Menée à partir d'échantillons tumoraux issus de patients atteints d'un cancer du poumon à petites cellules, cette étude identifie les caractéristiques moléculaires des cellules cancéreuses surexprimant ASCL1 et des cellules cancéreuses surexprimant NEUROD1 puis analyse l'évolution de ces deux sous-types cellulaires

Molecular features and evolutionary trajectory of ASCL1+ and NEUROD1+ SCLC cells

Zhang, Xuexi ; Wang, Hao ; Liu, Wenxu ; Xiao, Zengtuan ; Ma, Zhenyi ; Zhang, Zhenfa ; Gong, Wenchen ; Chen, Jun ; Liu, Zhe

Background : Small cell lung cancer (SCLC) is the most aggressive subtype of lung cancer without recognised morphologic or genetic heterogeneity. Based on the expression of four transcription factors, ASCL1, NEUROD1, POU2F3, and YAP1, SCLCs are classified into four subtypes. However, biological functions of these different subtypes are largely uncharacterised. Methods : We studied intratumoural heterogeneity of resected human primary SCLC tissues using single-cell RNA-Seq. In addition, we [...]

Cet article analyse le rôle du récepteur PPAR gamma dans le développement et la progression d'un cancer de la prostate

The role of PPARgamma in prostate cancer development and progression

Hartley, Andrew ; Ahmad, Imran

Advanced and metastatic prostate cancer is often incurable, but its dependency on certain molecular alterations may provide the basis for targeted therapies. A growing body of research has demonstrated that peroxisome proliferator-activated receptor gamma (PPARγ) is amplified as prostate cancer progresses. PPARγ has been shown to support prostate cancer growth through its roles in fatty acid synthesis, mitochondrial biogenesis, and co-operating with androgen receptor signalling. Interestingly, [...]

Menée à l'aide de lignées cellulaires et de modèles murins, cette étude met en évidence les rôles opposés, dans la régulation de la colonisation métastatique et la croissance des cellules cancéreuses du sein, de deux ARNs de transfert isoaccepteurs de l'isoleucine puis identifie le mécanisme impliqué

Two isoleucyl tRNAs that decode synonymous codons divergently regulate breast cancer metastatic growth by controlling translation of proliferation-regulating genes

Earnest-Noble, Lisa B. ; Hsu, Dennis ; Chen, Siyu ; Asgharian, Hosseinali ; Nandan, Mandayam ; Passarelli, Maria C. ; Goodarzi, Hani ; Tavazoie, Sohail F.

The human genome contains 61 codons encoding 20 amino acids. Synonymous codons representing a given amino acid are decoded by a set of transfer RNAs (tRNAs) called isoacceptors. We report the surprising observation that two isoacceptor tRNAs that decode synonymous codons become modulated in opposing directions during breast cancer progression. Specifically, tRNAIleUAU became upregulated, whereas tRNAIleGAU became repressed as breast cancer cells attained enhanced metastatic capacity. [...]

Menée in vitro et à l'aide notamment de xénogreffes de cellules de glioblastomes humains sur le cerveau de souris, cette étude met en évidence le rôle dans la croissance tumorale de réseaux de cellules cancéreuses très actives présentant une activité calcique périodique autonome

Autonomous rhythmic activity in glioma networks drives brain tumour growth

Hausmann, David ; Hoffmann, Dirk C. ; Venkataramani, Varun ; Jung, Erik ; Horschitz, Sandra ; Tetzlaff, Svenja K. ; Jabali, Ammar ; Hai, Ling ; Kessler, Tobias ; Azoŕin, Daniel D. ; Weil, Sophie ; Kourtesakis, Alexandros ; Sievers, Philipp ; Habel, Antje ; Breckwoldt, Michael O. ; Karreman, Matthia A. ; Ratliff, Miriam ; Messmer, Julia M. ; Yang, Yvonne ; Reyhan, Ekin ; Wendler, Susann ; Löb, Cathrin ; Mayer, Chanté ; Figarella, Katherine ; Osswald, Matthias ; Solecki, Gergely ; Sahm, Felix ; Garaschuk, Olga ; Kuner, Thomas ; Koch, Philipp ; Schlesner, Matthias ; Wick, Wolfgang ; Winkler, Frank

Diffuse gliomas, particularly glioblastomas, are incurable brain tumours1. They are characterized by networks of interconnected brain tumour cells that communicate via Ca2+ transients2–6. However, the networks’ architecture and communication strategy and how these influence tumour biology remain unknown. Here we describe how glioblastoma cell networks include a small, plastic population of highly active glioblastoma cells that display rhythmic Ca2+ oscillations and are particularly connected to [...]

A partir d'une analyse moléculaire d'adénocarcinomes appendiculaires, de données cliniques et de données histopathologiques, cette étude identifie des sous-types moléculaires distincts

Molecular Classification of Appendiceal Adenocarcinoma

Foote, Michael B. ; Walch, Henry ; Chatila, Walid ; Vakiani, Efsevia ; Chandler, Chris ; Steinruecke, Felix ; Nash, Garrett M. ; Stadler, Zsofia ; Chung, Sebastian ; Yaeger, Rona ; Braghrioli, Maria Ignez ; Shia, Jinru ; Kemel, Yelena ; Maio, Anna ; Sheehan, Margaret ; Rousseau, Benoit ; Argiles, Guillem ; Berger, Michael ; Solit, David ; Schultz, Nikolaus ; Diaz, Luis A. ; Cercek, Andrea

PURPOSE : Appendiceal adenocarcinomas (ACs) are rare, histologically diverse malignancies treated as colorectal cancers despite having distinct biology and clinical behavior. To guide clinical decision making, we defined molecular subtypes of AC associated with patient survival, metastatic burden, and chemotherapy response. PATIENTS AND METHODS : A comprehensive molecular analysis was performed in patients with AC to define molecular subtypes. Associations between molecular subtype and overall [...]

Menée à l'aide de lignées cellulaires et d'échantillons de carcinomes à cellules rénales ainsi que de données de l'"International Cancer Genome Consortium", du projet "The Cancer Genome Atlas" et du "Pan-Cancer Analysis of Whole Genomes", cette étude identifie 160 séquences nucléotidiques répétées dans le génome de 7 types de cancer

Recurrent repeat expansions in human cancer genomes

Erwin, Graham S. ; Gürsoy, Gamze ; Al-Abri, Rashid ; Suriyaprakash, Ashwini ; Dolzhenko, Egor ; Zhu, Kevin ; Hoerner, Christian R. ; White, Shannon M. ; Ramirez, Lucia ; Vadlakonda, Ananya ; Vadlakonda, Alekhya ; von Kraut, Konor ; Park, Julia ; Brannon, Charlotte M. ; Sumano, Daniel A. ; Kirtikar, Raushun A. ; Erwin, Alicia A. ; Metzner, Thomas J. ; Yuen, Ryan K. C. ; Fan, Alice C. ; Leppert, John T. ; Eberle, Michael A. ; Gerstein, Mark ; Snyder, Michael P.

Expansion of a single repetitive DNA sequence, termed a tandem repeat (TR), is known to cause more than 50 diseases1,2. However, repeat expansions are often not explored beyond neurological and neurodegenerative disorders. In some cancers, mutations accumulate in short tracts of TRs, a phenomenon termed microsatellite instability; however, larger repeat expansions have not been systematically analysed in cancer3–8. Here we identified TR expansions in 2,622 cancer genomes spanning 29 cancer [...]

Menée à partir de l'analyse multi-omique d'échantillons tumoraux prélevés sur 42 patientes atteintes d'un cancer séreux ovarien de haut grade, cette étude examine la manière dont les mécanismes mutationnels et les sites anatomiques des foyers tumoraux façonnent les caractéristiques immunologiques du microenvironnement tumoral

Ovarian cancer mutational processes drive site-specific immune evasion

Vázquez-García, Ignacio ; Uhlitz, Florian ; Ceglia, Nicholas ; Lim, Jamie L. P. ; Wu, Michelle ; Mohibullah, Neeman ; Niyazov, Juliana ; Ruiz, Arvin Eric B. ; Boehm, Kevin M. ; Bojilova, Viktoria ; Fong, Christopher J. ; Funnell, Tyler ; Grewal, Diljot ; Havasov, Eliyahu ; Leung, Samantha ; Pasha, Arfath ; Patel, Druv M. ; Pourmaleki, Maryam ; Rusk, Nicole ; Shi, Hongyu ; Vanguri, Rami ; Williams, Marc J. ; Zhang, Allen W. ; Broach, Vance ; Chi, Dennis S. ; da Cruz Paula, Arnaud ; Gardner, Ginger J. ; Kim, Sarah H. ; Lennon, Matthew ; Long Roche, Kara ; Sonoda, Yukio ; Zivanovic, Oliver ; Kundra, Ritika ; Viale, Agnes ; Derakhshan, Fatemeh N. ; Geneslaw, Luke ; Issa Bhaloo, Shirin ; Maroldi, Ana ; Nunez, Rahelly ; Pareja, Fresia ; Stylianou, Anthe ; Vahdatinia, Mahsa ; Bykov, Yonina ; Grisham, Rachel N. ; Liu, Ying L. ; Lakhman, Yulia ; Nikolovski, Ines ; Kelly, Daniel ; Gao, JianJiong ; Schietinger, Andrea ; Hollmann, Travis J. ; Bakhoum, Samuel F. ; Soslow, Robert A. ; Ellenson, Lora H. ; Abu-Rustum, Nadeem R. ; Aghajanian, Carol ; Friedman, Claire F. ; McPherson, Andrew ; Weigelt, Britta ; Zamarin, Dmitriy ; Shah, Sohrab P.

High-grade serous ovarian cancer (HGSOC) is an archetypal cancer of genomic instability1–4 patterned by distinct mutational processes5,6, tumour heterogeneity7–9 and intraperitoneal spread7,8,10. Immunotherapies have had limited efficacy in HGSOC11–13, highlighting an unmet need to assess how mutational processes and the anatomical sites of tumour foci determine the immunological states of the tumour microenvironment. Here we carried out an integrative analysis of whole-genome sequencing, [...]

Menée à l'aide de lignées cellulaires, d'un modèle murin et d'échantillons tumoraux issus de patients atteints d'un carcinome du poumon à petites cellules, cette étude identifie des états cellulaires distincts et réversibles qui confèrent hétérogénéité et plasticité à la tumeur

Multivalent state transitions shape the intratumoral composition of small cell lung carcinoma

Gopal, Priyanka ; Petty, Aaron ; Rogacki, Kevin ; Bera, Titas ; Bareja, Rohan ; Peacock, Craig D. ; Abazeed, Mohamed E.

Studies to date have not resolved how diverse transcriptional programs contribute to the intratumoral heterogeneity of small cell lung carcinoma (SCLC), an aggressive tumor associated with a dismal prognosis. Here, we identify distinct and commutable transcriptional states that confer discrete functional attributes in individual SCLC tumors. We combine an integrative approach comprising the transcriptomes of 52,975 single cells, high-resolution measurement of cell state dynamics at the [...]