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Sommaire du n° 386 du 9 octobre 2018
Aberrations chromosomiques (3)
Menée à l'aide de 4 modèles murins de carcinome hépatocellulaire (CHC) et à l'aide de 987 échantillons tumoraux prélevés sur des patients atteints d'un CHC, cette étude analyse les profils génomiques et transcriptomiques des modèles murins et, notamment, suggère l'intérêt de deux d'entre eux pour l'étude de différents stades de la maladie chez l'humain
Integrative genomic analysis of mouse and human hepatocellular carcinoma
Menée à l'aide de 4 modèles murins de carcinome hépatocellulaire (CHC) et à l'aide de 987 échantillons tumoraux prélevés sur des patients atteints d'un CHC, cette étude analyse les profils génomiques et transcriptomiques des modèles murins et, notamment, suggère l'intérêt de deux d'entre eux pour l'étude de différents stades de la maladie chez l'humain
Integrative genomic analysis of mouse and human hepatocellular carcinoma
Dow, Michelle ; Pyke, Rachel M. ; Tsui, Brian Y. ; Alexandrov, Ludmil B. ; Nakagawa, Hayato ; Taniguchi, Koji ; Seki, Ekihiro ; Harismendy, Olivier ; Shalapour, Shabnam ; Karin, Michael ; Carter, Hannah ; Font-Burgada, Joan
Hepatocellular carcinoma (HCC) research has been hampered by the absence of consensus mouse models with clearly defined molecular features faithfully recapitulating human HCC. Here we tackle this gap by implementing a cross-species comparative analysis between a large cohort of patients and four diverse mouse models focused on clinically and therapeutically relevant aspects of genomic and transcriptomic profiles and propose two of these models as valid for the study of different stages of human [...]
A partir de données issues du projet "The Cancer Genome Atlas", cette étude identifie notamment la présence plus fréquente de mutations du gène TP53 et d'une amplification du gène CCNE1 dans les tumeurs de patients afro-américains par rapport aux tumeurs de patients d'origine européenne
Integrated Analysis of Genetic Ancestry and Genomic Alterations across Cancers
A partir de données issues du projet "The Cancer Genome Atlas", cette étude identifie notamment la présence plus fréquente de mutations du gène TP53 et d'une amplification du gène CCNE1 dans les tumeurs de patients afro-américains par rapport aux tumeurs de patients d'origine européenne
Integrated Analysis of Genetic Ancestry and Genomic Alterations across Cancers
Yuan, Jiao ; Hu, Zhongyi ; Mahal, Brandon A. ; Zhao, Sihai D. ; Kensler, Kevin H. ; Pi, Jingjiang ; Hu, Xiaowen ; Zhang, Youyou ; Wang, Yueying ; Jiang, Junjie ; Li, Chunsheng ; Zhong, Xiaomin ; Montone, Kathleen T. ; Guan, Guoqiang ; Tanyi, Janos L. ; Fan, Yi ; Xu, Xiaowei ; Morgan, Mark A. ; Long, Meixiao ; Zhang, Yuzhen ; Zhang, Rugang ; Sood, Anil K. ; Rebbeck, Timothy R. ; Dang, Chi V. ; Zhang, Lin
Disparities in cancer care have been a long-standing challenge. We estimated the genetic ancestry of The Cancer Genome Atlas patients, and performed a pan-cancer analysis on the influence of genetic ancestry on genomic alterations. Compared with European Americans, African Americans (AA) with breast, head and neck, and endometrial cancers exhibit a higher level of chromosomal instability, while a lower level of chromosomal instability was observed in AAs with kidney cancers. The frequencies of [...]
Genetic Ancestry May Influence the Evolutionary Trajectory of Cancers
A partir de données issues du projet "The Cancer Genome Atlas", cette étude identifie notamment la présence plus fréquente de mutations du gène TP53 et d'une amplification du gène CCNE1 dans les tumeurs de patients afro-américains par rapport aux tumeurs de patients d'origine européenne
Genetic Ancestry May Influence the Evolutionary Trajectory of Cancers
Pitt, Jason J. ; Zheng, Yonglan ; Olopade, Olufunmilayo I.
In this issue of Cancer Cell, Yuan et al. compared the somatic alterations harbored by tumors from European and African ancestry individuals. They determined that the latter group has a propensity for aberrations that are consistent with genomic instability, potentially lending insight to the genomic basis of cancer health disparities.
A partir de 33 échantillons de tumeurs métastatiques prélevés sur des patients atteints d'un carcinome corticosurrénalien, cette étude met notamment en évidence une plus forte hétérogénéité, du point de vue des anomalies génétiques, à l'intérieur des métastases par rapport aux tumeurs primitives
Metastatic adrenocortical carcinoma displays higher mutation rate and tumor heterogeneity than primary tumors
A partir de 33 échantillons de tumeurs métastatiques prélevés sur des patients atteints d'un carcinome corticosurrénalien, cette étude met notamment en évidence une plus forte hétérogénéité, du point de vue des anomalies génétiques, à l'intérieur des métastases par rapport aux tumeurs primitives
Metastatic adrenocortical carcinoma displays higher mutation rate and tumor heterogeneity than primary tumors
Gara, Sudheer Kumar ; Lack, Justin ; Zhang, Lisa ; Harris, Emerson ; Cam, Margaret ; Kebebew, Electron
Adrenocortical cancer (ACC) is a rare cancer with poor prognosis and high mortality due to metastatic disease. All reported genetic alterations have been in primary ACC, and it is unknown if there is molecular heterogeneity in ACC. Here, we report the genetic changes associated with metastatic ACC compared to primary ACCs and tumor heterogeneity. We performed whole-exome sequencing of 33 metastatic tumors. The overall mutation rate (per megabase) in metastatic tumors was 2.8-fold higher than [...]
Oncogènes et suppresseurs de tumeurs (3)
Menée in vitro à l'aide de cultures de cellules épithéliales humaines normales du poumon et de la prostate, cette étude identifie des mécanismes par lesquels, en "reprogrammant" ces cellules, des oncogènes favorisent le développement de tumeurs neuroendocrines à petites cellules
Reprogramming normal human epithelial tissues to a common, lethal neuroendocrine cancer lineage
Menée in vitro à l'aide de cultures de cellules épithéliales humaines normales du poumon et de la prostate, cette étude identifie des mécanismes par lesquels, en "reprogrammant" ces cellules, des oncogènes favorisent le développement de tumeurs neuroendocrines à petites cellules
Reprogramming normal human epithelial tissues to a common, lethal neuroendocrine cancer lineage
Park, Jung Wook ; Lee, John K. ; Sheu, Katherine M. ; Wang, Liang ; Balanis, Nikolas G. ; Nguyen, Kim ; Smith, Bryan A. ; Cheng, Chen ; Tsai, Brandon L. ; Cheng, Donghui ; Huang, Jiaoti ; Kurdistani, Siavash K. ; Graeber, Thomas G. ; Witte, Owen N.
Epithelial cancers develop resistance to targeted therapies in a number of different ways. Several cancer types do so by undergoing phenotypic conversion to a highly aggressive cancer called small cell neuroendocrine carcinoma (SCNC). Whether distinct cancer types accomplish this “reprogramming” through the same mechanism has been unclear. Park et al. show that the same set of oncogenic factors transforms both normal lung and normal prostate epithelial cells into SCNCs that resemble clinical [...]
Cancer origins—genetics rules the day
Menée in vitro à l'aide de cultures de cellules épithéliales humaines normales du poumon et de la prostate, cette étude identifie des mécanismes par lesquels, en "reprogrammant" ces cellules, des oncogènes favorisent le développement de tumeurs neuroendocrines à petites cellules
Cancer origins—genetics rules the day
Kareta, Michael S. ; Sage, Julien
A major goal of cancer research is to identify central molecular and cellular mechanisms underlying the development of tumors and their response to treatment, with the aim of uncovering key vulnerabilities. Early events in the development of cancer may inform such vulnerabilities (1), but early tumors are much more difficult to observe and study in patients than established tumors. Indeed, one of the hardest issues to resolve in early tumor development is the relative contributions of the [...]
Cet article décrit les caractéristiques de la dernière mise à jour de la base de données "COSMIC Cancer Gene Census" qui récapitule les effets de 719 gènes associés au développement d'un cancer
The COSMIC Cancer Gene Census: describing genetic dysfunction across all human cancers
Cet article décrit les caractéristiques de la dernière mise à jour de la base de données "COSMIC Cancer Gene Census" qui récapitule les effets de 719 gènes associés au développement d'un cancer
The COSMIC Cancer Gene Census: describing genetic dysfunction across all human cancers
Sondka, Zbyslaw ; Bamford, Sally ; Cole, Charlotte G. ; Ward, Sari A. ; Dunham, Ian ; Forbes, Simon A.
The Catalogue of Somatic Mutations in Cancer (COSMIC) Cancer Gene Census (CGC) is an expert-curated description of the genes driving human cancer that is used as a standard in cancer genetics across basic research, medical reporting and pharmaceutical development. After a major expansion and complete re-evaluation, the 2018 CGC describes in detail the effect of 719 cancer-driving genes. The recent expansion includes functional and mechanistic descriptions of how each gene contributes to disease [...]
Menée in vitro et in vivo sur des modèles de leucémie myéloïde aiguë, cette étude met en évidence des mécanismes par lesquels le facteur de transcription RUNX1/ETO favorise le développement de la maladie
The Oncogenic Transcription Factor RUNX1/ETO Corrupts Cell Cycle Regulation to Drive Leukemic Transformation
Menée in vitro et in vivo sur des modèles de leucémie myéloïde aiguë, cette étude met en évidence des mécanismes par lesquels le facteur de transcription RUNX1/ETO favorise le développement de la maladie
The Oncogenic Transcription Factor RUNX1/ETO Corrupts Cell Cycle Regulation to Drive Leukemic Transformation
Martinez-Soria, Natalia ; McKenzie, Lynsey ; Draper, Julia ; Ptasinska, Anetta ; Issa, Hasan ; Potluri, Sandeep ; Blair, Helen J. ; Pickin, Anna ; Isa, Asmida ; Chin, Paulynn Suyin ; Tirtakusuma, Ricky ; Coleman, Daniel ; Nakjang, Sirintra ; Assi, Salam ; Forster, Victoria ; Reza, Mojgan ; Law, Ed ; Berry, Philip ; Mueller, Dorothee ; Elder, Alex ; Bomken, Simon N. ; Pal, Deepali ; Allan, James M. ; Veal, Gareth J. ; Cockerill, Peter N. ; Wichmann, Christian ; Vormoor, Josef ; Lacaud, Georges ; Bonifer, Constanze ; Heidenreich, Olaf
Oncogenic transcription factors such as the leukemic fusion protein RUNX1/ETO, which drives t(8;21) acute myeloid leukemia (AML), constitute cancer-specific but highly challenging therapeutic targets. We used epigenomic profiling data for an RNAi screen to interrogate the transcriptional network maintaining t(8;21) AML. This strategy identified Cyclin D2 (CCND2) as a crucial transmitter of RUNX1/ETO-driven leukemic propagation. RUNX1/ETO cooperates with AP-1 to drive CCND2 expression. Knockdown [...]
Progression et métastases (3)
Cet article passe en revue les travaux récents sur les mécanismes par lesquels des voies de signalisation impliquées dans l'angiogenèse favorisent le développement et la progression d'un carcinome hépatocellulaire
The Role of Angiogenesis in Hepatocellular Carcinoma
Cet article passe en revue les travaux récents sur les mécanismes par lesquels des voies de signalisation impliquées dans l'angiogenèse favorisent le développement et la progression d'un carcinome hépatocellulaire
The Role of Angiogenesis in Hepatocellular Carcinoma
Morse, Michael A. ; Sun, Weijing ; Kim, Richard ; He, Aiwu Ruth ; Abada, Paolo B. ; Mynderse, Michelle ; Finn, Richard S.
Hepatocellular carcinoma (HCC) accounts for about 90% of all primary liver cancers and is the second leading cause of cancer-related deaths worldwide. The hypervascular nature of most HCC tumors underlines the importance of angiogenesis in the pathobiology of these tumors. Several angiogenic pathways have been identified as being dysregulated in HCC, suggesting they may be involved in the development and pathogenesis of HCC. These data provide practical targets for systemic treatments such as [...]
Menée à l'aide de modèles murins présentant de grosses tumeurs, cette étude identifie des mécanismes par lesquels, en réduisant les nombres de lymphocytes T régulateurs et de cellules myéloïdes suppressives, la prolifération d'une population de cellules progénitrices érythroïdes CD45+ exerce un rôle immunosuppresseur
Late-stage tumors induce anemia and immunosuppressive extramedullary erythroid progenitor cells
Menée à l'aide de modèles murins présentant de grosses tumeurs, cette étude identifie des mécanismes par lesquels, en réduisant les nombres de lymphocytes T régulateurs et de cellules myéloïdes suppressives, la prolifération d'une population de cellules progénitrices érythroïdes CD45+ exerce un rôle immunosuppresseur
Late-stage tumors induce anemia and immunosuppressive extramedullary erythroid progenitor cells
Zhao, Lintao ; He, Ran ; Long, Haixia ; Guo, Bo ; Jia, Qingzhu ; Qin, Diyuan ; Liu, Si-Qi ; Wang, Zhongyu ; Xiang, Tong ; Zhang, Jue ; Tan, Yulong ; Huang, Jiani ; Chen, Junying ; Wang, Fang ; Xiao, Minglu ; Gao, Jianbao ; Yang, Xinxin ; Zeng, Hao ; Wang, Xinxin ; Hu, Chunyan ; Alexander, Peter B. ; Symonds, Alistair L. J. ; Yu, Jia ; Wan, Yisong ; Li, Qi-Jing ; Ye, Lilin ; Zhu, Bo
Impaired immunity in patients with late-stage cancer is not limited to antitumor responses, as demonstrated by poor vaccination protection and high susceptibility to infection1–3. This has been largely attributed to chemotherapy-induced impairment of innate immunity, such as neutropenia2, whereas systemic effects of tumors on hematopoiesis and adoptive immunity remain incompletely understood. Here we observed anemia associated with severe deficiency of CD8+ T cell responses against pathogens in [...]
Menées in vitro et in vivo, ces études mettent en évidence des mécanismes par lesquels, en raison de modification de son expression avec l'âge, la protéine HAPLN1 est impliquée dans la perméabilité de la matrice extracellulaire du derme, la motilité des cellules tumorales et, ainsi, dans le processus métastatique
Age-Related Changes in HAPLN1 Increase Lymphatic Permeability and Affect Routes of Melanoma Metastasis
Menées in vitro et in vivo, ces études mettent en évidence des mécanismes par lesquels, en raison de modification de son expression avec l'âge, la protéine HAPLN1 est impliquée dans la perméabilité de la matrice extracellulaire du derme, la motilité des cellules tumorales et, ainsi, dans le processus métastatique
Age-Related Changes in HAPLN1 Increase Lymphatic Permeability and Affect Routes of Melanoma Metastasis
Ecker, Brett L. ; Kaur, Amanpreet ; Douglass, Stephen M. ; Webster, Marie R. ; Almeida, Filipe V. ; Marino, Gloria ; Sinnamon, Andrew J. ; Neuwirth, Madalyn G. ; Alicea, Gretchen M. ; Ndoye, Abibatou ; Fane, Mitchell ; Xu, Xiaowei ; Sim, Myung Shin ; Deutsch, Gary B. ; Faries, Mark B. ; Karakousis, Giorgos C. ; Weeraratna, Ashani T.
Older melanoma patients have lower rates of sentinel lymph node (LN) metastases yet paradoxically have inferior survival. Patient age correlated with an inability to retain Technetium radiotracer during sentinel LN biopsy in over 1000 patients, and high technecium counts correlated to better survival. We hypothesized that loss of integrity in the lymphatic vasculature due to ECM degradation might play a role. We have implicated HAPLN1 in age-dependent ECM degradation in the dermis. Here we [...]
Remodeling of the collagen matrix in aging skin promotes melanoma metastasis and affects immune cell motility
Menées in vitro et in vivo, ces études mettent en évidence des mécanismes par lesquels, en raison de modification de son expression avec l'âge, la protéine HAPLN1 est impliquée dans la perméabilité de la matrice extracellulaire du derme, la motilité des cellules tumorales et, ainsi, dans le processus métastatique
Remodeling of the collagen matrix in aging skin promotes melanoma metastasis and affects immune cell motility
Kaur, Amanpreet ; Ecker, Brett L. ; Douglass, Stephen M. ; Kugel, Curtis H. ; Webster, Marie R. ; Almeida, Filipe V. ; Somasundaram, Rajasekharan ; Hayden, James ; Ban, Ehsan ; Ahmadzadeh, Hossein ; Franco-Barraza, Janusz ; Shah, Neelima ; Mellis, Ian A. ; Keeney, Frederick ; Kossenkov, Andrew ; Tang, Hsin-Yao ; Yin, Xiangfan ; Liu, Qin ; Xu, Xiaowei ; Fane, Mitchell ; Brafford, Patricia ; Herlyn, Meenhard ; Speicher, David W. ; Wargo, Jennifer A. ; Tetzlaff, Michael T. ; Haydu, Lauren E. ; Raj, Arjun ; Shenoy, Vivek ; Cukierman, Edna ; Weeraratna, Ashani T.
Physical changes in skin are among the most visible signs of aging. We found that young dermal fibroblasts secrete high levels of extracellular matrix (ECM) constituents, including proteoglycans, glycoproteins and cartilage-linking proteins. The most abundantly secreted was HAPLN1, a hyaluronic and proteoglycan link protein. HAPLN1 was lost in aged fibroblasts, resulting in a more aligned ECM that promoted metastasis of melanoma cells. Reconstituting HAPLN1 inhibited metastasis in an aged [...]