Menée sur un modèle murin de cancer du côlon induit par l'azoxyméthane, cette étude analyse l'évolution du microbiome intestinal, de la composition des acides biliaires et du profil inflammatoire lors de la tumorigenèse

Investigation of the gut microbiome, bile acid composition and host immunoinflammatory response in a model of azoxymethane-induced colon cancer at discrete timepoints

Keane, J. M. ; Walsh, C. J. ; Cronin, P. ; Baker, K. ; Melgar, S. ; Cotter, P. D. ; Joyce, S. A. ; Gahan, C. G. M. ; Houston, A. ; Hyland, N. P.

Background : Distinct sets of microbes contribute to colorectal cancer (CRC) initiation and progression. Some occur due to the evolving intestinal environment but may not contribute to disease. In contrast, others may play an important role at particular times during the tumorigenic process. Here, we describe changes in the microbiota and host over the course of azoxymethane (AOM)-induced tumorigenesis. Methods : Mice were administered AOM or PBS and were euthanised 8, 12, 24 and 48 weeks [...]

Menée à l'aide de lignées cellulaires et de modèles murins de tumeurs, cette étude démontre que le récepteur CLEC-1 des cellules myéloïdes détecte les cellules mortes par nécrose programmée puis met en évidence un mécanisme par lequel l'absence d'expression de CLEC-1 favorise la réponse antitumorale en réduisant l'accumulation des cellules myéloïdes immunosuppressives dans la tumeur et en augmentant la présentation croisée des antigènes des cellules mortes par les cellules dendritiques

CLEC-1 is a death sensor that limits antigen cross-presentation by dendritic cells and represents a target for cancer immunotherapy

Drouin, Marion ; Saenz, Javier ; Gauttier, Vanessa ; Evrard, Berangere ; Teppaz, Geraldine ; Pengam, Sabrina ; Mary, Caroline ; Desselle, Ariane ; Thepenier, Virginie ; Wilhelm, Emmanuelle ; Merieau, Emmanuel ; Ligeron, Camille ; Girault, Isabelle ; Lopez, Maria-Dolores ; Fourgeux, Cynthia ; Sinha, Debajyoti ; Baccelli, Irene ; Moreau, Aurelie ; Louvet, Cedric ; Josien, Regis ; Poschmann, Jeremie ; Poirier, Nicolas ; Chiffoleau, Elise

Tumors exploit numerous immune checkpoints, including those deployed by myeloid cells to curtail antitumor immunity. Here, we show that the C-type lectin receptor CLEC-1 expressed by myeloid cells senses dead cells killed by programmed necrosis. Moreover, we identified Tripartite Motif Containing 21 (TRIM21) as an endogenous ligand overexpressed in various cancers. We observed that the combination of CLEC-1 blockade with chemotherapy prolonged mouse survival in tumor models. Loss of CLEC-1 [...]

Menée à l'aide de lignées cellulaires et de sphéroïdes de cancer du pancréas, cette étude met en évidence un mécanisme par lequel les interactions entre l'acidose tumorale, la protéine p53 et la matrice extracellulaire contribuent au développement tumoral

Crosstalk between tumor acidosis, p53, and extracellular matrix regulates pancreatic cancer aggressiveness

Czaplinska, Dominika ; Ialchina, Renata ; Andersen, Henriette Berg ; Yao, Jiayi ; Stigliani, Arnaud ; Dannesboe, Johs ; Flinck, Mette ; Chen, Xiaoming ; Mitrega, Jakub ; Gnosa, Sebastian Peter ; Dmytriyeva, Oksana ; Alves, Frauke ; Napp, Joanna ; Sandelin, Albin ; Pedersen, Stine Falsig

Pancreatic ductal adenocarcinoma (PDAC) is an extremely aggressive malignancy with minimal treatment options and a global rise in prevalence. PDAC is characterized by frequent driver mutations including KRAS and TP53 (p53), and a dense, acidic tumor microenvironment (TME). The relation between genotype and TME in PDAC development is unknown. Strikingly, when wild type (WT) Panc02 PDAC cells were adapted to growth in an acidic TME and returned to normal pH to mimic invasive cells escaping acidic [...]

Menée in vitro et à l'aide d'un modèle murin d'adénocarcinome canalaire du pancréas, cette étude identifie deux sous-types métaboliques distincts de cellules néoplasiques, l'un surproduisant et sécrétant de l'asparagine lors du stress mitochondrial, l'autre capturant cet acide aminé pour assurer la prolifération cellulaire

Differential integrated stress response and asparagine production drive symbiosis and therapy resistance of pancreatic adenocarcinoma cells

Halbrook, Christopher J. ; Thurston, Galloway ; Boyer, Seth ; Anaraki, Cecily ; Jiménez, Jennifer A. ; McCarthy, Amy ; Steele, Nina G. ; Kerk, Samuel A. ; Hong, Hanna S. ; Lin, Lin ; Law, Fiona V. ; Felton, Catherine ; Scipioni, Lorenzo ; Sajjakulnukit, Peter ; Andren, Anthony ; Beutel, Alica K. ; Singh, Rima ; Nelson, Barbara S. ; Van Den Bergh, Fran ; Krall, Abigail S. ; Mullen, Peter J. ; Zhang, Li ; Batra, Sandeep ; Morton, Jennifer P. ; Stanger, Ben Z. ; Christofk, Heather R. ; Digman, Michelle A. ; Beard, Daniel A. ; Viale, Andrea ; Zhang, Ji ; Crawford, Howard C. ; Pasca di Magliano, Marina ; Jorgensen, Claus ; Lyssiotis, Costas A.

The pancreatic tumor microenvironment drives deregulated nutrient availability. Accordingly, pancreatic cancer cells require metabolic adaptations to survive and proliferate. Pancreatic cancer subtypes have been characterized by transcriptional and functional differences, with subtypes reported to exist within the same tumor. However, it remains unclear if this diversity extends to metabolic programming. Here, using metabolomic profiling and functional interrogation of metabolic dependencies, [...]

Menée à l'aide d'une lignée cellulaire de cancer du sein triple négatif, d'un modèle murin et de données génomiques, cette étude met en évidence un mécanisme par lequel la présence de cellules cancéreuses, en altèrant les voies de signalisation du microenvironnement et la méthylation de l'ADN des macrophages associés à la tumeur, favorise le développement d'une tumeur agressive au pronostic défavorable

DNA methylation landscape of tumor-associated macrophages reveals pathways, transcription factors, and prognostic value relevant to triple-negative breast cancer patients

Hey, Joschka ; Halperin, Coral ; Hartmann, Mark ; Mayer, Shimrit ; Schönung, Maximilian ; Lipka, Daniel B. ; Scherz-Shouval, Ruth ; Plass, Christoph

The accumulation of myeloid cells, particularly tumor-associated macrophages (TAMs), +97289342299characterizes the tumor microenvironment (TME) of many solid cancers, including breast ruth.shouval@weizmann.ac.il cancer. Compared to healthy tissue-resident macrophages, TAMs acquire distinct transcriptomes and tumor-promoting functions by largely unknown mechanisms. Here, we hypothesize the involvement of TME signaling and subsequent epigenetic reprogramming of TAMs. Using the 4 T1 mouse model of [...]

Menée in vitro et à l'aide d'un modèle murin de tumeur mammaire, cette étude met en évidence un mécanisme par lequel une hyperglycémie liée au diabète favorise la progression tumorale via le raidissement de la matrice extracellulaire induit par la glycation

Diabetic hyperglycemia promotes primary tumor progression through glycation-induced tumor extracellular matrix stiffening

Wang, Wenjun ; Hapach, Lauren A. ; Griggs, Lauren ; Smart, Kyra ; Wu, Yusheng ; Taufalele, Paul V. ; Rowe, Matthew M. ; Young, Katherine M. ; Bates, Madison E. ; Johnson, Andrew C. ; Ferrell, Nicholas J. ; Pozzi, Ambra ; Reinhart-King, Cynthia A.

Diabetes mellitus is a complex metabolic disorder that is associated with an increased risk of breast cancer. Despite this correlation, the interplay between tumor progression and diabetes, particularly with regard to stiffening of the extracellular matrix, is still mechanistically unclear. Here, we established a murine model where hyperglycemia was induced before breast tumor development. Using the murine model, in vitro systems, and patient samples, we show that hyperglycemia increases tumor [...]

Cet article présente les caractéristiques de la biobanque britannique "UK Biobank" et examine son utilisation dans la recherche sur les cancers

UK Biobank: a globally important resource for cancer research

Conroy, Megan C. ; Lacey, Ben ; Besevic, Jelena ; Omiyale, Wemimo ; Feng, Qi ; Effingham, Mark ; Sellers, Jonathan ; Sheard, Simon ; Pancholi, Mahesh ; Gregory, Gareth ; Busby, John ; Collins, Rory ; Allen, Naomi E.

UK Biobank is a large-scale prospective study with deep phenotyping and genomic data. Its open-access policy allows researchers worldwide, from academia or industry, to perform health research in the public interest. Between 2006 and 2010, the study recruited 502,000 adults aged 40–69 years from the general population of the United Kingdom. At enrolment, participants provided information on a wide range of factors, physical measurements were taken, and biological samples (blood, urine and [...]

Cet article analyse le rôle, dans le microenvironnement des tumeurs solides, des métabolites associés à la protéine transmembranaire CD38 puis examine l'intérêt de cibler les voies de signalisation CD38-NAD+ ou CD38-cADPR/ADPR pour enrayer le développement tumoral

Evolving roles of CD38 metabolism in solid tumour microenvironment

Gao, Long ; Du, Xiaohong ; Li, Jiabin ; Qin, F. Xiao-Feng

Given that plenty of clinical findings and reviews have already explained in detail on the progression of CD38 in multiple myeloma and haematological system tumours, here we no longer give unnecessary discussion on the above progression. Though therapeutic antibodies have been regarded as a greatest breakthrough in multiple myeloma immunotherapies due to the durable anti-tumour responses in the clinic, but the role of CD38 in the immunologic regulation and evasion of non-hematopoietic solid [...]

Menée à partir de données cliniques et diagnostiques portant sur 854 patients présentant des variants rares du gène CDH1 et sur 1 021 parents (âge : 1 à 93 ans), cette étude européenne multicentrique identifie des associations entre des variants constitutionnels du gène CDH1 et des phénotypes tumoraux

Genotype-first approach to identify associations between CDH1 germline variants and cancer phenotypes: a multicentre study by the European Reference Network on Genetic Tumour Risk Syndromes

Garcia-Pelaez, José ; Barbosa-Matos, Rita ; Lobo, Silvana ; Dias, Alexandre ; Garrido, Luzia ; Castedo, Sérgio ; Sousa, Sónia ; Pinheiro, Hugo ; Sousa, Liliana ; Monteiro, Rita ; Maqueda, Joaquin J. ; Fernandes, Susana ; Carneiro, Fatima ; Pinto, Nádia ; Lemos, Carolina ; Pinto, Carla ; Teixeira, Manuel R. ; Aretz, Stefan ; Bajalica-Lagercrantz, Svetlana ; Balmañà, Judith ; Blatnik, Ana ; Benusiglio, Patrick R. ; Blanluet, Maud ; Bours, Vicent ; Brems, Hilde ; Brunet, Joan ; Calistri, Daniele ; Capella, Gabriel ; Carrera, Sergio ; Colas, Chrystelle ; Dahan, Karin ; de Putter, Robin ; Desseignés, Camille ; Domínguez-Garrido, Elena ; Egas, Conceição ; Evans, D. Gareth ; Feret, Damien ; Fewings, Eleanor ; Fitzgerald, Rebecca C. ; Coulet, Florence ; Garcia-Barcina, María ; Genuardi, Maurizio ; Golmard, Lisa ; Hackmann, Karl ; Hanson, Helen ; Holinski-Feder, Elke ; Hüneburg, Robert ; Krajc, Mateja ; Lagerstedt-Robinson, Kristina ; Lázaro, Conxi ; Ligtenberg, Marjolijn J. L. ; Martínez-Bouzas, Cristina ; Merino, Sonia ; Michils, Geneviève ; Novakovic, Srdjan ; Patino-Garcia, Ana ; Ranzani, Guglielmina Nadia ; Schröck, Evelin ; Silva, Ines ; Silveira, Catarina ; Soto, José L. ; Spier, Isabel ; Steinke-Lange, Verena ; Tedaldi, Gianluca ; Tejada, Maria-Isabel ; Woodward, Emma R. ; Tischkowitz, Marc ; Hoogerbrugge, Nicoline ; Oliveira, Carla

Background : Truncating pathogenic or likely pathogenic variants of CDH1 cause hereditary diffuse gastric cancer (HDGC), a tumour risk syndrome that predisposes carrier individuals to diffuse gastric and lobular breast cancer. Rare CDH1 missense variants are often classified as variants of unknown significance. We conducted a genotype–phenotype analysis in families carrying rare CDH1 variants, comparing cancer spectrum in carriers of pathogenic or likely pathogenic variants (PV/LPV; analysed [...]

Menée à l'aide de lignées cellulaires, de xénogreffes sur des modèles murins et d'une technique de criblage génétique utilisant la technologie d'édition CRISPER/Cas9, cette étude met en évidence un mécanisme par lequel la suppression de cFLIP, une protéine impliquée dans l'inhibition de l'apoptose, et l'activation du récepteur DR5 sensiblisent les cellules cancéreuses sénescentes à la sénolyse

cFLIP suppression and DR5 activation sensitize senescent cancer cells to senolysis

Wang, Liqin ; Jin, Haojie ; Jochems, Fleur ; Wang, Siying ; Lieftink, Cor ; Martinez, Isabel Mora ; De Conti, Giulia ; Edwards, Finn ; de Oliveira, Rodrigo Leite ; Schepers, Arnout ; Zhou, Yangyang ; Zheng, Jiaojiao ; Wu, Wei ; Zheng, Xingling ; Yuan, Shengxian ; Ling, Jing ; Jastrzebski, Kathy ; Santos Dias, Matheus Dos ; Song, Ji-Ying ; Celie, Patrick N. H. ; Yagita, Hideo ; Yao, Ming ; Zhou, Weiping ; Beijersbergen, Roderick L. ; Qin, Wenxin ; Bernards, Rene

Senolytics, drugs that kill senescent cells, have been proposed to improve the response to pro-senescence cancer therapies; however, this remains challenging due to a lack of broadly acting senolytic drugs. Using CRISPR/Cas9-based genetic screens in different senescent cancer cell models, we identify loss of the death receptor inhibitor cFLIP as a common vulnerability of senescent cancer cells. Senescent cells are primed for apoptotic death by NF-κB-mediated upregulation of death receptor 5 [...]

Cet article présente une méthode computationnelle pour mesurer directement le niveau d'hypertranscription dans plusieurs types tumoraux

Widespread hypertranscription in aggressive human cancers

Zatzman, Matthew ; Fuligni, Fabio ; Ripsman, Ryan ; Suwal, Tannu ; Comitani, Federico ; Edward, Lisa-Monique ; Denroche, Rob ; Jang, Gun Ho ; Notta, Faiyaz ; Gallinger, steven ; Selvanathan, Saravana P. ; Toretsky, Jeffrey A. ; Hellmann, Matthew D. ; Tabori, Uri ; Huang, Annie ; Shlien, Adam

Cancers are often defined by the dysregulation of specific transcriptional programs; however, the importance of global transcriptional changes is less understood. Hypertranscription is the genome-wide increase in RNA output. Hypertranscription’s prevalence, underlying drivers, and prognostic significance are undefined in primary human cancer. This is due, in part, to limitations of expression profiling methods, which assume equal RNA output between samples. Here, we developed a computational [...]

Cet article présente les mécanismes moléculaires régulant la différenciation des lymphocytes T auxiliaires folliculaires et analyse le rôle de ces cellules dans l'immunité antitumorale

Regulation of follicular T helper cell differentiation in antitumor immunity

Hou, Yueru ; Cao, Yejin ; Dong, Lin ; Huang, Yijin ; Zhang, Zhiyuan ; Bi, Yujing ; Liu, Guangwei

Follicular T helper (Tfh) cells are a subset of CD4+ T cells that play an important role in the formation of germinal centers and the maturation and differentiation of affinity-matured B cells. Recent studies have demonstrated important functions of Tfh cells in tertiary lymphoid structures of tumors, revealing great potential of Tfh cells in tumor immunity. However, Tfh development is incompletely understood. The differentiation of Tfh cells is a complex, multistage process regulated at the [...]

Menée à partir de l'analyse de 270 000 transcriptomes à l'échelle cellulaire et 100 exomes entiers de patients atteints d'un carcinome rénal à cellules claires, cette étude cartographie les caractéristiques génomiques de différentes régions tumorales, du microenvironnement et des tissus environnants puis examine la répartition de différentes populations cellulaires (cellules cancéreuses, cellules stromales, cellules immunitaires)

Mapping single-cell transcriptomes in the intra-tumoral and associated territories of kidney cancer

Li, Ruoyan ; Ferdinand, John R. ; Loudon, Kevin W. ; Bowyer, Georgina S. ; Laidlaw, Sean ; Muyas, Francesc ; Mamanova, Lira ; Neves, Joana B. ; Bolt, Liam ; Fasouli, Eirini S. ; Lawson, Andrew R. J. ; Young, Matthew D. ; Hooks, Yvette ; Oliver, Thomas R. W. ; Butler, Timothy M. ; Armitage, James N. ; Aho, Tev ; Riddick, Antony C. P. ; Gnanapragasam, Vincent ; Welsh, Sarah J. ; Meyer, Kerstin B. ; Warren, Anne Y. ; Tran, Maxine G. B. ; Stewart, Grant D. ; Cortés-Ciriano, Isidro ; Behjati, Sam ; Clatworthy, Menna R. ; Campbell, Peter J. ; Teichmann, Sarah A. ; Mitchell, Thomas J.

Tumor behavior is intricately dependent on the oncogenic properties of cancer cells and their multi-cellular interactions. To understand these dependencies within the wider microenvironment, we studied over 270,000 single-cell transcriptomes and 100 microdissected whole exomes from 12 patients with kidney tumors, prior to validation using spatial transcriptomics. Tissues were sampled from multiple regions of the tumor core, the tumor-normal interface, normal surrounding tissues, and peripheral [...]

Menée à l'aide de modèles murins, d'échantillons de tissus sains ou cancéreux de vessie et de données du projet "The Cancer Genome Atlas", cette étude met en évidence un mécanisme par lequel la baisse d'expression de la protéine CBX7, induite par l'activateur de l'homologue 2 de Zeste, réduit la sensibilité des cellules cancéreuses au cisplatine en augmentant le niveau d'expression du récepteur FGFR3

Downregulation of CBX7 induced by EZH2 upregulates FGFR3 expression to reduce sensitivity to cisplatin in bladder cancer

Ren, Jiannan ; Yu, Haixin ; Li, Wei ; Jin, Xin ; Yan, Bin

Background : Cisplatin-based cytotoxic chemotherapy is considered to be the first-line therapy for advanced bladder cancer (BC), but resistance to cisplatin limits its antitumor effect. Fibroblast growth factor receptor 3 (FGFR3) has been reported to contribute to the progression and cisplatin resistance of BC. Meanwhile, chromobox protein homologue 7 (CBX7) was reported to inhibit BC progression. And our previous RNA-seq data on CBX7 (GSE185630) suggested that CBX7 might repress FGFR3, but the [...]