Menée à partir de 302 échantillons de tissu hépatique prélevés sur 166 patients présentant une cirrhose hépatique, un nodule dysplasique de bas ou haut grade, un carcinome hépatocellulaire de stade précoce ou de stade plus avancé, cette étude analyse l'évolution des aberrations génomiques, épigénomiques et transcriptomiques durant les différentes étapes de l'hépatocarcinogenèse

Dynamics of genomic, epigenomic, and transcriptomic aberrations during stepwise hepatocarcinogenesis

Jee, Byul A. ; Choi, Ji-Hye ; Rhee, Hyungjin ; Yoon, Sarah ; Kwon, So Mee ; Nahm, Ji Hae ; Yoo, Jeong Eun ; Jeon, Youngsic ; Choi, Gi Hong ; Woo, Hyun Goo ; Park, Young Nyun

Hepatocellular carcinoma (HCC) undergoes a stepwise progression from liver cirrhosis (LC) to low-grade dysplastic nodule (LGDN), high-grade dysplastic nodule (HGDN), early HCC (eHCC), and progressed HCC (pHCC). Here, we profiled multi-layered genomic, epigenomic, and transcriptomic aberrations in the stepwise hepatocarcinogenesis. Initial DNA methylation was observed in eHCC (e.g., DKK3, SALL3, and SOX1) while more extensive methylation was observed in pHCC. In addition, eHCCs showed an initial [...]

Menée in vitro, cette étude met en évidence un mécanisme par lequel l'oncoprotéine E7 du papillomavirus humain, en altérant la fonction de la ligase RNF 168, perturbe le mécanisme de réparation de l'ADN et favorise ainsi l'instabilité génomique de la cellule hôte

Human papillomavirus E7 oncoprotein targets RNF168 to hijack the host DNA damage response

Sitz, Justine ; Blanchet, Sophie Anne ; Gameiro, Steven F. ; Biquand, Elise ; Morgan, Tia M. ; Galloy, Maxime ; Dessapt, Julien ; Lavoie, Elise G. ; Blondeau, Andréanne ; Smith, Brandon C. ; Mymryk, Joe S. ; Moody, Cary A. ; Fradet-Turcotte, Amélie

Human papillomaviruses (HPVs) cause 5% of all cancers, including cervical cancers and a growing number of oropharyngeal cancers, which are reaching epidemic proportion. While HPV oncogenes promote the acquisition of cancer hallmarks such as sustained proliferation and resistance to cell death by targeting the p53 and pRb pathways, the mechanism by which they induce genomic instability leading to cellular transformation remains largely unknown. This paper describes how the HPV oncoprotein E7 [...]

Menée in vitro et à l'aide d'un modèle murin d'adénocarcinome canalaire du pancréas, cette étude met en évidence un mécanisme par lequel la déubiquitinase USP21 favorise la croissance des cellules souches cancéreuses en activant la voie de signalisation des glycoprotéines Wnt

USP21 deubiquitinase promotes pancreas cancer cell stemness via Wnt pathway activation

Hou, Pingping ; Ma, Xingdi ; Zhang, Qiang ; Wu, Chang-Jiun ; Liao, Wenting ; Li, Jun ; Wang, Huamin ; Zhao, Jun ; Zhou, Xin ; Guan, Carolyn ; Ackroyd, Jeffery ; Jiang, Shan ; Zhang, Jianhua ; Spring, Denise J. ; Wang, Y. Alan ; DePinho, Ronald A.

The ubiquitin-specific protease (USP) family is the largest group of cysteine proteases. Cancer genomic analysis identified frequent amplification of USP21 (22%) in human pancreatic ductal adenocarcinoma (PDAC). USP21 overexpression correlates with human PDAC progression, and enforced expression of USP21 accelerates murine PDAC tumor growth and drives PanIN to PDAC progression in immortalized human pancreatic ductal cells. Conversely, depletion of USP21 impairs PDAC tumor growth. [...]

Menée à partir de l'analyse de l'ADN de 252 échantillons de moelle osseuse ou de sang périphérique prélevés sur des patients pédiatriques atteints du syndrome de Down (trisomie 21) et présentant une myélopoïèse anormale transitoire ou une leucémie myéloïde, puis menée in vitro et à l'aide de modèles murins, cette étude identifie des mutations génétiques et des mécanismes pouvant expliquer la transformation d'un syndrome myéloprolifératif transitoire en leucémie myéloïde

Mechanisms of Progression of Myeloid Preleukemia to Transformed Myeloid Leukemia in Children with Down Syndrome

Labuhn, Maurice ; Perkins, Kelly ; Matzk, Sören ; Varghese, Leila ; Garnett, Catherine ; Papaemmanuil, Elli ; Metzner, Marlen ; Kennedy, Alison ; Amstislavskiy, Vyacheslav ; Risch, Thomas ; Bhayadia, Raj ; Samulowski, David ; Hernandez, David Cruz ; Stoilova, Bilyana ; Iotchkova, Valentina ; Oppermann, Udo ; Scheer, Carina ; Yoshida, Kenichi ; Schwarzer, Adrian ; Taub, Jeffrey ; Crispino, John D. ; Weiss, Mitchell J. ; Hayashi, Yasuhide ; Taga, Takashi ; Ito, Etsuro ; Ogawa, Seishi ; Reinhardt, Dirk ; Yaspo, Marie-Laure ; Campbell, Peter J. ; Roberts, Irene ; Constantinescu, Stefan ; Vyas, Paresh ; Heckl, Dirk ; Klusmann, Jan-Henning

Myeloid leukemia in Down syndrome (ML-DS) clonally evolves from transient abnormal myelopoiesis (TAM), a preleukemic condition in DS newborns. To define mechanisms of leukemic transformation, we combined exome and targeted resequencing of 111 TAM and 141 ML-DS samples with functional analyses. TAM requires trisomy 21 and truncating mutations in GATA1; additional TAM variants are usually not pathogenic. By contrast, in ML-DS, clonal and subclonal variants are functionally required. We identified [...]

Menée in vitro et à l'aide de modèles murins de cancer colorectal, cette étude met en évidence un mécanisme par lequel l'acide hyaluronique, un constituant de la matrice extracellulaire, favorise la prolifération des cellules cancéreuses et bloque leur processus d'apoptose en se liant au récepteur TLR4

Hyaluronic acid binding to TLR4 promotes proliferation and blocks apoptosis in colon cancer

Stenson, William F. ; Makkar, Sarbjeet ; Riehl, Terrence E. ; Chen, Baosheng ; Yan, Yan ; Ciorba, Matthew A. ; Alvarado, David M.

Hyaluronic acid (HA), a constituent of the extracellular matrix, promotes colorectal cancer (CRC) growth. CD44 is a relevant HA receptor in this context. However, HA is also a ligand for TLR4, a receptor of significance in CRC. In this study we examine the relative contribution of HA interactions with CD44 and TLR4 in colon tumorigenesis. CRC models included ApcMin/+ mice, azoxymethane/dextran sodium sulfate (AOM-DSS) and CT26 tumor isografts. We used knockout mice and CT26 CRC cells with [...]

Menée à l'aide de lignées cellulaires et d'un échantillon tumoral prélevé sur un patient pédiatrique atteint d'un sarcome d'Ewing récidivant, cette étude identifie un nouvel oncogène de fusion impliqué dans la progression tumorale

Newly identified LMO3-BORCS5 fusion oncogene in Ewing sarcoma at relapse is a driver of tumor progression

Dupain, Célia ; Gracia, Céline ; Harttrampf, Anne C. ; Rivière, Julie ; Geoerger, Birgit ; Massaad-Massade, Liliane

Recently, we detected a new fusion transcript LMO3-BORCS5 in a patient with Ewing sarcoma within a cohort of relapsed pediatric cancers. LMO3-BORCS5 was as highly expressed as the characteristic fusion oncogene EWS/FLI1. However, the expression level of LMO3-BORCS5 at diagnosis was very low. Sanger sequencing depicted two LMO3-BORCS5 variants leading to loss of the functional domain LIM2 in LMO3 gene, and disruption of BORCS5. In vitro studies showed that LMO3-BORCS5 (i) increases [...]