Menée à l'aide de lignées cellulaires, de modèles murins, d'échantillons tumoraux issus de patients atteints d'un carcinome hépatocellulaire et de données du projet "The Cancer Genome Atlas", cette étude met en évidence un mécanisme par lequel l'activation du récepteur NOD1 des macrophages associés à la tumeur augmente l'immunité antitumorale induite par les lymphocytes T CD8+

Activation of NOD1 on tumor-associated macrophages augments CD8+ T cell–mediated antitumor immunity in hepatocellular carcinoma

Zhang, Feng ; Jiang, Qiuyu ; Cai, Jialiang ; Meng, Fansheng ; Tang, Wenqing ; Liu, Zhiyong ; Lin, Xiahui ; Liu, Wenfeng ; Zhou, Yi ; Shen, Xizhong ; Xue, Ruyi ; Dong, Ling ; Zhang, Si

The efficacy of immunotherapy targeting the PD-1/PD-L1 pathway in hepatocellular carcinoma (HCC) is limited. NOD-like receptors (NLRs) comprise a highly evolutionarily conserved family of cytosolic bacterial sensors, yet their impact on antitumor immunity against HCC remains unclear. In this study, we uncovered that NOD1, a well-studied member of NLR family, exhibits predominant expression in tumor-associated macrophages (TAMs) and correlates positively with improved prognosis and responses to [...]

Menée à l'aide de lignées cellulaires, de modèles murins et d'échantillons de carcinomes oesophagiens à petites cellules d'origine humaine, cette étude met en évidence un mécanisme par lequel la régulation épigénétique du facteur de transcription p63 détermine le devenir des cellules de l'oesophage durant son développement ou la progression tumorale

Epigenetic regulation of p63 blocks squamous-to-neuroendocrine transdifferentiation in esophageal development and malignancy

Zhang, Yongchun ; Karagiannis, Dimitris ; Liu, Helu ; Lin, Mi ; Fang, Yinshan ; Jiang, Ming ; Chen, Xiao ; Suresh, Supriya ; Huang, Haidi ; She, Junjun ; Shi, Feiyu ; Liu, Jiangying ; Luo, Dan ; Angel, J. Carlos ; Lin, Guangtan ; Yang, Patrick ; El-Rifai, Wael ; Zaika, Alexander ; Oro, Anthony E. ; Liu, Kuancan ; Rustgi, Anil K. ; Wang, Timothy C. ; Lu, Chao ; Que, Jianwen

While cell fate determination and maintenance are important in establishing and preserving tissue identity and function during development, aberrant cell fate transition leads to cancer cell heterogeneity and resistance to treatment. Here, we report an unexpected role for the transcription factor p63 (Trp63/TP63) in the fate choice of the squamous versus neuroendocrine lineage in esophageal development and malignancy. Deletion of p63 results in extensive neuroendocrine differentiation in the [...]

Menée à l'aide de lignées cellulaires, d'organoïdes, de modèles murins et de xénogreffes dérivées de tumeurs de patients, cette étude met en évidence le rôle de la pentraxine neurale NPTXI, une protéine sécrétée par les cellules cancéreuses du pancréas, dans la colonisation métastatique et la rétention nucléaire de la protéine HIF1alpha

A Targetable Secreted Neural Protein Drives Pancreatic Cancer Metastatic Colonization and HIF1α Nuclear Retention

Yamaguchi, Norihiro ; Wu, Y. Gloria ; Ravetch, Ethan ; Takahashi, Mai ; Khan, Abdul G. ; Hayashi, Akimasa ; Mei, Wenbin ; Hsu, Dennis ; Umeda, Shigeaki ; de Stanchina, Elisa ; Lorenz, Ivo C. ; Iacobuzio-Donahue, Christine A. ; Tavazoie, Sohail F.

Pancreatic ductal adenocarcinoma (PDAC) is an increasingly diagnosed cancer that kills 90% of afflicted patients, with most patients receiving palliative chemotherapy. We identified neuronal pentraxin 1 (NPTX1) as a cancer-secreted protein that becomes overexpressed in human and murine PDAC cells during metastatic progression and identified adhesion molecule with Ig-like domain 2 (AMIGO2) as its receptor. Molecular, genetic, biochemical, and pharmacologic experiments revealed that secreted [...]

Cet article présente un outil permettant, à partir de données de séquençage, d'identifier avec précision des mutations spécifiques d'allèles de gènes HLA de classe I et d'examiner la perte d'hétérozygotie, l'expression allélique, la répression allélique et l'épissage alternatif de ces gènes

MHC Hammer reveals genetic and non-genetic HLA disruption in cancer evolution

Puttick, Clare ; Jones, Thomas P. ; Leung, Michelle M. ; Galvez-Cancino, Felipe ; Liu, Jiali ; Varas-Godoy, Manuel ; Rowan, Andrew ; Pich, Oriol ; Martínez-Ruiz, Carlos ; Bentham, Robert ; Dijkstra, Krijn K. ; Black, James R. M. ; Rosenthal, Rachel ; Kanu, Nnennaya ; Litchfield, Kevin ; Salgado, Roberto ; Moore, David A. ; Van Loo, Peter ; Jamal-Hanjani, Mariam ; Quezada, Sergio A. ; Cheyne, Heather ; Khalil, Mohammed ; Richardson, Shirley ; Cruickshank, Tracey ; Lim, Eric ; Aerts, Hugo J. W. L. ; Kaufmann, Tom L. ; Huska, Matthew R. ; Naidu, Babu ; Wilson, Gareth A. ; Bailey, Chris ; Lee, Claudia ; Colliver, Emma ; Enfield, Katey S. S. ; Hill, Mark S. ; Angelova, Mihaela ; Biswas, Dhruva ; Vendramin, Roberto ; Murphy, Cian ; Zagorulya, Maria ; McGranahan, Nicholas ; Castignani, Carla ; Cadieux, Elizabeth Larose ; Kittel, Jeanette ; Haase, Kerstin ; Koh, Kexin ; Scott, Rachel ; Matharu, Gurdeep ; Shaw, Jacqui A. ; Hackshaw, Allan ; Pilotti, Camilla ; Leslie, Rachel ; Hacker, Anne-Marie ; Smith, Sean ; Walker, Aoife ; Abbosh, Christopher ; Richard, Corentin ; Naceur-Lombardelli, Cristina ; Gimeno-Valiente, Francisco ; Thakkar, Krupa ; Sunderland, Mariana Werner ; Sivakumar, Monica ; Usaite, Ieva ; Saghafinia, Sadegh ; Veeriah, Selvaraju ; Vanloo, Sharon ; Mussa, Bushra ; Magala, Michalina ; Keene, Elizabeth ; Lim, Emilia L. ; Black, James R. sM ; Bakir, Maise Al ; Huebner, Ariana ; Grigoriadis, Kristiana ; Karasaki, Takahiro ; Frankell, Alexander M. ; Hiley, Crispin T. ; Ward, Sophia ; Harries, Sian ; Lucas, Olivia ; Birkbak, Nicolai J. ; Thol, Kerstin ; Liu, Wing Kin ; Bunkum, Abigail ; Hessey, Sonya ; Forster, Martin D. ; Lee, Siow Ming ; Karagianni, Despoina ; Bola, Supreet Kaur ; Swanton, Charles ; Le Quesne, John ; AbdulJabbar, Khalid ; Veiga, Catarina ; Zaccaria, Simone ; Tugwood, Jonathan ; Dive, Caroline ; Szallasi, Zoltan ; Diossy, Miklos ; Marafioti, Teresa ; Borg, Elaine ; Falzon, Mary ; Khiroya, Reena ; Peggs, Karl S. ; Price, Gillian ; Royle, Gary ; Collins-Fekete, Charles-Antoine ; Papadatos-Pastos, Dionysis ; Wilson, James ; Ahmad, Tanya ; Benafif, Sarah ; Cave, Judith ; Kerr, Keith M. ; Watkins, Thomas B. K. ; Procter, Alexander James ; Ahmed, Asia ; Taylor, Magali N. ; Nair, Arjun ; Lawrence, David ; Patrini, Davide ; Lindsay, Colin R. ; Blackhall, Fiona H. ; Summers, Yvonne ; Krebs, Matthew G. ; Nye, Emma ; Stone, Richard Kevin ; Zhang, Hanyun ; Nicod, Jerome ; Kirk, Alan ; Asif, Mo ; Bilancia, Rocco ; Kostoulas, Nikos ; Whiteley, Jennifer ; Thomas, Mathew ; Patel, Akshay J. ; Chuter, David ; MacKenzie, Mairead ; Schwarz, Roland F. ; Kidd, Andrew ; Fraioli, Francesco ; Ashford, Paul ; Kaplar, Zoltan ; Demeulemeester, Jonas ; Wilson, Claire ; Shackcloth, Michael J. ; Janes, Sam M. ; Navani, Neal ; Thakrar, Ricky M. ; Leek, Angela ; Hodgkinson, Jack Davies ; Totton, Nicola ; Paiva-Correia, Antonio ; Beck, Stephan ; Tanić, Miljana ; Dick, Craig ; Robinson, Lily ; Russell, Peter ; De Sousa, Paulo ; Jordan, Simon ; Rice, Alexandra ; Raubenheimer, Hilgardt ; Bhayani, Harshil ; Ambrose, Lyn ; Devaraj, Anand ; Chavan, Hemangi ; Begum, Sofina ; Buderi, Silviu I. ; Kaniu, Daniel ; Malima, Mpho ; Booth, Sarah ; Fernandes, Nadia ; Shah, Pratibha ; Proli, Chiara ; Nicholson, Andrew G. ; Boleti, Ekaterini ; Hewish, Madeleine ; Blyth, Kevin G. ; Lester, Jason F. ; Chaturvedi, Anshuman ; Oliveira, Pedro ; Brown, Katherine D. ; Carter, Mathew ; Magness, Alastair ; Weeden, Clare E. ; Grönroos, Eva ; Goldman, Jacki ; Escudero, Mickael ; Hobson, Philip ; Boeing, Stefan ; Denner, Tamara ; Barbè, Vittorio ; Lu, Wei-Ting ; Hill, William ; Naito, Yutaka ; Ramsden, Zoe ; Kassiotis, George ; Noorani, Imran ; Grapa, Anca ; Alzetani, Aiman ; Yuan, Yinyin ; Pan, Xiaoxi ; French, Jack ; Gilbert, Kayleigh ; Dwornik, Angela ; Karamani, Angeliki ; Chain, Benny ; Pearce, David R. ; Gálvez-Cancino, Felip ; Stavrou, Georgia ; Mastrokalos, Gerasimos-Theodoros ; Lowe, Helen L. ; Matos, Ignacio Garcia ; Reading, James L. ; Hartley, John A. ; Selvaraju, Kayalvizhi ; Chen, Kezhong ; Ensell, Leah ; Shah, Mansi ; Litovchenko, Maria ; Pawlik, Piotr ; Gamble, Samuel ; Ung, Seng Kuong Anakin ; Spanswick, Victoria ; Wu, Yin ; Rane, Jayant K. ; Al-Sawaf, Othman ; Chervova, Olga ; Hoogenboom, Emilie Martinoni ; Monk, Fleur ; Holding, James W. ; Choudhary, Junaid ; Bhakhri, Kunal ; Gorman, Pat ; Stephens, Robert C. M. ; Pisciella, Maria Chiara ; Bandula, Steve ; Wong, Yien Ning Sophia ; Osman, Aya ; Sangha, Mandeesh ; Langman, Gerald ; Shackleford, Helen ; Djearaman, Madava ; Middleton, Gary ; Chee, Serena ; Georg, Patricia ; Bajaj, Amrita ; Nakas, Apostolos ; Sodha-Ramdeen, Azmina ; Tufail, Mohamad ; Scotland, Molly ; Boyles, Rebecca ; Rathinam, Sridhar ; Marrone, Domenic ; Dulloo, Sean ; Fennell, Dean A. ; Danson, Sarah ; Smith, Elaine ; Fontaine, Eustace ; Granato, Felice ; Novasio, Juliette ; Rammohan, Kendadai ; Joseph, Leena ; Bishop, Paul ; Shah, Rajesh ; Joshi, Vijay ; Crosbie, Philip ; T. RACERx Consortium

Disruption of the class I human leukocyte antigen (HLA) molecules has important implications for immune evasion and tumor evolution. We developed major histocompatibility complex loss of heterozygosity (LOH), allele-specific mutation and measurement of expression and repression (MHC Hammer). We identified extensive variability in HLA allelic expression and pervasive HLA alternative splicing in normal lung and breast tissue. In lung TRACERx and lung and breast TCGA cohorts, 61% of lung [...]

A partir de l'analyse de 91 adénocarcinomes canalaires du pancréas, cette étude examine les caractéristiques génomiques, la philogénie et la composition clonale de ce type de tumeur en fonction de données clinicopathologiques

The Evolutionary Forest of Pancreatic Cancer

Mullen, Katelyn M. ; Hong, Jungeui ; Attiyeh, Marc A. ; Hayashi, Akimasa ; Sakamoto, Hitomi ; Kohutek, Zachary A. ; McIntyre, Caitlin A. ; Zhang, Haochen ; Makohon-Moore, Alvin P. ; Zucker, Amanda ; Wood, Laura D. ; Myers, Matthew A. ; Arnold, Brian J. ; Zaccaria, Simone ; Chou, Joanne F. ; Capanu, Marinela ; Socci, Nicholas D. ; Raphael, Benjamin J. ; Iacobuzio-Donahue, Christine A.

The genomic features of pancreatic ductal adenocarcinoma (PDAC) have been well described, yet the evolutionary contexts within which those features occur remains unexplored. We studied the genome landscapes, phylogenies and clonal compositions of 91 PDACs in relation to clinicopathologic features. There was no difference in the number of driver mutations or the evolutionary timing that each mutation occurred. High truncal density, a metric of the accumulation of somatic mutations in the lineage [...]

A partir d'échantillons biopsiques prélevés sur 80 patients atteints d'un cancer du poumon non à petites cellules traité par nivolumab, cette étude examine les caractéristiques immunogènes des néo-antigènes ainsi que l'évolution du microenvironnement tumoral durant le traitement

Neoantigen immunogenicity landscapes and evolution of tumor ecosystems during immunotherapy with nivolumab

Alban, Tyler J. ; Riaz, Nadeem ; Parthasarathy, Prerana ; Makarov, Vladimir ; Kendall, Sviatoslav ; Yoo, Seong-Keun ; Shah, Rachna ; Weinhold, Nils ; Srivastava, Raghvendra ; Ma, Xiaoxiao ; Krishna, Chirag ; Mok, Juk Yee ; van Esch, Wim J. E. ; Garon, Edward ; Akerley, Wallace ; Creelan, Benjamin ; Aanur, Nivedita ; Chowell, Diego ; Geese, William J. ; Rizvi, Naiyer A. ; Chan, Timothy A.

Neoantigen immunoediting drives immune checkpoint blockade efficacy, yet the molecular features of neoantigens and how neoantigen immunogenicity shapes treatment response remain poorly understood. To address these questions, 80 patients with non-small cell lung cancer were enrolled in the biomarker cohort of CheckMate 153 (CA209-153), which collected radiographic guided biopsy samples before treatment and during treatment with nivolumab. Early loss of mutations and neoantigens during therapy [...]

Menée à l'aide notamment de modèles murins modifiés génétiquement, cette étude met en évidence un mécanisme par lequel l'histone désacétylase 3 réprime le recrutement des lymphocytes T dans les tumeurs pulmonaires avec mutation du gène Kras

Transcriptional repression by HDAC3 mediates T cell exclusion from Kras mutant lung tumors

McGuire, Caroline K. ; Meehan, Ambryn S. ; Couser, Evan ; Bull, Lois ; Minor, Allegra C. ; Kuhlmann-Hogan, Alexandra ; Kaech, Susan M. ; Shaw, Reuben J. ; Eichner, Lillian J.

Lung cancer is the leading cause of cancer-related death in the United States, and KRAS is the most frequently mutated oncogene in lung cancer. However, KRAS mutant lung tumors acquire resistance to standard-of-care therapies, and improved understanding of the underlying tumor biology is warranted in order to improve therapeutic options for this patient population. We found that HDAC3 restrains a gene expression program in lung cancer cells that is functionally linked to T cell recruitment. [...]

Menée à partir de l'analyse par immunohistochimie et double hybridation in situ de 806 échantillons de tumeurs de l'endomètre récidivantes, métastatiques ou à haut risque de récidive, cette étude examine le statut HER2 de ces tumeurs en fonction de leurs caractéristiques cliniques et moléculaires

Clinical and Molecular Characteristics of High-Risk, Recurrent, or Metastatic Endometrial Cancer That Is Human Epidermal Growth Factor Receptor 2–Low

Dione van Dijk ; Lisa Vermij ; Alicia León-Castillo ; Melanie Powell ; Jan Jobsen ; Alexandra Leary ; David Bowes ; Linda Mileshkin ; Catherine Genestie ; Ina Jürgenliemk-Schulz ; Cor de Kroon ; Cathelijne Post ; Stephanie de Boer ; Linda Nooij ; Judith Kroep ; Carien Creutzberg ; Vincent Smit ; Nanda Horeweg ; Tjalling Bosse ; Anneke Westermann

Purpose : Recent success of human epidermal growth factor receptor 2 (HER2)–targeted antibody-drug-conjugate trastuzumab-deruxtecan in HER2-low and HER2-positive tumors has sparked interest in examining the HER2 status of tumors not traditionally associated with HER2 amplification. Despite the increasing number of systemic treatment options, patients with advanced endometrial cancer (EC) still face a poor prognosis. This study evaluates HER2-low status in over 800 EC, correlating HER2 with both [...]