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Sommaire du n° 221 du 20 mars 2014
Aberrations chromosomiques (4)
A partir de données issues de divers travaux sur les génomes de cancer, cette étude montre que des mutations synonymes (qui modifient la séquence d'un gène sans directement altérer la séquence de la protéine codée) de certains oncogènes contribuent fréquemment au développement d'un cancer à travers divers mécanismes, notamment la régulation de l'épissage
Silent Mutations Make Some Noise
A partir de données issues de divers travaux sur les génomes de cancer, cette étude montre que des mutations synonymes (qui modifient la séquence d'un gène sans directement altérer la séquence de la protéine codée) de certains oncogènes contribuent fréquemment au développement d'un cancer à travers divers mécanismes, notamment la régulation de l'épissage
Silent Mutations Make Some Noise
Zheng, Siyuan ; Kim, Hoon ; Verhaak, Roel G W.
Synonymous mutations do not alter amino acids and are generally considered nonfunctional in cancer. Supek et al. now present a compelling analysis suggesting that such silent mutations can be oncogenic by altering transcript splicing and thereby affecting protein function.
Synonymous Mutations Frequently Act as Driver Mutations in Human Cancers
A partir de données issues de divers travaux sur les génomes de cancer, cette étude montre que des mutations synonymes (qui modifient la séquence d'un gène sans directement altérer la séquence de la protéine codée) de certains oncogènes contribuent fréquemment au développement d'un cancer à travers divers mécanismes, notamment la régulation de l'épissage
Synonymous Mutations Frequently Act as Driver Mutations in Human Cancers
Supek, Fran ; Miñana, Belén ; Valcárcel, Juan ; Gabaldón, Toni ; Lehner, Ben
Synonymous mutations change the sequence of a gene without directly altering the sequence of the encoded protein. Here, we present evidence that these silent mutations frequently contribute to human cancer. Selection on synonymous mutations in oncogenes is cancer-type specific, and although the functional consequences of cancer-associated synonymous mutations may be diverse, they recurrently alter exonic motifs that regulate splicing and are associated with changes in oncogene splicing in [...]
Menée dans le cadre du projet "International Cancer Genome Consortium" sur des échantillons tumoraux prélevés sur 158 patients atteints d'un carcinome épidermoïde de l'œsophage, cette étude chinoise identifie un ensemble d'anomalies génomiques, principalement liées aux voies de signalisation Notch, Wnt et de régulation du cycle cellulaire
Identification of genomic alterations in oesophageal squamous cell cancer
Menée dans le cadre du projet "International Cancer Genome Consortium" sur des échantillons tumoraux prélevés sur 158 patients atteints d'un carcinome épidermoïde de l'œsophage, cette étude chinoise identifie un ensemble d'anomalies génomiques, principalement liées aux voies de signalisation Notch, Wnt et de régulation du cycle cellulaire
Identification of genomic alterations in oesophageal squamous cell cancer
Song, Yongmei ; Li, Lin ; Ou, Yunwei ; Gao, Zhibo ; Li, Enmin ; Li, Xiangchun ; Zhang, Weimin ; Wang, Jiaqian ; Xu, Liyan ; Zhou, Yong ; Ma, Xiaojuan ; Liu, Lingyan ; Zhao, Zitong ; Huang, Xuanlin ; Fan, Jing ; Dong, Lijia ; Chen, Gang ; Ma, Liying ; Yang, Jie ; Chen, Longyun ; He, Minghui ; Li, Miao ; Zhuang, Xuehan ; Huang, Kai ; Qiu, Kunlong ; Yin, Guangliang ; Guo, Guangwu ; Feng, Qiang ; Chen, Peishan ; Wu, Zhiyong ; Wu, Jianyi ; Ma, Ling ; Zhao, Jinyang ; Luo, Longhai ; Fu, Ming ; Xu, Bainan ; Chen, Bo ; Li, Yingrui ; Tong, Tong ; Wang, Mingrong ; Liu, Zhihua ; Lin, Dongxin ; Zhang, Xiuqing ; Yang, Huanming ; Wang, Jun ; Zhan, Qimin
Oesophageal cancer is one of the most aggressive cancers and is the sixth leading cause of cancer death worldwide. Approximately 70% of global oesophageal cancer cases occur in China, with oesophageal squamous cell carcinoma (ESCC) being the histopathological form in the vast majority of cases (>90%). Currently, there are limited clinical approaches for the early diagnosis and treatment of ESCC, resulting in a 10% five-year survival rate for patients. However, the full repertoire of genomic [...]
Menée à l'aide d'un modèle murin génétiquement modifié, cette étude met en évidence des anomalies génomiques dans les tumeurs primitives et les métastases, puis propose un modèle temporel de l'évolution clonale d'un cancer du poumon à petites cellules
Genetic and Clonal Dissection of Murine Small Cell Lung Carcinoma Progression by Genome Sequencing
Menée à l'aide d'un modèle murin génétiquement modifié, cette étude met en évidence des anomalies génomiques dans les tumeurs primitives et les métastases, puis propose un modèle temporel de l'évolution clonale d'un cancer du poumon à petites cellules
Genetic and Clonal Dissection of Murine Small Cell Lung Carcinoma Progression by Genome Sequencing
McFadden, David G ; Papagiannakopoulos, Thales ; Taylor-Weiner, Amaro ; Stewart, Chip ; Carter, Scott L ; Cibulskis, Kristian ; Bhutkar, Arjun ; McKenna, Aaron ; Dooley, Alison ; Vernon, Amanda ; Sougnez, Carrie ; Malstrom, Scott ; Heimann, Megan ; Park, Jennifer ; Chen, Frances ; Farago, Anna F ; Dayton, Talya ; Shefler, Erica ; Gabriel, Stacey ; Getz, Gad ; Jacks, Tyler
Small cell lung carcinoma (SCLC) is a highly lethal, smoking-associated cancer with few known targetable genetic alterations. Using genome sequencing, we characterized the somatic evolution of a genetically engineered mouse model (GEMM) of SCLC initiated by loss of Trp53 and Rb1. We identified alterations in DNA copy number and complex genomic rearrangements and demonstrated a low somatic point mutation frequency in the absence of tobacco mutagens. Alterations targeting the tumor suppressor [...]
Menée sur 39 échantillons tumoraux prélevés sur des patients atteints d'un angiosarcome primitif ou secondaire, cette étude identifie des mutations fréquentes dans deux gènes, PTPRB et PLCG1, qui sont impliqués dans le processus d'angiogenèse
Recurrent PTPRB and PLCG1 mutations in angiosarcoma
Menée sur 39 échantillons tumoraux prélevés sur des patients atteints d'un angiosarcome primitif ou secondaire, cette étude identifie des mutations fréquentes dans deux gènes, PTPRB et PLCG1, qui sont impliqués dans le processus d'angiogenèse
Recurrent PTPRB and PLCG1 mutations in angiosarcoma
Behjati, Sam ; Tarpey, Patrick S. ; Sheldon, Helen ; Martincorena, Inigo ; Van Loo, Peter ; Gundem, Gunes ; Wedge, David C. ; Ramakrishna, Manasa ; Cooke, Susanna L. ; Pillay, Nischalan ; Vollan, Hans Kristian M. ; Papaemmanuil, Elli ; Koss, Hans ; Bunney, Tom D. ; Hardy, Claire ; Joseph, Olivia R. ; Martin, Sancha ; Mudie, Laura ; Butler, Adam ; Teague, Jon W. ; Patil, Meena ; Steers, Graham ; Cao, Yu ; Gumbs, Curtis ; Ingram, Davis ; Lazar, Alexander J. ; Little, Latasha ; Mahadeshwar, Harshad ; Protopopov, Alexei ; Al Sannaa, Ghadah A. ; Seth, Sahil ; Song, Xingzhi ; Tang, Jiabin ; Zhang, Jianhua ; Ravi, Vinod ; Torres, Keila E. ; Khatri, Bhavisha ; Halai, Dina ; Roxanis, Ioannis ; Baumhoer, Daniel ; Tirabosco, Roberto ; Amary, M. Fernanda ; Boshoff, Chris ; McDermott, Ultan ; Katan, Matilda ; Stratton, Michael R. ; Futreal, P. Andrew ; Flanagan, Adrienne M. ; Harris, Adrian ; Campbell, Peter J.
Angiosarcoma is an aggressive malignancy that arises spontaneously or secondarily to ionizing radiation or chronic lymphoedema. Previous work has identified aberrant angiogenesis, including occasional somatic mutations in angiogenesis signaling genes, as a key driver of angiosarcoma. Here we employed whole-genome, whole-exome and targeted sequencing to study the somatic changes underpinning primary and secondary angiosarcoma. We identified recurrent mutations in two genes, PTPRB and PLCG1, [...]
Oncogènes et suppresseurs de tumeurs (4)
Menée à l'aide de modèles murins de lymphome, cette étude met en évidence des mécanismes par lesquels, en régulant l'instabilité génomique, la kinase CDK4 joue un rôle de suppresseur de tumeurs
CDK4 deficiency promotes genomic instability and enhances Myc-driven lymphomagenesis
Menée à l'aide de modèles murins de lymphome, cette étude met en évidence des mécanismes par lesquels, en régulant l'instabilité génomique, la kinase CDK4 joue un rôle de suppresseur de tumeurs
CDK4 deficiency promotes genomic instability and enhances Myc-driven lymphomagenesis
Lu, Yuanzhi ; Wu, Yongsheng ; Feng, Xiaoling ; Shen, Rulong ; Wang, Jing H. ; Fallahi, Mohammad ; Li, Weimin ; Yang, Chunying ; Hankey, William ; Zhao, Weiqiang ; Ganju, Ramesh K. ; Li, Ming O. ; Cleveland, John L. ; Zou, Xianghong
The G1 kinase CDK4 is amplified or overexpressed in some human tumors and promotes tumorigenesis by inhibiting known tumor suppressors. Here, we report that CDK4 deficiency markedly accelerated lymphoma development in the Eμ-Myc transgenic mouse model of B lymphoma and that silencing or loss of CDK4 augmented the tumorigenic potential of Myc-driven mouse and human B cell lymphoma in transplant models. Accelerated disease in CDK4-deficient Eμ-Myc transgenic mice was associated with rampant [...]
Menée sur des lignées cellulaires et à l'aide de xénogreffes d'adénocarcinome canalaire du pancréas, cette étude met en évidence des mécanismes par lesquels, en régulant l'expression de la mucine MUC4, le micro-ARN miR-219-1-3p joue un rôle de suppresseur de tumeurs
miR-219-1-3p is a negative regulator of the mucin MUC4 expression and is a tumor suppressor in pancreatic cancer
Menée sur des lignées cellulaires et à l'aide de xénogreffes d'adénocarcinome canalaire du pancréas, cette étude met en évidence des mécanismes par lesquels, en régulant l'expression de la mucine MUC4, le micro-ARN miR-219-1-3p joue un rôle de suppresseur de tumeurs
miR-219-1-3p is a negative regulator of the mucin MUC4 expression and is a tumor suppressor in pancreatic cancer
Lahdaoui, F. ; Delpu, Y. ; Vincent, A. ; Renaud, F. ; Messager, M. ; Duchene, B. ; Leteurtre, E. ; Mariette, C. ; Torrisani, J. ; Jonckheere, N. ; Van Seuningen, I.
Pancreatic ductal adenocarcinoma (PDAC) is among the most lethal cancers in the world with one of the worst outcome. The oncogenic mucin MUC4 has been identified as an actor of pancreatic carcinogenesis as it is involved in many processes regulating pancreatic cancer cell biology. MUC4 is not expressed in healthy pancreas whereas it is expressed very early in pancreatic carcinogenesis. Targeting MUC4 in these early steps may thus appear as a promising strategy to slow-down pancreatic [...]
Menée sur des lignées cellulaires et à l'aide de xénogreffes de cancer colorectal, cette étude met en évidence une interaction épistatique entre des anomalies "gain-de-fonction" du gène Myc et des anomalies "perte-de-fonction" de gènes de la signalisation TGF-β
Masking Epistasis Between MYC and TGF-β Pathways in Antiangiogenesis-Mediated Colon Cancer Suppression
Menée sur des lignées cellulaires et à l'aide de xénogreffes de cancer colorectal, cette étude met en évidence une interaction épistatique entre des anomalies "gain-de-fonction" du gène Myc et des anomalies "perte-de-fonction" de gènes de la signalisation TGF-β
Masking Epistasis Between MYC and TGF-β Pathways in Antiangiogenesis-Mediated Colon Cancer Suppression
Dews, Michael ; Tan, Grace S. ; Hultine, Stacy ; Raman, Pichai ; Choi, Jaewoo ; Duperret, Elizabeth K. ; Lawler, Jack ; Bass, Adam ; Thomas-Tikhonenko, Andrei
Background : The c-Myc oncoprotein is activated in the majority of colorectal cancers (CRCs), whereas the TGF-β pathway is frequently affected by loss-of-function mutations, for example in SMAD2/3/4 genes. The canonical model places Myc downstream of inhibitory TGF-β signaling. However, we previously demonstrated that Myc also inhibits TGF-β signaling through the miR-17~92 microRNA cluster, raising the question about functional relationships between these two pathways. Methods : We engineered a [...]
Menée in vitro, cette étude met en évidence des mécanismes permettant d'expliquer pourquoi, lorsqu'il est muté, le gène BRCA1 favorise spécifiquement la formation de tumeurs dans des tissus régulés par les estrogènes
BRCA1 Deficiency Exacerbates Estrogen Induced DNA Damage and Genomic Instability
Menée in vitro, cette étude met en évidence des mécanismes permettant d'expliquer pourquoi, lorsqu'il est muté, le gène BRCA1 favorise spécifiquement la formation de tumeurs dans des tissus régulés par les estrogènes
BRCA1 Deficiency Exacerbates Estrogen Induced DNA Damage and Genomic Instability
Savage, Kienan I ; Matchett, Kyle B ; Barros, Eliana M ; Cooper, Kevin M ; Irwin, Gareth ; Gorski, Julia J ; Orr, Katy S ; Vohhodina, Jekaterina ; Kavanagh, Joy N ; Madden, Angelina F ; Powell, Alexander ; Manti, Lorenzo ; McDade, Simon S ; Park, Ben Ho ; Prise, Kevin M. ; McIntosh, Stuart ; Salto-Tellez, Manuel ; Richard, Derek J ; Elliot, Christopher T ; Harkin, D Paul
Germline mutations in BRCA1 predispose carriers to a high incidence of breast and ovarian cancers. BRCA1 functions to maintain genomic stability through critical roles in DNA repair, cell cycle arrest and transcriptional control. A major question has been why BRCA1 loss or mutation leads to tumors mainly in estrogen-regulated tissues, given that BRCA1 has essential functions in all cell types. Here we report that estrogen and estrogen metabolites can cause DNA double strand breaks (DSB) in [...]
Progression et métastases (5)
Menée in vitro, in vivo et à partir d'échantillons de tissu tumoral et de tissu sain prélevés sur des patients atteints d'un cancer du pancréas, cette étude met en évidence des mécanismes par lesquels une surexpression du facteur de transcription FOXM1 favorise la progression tumorale
FOXM1 Promotes the Warburg Effect and Pancreatic Cancer Progression via Transactivation of LDHA Expression
Menée in vitro, in vivo et à partir d'échantillons de tissu tumoral et de tissu sain prélevés sur des patients atteints d'un cancer du pancréas, cette étude met en évidence des mécanismes par lesquels une surexpression du facteur de transcription FOXM1 favorise la progression tumorale
FOXM1 Promotes the Warburg Effect and Pancreatic Cancer Progression via Transactivation of LDHA Expression
Cui, Jiujie ; Shi, Min ; Xie, Dacheng ; Wei, Daoyan ; Jia, Zhiliang ; Zheng, Shaojiang ; Gao, Yong ; Huang, Suyun ; Xie, Keping
Purpose:The transcription factor Forkhead box M1 (FOXM1) plays critical roles in cancer development and progression. However, the regulatory role and underlying mechanisms of FOXM1 in cancer metabolism are unknown. In this study, we characterized the regulation of aerobic glycolysis by FOXM1 and its impact on pancreatic cancer metabolism. Experimental Design:The effect of altered expression of FOXM1 on expression of glycolytic enzymes and tumor development and progression was examined using [...]
Menée in vitro et in vivo, cette étude met en évidence des mécanismes par lesquels, en modulant l'expression du micro-ARN mirR-18a, une augmentation de la raideur mécanique de la matrice extracellulaire favorise la progression d'un cancer du sein
Tissue mechanics modulate microRNA-dependent PTEN expression to regulate malignant progression
Menée in vitro et in vivo, cette étude met en évidence des mécanismes par lesquels, en modulant l'expression du micro-ARN mirR-18a, une augmentation de la raideur mécanique de la matrice extracellulaire favorise la progression d'un cancer du sein
Tissue mechanics modulate microRNA-dependent PTEN expression to regulate malignant progression
Mouw, Janna K. ; Yui, Yoshihiro ; Damiano, Laura ; Bainer, Russell O. ; Lakins, Johnathon N. ; Acerbi, Irene ; Ou, Guanqing ; Wijekoon, Amanda C. ; Levental, Kandice R. ; Gilbert, Penney M. ; Hwang, E. Shelley ; Chen, Yunn-Yi ; Weaver, Valerie M.
Tissue mechanics regulate development and homeostasis and are consistently modified in tumor progression. Nevertheless, the fundamental molecular mechanisms through which altered mechanics regulate tissue behavior and the clinical relevance of these changes remain unclear. We demonstrate that increased matrix stiffness modulates microRNA expression to drive tumor progression through integrin activation of [beta]-catenin and MYC. Specifically, in human and mouse tissue, increased matrix [...]
Menée in vitro, cette étude met en évidence des mécanismes par lesquels, en régulant l'expression de GIT1, le micro-ARN miR-149 réprime les processus invasif et métastatique d'un cancer du sein
MicroRNA-149 targets GIT1 to suppress integrin signaling and breast cancer metastasis
Menée in vitro, cette étude met en évidence des mécanismes par lesquels, en régulant l'expression de GIT1, le micro-ARN miR-149 réprime les processus invasif et métastatique d'un cancer du sein
MicroRNA-149 targets GIT1 to suppress integrin signaling and breast cancer metastasis
Chan, S. H. ; Huang, W. C. ; Chang, J. W. ; Chang, K. J. ; Kuo, W. H. ; Wang, M. Y. ; Lin, K. Y. ; Uen, Y. H. ; Hou, M. F. ; Lin, C. M. ; Jang, T. H. ; Tu, C. W. ; Lee, Y. R. ; Lee, Y. H. ; Tien, M. T. ; Wang, L. H.
Metastasis is the predominant cause of death in breast cancer patients. Several lines of evidence have shown that microRNAs (miRs) can have an important role in cancer metastasis. Using isogenic pairs of low and high metastatic lines derived from a human breast cancer line, we have identified miR-149 to be a suppressor of breast cancer cell invasion and metastasis. We also identified GIT1 (G-protein-coupled receptor kinase-interacting protein 1) as a direct target of miR-149. Knockdown of GIT1 [...]
Menée à l'aide d'un modèle murin et sur neuf patientes atteintes d'un cancer du sein avec métastases cérébrales, cette étude met en évidence des mécanismes par lesquels la protéine COX-2 favorise la dissémination de cellules tumorales dans le sang périphérique et le liquide céphalo-rachidien
COX-2 drives metastatic breast cells from brain lesions into the cerebrospinal fluid and systemic circulation
Menée à l'aide d'un modèle murin et sur neuf patientes atteintes d'un cancer du sein avec métastases cérébrales, cette étude met en évidence des mécanismes par lesquels la protéine COX-2 favorise la dissémination de cellules tumorales dans le sang périphérique et le liquide céphalo-rachidien
COX-2 drives metastatic breast cells from brain lesions into the cerebrospinal fluid and systemic circulation
Allen, Joshua E. ; Patel, Akshal ; Prabhu, Varun V ; Dicker, David T ; Sheehan, Jonas M. ; Glantz, Michael ; El-Deiry, Wafik S.
Breast cancer is among the most common malignancies that metastasize to the brain, with 15-20% of metastatic breast cancer patients eventually developing brain metastases. We previously reported a method to enumerate tumor cells in the cerebrospinal fluid (CSF) of breast cancer patients with central nervous system (CNS) metastases, a setting that lacks sufficiently informative biomarkers. Here we show that breast cancer cells can spontaneously disseminate into the CSF from brain lesions in mice [...]
Menée sur 367 patientes atteintes d'un cancer du col de l'utérus, cette étude prospective analyse l'association entre des étapes de l'organogenèse du col utérin et la progression locorégionale de la maladie
Refining insight into cervical cancer progression
Menée sur 367 patientes atteintes d'un cancer du col de l'utérus, cette étude prospective analyse l'association entre des étapes de l'organogenèse du col utérin et la progression locorégionale de la maladie
Refining insight into cervical cancer progression
Sakuragi, Noriaki
To cut or not to cut: this is the dilemma faced by cancer surgeons. The aim of cancer surgery is to remove the tumour with sufficient margins so that no residual cancer cells remain that could lead to recurrence. Simultaneously, surgery should not be so extensive that it damages the physiological function of organs surrounding the tumour...
Association between developmental steps in the organogenesis of the uterine cervix and locoregional progression of cervical cancer: a prospective c...
Menée sur 367 patientes atteintes d'un cancer du col de l'utérus, cette étude prospective analyse l'association entre des étapes de l'organogenèse du col utérin et la progression locorégionale de la maladie
Association between developmental steps in the organogenesis of the uterine cervix and locoregional progression of cervical cancer: a prospective clinicopathological analysis
Höckel, Michael ; Hentschel, Bettina ; Horn, Lars-Christian
Background : Our previous work provided evidence that early cervical cancer is locally confined to the Müllerian compartment that develops in women from the embryonic paramesonephric-mesonephric complex. We aimed to investigate if the concept of tumour permeation within ontogenetic domains is also valid for tumour progression and advanced disease. Methods : Starting from Carnegie stage 13, four successive steps in the organogenesis of the human uterine cervix were defined and an ontogenetic [...]