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Sommaire du n° 538 du 26 septembre 2022
Oncogènes et suppresseurs de tumeurs (2)
Menée à l'aide de lignées cellulaires et de modèles murins de cancer hépatique, cette étude met en évidence un mécanisme par lequel une mutation oncogène de la bêta-caténine déclenche la tumorigenèse en stimulant la synthèse de pyrimidines via la voie de signalisation AKT2/CAD
Oncogenic bêta
Menée à l'aide de lignées cellulaires et de modèles murins de cancer hépatique, cette étude met en évidence un mécanisme par lequel une mutation oncogène de la bêta-caténine déclenche la tumorigenèse en stimulant la synthèse de pyrimidines via la voie de signalisation AKT2/CAD
Oncogenic bêta
Liu, Fangming ; Gai, Xiaochen ; Wu, Yuting ; Zhang, Baohui ; Wu, Xiaoyu ; Cheng, Rongrong ; Tang, Bufu ; Shang, Kezhuo ; Zhao, Na ; Deng, Weiwei ; Chen, Jie ; Zhang, Zhengyi ; Gu, Song ; Zheng, Liang ; Zhang, Hongbing
CTNNB1, encoding β-catenin protein, is the most frequently altered proto-oncogene in hepatic neoplasms. In this study, we studied the significance and pathological mechanism of CTNNB1 gain-of-function mutations in hepatocarcinogenesis. Activated β-catenin not only triggered hepatic tumorigenesis but also exacerbated Tp53 deletion or hepatitis B virus infection–mediated liver cancer development in mouse models. Using untargeted metabolomic profiling, we identified boosted de novo pyrimidine [...]
Ce dossier présente deux études, l'une mettant en évidence un mécanisme par lequel l'échec de la différenciation de la région des lèvres rhombiques au cours du développement du cervelet favorise la formation d'un médulloblastome, l'autre identifiant les origines des médulloblastomes des sous-groupes 3 et 4
Failure of human rhombic lip differentiation underlies medulloblastoma formation
Ce dossier présente deux études, l'une mettant en évidence un mécanisme par lequel l'échec de la différenciation de la région des lèvres rhombiques au cours du développement du cervelet favorise la formation d'un médulloblastome, l'autre identifiant les origines des médulloblastomes des sous-groupes 3 et 4
Failure of human rhombic lip differentiation underlies medulloblastoma formation
Hendrikse, Liam D. ; Haldipur, Parthiv ; Saulnier, Olivier ; Millman, Jake ; Sjoboen, Alexandria H. ; Erickson, Anders W. ; Ong, Winnie ; Gordon, Victor ; Coudière-Morrison, Ludivine ; Mercier, Audrey L. ; Shokouhian, Mohammad ; Suárez, Raúl A. ; Ly, Michelle ; Borlase, Stephanie ; Scott, David S. ; Vladoiu, Maria C. ; Farooq, Hamza ; Sirbu, Olga ; Nakashima, Takuma ; Nambu, Shohei ; Funakoshi, Yusuke ; Bahcheli, Alec ; Diaz-Mejia, J. Javier ; Golser, Joseph ; Bach, Kathleen ; Phuong-Bao, Tram ; Skowron, Patryk ; Wang, Evan Y. ; Kumar, Sachin A. ; Balin, Polina ; Visvanathan, Abhirami ; Lee, John J. Y. ; Ayoub, Ramy ; Chen, Xin ; Chen, Xiaodi ; Mungall, Karen L. ; Luu, Betty ; Bérubé, Pierre ; Wang, Yu C. ; Pfister, Stefan M. ; Kim, Seung-Ki ; Delattre, Olivier ; Bourdeaut, Franck ; Doz, Francois ; Masliah-Planchon, Julien ; Grajkowska, Wieslawa A. ; Loukides, James ; Dirks, Peter ; Fevre-Montange, Michelle ; Jouvet, Anne ; French, Pim J. ; Kros, Johan M. ; Zitterbart, Karel ; Bailey, Swneke D. ; Eberhart, Charles G. ; Rao, Amulya A. N. ; Giannini, Caterina ; Olson, James M. ; Garami, Miklos ; Hauser, Peter ; Phillips, Joanna J. ; Ra, Young S. ; de Torres, Carmen ; Mora, Jaume ; Li, Kay K. W. ; Ng, Ho-Keung ; Poon, Wai S. ; Pollack, Ian F. ; López-Aguilar, Enrique ; Gillespie, G. Yancey ; Van Meter, Timothy E. ; Shofuda, Tomoko ; Vibhakar, Rajeev ; Thompson, Reid C. ; Cooper, Michael K. ; Rubin, Joshua B. ; Kumabe, Toshihiro ; Jung, Shin ; Lach, Boleslaw ; Lolascon, Achille ; Ferrucci, Veronica ; De Antonellis, Pasqualino ; Zollo, Massimo ; Cinalli, Giuseppe ; Robinson, Shenandoah ; Stearns, Duncan S. ; Van Meir, Erwin G. ; Porrati, Paola ; Finocchiaro, Gaetano ; Massimino, Maura ; Carlotti, Carlos G. ; Faria, Claudia C. ; Roussel, Martine F. ; Boop, Frederick ; Chan, Jennifer A. ; Aldinger, Kimberly A. ; Razavi, Ferechte ; Silvestri, Evelina ; McLendon, Roger E. ; Thompson, Eric M. ; Ansari, Marc ; Garre, Maria L. ; Chico, Fernando ; Eguía, Pilar ; Pérezpeña, Mario ; Morrissy, A. Sorana ; Cavalli, Florence M. G. ; Wu, Xiaochong ; Daniels, Craig ; Rich, Jeremy N. ; Jones, Steven J. M. ; Moore, Richard A. ; Marra, Marco A. ; Huang, Xi ; Reimand, Jüri ; Sorensen, Poul H. ; Wechsler-Reya, Robert J. ; Weiss, William A. ; Pugh, Trevor J. ; Garzia, Livia ; Kleinman, Claudia L. ; Stein, Lincoln D. ; Jabado, Nada ; Malkin, David ; Ayrault, Olivier ; Golden, Jeffrey A. ; Ellison, David W. ; Doble, Brad ; Ramaswamy, Vijay ; Werbowetski-Ogilvie, Tamra E. ; Suzuki, Hiromichi ; Millen, Kathleen J. ; Taylor, Michael D.
Medulloblastoma (MB) comprises a group of heterogeneous paediatric embryonal neoplasms of the hindbrain with strong links to early development of the hindbrain1–4. Mutations that activate Sonic hedgehog signalling lead to Sonic hedgehog MB in the upper rhombic lip (RL) granule cell lineage5–8. By contrast, mutations that activate WNT signalling lead to WNT MB in the lower RL9,10. However, little is known about the more commonly occurring group 4 (G4) MB, which is thought to arise in the [...]
Unified rhombic lip origins of group 3 and group 4 medulloblastoma
Ce dossier présente deux études, l'une mettant en évidence un mécanisme par lequel l'échec de la différenciation de la région des lèvres rhombiques au cours du développement du cervelet favorise la formation d'un médulloblastome, l'autre identifiant les origines des médulloblastomes des sous-groupes 3 et 4
Unified rhombic lip origins of group 3 and group 4 medulloblastoma
Smith, Kyle S. ; Bihannic, Laure ; Gudenas, Brian L. ; Haldipur, Parthiv ; Tao, Ran ; Gao, Qingsong ; Li, Yiran ; Aldinger, Kimberly A. ; Iskusnykh, Igor Y. ; Chizhikov, Victor V. ; Scoggins, Matthew ; Zhang, Silu ; Edwards, Angela ; Deng, Mei ; Glass, Ian A. ; Overman, Lynne M. ; Millman, Jake ; Sjoboen, Alexandria H. ; Hadley, Jennifer ; Golser, Joseph ; Mankad, Kshitij ; Sheppard, Heather ; Onar-Thomas, Arzu ; Gajjar, Amar ; Robinson, Giles W. ; Hovestadt, Volker ; Orr, Brent A. ; Patay, Zoltan ; Millen, Kathleen J. ; Northcott, Paul A.
Medulloblastoma, a malignant childhood cerebellar tumour, segregates molecularly into biologically distinct subgroups, suggesting that a personalized approach to therapy would be beneficial1. Mouse modelling and cross-species genomics have provided increasing evidence of discrete, subgroup-specific developmental origins2. However, the anatomical and cellular complexity of developing human tissues3—particularly within the rhombic lip germinal zone, which produces all glutamatergic neuronal [...]
Progression et métastases (4)
Menée à l'aide de lignées cellulaires de mélanome humain et à l'aide de modèles murins, cette étude démontre que la croissance tumorale et la dissémination des cellules cancéreuses ont pour origine des sous-populations cellulaires distinctes
A cellular hierarchy in melanoma uncouples growth and metastasis
Menée à l'aide de lignées cellulaires de mélanome humain et à l'aide de modèles murins, cette étude démontre que la croissance tumorale et la dissémination des cellules cancéreuses ont pour origine des sous-populations cellulaires distinctes
A cellular hierarchy in melanoma uncouples growth and metastasis
Karras, Panagiotis ; Bordeu, Ignacio ; Poźniak, Joanna ; Nowosad, Ada ; Pazzi, Cecilia ; Van Raemdonck, Nina ; Landeloos, Ewout ; Van Herck, Yannick ; Pedri, Dennis ; Bervoets, Greet ; Makhzami, Samira ; Khoo, Jia Hui ; Pavie, Benjamin ; Lamote, Jochen ; Marin-Bejar, Oskar ; Dewaele, Michael ; Liang, Han ; Zhang, Xingju ; Hua, Yichao ; Wouters, Jasper ; Browaeys, Robin ; Bergers, Gabriele ; Saeys, Yvan ; Bosisio, Francesca ; van den Oord, Joost ; Lambrechts, Diether ; Rustgi, Anil K. ; Bechter, Oliver ; Blanpain, Cedric ; Simons, Benjamin D. ; Rambow, Florian ; Marine, Jean-Christophe
Although melanoma is notorious for its high degree of heterogeneity and plasticity1,2, the origin and magnitude of cell-state diversity remains poorly understood. Equally, it is unclear whether growth and metastatic dissemination are supported by overlapping or distinct melanoma subpopulations. Here, by combining mouse genetics, single-cell and spatial transcriptomics, lineage tracing and quantitative modelling, we provide evidence of a hierarchical model of tumour growth that mirrors the [...]
Menée à partir de données cliniques et moléculaires portant sur des échantillons de tumeurs ovariennes et menée à l'aide de modèles murins, cette étude met en évidence une létalité collatérale impliquant les gènes MTHFD2 et UQCR11
Metabolic collateral lethal target identification reveals MTHFD2 paralogue dependency in ovarian cancer
Menée à partir de données cliniques et moléculaires portant sur des échantillons de tumeurs ovariennes et menée à l'aide de modèles murins, cette étude met en évidence une létalité collatérale impliquant les gènes MTHFD2 et UQCR11
Metabolic collateral lethal target identification reveals MTHFD2 paralogue dependency in ovarian cancer
Achreja, Abhinav ; Yu, Tao ; Mittal, Anjali ; Choppara, Srinadh ; Animasahun, Olamide ; Nenwani, Minal ; Wuchu, Fulei ; Meurs, Noah ; Mohan, Aradhana ; Jeon, Jin Heon ; Sarangi, Itisam ; Jayaraman, Anusha ; Owen, Sarah ; Kulkarni, Reva ; Cusato, Michele ; Weinberg, Frank ; Kweon, Hye Kyong ; Subramanian, Chitra ; Wicha, Max S. ; Merajver, Sofia D. ; Nagrath, Sunitha ; Cho, Kathleen R. ; DiFeo, Analisa ; Lu, Xiongbin ; Nagrath, Deepak
Recurrent loss-of-function deletions cause frequent inactivation of tumour suppressor genes but often also involve the collateral deletion of essential genes in chromosomal proximity, engendering dependence on paralogues that maintain similar function. Although these paralogues are attractive anticancer targets, no methodology exists to uncover such collateral lethal genes. Here we report a framework for collateral lethal gene identification via metabolic fluxes, CLIM, and use it to reveal [...]
Menée à l'aide d'un modèle murin et de données transcriptomiques portant sur des tumeurs issues de patients atteints d'un adénocarcinome du pancréas, cette étude met en évidence une association entre l'expression du ligand PD-L2 et un pronostic défavorable puis démontre que la kinase FAK favorise l'expression de ce ligand sur certaines cellules du stroma tumoral (macrophages associés à la tumeur, cellules dendritiques et cellules endothéliales)
FAK promotes stromal PD-L2 expression associated with poor survival in pancreatic cancer
Menée à l'aide d'un modèle murin et de données transcriptomiques portant sur des tumeurs issues de patients atteints d'un adénocarcinome du pancréas, cette étude met en évidence une association entre l'expression du ligand PD-L2 et un pronostic défavorable puis démontre que la kinase FAK favorise l'expression de ce ligand sur certaines cellules du stroma tumoral (macrophages associés à la tumeur, cellules dendritiques et cellules endothéliales)
FAK promotes stromal PD-L2 expression associated with poor survival in pancreatic cancer
Davidson, Catherine ; Taggart, David ; Sims, Andrew H. ; Lonergan, David W. ; Canel, Marta ; Serrels, Alan
Background : Pancreatic Cancer is one of the most lethal cancers, with less than 8% of patients surviving 5 years following diagnosis. The last 40 years have seen only small incremental improvements in treatment options, highlighting the continued need to better define the cellular and molecular pathways contributing to therapy response and patient prognosis. Methods : We combined CRISPR, shRNA and flow cytometry with mechanistic experiments using a KrasG12Dp53R172H mouse model of pancreatic [...]
Menée in vitro et à l'aide d'un modèle murin de cancer du sein triple négatif, cette étude met en évidence un mécanisme par lequel le long ARN non codant TGFB2-AS1, en interagissant avec la protéine SMARCA4 et en réprimant la transcription des gènes TGFB2 et SOX2, inhibe la progression tumorale
TGFB2-AS1 inhibits triple-negative breast cancer progression via interaction with SMARCA4 and regulating its targets TGFB2 and SOX2
Menée in vitro et à l'aide d'un modèle murin de cancer du sein triple négatif, cette étude met en évidence un mécanisme par lequel le long ARN non codant TGFB2-AS1, en interagissant avec la protéine SMARCA4 et en réprimant la transcription des gènes TGFB2 et SOX2, inhibe la progression tumorale
TGFB2-AS1 inhibits triple-negative breast cancer progression via interaction with SMARCA4 and regulating its targets TGFB2 and SOX2
Zhou, Cixiang ; Wang, Difei ; Li, Jingchi ; Wang, Qiuyu ; Wo, Lulu ; Zhang, Xin ; Hu, Zhexuan ; Wang, Zheng ; Zhan, Mengna ; He, Ming ; Hu, Guohong ; Chen, Xiaosong ; Shen, Kunwei ; Chen, Guo-Qiang ; Zhao, Qian
Triple-negative breast cancer (TNBC) is the most challenging breast cancer subtype for its high rates of relapse, great metastatic potential, and short overall survival. How cancer cells acquire metastatic potency through the conversion of noncancer stem-like cells into cancer cells with stem-cell properties is poorly understood. Here, we identified the long noncoding RNA (lncRNA) TGFB2-AS1 as an important regulator of the reversibility and plasticity of noncancer stem cell populations in TNBC. [...]
Ressources et infrastructures (Biologie) (4)
Menée in vitro, cette étude analyse la dynamique évolutive de l'ADN extrachromosomique dans les cancers d'origine humaine
The evolutionary dynamics of extrachromosomal DNA in human cancers
Menée in vitro, cette étude analyse la dynamique évolutive de l'ADN extrachromosomique dans les cancers d'origine humaine
The evolutionary dynamics of extrachromosomal DNA in human cancers
Lange, Joshua T. ; Rose, John C. ; Chen, Celine Y. ; Pichugin, Yuriy ; Xie, Liangqi ; Tang, Jun ; Hung, King L. ; Yost, Kathryn E. ; Shi, Quanming ; Erb, Marcella L. ; Rajkumar, Utkrisht ; Wu, Sihan ; Taschner-Mandl, Sabine ; Bernkopf, Marie ; Swanton, Charles ; Liu, Zhe ; Huang, Weini ; Chang, Howard Y. ; Bafna, Vineet ; Henssen, Anton G. ; Werner, Benjamin ; Mischel, Paul S.
Oncogene amplification on extrachromosomal DNA (ecDNA) is a common event, driving aggressive tumor growth, drug resistance and shorter survival. Currently, the impact of nonchromosomal oncogene inheritance—random identity by descent—is poorly understood. Also unclear is the impact of ecDNA on somatic variation and selection. Here integrating theoretical models of random segregation, unbiased image analysis, CRISPR-based ecDNA tagging with live-cell imaging and CRISPR-C, we demonstrate that [...]
Menée à l'aide de 1 468 échantillons de mésothéliomes pleuraux ou péritonéaux, cette étude analyse leurs caractéristiques génomiques
Genomic landscape of pleural and peritoneal mesothelioma tumours
Menée à l'aide de 1 468 échantillons de mésothéliomes pleuraux ou péritonéaux, cette étude analyse leurs caractéristiques génomiques
Genomic landscape of pleural and peritoneal mesothelioma tumours
Hiltbrunner, Stefanie ; Fleischmann, Zoe ; Sokol, Ethan S. ; Zoche, Martin ; Felley-Bosco, Emanuela ; Curioni-Fontecedro, Alessandra
Background : Malignant pleural and peritoneal mesotheliomas are rare malignancies with unacceptable poor prognoses and limited treatment options. The genomic landscape is mainly characterised by the loss of tumour suppressor genes and mutations in DNA repair genes. Currently, data from next-generation sequencing (NGS) of mesothelioma tumours is restricted to a limited number of cases; moreover, data comparing molecular features of mesothelioma from the pleural and peritoneal origin with NGS are [...]
Menée à l'aide de lignées cellulaires de neuroblatomes, de modèles murins et d'échantillons sanguins d'origine humaine, cette étude met en évidence des phénotypes immunogéniques distincts entre les cellules cancéreuses présentant des caractéristiques mésenchymateuses et les cellules cancéreuses présentant des caractéristiques adrénergiques
Mesenchymal and adrenergic cell lineage states in neuroblastoma possess distinct immunogenic phenotypes
Menée à l'aide de lignées cellulaires de neuroblatomes, de modèles murins et d'échantillons sanguins d'origine humaine, cette étude met en évidence des phénotypes immunogéniques distincts entre les cellules cancéreuses présentant des caractéristiques mésenchymateuses et les cellules cancéreuses présentant des caractéristiques adrénergiques
Mesenchymal and adrenergic cell lineage states in neuroblastoma possess distinct immunogenic phenotypes
Sengupta, Satyaki ; Das, Sanjukta ; Crespo, Angela C. ; Cornel, Annelisa M. ; Patel, Anand G. ; Mahadevan, Navin R. ; Campisi, Marco ; Ali, Alaa K. ; Sharma, Bandana ; Rowe, Jared H. ; Huang, Hao ; Debruyne, David N. ; Cerda, Esther D. ; Krajewska, Malgorzata ; Dries, Ruben ; Chen, Minyue ; Zhang, Shupei ; Soriano, Luigi ; Cohen, Malkiel A. ; Versteeg, Rogier ; Jaenisch, Rudolf ; Spranger, Stefani ; Romee, Rizwan ; Miller, Brian C. ; Barbie, David A. ; Nierkens, Stefan ; Dyer, Michael A. ; Lieberman, Judy ; George, Rani E.
Apart from the anti-GD2 antibody, immunotherapy for neuroblastoma has had limited success due to immune evasion mechanisms, coupled with an incomplete understanding of predictors of response. Here, from bulk and single-cell transcriptomic analyses, we identify a subset of neuroblastomas enriched for transcripts associated with immune activation and inhibition and show that these are predominantly characterized by gene expression signatures of the mesenchymal lineage state. By contrast, tumors [...]
En prenant comme exemple le cancer colorectal, cet article analyse le rôle des organoïdes dans l'étude des cellules cancéreuses, du microenvironnement tumoral et de leurs interactions
From organoids to bedside: advances in modeling, decoding and targeting of colorectal cancer
En prenant comme exemple le cancer colorectal, cet article analyse le rôle des organoïdes dans l'étude des cellules cancéreuses, du microenvironnement tumoral et de leurs interactions
From organoids to bedside: advances in modeling, decoding and targeting of colorectal cancer
Betge, Johannes ; Jackstadt, Rene
Patient derived organoids closely resemble the biology of tissues and tumors. They are enabling ex vivo modeling of human diseases and dissecting key features of tumor biology like anatomical diversity or inter- and intra-tumoral heterogeneity. In the last years, organoids were established as models for drug discovery and explored to guide clinical decision making. In this review, we discuss the recent developments in organoid based research, elaborating on the developments in colorectal cancer [...]