition (EMT). Methods : We performed multiomic profiling (exome sequencing, RNA-sequencing, microRNA profiling) of [...]

Menée à l'aide de lignées cellulaires, d'organoïdes et de modèles murins de cancer du pancréas, cette étude met en évidence un mécanisme par lequel les myofibroblastes activés par le récepteur EGFR favorisent le développement de métastases

EGFR-activated myofibroblasts promote metastasis of pancreatic cancer

Mucciolo, Gianluca ; Araos Henríquez, Joaquín ; Jihad, Muntadher ; Pinto Teles, Sara ; Manansala, Judhell S. ; Li, Wenlong ; Ashworth, Sally ; Lloyd, Eloise G. ; Cheng, Priscilla S. W. ; Luo, Weike ; Anand, Akanksha ; Sawle, Ashley ; Piskorz, Anna ; Biffi, Giulia

Pancreatic ductal adenocarcinoma (PDAC) has a dismal prognosis. Cancer-associated fibroblasts (CAFs) are recognized potential therapeutic targets, but poor understanding of these heterogeneous cell populations has limited the development of effective treatment strategies. We previously identified transforming growth factor beta (TGF-

Menée à l'aide de lignées cellulaires, d'un modèle murin d'invasion tumorale du nerf sciatique et d'échantillons tissulaires issus de patients atteints d'un adénocarcinome canalaire du pancréas, cette étude met en évidence un mécanisme par lequel les macrophages associés à la tumeur et les cellules de Schwann favorisent l'invasion périneurale via une boucle de régulation paracrine

Tumour-associated macrophages and Schwann cells promote perineural invasion via paracrine loop in pancreatic ductal adenocarcinoma

Zhang, Bin ; Guo, Xiaofeng ; Huang, Leyi ; Zhang, Yuting ; Li, Zhiguo ; Su, Dan ; Lin, Longfa ; Zhou, Peng ; Ye, Huilin ; Lu, Yanan ; Zhou, Quanbo

Background : Pancreatic ductal adenocarcinoma (PDAC) is frequently accompanied by perineural invasion (PNI), which is associated with excruciating neuropathic pain and malignant progression. However, the relationship between PNI and tumour stromal cells has not been clarified. Methods : The dorsal root ganglia or sciatic nerves nerve model was used to observe the paracrine interaction and the activation effect among Schwann cells, tumour-associated macrophages (TAMs), and pancreatic cancer [...]

Menée à l'aide de lignées cellulaires, de modèles murins de glioblastome et d'une technologie combinant séquençage de l'ARN à l'échelle d'une cellule unique et suivi par fluorescence des modifications transcriptomiques des cellules immunitaires circulantes, cette étude met en évidence les modifications moléculaires du microenvironnement tumoral qui conduisent à un dysfonctionnement immunitaire

Time-resolved single-cell transcriptomics defines immune trajectories in glioblastoma

Kirschenbaum, Daniel ; Xie, Ken ; Ingelfinger, Florian ; Katzenelenbogen, Yonatan ; Abadie, Kathleen ; Look, Thomas ; Sheban, Fadi ; Phan, Truong San ; Li, Baoguo ; Zwicky, Pascale ; Yofe, Ido ; David, Eyal ; Mazuz, Kfir ; Hou, Jinchao ; Chen, Yun ; Shaim, Hila ; Shanley, Mayra ; Becker, Soeren ; Qian, Jiawen ; Colonna, Marco ; Ginhoux, Florent ; Rezvani, Katayoun ; Theis, Fabian J. ; Yosef, Nir ; Weiss, Tobias ; Weiner, Assaf ; Amit, Ido

Deciphering the cell-state transitions underlying immune adaptation across time is fundamental for advancing biology. Empirical in vivo genomic technologies that capture cellular dynamics are currently lacking. We present Zman-seq, a single-cell technology recording transcriptomic dynamics across time by introducing time stamps into circulating immune cells, tracking them in tissues for days. Applying Zman-seq resolved cell-state and molecular trajectories of the dysfunctional immune [...]

Menée à partir de l'analyse multi-omique de différentes régions de tumeurs primitives ou de métastases provenant de 182 patients atteints d'un carcinome hépatocellulaire, cette étude examine l'évolution spatio-temporelle des caractéristiques génétiques et moléculaires de ce type de tumeur

Integrated multi-omics profiling to dissect the spatiotemporal evolution of metastatic hepatocellular carcinoma

Sun, Yunfan ; Wu, Pin ; Zhang, Zefan ; Wang, Zejian ; Zhou, Kaiqian ; Song, Minfang ; Ji, Yuan ; Zang, Fenglin ; Lou, Limu ; Rao, Keqiang ; Wang, Pengxiang ; Gu, Yutong ; Gu, Jie ; Lu, Binbin ; Chen, Limeng ; Pan, Xiuqi ; Zhao, Xiaojing ; Peng, Lihua ; Liu, Dongbing ; Chen, Xiaofang ; Wu, Kui ; Lin, Penghui ; Wu, Liang ; Su, Yulin ; Du, Min ; Hou, Yingyong ; Yang, Xinrong ; Qiu, Shuangjian ; Shi, Yinghong ; Sun, Huichuan ; Zhou, Jian ; Huang, Xingxu ; Peng, David H. ; Zhang, Liye ; Fan, Jia

Comprehensive molecular analyses of metastatic hepatocellular carcinoma (HCC) are lacking. Here, we generate multi-omic profiling of 257 primary and 176 metastatic regions from 182 HCC patients. Primary tumors rich in hypoxia signatures facilitated polyclonal dissemination. Genomic divergence between primary and metastatic HCC is high, and early dissemination is prevalent. The remarkable neoantigen intratumor heterogeneity observed in metastases is associated with decreased T cell reactivity, [...]

Cet article passe en revue les connaissances concernant les interactions entre le microbiote intestinal et le système immunitaire dans un contexte de mélanome, identifie les mécanismes d'action potentiels, examine l'effet de l'alimentation et des prébiotiques sur les résultats thérapeutiques et le microbiote puis présente les différentes interventions centrées sur ce dernier

Melanoma and microbiota: Current understanding and future directions

Routy, Bertrand ; Jackson, Tanisha ; Mählmann, Laura ; Baumgartner, Christina K. ; Blaser, Martin ; Byrd, Allyson ; Corvaia, Nathalie ; Couts, Kasey ; Davar, Diwakar ; Derosa, Lisa ; Hang, Howard C. ; Hospers, Geke ; Isaksen, Morten ; Kroemer, Guido ; Malard, Florent ; McCoy, Kathy D. ; Meisel, Marlies ; Pal, Sumanta ; Ronai, Ze’ev ; Segal, Eran ; Sepich-Poore, Gregory D. ; Shaikh, Fyza ; Sweis, Randy F. ; Trinchieri, Giorgio ; van den Brink, Marcel ; Weersma, Rinse K. ; Whiteson, Katrine ; Zhao, Liping ; McQuade, Jennifer ; Zarour, Hassane ; Zitvogel, Laurence

Over the last decade, the composition of the gut microbiota has been found to correlate with the outcomes of cancer patients treated with immunotherapy. Accumulating evidence points to the various mechanisms by which intestinal bacteria act on distal tumors and how to harness this complex ecosystem to circumvent primary resistance to immune checkpoint inhibitors. Here, we review the state of the microbiota field in the context of melanoma, the recent breakthroughs in defining microbial modes of [...]

Menée à l'aide de modèles murins de cancer mammaire et à partir du séquençage de l'ARN de cellules d'échantillons tissulaires normaux et d'échantillons tumoraux, cette étude met en évidence le rôle de l'enzyme ENPP1 dans la réduction de l'immunité antitumorale induite par la voie de signalisation cGAMP–STING

ENPP1 is an innate immune checkpoint of the anticancer cGAMP–STING pathway in breast cancer

Wang, Songnan ; Böhnert, Volker ; Joseph, Alby J. ; Sudaryo, Valentino ; Skariah, Gemini ; Swinderman, Jason T. ; Yu, Feiqiao B. ; Subramanyam, Vishvak ; Wolf, Denise M. ; Lyu, Xuchao ; Gilbert, Luke A. ; van’t Veer, Laura J. ; Goodarzi, Hani ; Li, Lingyin

Ectonucleotide pyrophosphatase/phosphodiesterase 1 (ENPP1) expression correlates with poor prognosis in many cancers, and we previously discovered that ENPP1 is the dominant hydrolase of extracellular cGAMP: a cancer-cell-produced immunotransmitter that activates the anticancer stimulator of interferon genes (STING) pathway. However, ENPP1 has other catalytic activities and the molecular and cellular mechanisms contributing to its tumorigenic effects remain unclear. Here, using single-cell [...]