Menée à partir de 117 échantillons de lésions duodénales (66 métaplasies de type gastrique fovéolaire, 81 hétérotopies gastriques, 30 adénocarcinomes du duodénum), cette étude analyse la prévalence de mutations des gènes GNAS, KRAS et BRAF

Activating GNAS and KRAS mutations in gastric foveolar metaplasia, gastric heterotopia, and adenocarcinoma of the duodenum

Matsubara, A. ; Ogawa, R. ; Suzuki, H. ; Oda, I. ; Taniguchi, H. ; Kanai, Y. ; Kushima, R. ; Sekine, S.

Background: Heterotopic gastric-type epithelium, including gastric foveolar metaplasia (GFM) and gastric heterotopia (GH), is a common finding in duodenal biopsy specimens; however, there is still controversy regarding their histogenetic backgrounds. Methods: We analysed a total of 177 duodenal lesions, including 66 GFM lesions, 81 GH lesions, and 30 adenocarcinomas, for the presence of GNAS, KRAS, and BRAF mutations. Results: Activating GNAS mutations were identified in 27 GFM lesions (41%) [...]

Menée par séquençage de l'exome à partir d'échantillons tumoraux prélevés sur 243 patients atteints d'un carcinome hépatocellulaire, cette étude met notamment en évidence des anomalies génomiques en association avec des facteurs de risque connus (alcool, virus de l'hépatite B)

Exome sequencing of hepatocellular carcinomas identifies new mutational signatures and potential therapeutic targets

Schulze, Kornelius ; Imbeaud, Sandrine ; Letouzé, Eric ; Alexandrov, Ludmil B. ; Calderaro, Julien ; Rebouissou, Sandra ; Couchy, Gabrielle ; Meiller, Clement ; Shinde, Jayendra ; Soysouvanh, Frederic ; Calatayud, Anna-Line ; Pinyol, Roser ; Pelletier, Laura ; Balabaud, Charles ; Laurent, Alexis ; Blanc, Jean-Frederic ; Mazzaferro, Vincenzo ; Calvo, Fabien ; Villanueva, Augusto ; Nault, Jean-Charles ; Bioulac-Sage, Paulette ; Stratton, Michael R. ; Llovet, Josep M. ; Zucman-Rossi, Jessica

Genomic analyses promise to improve tumor characterization to optimize personalized treatment for patients with hepatocellular carcinoma (HCC). Exome sequencing analysis of 243 liver tumors identified mutational signatures associated with specific risk factors, mainly combined alcohol and tobacco consumption and exposure to aflatoxin B1. We identified 161 putative driver genes associated with 11 recurrently altered pathways. Associations of mutations defined 3 groups of genes related to risk [...]

Menée à l'échelle de cellules uniques à partir d'échantillons sanguins prélevés sur plusieurs patients atteints d'une leucémie myéloïde aiguë, cette étude met en évidence une diversité clonale complexe

Single-cell genotyping demonstrates complex clonal diversity in acute myeloid leukemia

Paguirigan, Amy L. ; Smith, Jordan ; Meshinchi, Soheil ; Carroll, Martin ; Maley, Carlo ; Radich, Jerald P.

Clonal evolution in cancer—the selection for and emergence of increasingly malignant clones during progression and therapy, resulting in cancer metastasis and relapse—has been highlighted as an important phenomenon in the biology of leukemia and other cancers. Tracking mutant alleles to determine clonality from diagnosis to relapse or from primary site to metastases in a sensitive and quantitative manner is most often performed using next-generation sequencing. Such methods determine clonal [...]

Menée sur des échantillons tumoraux prélevés sur 31 patients atteints d'un carcinome papillaire à cellules rénales (15 de type 1, 16 de type 2), cette étude française met en évidence des anomalies génomiques susceptibles de définir une nouvelle classification de la maladie

Dismantling papillary renal cell carcinoma classification: The heterogeneity of genetic profiles suggests several independent diseases

Marsaud, Alexandre ; Dadone, Bérengère ; Ambrosetti, Damien ; Baudoin, Christian ; Chamorey, Emmanuel ; Rouleau, Etienne ; Lefol, Cédrick ; Roussel, Jean-François ; Fabas, Thibault ; Cristofari, Gaël ; Carpentier, Xavier ; Michiels, Jean-François ; Amiel, Jean ; Pedeutour, Florence

Papillary renal cell carcinoma (pRCC) is the second most frequent renal cell carcinoma (RCC) after clear cell RCC. In contrast to clear cell RCC, there is no consensual protocol using targeted therapy for metastatic pRCC. Moreover, diagnosis of some pRCC, especially pRCC of type 2 (pRCC2) may be challenging. Our aim was to identify molecular biomarkers that could be helpful for the diagnosis and treatment of pRCC. We studied the clinical, histological, immunohistological, and comprehensive [...]

Menée à l'aide de modèles murins de leucémie myéloïde aiguë, cette étude met en évidence des mécanismes par lesquels le gène SPRY4, situé sur la région chromosomique 5q, exerce une fonction du suppresseur de tumeurs

Cooperative loss of RAS feedback regulation drives myeloid leukemogenesis

Zhao, Zhen ; Chen, Chi-Chao ; Rillahan, Cory D. ; Shen, Ronglai ; Kitzing, Thomas ; McNerney, Megan E. ; Diaz-Flores, Ernesto ; Zuber, Johannes ; Shannon, Kevin ; Le Beau, Michelle M. ; Spector, Mona S. ; Kogan, Scott C. ; Lowe, Scott W.

RAS network activation is common in human cancers, and in acute myeloid leukemia (AML) this activation is achieved mainly through gain-of-function mutations in KRAS, NRAS or the receptor tyrosine kinase FLT3. We show that in mice, premalignant myeloid cells harboring a KrasG12D allele retained low levels of Ras signaling owing to negative feedback involving Spry4 that prevented transformation. In humans, SPRY4 is located on chromosome 5q, a region affected by large heterozygous deletions that [...]

Menée sur des lignées cellulaires et à l'aide de modèles murins, cette étude met en évidence des mécanismes par lesquels, indépendamment du gène p53, le gène SIVA favorise le développement d'un cancer du poumon non à petites cellules

The p53 Target Gene Siva Enables Non-Small Cell Lung Cancer Development

Van Nostrand, Jeanine L ; Brisac, Alice ; Mello, Stephano S ; Jacobs, Suzanne B. R. ; Luong, Richard ; Attardi, Laura D

Although p53 transcriptional activation potential is critical for its ability to suppress cancer, the specific target genes involved in tumor suppression remain unclear. Siva is a p53 target gene essential for p53-dependent apoptosis, although it can also promote proliferation through inhibition of p53 in some settings. Thus, the role of SIVA in tumorigenesis remains unclear. Here, we seek to define the contribution of SIVA to tumorigenesis by generating Siva conditional knockout mice. [...]

Menée à l'aide de modèles murins de cancer de la prostate induit par une délétion du gène PTEN, cette étude met en évidence des mécanismes par lesquels la perte d'expression du récepteur bêta des estrogènes favorise le développement d'une tumeur

Prostate Tumorigenesis Induced by PTEN Deletion Involves Estrogen Receptor β Repression

Mak, Paul ; Li, Jiarong ; Samanta, Sanjoy ; Chang, Cheng ; Jerry, D.  Joseph ; Davis, Roger J ; Leav, Irwin ; Mercurio, Arthur M

The role of ER

Menée sur des modèles murins, cette étude met en évidence le rôle joué par les voies de signalisation EphB et Abl dans le développement et la croissance d'un adénome du côlon

An EphB-Abl signaling pathway is associated with intestinal tumor initiation and growth

Kundu, Parag ; Genander, Maria ; Strååt, Klas ; Classon, Johanna ; Ridgway, Rachel A. ; Tan, Ee Hong ; Björk, Jan ; Martling, Anna ; van Es, Johan ; Sansom, Owen J. ; Clevers, Hans ; Pettersson, Sven ; Frisén, Jonas

EphB receptors regulate the proliferation and positioning of intestinal stem and progenitor cells. In addition, they can act as tumor promoters for adenoma development but suppress progression to invasive carcinoma. We used imatinib to abrogate Abl kinase activity in ApcMin/+ mice and in mice with LGR5+ stem cells that were genetically engineered to develop adenomatous polyposis coli. Imatinib treatment inhibited the tumor-promoting effects of EphB signaling without attenuating EphB-mediated [...]

Menée à l'aide de modèles murins, cette étude met en évidence des mécanismes par lesquels des neutrophiles et des lymphocytes gamma delta produisant de l'interleukine 17 favorisent le processus métastatique d'un cancer du sein

IL-17-producing gamma delta T cells and neutrophils conspire to promote breast cancer metastasis

Coffelt, Seth B. ; Kersten, Kelly ; Doornebal, Chris W. ; Weiden, Jorieke ; Vrijland, Kim ; Hau, Cheei-Sing ; Verstegen, Niels J. M. ; Ciampricotti, Metamia ; Hawinkels, Lukas J. A. C. ; Jonkers, Jos ; de Visser, Karin E.

Metastatic disease remains the primary cause of death for patients with breast cancer. The different steps of the metastatic cascade rely on reciprocal interactions between cancer cells and their microenvironment. Within this local microenvironment and in distant organs, immune cells and their mediators are known to facilitate metastasis formation. However, the precise contribution of tumour-induced systemic inflammation to metastasis and the mechanisms regulating systemic inflammation are [...]

Menée in vitro et in vivo sur des modèles de cancer de la vessie, cette étude met en évidence le rôle joué par des cellules surexprimant CD14 dans les processus inflammatoires qui, dans le micro-environnement tumoral, favorisent la prolifération des cellules cancéreuses

CD14-expressing cancer cells establish the inflammatory and proliferative tumor microenvironment in bladder cancer

Cheah, Ming T. ; Chen, James Y. ; Sahoo, Debashis ; Contreras-Trujillo, Humberto ; Volkmer, Anne K. ; Scheeren, Ferenc A. ; Volkmer, Jens-Peter ; Weissman, Irving L.

Nonresolving chronic inflammation at the neoplastic site is consistently associated with promoting tumor progression and poor patient outcomes. However, many aspects behind the mechanisms that establish this tumor-promoting inflammatory microenvironment remain undefined. Using bladder cancer (BC) as a model, we found that CD14-high cancer cells express higher levels of numerous inflammation mediators and form larger tumors compared with CD14-low cells. CD14 antigen is a [...]

Cet article passe en revue les méthodes d'analyse de données obtenues par séquençage du génome entier pour identifier des anomalies génomiques d'intérêt clinique en oncologie

Cancer whole-genome sequencing: present and future

Nakagawa, H. ; Wardell, C. P. ; Furuta, M. ; Taniguchi, H. ; Fujimoto, A.

Recent explosive advances in next-generation sequencing technology and computational approaches to massive data enable us to analyze a number of cancer genome profiles by whole-genome sequencing (WGS). To explore cancer genomic alterations and their diversity comprehensively, global and local cancer genome-sequencing projects, including ICGC and TCGA, have been analyzing many types of cancer genomes mainly by exome sequencing. However, there is limited information on somatic mutations in [...]

Ce article présente les caractéristiques de cinq modèles murins à base de xénogreffes de lignées cellulaires de tumeurs des gaines des nerfs périphériques dérivées des patients

Comprehensive establishment and characterization of orthoxenograft mouse models of malignant peripheral nerve sheath tumors for personalized medicine

Castellsagué, Joan ; Gel, Bernat ; Fernández-Rodríguez, Juana ; Llatjós, Roger ; Blanco, Ignacio ; Benavente, Yolanda ; Pérez-Sidelnikova, Diana ; García-del Muro, Javier ; Viñals, Joan Maria ; Vidal, August ; Valdes-Mas, Rafael ; Terribas, Ernest ; López-Doriga, Adriana ; Pujana, Miguel Angel ; Capella, Gabriel ; Puente, Xose S. ; Serra, Eduard ; Villanueva, Alberto ; Lázaro, Conxi

Malignant peripheral nerve sheath tumors (MPNSTs) are soft-tissue sarcomas that can arise either sporadically or in association with neurofibromatosis type 1 (NF1). These aggressive malignancies confer poor survival, with no effective therapy available. We present the generation and characterization of five distinct MPNST orthoxenograft models for preclinical testing and personalized medicine. Four of the models are patient-derived tumor xenografts (PDTX), two independent MPNSTs from the same [...]