Nota Bene Cancer
Nota Bene Cancer est un bulletin hebdomadaire de veille bibliographique. En libre accès, Nota Bene Cancer permet à ses abonnés de gagner du temps pour se tenir informé de l’actualité scientifique et médicale dans les divers domaines de la recherche sur les cancers.
Pour retrouver les publications signalées par Nota Bene Cancer (archives indexées à partir du n°127 du 1" mars 2012) :
Sommaire du n° 551 du 27 janvier 2023
Oncogènes et suppresseurs de tumeurs (6)
Menée à l'aide de modèles murins, cette étude met en évidence un mécanisme par lequel le métabolisme cytosolique de l'aldose contribue à la transformation d'une cirrhose en carcinome hépatocellulaire
Cytosolic aldose metabolism contributes to progression from cirrhosis to hepatocarcinogenesis
Menée à l'aide de modèles murins, cette étude met en évidence un mécanisme par lequel le métabolisme cytosolique de l'aldose contribue à la transformation d'une cirrhose en carcinome hépatocellulaire
Cytosolic aldose metabolism contributes to progression from cirrhosis to hepatocarcinogenesis
Oaks, Z. ; Patel, A. ; Huang, N. ; Choudhary, G. ; Winans, T. ; Faludi, T. ; Krakko, D. ; Duarte, M. ; Lewis, J. ; Beckford, M. ; Blair, S. ; Kelly, R. ; Landas, S. K. ; Middleton, F. A. ; Asara, J. M. ; Chung, S. K. ; Fernandez, ; Banki, K. ; Perl, A.
Oxidative stress modulates carcinogenesis in the liver; however, direct evidence for metabolic control of oxidative stress during pathogenesis, particularly, of progression from cirrhosis to hepatocellular carcinoma (HCC), has been lacking. Deficiency of transaldolase (TAL), a rate-limiting enzyme of the non-oxidative branch of the pentose phosphate pathway (PPP), restricts growth and predisposes to cirrhosis and HCC in mice and humans. Here, we show that mitochondrial oxidative stress and [...]
Menée à l'aide de modèles murins et de tissus oesophagiens d'origine humaine, cette étude démontre que la présence de mutations au niveau du gène NOTCH1 des cellules épithéliales normales favorise l'expansion clonale mais empêche la carcinogenèse
Notch1 mutations drive clonal expansion in normal esophageal epithelium but impair tumor growth
Menée à l'aide de modèles murins et de tissus oesophagiens d'origine humaine, cette étude démontre que la présence de mutations au niveau du gène NOTCH1 des cellules épithéliales normales favorise l'expansion clonale mais empêche la carcinogenèse
Notch1 mutations drive clonal expansion in normal esophageal epithelium but impair tumor growth
Abby, Emilie ; Dentro, Stefan C. ; Hall, Michael W. J. ; Fowler, Joanna C. ; Ong, Swee Hoe ; Sood, Roshan ; Herms, Albert ; Piedrafita, Gabriel ; Abnizova, Irina ; Siebel, Christian W. ; Gerstung, Moritz ; Hall, Benjamin A. ; Jones, Philip H.
NOTCH1 mutant clones occupy the majority of normal human esophagus by middle age but are comparatively rare in esophageal cancers, suggesting NOTCH1 mutations drive clonal expansion but impede carcinogenesis. Here we test this hypothesis. Sequencing NOTCH1 mutant clones in aging human esophagus reveals frequent biallelic mutations that block NOTCH1 signaling. In mouse esophagus, heterozygous Notch1 mutation confers a competitive advantage over wild-type cells, an effect enhanced by loss of the [...]
Ce dossier présente deux articles mettant en évidence le rôle du facteur de transcription ETV6 dans l'activité oncogène de la protéine de fusion EWS-FLI
ETV6 dependency in Ewing sarcoma by antagonism of EWS-FLI1-mediated enhancer activation
Ce dossier présente deux articles mettant en évidence le rôle du facteur de transcription ETV6 dans l'activité oncogène de la protéine de fusion EWS-FLI
ETV6 dependency in Ewing sarcoma by antagonism of EWS-FLI1-mediated enhancer activation
Gao, Yuan ; He, Xue-Yan ; Wu, Xiaoli S. ; Huang, Yu-Han ; Toneyan, Shushan ; Ha, Taehoon ; Ipsaro, Jonathan J. ; Koo, Peter K. ; Joshua-Tor, Leemor ; Bailey, Kelly M. ; Egeblad, Mikala ; Vakoc, Christopher R.
The EWS-FLI1 fusion oncoprotein deregulates transcription to initiate the paediatric cancer Ewing sarcoma. Here we used a domain-focused CRISPR screen to implicate the transcriptional repressor ETV6 as a unique dependency in this tumour. Using biochemical assays and epigenomics, we show that ETV6 competes with EWS-FLI1 for binding to select DNA elements enriched for short GGAA repeat sequences. Upon inactivating ETV6, EWS-FLI1 overtakes and hyper-activates these cis-elements to promote [...]
The ETS transcription factor ETV6 constrains the transcriptional activity of EWS–FLI to promote Ewing sarcoma
Ce dossier présente deux articles mettant en évidence le rôle du facteur de transcription ETV6 dans l'activité oncogène de la protéine de fusion EWS-FLI
The ETS transcription factor ETV6 constrains the transcriptional activity of EWS–FLI to promote Ewing sarcoma
Lu, Diana Y. ; Ellegast, Jana M. ; Ross, Kenneth N. ; Malone, Clare F. ; Lin, Shan ; Mabe, Nathaniel W. ; Dharia, Neekesh V. ; Meyer, Ashleigh ; Conway, Amy ; Su, Angela H. ; Selich-Anderson, Julia ; Taslim, Cenny ; Byrum, Andrea K. ; Seong, Bo Kyung A. ; Adane, Biniam ; Gray, Nathanael S. ; Rivera, Miguel N. ; Lessnick, Stephen L. ; Stegmaier, Kimberly
Transcription factors (TFs) are frequently mutated in cancer. Paediatric cancers exhibit few mutations genome-wide but frequently harbour sentinel mutations that affect TFs, which provides a context to precisely study the transcriptional circuits that support mutant TF-driven oncogenesis. A broadly relevant mechanism that has garnered intense focus involves the ability of mutant TFs to hijack wild-type lineage-specific TFs in self-reinforcing transcriptional circuits. However, it is not known [...]
Menée in vitro et à l'aide de modèles murins de cancer mammaire, cette étude met en évidence un mécanisme par lequel un déficit en culline-5 favorise le développement de la tumeur via l'activation de la voie de signalisation CREB1-CCL2 et l'accumulation intratumorale de cellules myéloïdes suppressives
Cullin-5 deficiency orchestrates the tumor microenvironment to promote mammary tumor development through CREB1-CCL2 signaling
Menée in vitro et à l'aide de modèles murins de cancer mammaire, cette étude met en évidence un mécanisme par lequel un déficit en culline-5 favorise le développement de la tumeur via l'activation de la voie de signalisation CREB1-CCL2 et l'accumulation intratumorale de cellules myéloïdes suppressives
Cullin-5 deficiency orchestrates the tumor microenvironment to promote mammary tumor development through CREB1-CCL2 signaling
Chen, Si ; Shao, Fangyuan ; Zeng, Jianming ; Guo, Sen ; Wang, Lijian ; Sun, Heng ; Lei, Josh Haipeng ; Lyu, Xueying ; Gao, Shuai ; Chen, Qiang ; Miao, Kai ; Xu, Xiaoling ; Deng, Chu-Xia
Breast cancer–associated gene 1 (Brca1) deficiency induces the onset of breast cancer formation, accompanied with extensive genetic alterations. Here, we used both the sleeping beauty transposon mutagenesis system and CRISPR-Cas9–mediated genome-wide screening in mice to identify potential genetic alterations that act synergistically with Brca1 deficiency to promote tumorignesis. Both approaches identified Cullin-5 as a tumor suppressor, whose mutation enabled Brca1-deficient cell survival and [...]
Menée in vitro et à l'aide d'un modèle murin de cancer mammaire HER2+, cette étude met en évidence un mécanisme par lequel la voie de signalisation de la kinase JNK supprime les cellules cancéreuses
HER2-driven breast cancer suppression by the JNK signaling pathway
Menée in vitro et à l'aide d'un modèle murin de cancer mammaire HER2+, cette étude met en évidence un mécanisme par lequel la voie de signalisation de la kinase JNK supprime les cellules cancéreuses
HER2-driven breast cancer suppression by the JNK signaling pathway
Itah, Zeynep ; Chaudhry, Shanzah ; Raju Ponny, Sithara ; Aydemir, Ozkan ; Lee, Alexandra ; Cavanagh-Kyros, Julie ; Tournier, Cathy ; Muller, William J. ; Davis, Roger J.
The HER2+ subtype of human breast cancer is associated with the malignant transformation of luminal ductal cells of the mammary epithelium. The sequence analysis of tumor DNA identifies loss of function mutations and deletions of the MAP2K4 and MAP2K7 genes that encode direct activators of the JUN NH2-terminal kinase (JNK). We report that in vitro studies of human mammary epithelial cells with CRISPR-induced mutations in the MAPK and MAP2K components of the JNK pathway caused no change in [...]
Cet article examine l'association entre trois bactéries buccales liées aux parodontites (Porphyromonas gingivalis, Fusobacterium nucleatum et Prevotella intermedia) et le carcinome épidermoïde gingival puis identifie les mécanismes biologiques par lesquels ces bactéries favorisent la carcinogenèse
Oral bacterial contributions to gingival carcinogenesis and progression
Cet article examine l'association entre trois bactéries buccales liées aux parodontites (Porphyromonas gingivalis, Fusobacterium nucleatum et Prevotella intermedia) et le carcinome épidermoïde gingival puis identifie les mécanismes biologiques par lesquels ces bactéries favorisent la carcinogenèse
Oral bacterial contributions to gingival carcinogenesis and progression
Okuyama, Kohei ; Yanamoto, Souichi
Several periodontitis-associated species induce genes related to cell proliferation, cell-cycle progression, apoptosis, intracellular transport, immune and inflammatory responses, carcinogenesis, and cancer progression. Here, we reviewed studies showing strong associations between gingival squamous cell carcinoma (GSCC) and three periodontitis-related oral bacteria (Porphyromonas gingivalis, Fusobacterium nucleatum, and Prevotella intermedia) in the microenvironment. These bacteria produce [...]
Progression et métastases (2)
Menée à l'aide de modèles murins et de xénogreffes, cette étude met en évidence un mécanisme par lequel les granulocytes activés et la voie de signalisation des cytokines pro-inflammatoires favorisent la progression des lymphomes à lymphocytes T et les symptômes de la maladie
Activated granulocytes and inflammatory cytokine signaling drive T-cell lymphoma progression and disease symptoms
Menée à l'aide de modèles murins et de xénogreffes, cette étude met en évidence un mécanisme par lequel les granulocytes activés et la voie de signalisation des cytokines pro-inflammatoires favorisent la progression des lymphomes à lymphocytes T et les symptômes de la maladie
Activated granulocytes and inflammatory cytokine signaling drive T-cell lymphoma progression and disease symptoms
Jaeger, Amelie ; Gambheer, Sudheer Madan Mohan ; Sun, XiaoYang ; Chernyakov, Dmitry ; Skorobohatko, Oleksandra ; Mack, Thomas M. ; Kissel, Sandra ; Pfeifer, Dietmar ; Zeiser, Robert ; Fisch, Paul ; Andrieux, Geoffroy ; Bräuer-Hartmann, Daniela ; Bauer, Marcus ; Schulze, Susann ; Follo, Marie ; Boerries, Melanie ; von Bubnoff, Nikolas ; Miething, Cornelius ; Hidalgo, Jose Villacorta ; Klein, Claudius ; Weber, Thomas ; Wickenhauser, Claudia ; Binder, Mascha ; Dierks, Christine
Peripheral T-cell lymphomas (PTCL) - especially angioimmunoblastic (AITL) and follicular TCL - have a dismal prognosis due to lack of efficient therapies, and patients` symptoms are often dominated by an inflammatory phenotype including fever, night sweats, weight loss and skin rash. In this study, we investigated the role of inflammatory granulocytes and activated cytokine signaling on PTCL-TFH (T-follicular helper type) disease progression and symptoms. We show, that ITK-SYK driven murine [...]
Menée à partir d'échantillons biopsiques prélevés sur des patients atteints d'un mésothéliome avec mutation biallélique du gène BAP1, cette étude met en évidence un mécanisme par lequel la protéine BAP1 favorise l'expression du facteur HIF-1alpha et démontre que la mutation du gène BAP1, en réduisant l'activité du facteur HIF-1alpha, rend la tumeur moins agressive
BAP1 is a novel regulator of HIF-1alpha
Menée à partir d'échantillons biopsiques prélevés sur des patients atteints d'un mésothéliome avec mutation biallélique du gène BAP1, cette étude met en évidence un mécanisme par lequel la protéine BAP1 favorise l'expression du facteur HIF-1alpha et démontre que la mutation du gène BAP1, en réduisant l'activité du facteur HIF-1alpha, rend la tumeur moins agressive
BAP1 is a novel regulator of HIF-1alpha
Bononi, Angela ; Wang, Qian ; Zolondick, Alicia A. ; Bai, Fang ; Steele-Tanji, Mika ; Suarez, Joelle S. ; Pastorino, Sandra ; Sipes, Abigail ; Signorato, Valentina ; Ferro, Angelica ; Novelli, Flavia ; Kim, Jin-Hee ; Minaai, Michael ; Takinishi, Yasutaka ; Pellegrini, Laura ; Napolitano, Andrea ; Xu, Ronghui ; Farrar, Christine ; Goparaju, Chandra ; Bassi, Cristian ; Negrini, Massimo ; Pagano, Ian ; Sakamoto, Greg ; Gaudino, Giovanni ; Pass, Harvey I. ; Onuchic, José N. ; Yang, Haining ; Carbone, Michele
BAP1 is a powerful tumor suppressor gene characterized by haplo insufficiency. Individuals carrying germline BAP1 mutations often develop mesothelioma, an aggressive malignancy of the serosal layers covering the lungs, pericardium, and abdominal cavity. Intriguingly, mesotheliomas developing in carriers of germline BAP1 mutations are less aggressive, and these patients have significantly improved survival. We investigated the apparent paradox of a tumor suppressor gene that, when mutated, [...]
Ressources et infrastructures (Biologie) (2)
Cet article présente une approche méthodologique permettant de cartographier les interactions entre des petites molécules médicamenteuses (anticancéreux ou autres) et l'ADN génomique ou des protéines de la chromatine
Chem-map profiles drug binding to chromatin in cells
Cet article présente une approche méthodologique permettant de cartographier les interactions entre des petites molécules médicamenteuses (anticancéreux ou autres) et l'ADN génomique ou des protéines de la chromatine
Chem-map profiles drug binding to chromatin in cells
Yu, Zutao ; Spiegel, Jochen ; Melidis, Larry ; Hui, Winnie W. I. ; Zhang, Xiaoyun ; Radzevičius, Antanas ; Balasubramanian, Shankar
Characterizing drug–target engagement is essential to understand how small molecules influence cellular functions. Here we present Chem-map for in situ mapping of small molecules that interact with DNA or chromatin-associated proteins, utilizing small-molecule-directed transposase Tn5 tagmentation. We demonstrate Chem-map for three distinct drug-binding modalities as follows: molecules that target a chromatin protein, a DNA secondary structure or that intercalate in DNA. We map the BET [...]
Menée à l'aide de modèles murins ainsi que d'échantillons sanguins et d'échantillons tumoraux issus de patients atteints d'un mélanome métastatique, cette étude met en évidence un mécanisme par lequel la fucosylation de la chaîne bêta DRB1 du complexe majeur d'histocompatibilité de classe II favorise l'immunité antitumorale induite par les lymphocytes CD4+ et augmente l'efficacité des anti-PD1
Fucosylation of HLA-DRB1 regulates CD4+ T cell-mediated anti-melanoma immunity and enhances immunotherapy efficacy
Menée à l'aide de modèles murins ainsi que d'échantillons sanguins et d'échantillons tumoraux issus de patients atteints d'un mélanome métastatique, cette étude met en évidence un mécanisme par lequel la fucosylation de la chaîne bêta DRB1 du complexe majeur d'histocompatibilité de classe II favorise l'immunité antitumorale induite par les lymphocytes CD4+ et augmente l'efficacité des anti-PD1
Fucosylation of HLA-DRB1 regulates CD4+ T cell-mediated anti-melanoma immunity and enhances immunotherapy efficacy
Lester, Daniel K. ; Burton, Chase ; Gardner, Alycia ; Innamarato, Patrick ; Kodumudi, Krithika ; Liu, Qian ; Adhikari, Emma ; Ming, Qianqian ; Williamson, Daniel B. ; Frederick, Dennie T. ; Sharova, Tatyana ; White, Michael G. ; Markowitz, Joseph ; Cao, Biwei ; Nguyen, Jonathan ; Johnson, Joseph ; Beatty, Matthew ; Mockabee-Macias, Andrea ; Mercurio, Matthew ; Watson, Gregory ; Chen, Pei-Ling ; McCarthy, Susan ; MoranSegura, Carlos ; Messina, Jane ; Thomas, Kerry L. ; Darville, Lancia ; Izumi, Victoria ; Koomen, John M. ; Pilon-Thomas, Shari A. ; Ruffell, Brian ; Luca, Vincent C. ; Haltiwanger, Robert S. ; Wang, Xuefeng ; Wargo, Jennifer A. ; Boland, Genevieve M. ; Lau, Eric K.
Immunotherapy efficacy is limited in melanoma, and combinations of immunotherapies with other modalities have yielded limited improvements but also adverse events requiring cessation of treatment. In addition to ineffective patient stratification, efficacy is impaired by paucity of intratumoral immune cells (itICs); thus, effective strategies to safely increase itICs are needed. We report that dietary administration of l-fucose induces fucosylation and cell surface enrichment of the major [...]