Menée à l'aide de lignées cellulaires et à partir de données du projet "The Cancer Genome Atlas" portant sur plus de 5 000 tumeurs primitives provenant de patients masculins, cette étude analyse la fréquence et le rôle de la perte du chromosome Y dans les tumeurs

Loss of chromosome Y in primary tumors

Qi, Meifang ; Pang, Jiali ; Mitsiades, Irene ; Lane, Andrew A. ; Rheinbay, Esther

Certain cancer types afflict female and male patients disproportionately. The reasons include differences in male/female physiology, effect of sex hormones, risk behavior, environmental exposures, and genetics of the sex chromosomes X and Y. Loss of Y (LOY) is common in peripheral blood cells in aging men, and this phenomenon is associated with several diseases. However, the frequency and role of LOY in tumors is little understood. Here, we present a comprehensive catalog of LOY in >5,000 [...]

Menée in vitro et à l'aide de la cryo-microscopie électronique, cette étude analyse la structure et la fonction du complexe protéique BCDX2 (RAD51B–RAD51C–RAD51D–XRCC2), un suppresseur de tumeur

Structure and function of the RAD51B–RAD51C–RAD51D–XRCC2 tumour suppressor

Greenhough, Luke A. ; Liang, Chih-Chao ; Belan, Ondrej ; Kunzelmann, Simone ; Maslen, Sarah ; Rodrigo-Brenni, Monica C. ; Anand, Roopesh ; Skehel, Mark ; Boulton, Simon J. ; West, Stephen C.

Homologous recombination is a fundamental process of life. It is required for the protection and restart of broken replication forks, the repair of chromosome breaks and the exchange of genetic material during meiosis. Individuals with mutations in key recombination genes, such as BRCA2 (also known as FANCD1), or the RAD51 paralogues RAD51B, RAD51C (also known as FANCO), RAD51D, XRCC2 (also known as FANCU) and XRCC3, are predisposed to breast, ovarian and prostate cancers1–10 and the [...]

Menée à l'aide de lignées cellulaires, d'organoïdes et de modèles murins transgéniques de cancer colorectal, cette étude met en évidence un mécanisme par lequel l'expression de l'histone déméthylase KDM5D codée par le chromosome Y favorise la survenue de tumeurs métastatiques létales

Histone demethylase KDM5D upregulation drives sex differences in colon cancer

Li, Jiexi ; Lan, Zhengdao ; Liao, Wenting ; Horner, James W. ; Xu, Xueping ; Liu, Jielin ; Yoshihama, Yohei ; Jiang, Shan ; Shim, Hong Seok ; Slotnik, Max ; LaBella, Kyle A. ; Wu, Chang-Jiun ; Dunner, Kenneth ; Hsu, Wen-Hao ; Lee, Rumi ; Khanduri, Isha ; Terranova, Christopher ; Akdemir, Kadir ; Chakravarti, Deepavali ; Shang, Xiaoying ; Spring, Denise J. ; Wang, Y. Alan ; DePinho, Ronald A.

Sex exerts a profound impact on cancer incidence, spectrum and outcomes, yet the molecular and genetic bases of such sex differences are ill-defined and presumptively ascribed to X-chromosome genes and sex hormones1. Such sex differences are particularly prominent in colorectal cancer (CRC) in which men experience higher metastases and mortality. A murine CRC model, engineered with an inducible transgene encoding oncogenic mutant KRASG12D and conditional null alleles of Apc and Trp53 tumour [...]

Menée à l'aide de lignées cellulaires, de modèles murins et d'échantillons tumoraux ainsi que d'échantillons tissulaires adjacents fixés au formaldéhyde et inclus en paraffine après prélèvement sur des patients atteints d'un cancer colorectal, cette étude met en évidence un mécanisme par lequel, dans les cellules cancéreuses aneuploïdes, l'augmentation de NADPH, induite par la glucose 6-phosphate déshydrogénase à l'entrée de la mitose, favorise la ségrégation chromosomique et la progression tumorale

A mitotic NADPH upsurge promotes chromosome segregation and tumour progression in aneuploid cancer cells

Cheng, Aoxing ; Xu, Tian ; You, Weiyi ; Wang, Ting ; Zhang, Dongming ; Guo, Huimin ; Zhang, Haiyan ; Pan, Xin ; Wang, Yucai ; Liu, Liu ; Zhang, Kaiguang ; Shi, Jue ; Yao, Xuebiao ; Guo, Jing ; Yang, Zhenye

Redox metabolites have been observed to fluctuate through the cell cycle in cancer cells, but the functional impacts of such metabolic oscillations remain unknown. Here, we uncover a mitosis-specific nicotinamide adenine dinucleotide phosphate (NADPH) upsurge that is essential for tumour progression. Specifically, NADPH is produced by glucose 6-phosphate dehydrogenase (G6PD) upon mitotic entry, which neutralizes elevated reactive oxygen species (ROS) and prevents ROS-mediated inactivation of [...]

Menée à l'aide de lignées cellulaires, de modèles murins et de données du projet "The Cancer Genome Atlas" portant sur 300 patients masculins atteints d'un cancer invasif de la vessie de stade localement avancé, cette étude met en évidence un mécanisme par lequel les cellules cancéreuses ayant perdu le chromosome Y favorisent la croissance tumorale en induisant l'épuisement des lymphocytes T

Y chromosome loss in cancer drives growth by evasion of adaptive immunity

Abdel-Hafiz, Hany A. ; Schafer, Johanna M. ; Chen, Xingyu ; Xiao, Tong ; Gauntner, Timothy D. ; Li, Zihai ; Theodorescu, Dan

Loss of the Y chromosome (LOY) is observed in multiple cancer types, including 10–40% of bladder cancers1–6, but its clinical and biological significance is unknown. Here, using genomic and transcriptomic studies, we report that LOY correlates with poor prognoses in patients with bladder cancer. We performed in-depth studies of naturally occurring LOY mutant bladder cancer cells as well as those with targeted deletion of Y chromosome by CRISPR–Cas9. Y-positive (Y+) and Y-negative (Y–) tumours [...]

Menée à l'aide de lignées cellulaires, d'organoïdes, de modèles murins et d'échantillons tumoraux issus de patients atteints d'un carcinome gastrique neuroendocrinien, cette étude examine les caractéristiques génomiques de ce type de tumeur

An integrated cellular and molecular model of gastric neuroendocrine cancer evolution highlights therapeutic targets

Griger, Joscha ; Widholz, Sebastian A. ; Jesinghaus, Moritz ; de Andrade Krätzig, Niklas ; Lange, Sebastian ; Engleitner, Thomas ; Montero, Juan José ; Zhigalova, Ekaterina ; Ollinger, Rupert ; Suresh, Veveeyan ; Winkler, Wiebke ; Lier, Svenja ; Baranov, Olga ; Trozzo, Riccardo ; Ben Khaled, Najib ; Chakraborty, Shounak ; Yu, Jiakun ; Konukiewitz, Björn ; Steiger, Katja ; Pfarr, Nicole ; Rajput, Ashish ; Sailer, David ; Keller, Gisela ; Schirmacher, Peter ; Röcken, Christoph ; Fagerstedt, Klaus W. ; Mayerle, Julia ; Schmidt-Supprian, Marc ; Schneider, Günter ; Weichert, Wilko ; Calado, Dinis P. ; Sommermann, Thomas ; Klöppel, Günter ; Rajewsky, Klaus ; Saur, Dieter ; Rad, Roland

Gastric neuroendocrine carcinomas (G-NEC) are aggressive malignancies with poorly understood biology and a lack of disease models. Here, we use genome sequencing to characterize the genomic landscapes of human G-NEC and its histologic variants. We identify global and subtype-specific alterations and expose hitherto unappreciated gains of MYC family members in a large part of cases. Genetic engineering and lineage tracing in mice delineate a model of G-NEC evolution, which defines MYC as a [...]

Cet article analyse le rôle des fibroblastes et de leurs médiateurs dans le développement des carcinomes hépatocellulaires et des cholangiocarcinomes puis identifie des stratégies pour prévenir ou traiter ces tumeurs

Fibroblasts in liver cancer: functions and therapeutic translation

Affò, Silvia ; Filliol, Aveline ; Gores, Gregory J. ; Schwabe, Robert F.

Accumulation of fibroblasts in the premalignant or malignant liver is a characteristic feature of liver cancer, but has not been therapeutically leveraged despite evidence for pathophysiologically relevant roles in tumour growth. Hepatocellular carcinoma is a largely non-desmoplastic tumour, in which fibroblasts accumulate predominantly in the pre-neoplastic fibrotic liver and regulate the risk for hepatocellular carcinoma development through a balance of tumour-suppressive and tumour-promoting [...]

Menée à partir de l'analyse protéomique et métabolomique d'échantillons de carcinomes hépatocellulaires fibrolamellaires et d'échantillons tissulaires adjacents normaux, cette étude met en évidence une modification du protéome dans les tissus transformés et identifie un mécanisme expliquant la survenue d'une encéphalopathie hyperammoniémique chez les patients atteints de ce type de tumeur

Disruption of proteome by an oncogenic fusion kinase alters metabolism in fibrolamellar hepatocellular carcinoma

Levin, Solomon N. ; Tomasini, Michael D. ; Knox, James ; Shirani, Mahsa ; Shebl, Bassem ; Requena, David ; Clark, Jackson ; Heissel, Søren ; Alwaseem, Hanan ; Surjan, Rodrigo ; Lahasky, Ron ; Molina, Henrik ; Torbenson, Michael S. ; Lyons, Barbara ; Migler, Rachael D. ; Coffino, Philip ; Simon, Sanford M.

Fibrolamellar hepatocellular carcinoma (FLC) is a usually lethal primary liver cancer driven by a somatic dysregulation of protein kinase A. We show that the proteome of FLC tumors is distinct from that of adjacent nontransformed tissue. These changes can account for some of the cell biological and pathological alterations in FLC cells, including their drug sensitivity and glycolysis. Hyperammonemic encephalopathy is a recurrent problem in these patients, and established treatments based on the [...]

Menée à partir du séquençage à l'échelle cellulaire de l'ARN d'échantillons sanguins et d'échantillons tissulaires provenant de patients atteints d'un cancer colorectal avec métastases hépatiques, cette étude cartographie le profil transcriptionnel des cellules des sites primitifs et des cellules des sites métastatiques (cellules endothéliales, fibroblastes, cellules cancéreuses, cellules myéloïdes, cellules T/NK et plasmocytes)

Single-cell and spatial transcriptome analysis reveals the cellular heterogeneity of liver metastatic colorectal cancer

Wang, Fei ; Long, Jie ; Li, Liang ; Wu, Zi-Xin ; Da, Tian-Tian ; Wang, Xiao-Qing ; Huang, Chuan ; Jiang, Yi-Hua ; Yao, Xue-Qing ; Ma, Hai-Qing ; Lian, Zhe-Xiong ; Zhao, Zhi-Bin ; Cao, Jie

In this study, we comprehensively charted the cellular landscape of colorectal cancer (CRC) and well-matched liver metastatic CRC using single-cell and spatial transcriptome RNA sequencing. We generated 41,892 CD45− nonimmune cells and 196,473 CD45+ immune cells from 27 samples of six CRC patients, and found that CD8_CXCL13 and CD4_CXCL13 subsets increased significantly in liver metastatic samples that exhibited high proliferation ability and tumor-activating characterization, contributing to [...]

Menée à l'aide de données génomiques du projet "The Cancer Genome Atlas" portant sur 10 872 tumeurs et menée à l'aide d'un algorithme, cette étude analyse l'origine de l'aneuploïdie des cellules cancéreuses

Cancer aneuploidies are shaped primarily by effects on tumour fitness

Shih, Juliann ; Sarmashghi, Shahab ; Zhakula-Kostadinova, Nadja ; Zhang, Shu ; Georgis, Yohanna ; Hoyt, Stephanie H. ; Cuoco, Michael S. ; Gao, Galen F. ; Spurr, Liam F. ; Berger, Ashton C. ; Ha, Gavin ; Rendo, Verónica ; Shen, Hui ; Meyerson, Matthew ; Cherniack, Andrew D. ; Taylor, Alison M. ; Beroukhim, Rameen

Aneuploidies—whole-chromosome or whole-arm imbalances—are the most prevalent alteration in cancer genomes1,2. However, it is still debated whether their prevalence is due to selection or ease of generation as passenger events1,2. Here we developed a method, BISCUT, that identifies loci subject to fitness advantages or disadvantages by interrogating length distributions of telomere- or centromere-bounded copy-number events. These loci were significantly enriched for known cancer driver genes, [...]

Cet article décrit les modifications de la composition du microbiote intestinal chez les patients atteints d'un cancer de stade avancé, examine les effets de ces modifications sur la tumeur puis analyse l'utilité des signatures basées sur le microbiote pour les immunothérapies anticancéreuses, plus particulièrement les inhibiteurs de points de contrôle immunitaires

Gut OncoMicrobiome Signatures (GOMS) as next-generation biomarkers for cancer immunotherapy

Thomas, Andrew Maltez ; Fidelle, Marine ; Routy, Bertrand ; Kroemer, Guido ; Wargo, Jennifer A. ; Segata, Nicola ; Zitvogel, Laurence

Oncogenesis is associated with intestinal dysbiosis, and stool shotgun metagenomic sequencing in individuals with this condition might constitute a non-invasive approach for the early diagnosis of several cancer types. The prognostic relevance of antibiotic intake and gut microbiota composition urged investigators to develop tools for the detection of intestinal dysbiosis to enable patient stratification and microbiota-centred clinical interventions. Moreover, since the advent of [...]