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Sommaire du n° 499 du 17 septembre 2021
Oncogènes et suppresseurs de tumeurs (3)
Menée in vitro et à l'aide de modèles murins, cette étude met en évidence le rôle de la plasticité des cellules principales de l'estomac dans le développement d'une métaplasie après la survenue de lésions sévères au niveau de la muqueuse gastrique
Chief cell plasticity is the origin of metaplasia following acute injury in the stomach mucosa
Menée in vitro et à l'aide de modèles murins, cette étude met en évidence le rôle de la plasticité des cellules principales de l'estomac dans le développement d'une métaplasie après la survenue de lésions sévères au niveau de la muqueuse gastrique
Chief cell plasticity is the origin of metaplasia following acute injury in the stomach mucosa
Caldwell, Brianna ; Meyer, Anne R. ; Weis, Jared A. ; Engevik, Amy C. ; Choi, Eunyoung
Objective : Metaplasia arises from differentiated cell types in response to injury and is considered a precursor in many cancers. Heterogeneous cell lineages are present in the reparative metaplastic mucosa with response to injury, including foveolar cells, proliferating cells and spasmolytic polypeptide-expressing metaplasia (SPEM) cells, a key metaplastic cell population. Zymogen-secreting chief cells are long-lived cells in the stomach mucosa and have been considered the origin of SPEM [...]
Menée in vitro et à l'aide de modèles murins de cancer hépatique ou de cancer du pancréas, cette étude met en évidence un mécanisme par lequel la déméthylase KDM6A, en diminuant l'activité du complexe protéique mTORC1, réduit la progression tumorale
Histone H3K27 demethylase KDM6A is an epigenetic gatekeeper of mTORC1 signalling in cancer
Menée in vitro et à l'aide de modèles murins de cancer hépatique ou de cancer du pancréas, cette étude met en évidence un mécanisme par lequel la déméthylase KDM6A, en diminuant l'activité du complexe protéique mTORC1, réduit la progression tumorale
Histone H3K27 demethylase KDM6A is an epigenetic gatekeeper of mTORC1 signalling in cancer
Revia, Steffie ; Seretny, Agnieszka ; Wendler, Lena ; Banito, Ana ; Eckert, Christoph ; Breuer, Kersten ; Mayakonda, Anand ; Lutsik, Pavlo ; Evert, Matthias ; Ribback, Silvia ; Gallage, Suchira ; Chikh Bakri, Ismaiel ; Breuhahn, Kai ; Schirmacher, Peter ; Heinrich, Stefan ; Gaida, Matthias M. ; Heikenwalder, Mathias ; Calvisi, Diego F. ; Plass, Christoph ; Lowe, Scott W. ; Tschaharganeh, Darjus F.
Objective: Large-scale genome sequencing efforts of human tumours identified epigenetic modifiers as one of the most frequently mutated gene class in human cancer. However, how these mutations drive tumour development and tumour progression are largely unknown. Here, we investigated the function of the histone demethylase KDM6A in gastrointestinal cancers, such as liver cancer and pancreatic cancer. Design : Genetic alterations as well as expression analyses of KDM6A were performed in patients [...]
Menée à l'aide de modèles murins et de pièces de résection provenant de patients atteints d'un adénocarcinome canalaire du pancréas, cette étude identifie une sous-population de cellules acineuses impliquées dans la carcinogenèse
Acinar cell clonal expansion in pancreas homeostasis and carcinogenesis
Menée à l'aide de modèles murins et de pièces de résection provenant de patients atteints d'un adénocarcinome canalaire du pancréas, cette étude identifie une sous-population de cellules acineuses impliquées dans la carcinogenèse
Acinar cell clonal expansion in pancreas homeostasis and carcinogenesis
Neuhöfer, Patrick ; Roake, Caitlin M. ; Kim, Stewart J. ; Lu, Ryan J. ; West, Robert B. ; Charville, Gregory W. ; Artandi, Steven E.
Pancreatic ductal adenocarcinoma (PDAC) is one of the leading causes of cancer deaths worldwide1. Studies in human tissues and in mouse models have suggested that for many cancers, stem cells sustain early mutations driving tumour development2,3. For the pancreas, however, mechanisms underlying cellular renewal and initiation of PDAC remain unresolved. Here, using lineage tracing from the endogenous telomerase reverse transcriptase (Tert) locus, we identify a rare TERT-positive subpopulation of [...]
Progression et métastases (2)
Menée in vitro et à l'aide de xénogreffes de tumeurs sur des modèles murins, cette étude met en évidence le rôle de la myosine 10 dans l'instabilité génomique, la réponse inflammatoire et la progression tumorale
MYO10 drives genomic instability and inflammation in cancer
Menée in vitro et à l'aide de xénogreffes de tumeurs sur des modèles murins, cette étude met en évidence le rôle de la myosine 10 dans l'instabilité génomique, la réponse inflammatoire et la progression tumorale
MYO10 drives genomic instability and inflammation in cancer
Franklin Mayca Pozo ; Xinran Geng ; Ilaria Tamagno ; Mark W. Jackson ; Ernest G. Heimsath ; John A. Hammer ; Richard E. Cheney ; Youwei Zhang
Genomic instability is a hallmark of human cancer; yet the underlying mechanisms remain poorly understood. Here, we report that the cytoplasmic unconventional Myosin X (MYO10) regulates genome stability, through which it mediates inflammation in cancer. MYO10 is an unstable protein that undergoes ubiquitin-conjugating enzyme H7 (UbcH7)/
Menée à l'aide de lignées cellulaires d'adénocarcinome pulmonaire n'exprimant pas TTF-1 et menée à l'aide d'un modèle murin, cette étude met en évidence le rôle de la serglycine dans les interactions entre les cellules tumorales et le stroma, l'acquisition d'un phénotype agressif et l'immunosuppression
SRGN-Triggered Aggressive and Immunosuppressive Phenotype in a Subset of TTF-1–Negative Lung Adenocarcinomas
Menée à l'aide de lignées cellulaires d'adénocarcinome pulmonaire n'exprimant pas TTF-1 et menée à l'aide d'un modèle murin, cette étude met en évidence le rôle de la serglycine dans les interactions entre les cellules tumorales et le stroma, l'acquisition d'un phénotype agressif et l'immunosuppression
SRGN-Triggered Aggressive and Immunosuppressive Phenotype in a Subset of TTF-1–Negative Lung Adenocarcinomas
Tanaka, Ichidai ; Dayde, Delphine ; Tai, Mei Chee ; Mori, Haruki ; Solis, Luisa M. ; Tripathi, Satyendra C. ; Fahrmann, Johannes F. ; Unver, Nese ; Parhy, Gargy ; Jain, Rekha ; Parra, Edwin R. ; Murakami, Yoshiko ; Aguilar-Bonavides, Clemente ; Mino, Barbara ; Celiktas, Muge ; Dhillon, Dilsher ; Casabar, Julian Phillip ; Nakatochi, Masahiro ; Stingo, Francesco ; Baladandayuthapani, Veera ; Wang, Hong ; Katayama, Hiroyuki ; Dennison, Jennifer B. ; Lorenzi, Philip L. ; Do, Kim-Anh ; Fujimoto, Junya ; Behrens, Carmen ; Ostrin, Edwin J. ; Rodriguez-Canales, Jaime ; Hase, Tetsunari ; Fukui, Takayuki ; Kajino, Taisuke ; Kato, Seiichi ; Yatabe, Yasushi ; Hosoda, Waki ; Kawaguchi, Koji ; Yokoi, Kohei ; Chen-Yoshikawa, Toyofumi F. ; Hasegawa, Yoshinori ; Gazdar, Adi F. ; Wistuba, Ignacio I. ; Hanash, Samir ; Taguchi, Ayumu
Background : About 20% of lung adenocarcinoma (LUAD) is negative for the lineage-specific oncogene Thyroid transcription factor 1 (TTF-1) and exhibits worse clinical outcome with a low frequency of actionable genomic alterations. To identify molecular features associated with TTF-1–negative LUAD, we compared the transcriptomic and proteomic profiles of LUAD cell lines. SRGN, a chondroitin sulfate proteoglycan Serglycin, was identified as a markedly overexpressed gene in TTF-1–negative LUAD. We [...]
Ressources et infrastructures (Biologie) (3)
Menée à l'aide de lignées cellulaires et de modèles murins, cette étude met en évidence le rôle de la protéine TIPE2 dans la maturation des cellules NK et l'immunité antitumorale
TIPE2 is a checkpoint of natural killer cell maturation and antitumor immunity
Menée à l'aide de lignées cellulaires et de modèles murins, cette étude met en évidence le rôle de la protéine TIPE2 dans la maturation des cellules NK et l'immunité antitumorale
TIPE2 is a checkpoint of natural killer cell maturation and antitumor immunity
Jiacheng Bi ; Chen Cheng ; Chaoyue Zheng ; Chen Huang ; Xiaohu Zheng ; Xiaochun Wan ; Youhai H. Chen ; Zhigang Tian ; Haoyu Sun
The maturation process of NK cells determines their functionality during which IL-15 plays a critical role. However, very few checkpoints specifically targeting this process have been discovered. Here, we report that TIPE2 expression gradually increased during NK cell ontogenesis correlating to their maturation stages in both mice and humans. NK-specific TIPE2 deficiency increased mature NK cells in mice, and these TIPE2-deficient NK cells exhibited enhanced activation, cytotoxicity, and IFN-
Menée à partir d'échantillons tumoraux, d'échantillons de tissus sains et d'échantillons sanguins prélevés sur 232 patients atteints d'un cancer du poumon et n'ayant jamais fumé, cette étude analyse les caractéristiques génomiques des tumeurs ainsi que leur évolution clonale
Genomic and evolutionary classification of lung cancer in never smokers
Menée à partir d'échantillons tumoraux, d'échantillons de tissus sains et d'échantillons sanguins prélevés sur 232 patients atteints d'un cancer du poumon et n'ayant jamais fumé, cette étude analyse les caractéristiques génomiques des tumeurs ainsi que leur évolution clonale
Genomic and evolutionary classification of lung cancer in never smokers
Zhang, Tongwu ; Joubert, Philippe ; Ansari-Pour, Naser ; Zhao, Wei ; Hoang, Phuc H. ; Lokanga, Rachel ; Moye, Aaron L. ; Rosenbaum, Jennifer ; Gonzalez-Perez, Abel ; Martínez-Jiménez, Francisco ; Castro, Andrea ; Muscarella, Lucia Anna ; Hofman, Paul ; Consonni, Dario ; Pesatori, Angela C. ; Kebede, Michael ; Li, Mengying ; Gould Rothberg, Bonnie E. ; Peneva, Iliana ; Schabath, Matthew B. ; Poeta, Maria Luana ; Costantini, Manuela ; Hirsch, Daniela ; Heselmeyer-Haddad, Kerstin ; Hutchinson, Amy ; Olanich, Mary ; Lawrence, Scott M. ; Lenz, Petra ; Duggan, Maire ; Bhawsar, Praphulla M. S. ; Sang, Jian ; Kim, Jung ; Mendoza, Laura ; Saini, Natalie ; Klimczak, Leszek J. ; Islam, S. M. Ashiqul ; Otlu, Burcak ; Khandekar, Azhar ; Cole, Nathan ; Stewart, Douglas R. ; Choi, Jiyeon ; Brown, Kevin M. ; Caporaso, Neil E. ; Wilson, Samuel H. ; Pommier, Yves ; Lan, Qing ; Rothman, Nathaniel ; Almeida, Jonas S. ; Carter, Hannah ; Ried, Thomas ; Kim, Carla F. ; Lopez-Bigas, Nuria ; Garcia-Closas, Montserrat ; Shi, Jianxin ; Bosse, Yohan ; Zhu, Bin ; Gordenin, Dmitry A. ; Alexandrov, Ludmil B. ; Chanock, Stephen J. ; Wedge, David C. ; Landi, Maria Teresa
Lung cancer in never smokers (LCINS) is a common cause of cancer mortality but its genomic landscape is poorly characterized. Here high-coverage whole-genome sequencing of 232 LCINS showed 3 subtypes defined by copy number aberrations. The dominant subtype (piano), which is rare in lung cancer in smokers, features somatic UBA1 mutations, germline AR variants and stem cell-like properties, including low mutational burden, high intratumor heterogeneity, long telomeres, frequent KRAS mutations and [...]
Menée à l'aide de lignées cellulaires, de xénogreffes, de données du projet "The Cancer Genome Atlas" et d'échantillons tumoraux prélevés sur des patientes atteintes d'un cancer invasif du col de l'utérus, cette étude met en évidence l'intérêt d'une cartographie multi-omique des sites d'intégration du papillomavirus humain pour identifier des gènes impliqués dans la carcinogenèse et pouvant constituer des cibles thérapeutiques
Multi-omics mapping of human papillomavirus integration sites illuminates novel cervical cancer target genes
Menée à l'aide de lignées cellulaires, de xénogreffes, de données du projet "The Cancer Genome Atlas" et d'échantillons tumoraux prélevés sur des patientes atteintes d'un cancer invasif du col de l'utérus, cette étude met en évidence l'intérêt d'une cartographie multi-omique des sites d'intégration du papillomavirus humain pour identifier des gènes impliqués dans la carcinogenèse et pouvant constituer des cibles thérapeutiques
Multi-omics mapping of human papillomavirus integration sites illuminates novel cervical cancer target genes
Iden, Marissa ; Tsaih, Shirng-Wern ; Huang, Yi-Wen ; Liu, Pengyuan ; Xiao, Meizhu ; Flister, Michael J. ; Rader, Janet S.
Background : Integration of human papillomavirus (HPV) into the host genome is a dominant feature of invasive cervical cancer (ICC), yet the tumorigenicity of cis genomic changes at integration sites remains largely understudied. Methods : Combining multi-omics data from The Cancer Genome Atlas with patient-matched long-read sequencing of HPV integration sites, we developed a strategy for using HPV integration events to identify and prioritise novel candidate ICC target genes [...]