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Sommaire du n° 511 du 17 janvier 2022
Biologie
Oncogènes et suppresseurs de tumeurs (2)
Menée à partir de données transcriptomiques et métabolomiques portant sur des tissus hépatiques sains ou tumoraux prélevés sur 551 patients atteints d'un carcinome hépatocellulaire et menée sur des souris, cette étude met en évidence le rôle suppresseur de tumeur du cytochrome CYP39A1, une protéine appartenant à la famille des cytochromes P450 et dont le niveau d'expression est plus élevé chez la femme que chez l'homme
Blocking hepatocarcinogenesis by a cytochrome P450 family member with female-preferential expression
Menée à partir de données transcriptomiques et métabolomiques portant sur des tissus hépatiques sains ou tumoraux prélevés sur 551 patients atteints d'un carcinome hépatocellulaire et menée sur des souris, cette étude met en évidence le rôle suppresseur de tumeur du cytochrome CYP39A1, une protéine appartenant à la famille des cytochromes P450 et dont le niveau d'expression est plus élevé chez la femme que chez l'homme
Blocking hepatocarcinogenesis by a cytochrome P450 family member with female-preferential expression
Ji, Fubo ; Zhang, Jianjuan ; Liu, Niya ; Gu, Yuanzhuo ; Zhang, Yan ; Huang, Peipei ; Zhang, Nachuan ; Lin, Shengda ; Pan, Ran ; Meng, Zhuoxian ; Feng, Xin-Hua ; Roessler, Stephanie ; Zheng, Xin ; Ji, Junfang
Objects : The incidence of hepatocellular carcinoma (HCC) shows an obvious male dominance in rodents and humans. We aimed to identify the key autosomal liver-specific sex-related genes and investigate their roles in hepatocarcinogenesis. Design : Two HCC cohorts (n=551) with available transcriptome and metabolome data were used. Class comparisons of omics data and ingenuity pathway analysis were performed to explore sex-related molecules and their associated functions. Functional assays were [...]
Menée in vitro et à l'aide d'un modèle murin, cette étude met en évidence un mécanisme par lequel le long ARN non codant lnc-CTHCC, en liant la ribonucléoprotéine nucléaire hétérogène K et en activant la transcription du facteur YAP1, favorise la carcinogenèse des cellules hépatiques
The cancer-testis lncRNA lnc-CTHCC promotes hepatocellular carcinogenesis by binding hnRNP K and activating YAP1 transcription
Menée in vitro et à l'aide d'un modèle murin, cette étude met en évidence un mécanisme par lequel le long ARN non codant lnc-CTHCC, en liant la ribonucléoprotéine nucléaire hétérogène K et en activant la transcription du facteur YAP1, favorise la carcinogenèse des cellules hépatiques
The cancer-testis lncRNA lnc-CTHCC promotes hepatocellular carcinogenesis by binding hnRNP K and activating YAP1 transcription
Xia, Anliang ; Yuan, Wenwen ; Wang, Qiang ; Xu, Jianbo ; Gu, Yayun ; Zhang, Liansheng ; Chen, Chen ; Wang, Zhangding ; Wu, Di ; He, Qifeng ; Yu, Weiwei ; Wang, Fei ; Xue, Cailin ; Zhang, Yan ; Bao, Guojian ; Tao, Xuewen ; Liu, Siyuan ; Wang, Shouyu ; Hu, Zhibin ; Sun, Beicheng
Cancer-testis (CT) genes participate in the initiation and progression of cancer, but the role of CT-associated long non-coding RNAs (CT-lncRNAs) in hepatocellular carcinoma (HCC) is still elusive. Here, we discovered a conserved CT-lncRNA, named lnc-CTHCC, which was highly expressed in the testes and HCC. A lnc-CTHCC-knockout (KO) mouse model further confirmed that the global loss of lnc-CTHCC inhibited the occurrence and development of HCC. In vitro and in vivo assays also showed that [...]
Progression et métastases (5)
Cet article passe en revue les études concernant les mécanismes de progression des cancers et analyse le rôle de deux processus distincts dans cette progression
Vessel co-option and angiotropic extravascular migratory metastasis: a continuum of tumour growth and spread ?
Cet article passe en revue les études concernant les mécanismes de progression des cancers et analyse le rôle de deux processus distincts dans cette progression
Vessel co-option and angiotropic extravascular migratory metastasis: a continuum of tumour growth and spread ?
Lugassy, Claire ; Vermeulen, Peter B. ; Ribatti, Domenico ; Pezzella, Francesco ; Barnhill, Raymond L.
Two fields of cancer research have emerged dealing with the biology of tumour cells localised to the abluminal vascular surface: vessel co-option (VCo), a non-angiogenic mode of tumour growth and angiotropic extravascular migratory metastasis (EVMM), a non-hematogenous mode of tumour migration and metastasis. VCo is a mechanism by which tumour cells gain access to a blood supply by spreading along existing blood vessels in order to grow locally. Angiotropic EVMM involves “pericytic mimicry” [...]
Menée à l'aide de modèles murins d'adénocarcinome canalaire du pancréas, cette étude met en évidence un mécanisme par lequel les vésicules extracellulaires des cellules souches cancéreuses, en formant au sein de la tumeur un réseau de communication entre les différentes sous-populations de cellules cancéreuses, favorisent la progression de la maladie
Extracellular Vesicles from Pancreatic Cancer Stem Cells Lead an Intratumor Communication Network (EVNet) to fuel tumour progression
Menée à l'aide de modèles murins d'adénocarcinome canalaire du pancréas, cette étude met en évidence un mécanisme par lequel les vésicules extracellulaires des cellules souches cancéreuses, en formant au sein de la tumeur un réseau de communication entre les différentes sous-populations de cellules cancéreuses, favorisent la progression de la maladie
Extracellular Vesicles from Pancreatic Cancer Stem Cells Lead an Intratumor Communication Network (EVNet) to fuel tumour progression
Ruivo, Carolina F. ; Bastos, Nuno ; Adem, Barbara ; Batista, Ines ; Duraes, Cecilia ; Melo, Carlos A. ; Castaldo, Stéphanie A. ; Campos‐Laborie, Francisco ; Moutinho-Ribeiro, Pedro ; Morão, Barbara ; Costa-Pinto, Ana ; Silva, Soraia ; Osorio, Hugo ; Ciordia, Sergio ; Costa, Jose Luis ; Goodrich, David ; Cavadas, Bruno ; Pereira, Luisa ; Kouzarides, Tony ; Macedo, Guilherme ; Maio, Rui ; Carneiro, Fatima ; Cravo, Marília ; Kalluri, Raghu ; Machado, Jose Carlos ; Melo, Sonia A.
Objective : Intratumor heterogeneity drives cancer progression and therapy resistance. However, it has yet to be determined whether and how subpopulations of cancer cells interact and how this interaction affects the tumour. Design : We have studied the spontaneous flow of extracellular vesicles (EVs) between subpopulations of cancer cells: cancer stem cells (CSC) and non-stem cancer cells (NSCC). To determine the biological significance of the most frequent communication route, we used [...]
Menée à l'aide d'une analyse in silico de la méthylation de l'ADN de chondrosarcomes dédifférenciés et de chondrosarcomes conventionnels puis menée à l'aide d'échantillons tumoraux et de lignées cellulaires, cette étude met en évidence un mécanisme par lequel la réduction du niveau d'expression de la protéine kinase C zêta, induite par la méthylation de l'ADN, prévient l'apoptose des cellules des chondrosarcomes dédifférenciés via l'inactivation de la voie de signalisation ATM/CHK2
Methylation-mediated silencing of protein kinase C zeta induces apoptosis avoidance through ATM/CHK2 inactivation in dedifferentiated chondrosarcoma
Menée à l'aide d'une analyse in silico de la méthylation de l'ADN de chondrosarcomes dédifférenciés et de chondrosarcomes conventionnels puis menée à l'aide d'échantillons tumoraux et de lignées cellulaires, cette étude met en évidence un mécanisme par lequel la réduction du niveau d'expression de la protéine kinase C zêta, induite par la méthylation de l'ADN, prévient l'apoptose des cellules des chondrosarcomes dédifférenciés via l'inactivation de la voie de signalisation ATM/CHK2
Methylation-mediated silencing of protein kinase C zeta induces apoptosis avoidance through ATM/CHK2 inactivation in dedifferentiated chondrosarcoma
Shimada, Eijiro ; Matsumoto, Yoshihiro ; Nakagawa, Makoto ; Susuki, Yosuke ; Endo, Makoto ; Setsu, Nokitaka ; Fujiwara, Toshifumi ; Iida, Keiichiro ; Nabeshima, Akira ; Yahiro, Kenichiro ; Kimura, Atsushi ; Hirose, Takeshi ; Kanahori, Masaya ; Oyama, Ryunosuke ; Oda, Yoshinao ; Nakashima, Yasuharu
Background : Dedifferentiated chondrosarcoma (DDCS) is an aggressive bone tumour with a poor prognosis and no effective treatment. Because changes in DNA methylation play critical roles in DDCS, we explored the roles that DNA methylation plays in oncogenesis to potentially identify an effective epigenetic treatment. Methods : We identified genes downregulated in DDCS vs. conventional chondrosarcoma (CCS) due to DNA methylation using in silico analysis. The results were validated in DDCS [...]
Menée in vitro et à l'aide d'une xénogreffe de glioblastome sur un modèle murin, cette étude met en évidence le rôle de la protéine DPY30, un régulateur de la triméthylation de la lysine 4 de l'histone 3, et de la phosphodiestérase PDE4 dans la croissance de la tumeur in vivo
Glioblastoma stem cells reprogram chromatin in vivo to generate selective therapeutic dependencies on DPY30 and phosphodiesterases
Menée in vitro et à l'aide d'une xénogreffe de glioblastome sur un modèle murin, cette étude met en évidence le rôle de la protéine DPY30, un régulateur de la triméthylation de la lysine 4 de l'histone 3, et de la phosphodiestérase PDE4 dans la croissance de la tumeur in vivo
Glioblastoma stem cells reprogram chromatin in vivo to generate selective therapeutic dependencies on DPY30 and phosphodiesterases
Dixit, Deobrat ; Prager Briana, C. ; Gimple Ryan, C. ; Miller Tyler, E. ; Wu, Qiulian ; Yomtoubian, Shira ; Kidwell Reilly, L. ; Lv, Deguan ; Zhao, Linjie ; Qiu, Zhixin ; Zhang, Guoxin ; Lee, Derrick ; Park Donglim, Esther ; Wechsler-Reya Robert, J. ; Wang, Xiuxing ; Bao, Shideng ; Rich Jeremy, N.
Glioblastomas are universally fatal cancers and contain self-renewing glioblastoma stem cells (GSCs) that initiate tumors. Traditional anticancer drug discovery based on in vitro cultures tends to identify targets with poor therapeutic indices and fails to accurately model the effects of the tumor microenvironment. Here, leveraging in vivo genetic screening, we identified the histone H3 lysine 4 trimethylation (H3K4me3) regulator DPY30 (Dpy-30 histone methyltransferase complex regulatory [...]
Menée à partir de l'analyse du transcriptome d'échantillons tumoraux prélevés sur 35 patients atteints d'une tumeur testiculaire germinale séminomateuse, cette étude met en évidence, pour les tumeurs métastatiques, une augmentation de l'expression des gènes impliqués dans le processus inflammatoire, l'angiogenèse et le métabolisme au niveau de la région frontale des cellules cancéreuses invasives
Transcriptome analysis reveals upregulation of immune response pathways at the invasive tumour front of metastatic seminoma germ cell tumours
Menée à partir de l'analyse du transcriptome d'échantillons tumoraux prélevés sur 35 patients atteints d'une tumeur testiculaire germinale séminomateuse, cette étude met en évidence, pour les tumeurs métastatiques, une augmentation de l'expression des gènes impliqués dans le processus inflammatoire, l'angiogenèse et le métabolisme au niveau de la région frontale des cellules cancéreuses invasives
Transcriptome analysis reveals upregulation of immune response pathways at the invasive tumour front of metastatic seminoma germ cell tumours
Nestler, Tim ; Dalvi, Priya ; Haidl, Friederike ; Wittersheim, Maike ; von Brandenstein, Melanie ; Paffenholz, Pia ; Wagener-Ryczek, Svenja ; Pfister, David ; Koitzsch, Ulrike ; Hellmich, Martin ; Buettner, Reinhard ; Odenthal, Margarete ; Heidenreich, Axel
Background : Testicular germ cell tumours (TGCTs) have a high metastasis rate. However, the mechanisms related to their invasion, progression and metastasis are unclear. Therefore, we investigated gene expression changes that might be linked to metastasis in seminomatous testicular germ cell tumour (STGCT) patients. Methods : Defined areas [invasive tumour front (TF) and tumour centre (TC)] of non-metastatic (with surveillance and recurrence-free follow-up >2 years) and metastatic STGCTs were [...]
Ressources et infrastructures (Biologie) (2)
Menée à partir de données multi-omiques et de données de séquençage de l'ARN portant sur des tumeurs séreuses ovariennes de haut grade, cette étude analyse les caractéristiques immunogénomiques de ce type de tumeur, met en évidence des mécanismes d'échappement immunitaire et identifie un sous-type immunologique bénéficiant d'un pronostic favorable
Immuno-genomic characterisation of high-grade serous ovarian cancer reveals immune evasion mechanisms and identifies an immunological subtype with...
Menée à partir de données multi-omiques et de données de séquençage de l'ARN portant sur des tumeurs séreuses ovariennes de haut grade, cette étude analyse les caractéristiques immunogénomiques de ce type de tumeur, met en évidence des mécanismes d'échappement immunitaire et identifie un sous-type immunologique bénéficiant d'un pronostic favorable
Immuno-genomic characterisation of high-grade serous ovarian cancer reveals immune evasion mechanisms and identifies an immunological subtype with a favourable prognosis and improved therapeutic efficacy
Sun, Jie ; Yan, Congcong ; Xu, Dandan ; Zhang, Zicheng ; Li, Ke ; Li, Xiaobo ; Zhou, Meng ; Hao, Dapeng
Background : Immunotherapy has revolutionised the field of cancer therapy and immunology, but has demonstrated limited therapeutic efficacy in high-grade serous ovarian cancer (HGSOC). Methods : Multi-omics data of 495 TCGA HGSOC tumours and RNA-seq data of 1708 HGSOC tumours were analyzed. Multivariate Cox regression analysis and meta-analyses were used to identify prognostic genes. The immune microenvironment was characterised using the ssGSEA methods for 28 immune cell types. [...]
Menée à l'aide de lignées cellulaires, d'organoïdes issus de tumeurs de patientes atteintes d'un cancer du sein et à l'aide d'une xénogreffe sur un modèle murin, cette étude met en évidence la présence d'O-glycanes sialylés en position alpha
O-linked alpha2,3 sialylation defines stem cell populations in breast cancer
Menée à l'aide de lignées cellulaires, d'organoïdes issus de tumeurs de patientes atteintes d'un cancer du sein et à l'aide d'une xénogreffe sur un modèle murin, cette étude met en évidence la présence d'O-glycanes sialylés en position alpha
O-linked alpha2,3 sialylation defines stem cell populations in breast cancer
Walker Melanie, R. ; Goel Hira, Lal ; Mukhopadhyay, Dimpi ; Chhoy, Peter ; Karner Emmet, R. ; Clark Jennifer, L. ; Liu, Haibo ; Li, Rui ; Zhu Julie, Lihua ; Chen, Shuhui ; Mahal Lara, K. ; Bensing Barbara, A. ; Mercurio Arthur, M.
We pursued the hypothesis that specific glycans can be used to distinguish breast cancer stem cells (CSCs) and influence their function. Comparison of CSCs and non-CSCs from multiple breast cancer models revealed that CSCs are distinguished by expression of
