Nota Bene Cancer
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Sommaire du n° 349 du 11 septembre 2017
Aberrations chromosomiques (2)
A partir d'échantillons tumoraux prélevés sur des chiens atteints d'un cancer (lymphome, sarcome ou gliome), cette étude française identifie des fusions de gènes analogues à celles observées dans les tumeurs humaines correspondantes
Discovery of human-similar gene fusions in canine cancers
A partir d'échantillons tumoraux prélevés sur des chiens atteints d'un cancer (lymphome, sarcome ou gliome), cette étude française identifie des fusions de gènes analogues à celles observées dans les tumeurs humaines correspondantes
Discovery of human-similar gene fusions in canine cancers
Ulvé, Ronan ; Rault, Mélanie ; Bahin, Mathieu ; Lagoutte, Laetitia ; Abadie, Jérôme ; De Brito, Clotilde ; Coindre, Jean-Michel ; Botherel, Nadine ; Rousseau, Audrey ; Wucher, Valentin ; Cadieu, Edouard ; Thieblemont, Catherine ; Hitte, Christophe ; Cornevin, Laurence ; Cabillic, Florian ; Bachelot, Laura ; Gilot, David ; Hennuy, Benoit ; Guillaudeux, Thierry ; Le Goff, Arnaud ; Derrien, Thomas ; Hédan, Benoit ; André, Catherine
Canine cancers represent a tremendous natural resource due to their incidence and striking similarities to human cancers, sharing similar clinical and pathological features as well as oncogenic events including identical somatic mutations. Considering the importance of gene fusions as driver alterations, we explored their relevance in canine cancers. We focused on three distinct human-comparable canine cancers representing different tissues and embryonic origins. Through RNA-Seq, we discovered [...]
A partir d'échantillons prélevés sur 415 patients atteints d'une leucémie myéloïde aiguë, puis menée in vitro et in vivo, cette étude met en évidence des mécanismes par lesquels, en lien avec des anomalies d'expression du gène RUNX1, des mutations du gène de l'histone 3 favorisent le développement de la maladie
H3K27M/I mutations promote context-dependent transformation in acute myeloid leukemia with RUNX1 alterations
A partir d'échantillons prélevés sur 415 patients atteints d'une leucémie myéloïde aiguë, puis menée in vitro et in vivo, cette étude met en évidence des mécanismes par lesquels, en lien avec des anomalies d'expression du gène RUNX1, des mutations du gène de l'histone 3 favorisent le développement de la maladie
H3K27M/I mutations promote context-dependent transformation in acute myeloid leukemia with RUNX1 alterations
Lehnertz, Bernhard ; Zhang, Yu Wei ; Boivin, Isabel ; Mayotte, Nadine ; Tomellini, Elisa ; Chagraoui, Jalila ; Lavallée, Vincent-Philippe ; Hébert, Josée ; Sauvageau, Guy
First characterization of neomorphic H3K27 mutations in AML.H3K27 mutations associate and collaborate with RUNX1 mutations and translocations. Neomorphic missense mutations affecting crucial lysine residues in histone H3 genes significantly contribute to a variety of solid cancers. Despite the high prevalence of H3K27M mutations in pediatric glioblastoma and their well-established impact on global histone H3 lysine 27 di and trimethylation (H3K27me2/3), the relevance of these mutations has not [...]
Oncogènes et suppresseurs de tumeurs (4)
Menée à l'aide de modèles murins de leucémie, cette étude met en évidence des mécanismes par lesquels, en s'accumulant à l'intérieur des cellules souches hématopoïétiques, l'ascorbate (vitamine C) favorise l'expression d'une protéine suppresseur de tumeurs (Tet2) et limite le développement de la maladie
Ascorbate regulates haematopoietic stem cell function and leukaemogenesis
Menée à l'aide de modèles murins de leucémie, cette étude met en évidence des mécanismes par lesquels, en s'accumulant à l'intérieur des cellules souches hématopoïétiques, l'ascorbate (vitamine C) favorise l'expression d'une protéine suppresseur de tumeurs (Tet2) et limite le développement de la maladie
Ascorbate regulates haematopoietic stem cell function and leukaemogenesis
Agathocleous, Michalis ; Meacham, Corbin E. ; Burgess, Rebecca J. ; Piskounova, Elena ; Zhao, Zhiyu ; Crane, Genevieve M. ; Cowin, Brianna L. ; Bruner, Emily ; Murphy, Malea M. ; Chen, Weina ; Spangrude, Gerald J. ; Hu, Zeping ; DeBerardinis, Ralph J. ; Morrison, Sean J.
Stem cell fate can be influenced by metabolite levels in culture but it is unknown whether physiological variations in metabolite levels in normal tissues regulate stem cell function in vivo. We developed a metabolomics method for analysis of rare cell populations isolated directly from tissues and used it to compare haematopoietic stem cells (HSCs) to restricted haematopoietic progenitors. Each haematopoietic cell type had a distinct metabolic signature. Human and mouse HSCs had unusually high [...]
Leukaemia: Vitamin C regulates stem cells and cancer
Menée à l'aide de modèles murins de leucémie, cette étude met en évidence des mécanismes par lesquels, en s'accumulant à l'intérieur des cellules souches hématopoïétiques, l'ascorbate (vitamine C) favorise l'expression d'une protéine suppresseur de tumeurs (Tet2) et limite le développement de la maladie
Leukaemia: Vitamin C regulates stem cells and cancer
Miller, Peter G. ; Ebert, Benjamin L.
It emerges that high levels of vitamin C in blood-forming stem cells influence the number and function of the cells and affect the development of leukaemia, through binding to a tumour-suppressor protein, Tet2.
Menée in vitro et in vivo sur des modèles de leucémie, cette étude met en évidence des mécanismes par lesquels une surexpression du récepteur FFAR2 réduit la prolifération des cellules cancéreuses
Ffar2 expression regulates leukaemic cell growth in vivo
Menée in vitro et in vivo sur des modèles de leucémie, cette étude met en évidence des mécanismes par lesquels une surexpression du récepteur FFAR2 réduit la prolifération des cellules cancéreuses
Ffar2 expression regulates leukaemic cell growth in vivo
Bindels, Laure B. ; Porporato, Paolo E. ; Ducastel, Sarah ; Sboarina, Martina ; Neyrinck, Audrey M. ; Dewulf, Evelyne M. ; Feron, Olivier ; Lestavel, Sophie ; Cani, Patrice D. ; Staels, Bart ; Sonveaux, Pierre ; Delzenne, Nathalie M.
Background: Activation of free fatty acid receptor 2 (FFAR2) by microbiota-derived metabolites (e.g., propionate) reduces leukaemic cell proliferation in vitro. This study aims to test whether Ffar2 expression per se also influences leukaemia cell growth in vivo. Methods: Bcr-Abl-expressing BaF cells were used as a leukaemia model and the role of Ffar2 was evaluated in Balb/c mice after lentiviral shRNA transduction. Results: Our data formally establish that reduced leukaemic cell proliferation [...]
A partir d'échantillons prélevés sur des patients appartenant à six familles affectées par un carcinome basocellulaire, puis menée in vitro et in vivo, cette étude met en évidence des mécanismes par lesquels la protéine ACTRT1 exerce une fonction de suppresseur de tumeurs
Mutations in ACTRT1 and its enhancer RNA elements lead to aberrant activation of Hedgehog signaling in inherited and sporadic basal cell carcinomas
A partir d'échantillons prélevés sur des patients appartenant à six familles affectées par un carcinome basocellulaire, puis menée in vitro et in vivo, cette étude met en évidence des mécanismes par lesquels la protéine ACTRT1 exerce une fonction de suppresseur de tumeurs
Mutations in ACTRT1 and its enhancer RNA elements lead to aberrant activation of Hedgehog signaling in inherited and sporadic basal cell carcinomas
Bal, Elodie ; Park, Hyun-Sook ; Belaid-Choucair, Zakia ; Kayserili, Hulya ; Naville, Magali ; Madrange, Marine ; Chiticariu, Elena ; Hadj-Rabia, Smail ; Cagnard, Nicolas ; Kuonen, Francois ; Bachmann, Daniel ; Huber, Marcel ; Le Gall, Cindy ; Cote, Francine ; Hanein, Sylvain ; Rosti, Rasim Ozgur ; Aslanger, Ayca Dilruba ; Waisfisz, Quinten ; Bodemer, Christine ; Hermine, Olivier ; Morice-Picard, Fanny ; Labeille, Bruno ; Caux, Frederic ; Mazereeuw-Hautier, Juliette ; Philip, Nicole ; Levy, Nicolas ; Taieb, Alain ; Avril, Marie-Françoise ; Headon, Denis J. ; Gyapay, Gabor ; Magnaldo, Thierry ; Fraitag, Sylvie ; Crollius, Hugues Roest ; Vabres, Pierre ; Hohl, Daniel ; Munnich, Arnold ; Smahi, Asma
Basal cell carcinoma (BCC), the most common human cancer, results from aberrant activation of the Hedgehog signaling pathway. Although most cases of BCC are sporadic, some forms are inherited, such as Bazex–Dupré–Christol syndrome (BDCS)—a cancer-prone genodermatosis with an X-linked, dominant inheritance pattern. We have identified mutations in the ACTRT1 gene, which encodes actin-related protein T1 (ARP-T1), in two of the six families with BDCS that were examined in this study. [...]
Menée sur des lignées cellulaires de cancer colorectal et à l'aide de xénogreffes, cette étude met en évidence des mécanismes par lesquels, via la régulation du niveau d'expression de p53, un long ARN non codant (PURPL) favorise la tumorigenèse
Long Noncoding RNA PURPL Suppresses Basal p53 Levels and Promotes Tumorigenicity in Colorectal Cancer
Menée sur des lignées cellulaires de cancer colorectal et à l'aide de xénogreffes, cette étude met en évidence des mécanismes par lesquels, via la régulation du niveau d'expression de p53, un long ARN non codant (PURPL) favorise la tumorigenèse
Long Noncoding RNA PURPL Suppresses Basal p53 Levels and Promotes Tumorigenicity in Colorectal Cancer
Li, Xiao Ling ; Subramanian, Murugan ; Jones, Matthew F. ; Chaudhary, Ritu ; Singh, Deepak K. ; Zong, Xinying ; Gryder, Berkley ; Sindri, Sivasish ; Mo, Min ; Schetter, Aaron ; Wen, Xinyu ; Parvathaneni, Swetha ; Kazandjian, Dickran ; Jenkins, Lisa M. ; Tang, Wei ; Elloumi, Fathi ; Martindale, Jennifer L. ; Huarte, Maite ; Zhu, Yuelin ; Robles, Ana I. ; Frier, Susan M. ; Rigo, Frank ; Cam, Maggie ; Ambs, Stefan ; Sharma, Sudha ; Harris, Curtis C. ; Dasso, Mary ; Prasanth, Kannanganattu V. ; Lal, Ashish
Basal p53 levels are tightly suppressed under normal conditions. Disrupting this regulation results in elevated p53 levels to induce cell cycle arrest, apoptosis, and tumor suppression. Here, we report the suppression of basal p53 levels by a nuclear, p53-regulated long noncoding RNA that we termed PURPL (p53 upregulated regulator of p53 levels). Targeted depletion of PURPL in colorectal cancer cells results in elevated basal p53 levels and induces growth defects in cell culture and in mouse [...]
Progression et métastases (2)
Menée in vitro et in vivo sur des modèles de cancer de l'estomac, cette étude met en évidence des mécanismes par lesquels, en inhibant le métabolisme des lymphocytes T CD8+, la voie de signalisation CD155T/TIGIT favorise la progression tumorale
CD155T/TIGIT Signaling Regulates CD8+ T Cell Metabolism and Promotes Tumor Progression in Human Gastric Cancer
Menée in vitro et in vivo sur des modèles de cancer de l'estomac, cette étude met en évidence des mécanismes par lesquels, en inhibant le métabolisme des lymphocytes T CD8+, la voie de signalisation CD155T/TIGIT favorise la progression tumorale
CD155T/TIGIT Signaling Regulates CD8+ T Cell Metabolism and Promotes Tumor Progression in Human Gastric Cancer
He, Wei-ling ; Zhang, Hui ; Han, Fei ; Chen, Xin-lin ; Lin, Run ; Wang, Wei ; Qiu, Hai-Bo ; Zhuang, Zhenhong ; Liao, Qi ; Zhang, Weijing ; Cai, Qinbo ; Cui, Yongmei ; Jiang, Wenting ; Wang, Han ; Ke, Zunfu
The T cell surface molecule TIGIT is an immune checkpoint molecule that inhibits T cell responses, but its roles in cancer are little understood. In this study, we evaluated the role TIGIT checkpoint plays in the development and progression of gastric cancer (GC). We show that the percentage of CD8 T cells that are TIGIT+ was increased in GC patients compared to healthy individuals. These cells showed functional exhaustion with impaired activation, proliferation, cytokine production and [...]
Menée à l'aide de modèles animaux de neuroblastome (poissons-zèbres), cette étude met en évidence des mécanismes par lesquels, en synergie avec la protéine MYCN, le co-facteur transcriptionnel LMO1 exerce une fonction d'oncogène et favorise le processus métastatique
LMO1 Synergizes with MYCN to Promote Neuroblastoma Initiation and Metastasis
Menée à l'aide de modèles animaux de neuroblastome (poissons-zèbres), cette étude met en évidence des mécanismes par lesquels, en synergie avec la protéine MYCN, le co-facteur transcriptionnel LMO1 exerce une fonction d'oncogène et favorise le processus métastatique
LMO1 Synergizes with MYCN to Promote Neuroblastoma Initiation and Metastasis
Zhu, Shizhen ; Zhang, Xiaoling ; Weichert-Leahey, Nina ; Dong, Zhiwei ; Zhang, Cheng ; Lopez, Gonzalo ; Tao, Ting ; He, Shuning ; Wood, Andrew C. ; Oldridge, Derek ; Ung, Choong Yong ; van Ree, Janine H. ; Khan, Amish ; Salazar, Brittany M. ; Lummertz da Rocha, Edroaldo ; Zimmerman, Mark W. ; Guo, Feng ; Cao, Hong ; Hou, Xiaonan ; Weroha, S. John ; Perez-Atayde, Antonio R. ; Neuberg, Donna S. ; Meves, Alexander ; McNiven, Mark A. ; van Deursen, Jan M. ; Li, Hu ; Maris, John M. ; Look, A. Thomas
A genome-wide association study identified LMO1, which encodes an LIM-domain-only transcriptional cofactor, as a neuroblastoma susceptibility gene that functions as an oncogene in high-risk neuroblastoma. Here we show that d?h promoter-mediated expression of LMO1 in zebrafish synergizes with MYCN to increase the proliferation of hyperplastic sympathoadrenal precursor cells, leading to a reduced latency and increased penetrance of neuroblastomagenesis. The transgenic expression of LMO1 also [...]
Ressources et infrastructures (Biologie) (2)
A partir de données portant sur 540 génomes et transcriptomes tumoraux issus de l'analyse d'échantillons prélevés sur des patients pédiatriques atteints d'un cancer, cette étude dresse le catalogue des néoépitopes associés aux anomalies somatiques (mutations et fusions de gènes)
The neoepitope landscape in pediatric cancers
A partir de données portant sur 540 génomes et transcriptomes tumoraux issus de l'analyse d'échantillons prélevés sur des patients pédiatriques atteints d'un cancer, cette étude dresse le catalogue des néoépitopes associés aux anomalies somatiques (mutations et fusions de gènes)
The neoepitope landscape in pediatric cancers
Chang, Ti-Cheng ; Carter, Robert A. ; Li, Yongjin ; Li, Yuxin ; Wang, Hong ; Edmonson, Michael N. ; Chen, Xiang ; Arnold, Paula ; Geiger, Terrence L. ; Wu, Gang ; Peng, Junmin ; Dyer, Michael ; Downing, James R. ; Green, Douglas R. ; Thomas, Paul G. ; Zhang, Jinghui
Background : Neoepitopes derived from tumor-specific somatic mutations are promising targets for immunotherapy in childhood cancers. However, the potential for such therapies in targeting these epitopes remains uncertain due to a lack of knowledge of the neoepitope landscape in childhood cancer. Studies to date have focused primarily on missense mutations without exploring gene fusions, which are a major class of oncogenic drivers in pediatric cancer. Methods : We developed an analytical [...]
Clinical implications of neoepitope landscapes for adult and pediatric cancers
A partir de données portant sur 540 génomes et transcriptomes tumoraux issus de l'analyse d'échantillons prélevés sur des patients pédiatriques atteints d'un cancer, cette étude dresse le catalogue des néoépitopes associés aux anomalies somatiques (mutations et fusions de gènes)
Clinical implications of neoepitope landscapes for adult and pediatric cancers
Feng, Yang-Yang ; Griffith, Obi L. ; Griffith, Malachi
Many immunotherapies rely on the presence of neoepitopes derived from somatic mutations that lead to altered peptide sequences. Several studies have now analyzed the neoepitope landscape of different cancer subtypes, predominantly for adult samples, which tend to feature significantly higher mutational burden. However, a new report publishing the first comprehensive analysis of the pediatric neoepitope landscape suggests that immunotherapies could also hold promise for pediatric cancers.
Cet article passe en revue les travaux récents sur les mécanismes par lesquels une métaplasie peut donner lieu à une dysplasie de bas grade puis, en fin de processus, à un carcinome
Metaplasia: tissue injury adaptation and a precursor to the dysplasia-cancer sequence
Cet article passe en revue les travaux récents sur les mécanismes par lesquels une métaplasie peut donner lieu à une dysplasie de bas grade puis, en fin de processus, à un carcinome
Metaplasia: tissue injury adaptation and a precursor to the dysplasia-cancer sequence
Giroux, Veronique ; Rustgi, Anil K.
Metaplasia is the replacement of one differentiated somatic cell type with another differentiated somatic cell type in the same tissue. Typically, metaplasia is triggered by environmental stimuli, which may act in concert with the deleterious effects of microorganisms and inflammation. The cell of origin for intestinal metaplasia in the oesophagus and stomach and for pancreatic acinar-ductal metaplasia has been posited through genetic mouse models and lineage tracing but has not been identified [...]