Dissecting bulk transcriptomes of diffuse large B cell lymphoma
Ce dossier présente deux études ayant permis, à l'aide de données du projet "The Cancer Genome Atlas" et d'un outil permettant de développer des algorithmes d'apprentissage automatique, d'identifier les états cellulaires et les écosystèmes de différents types de carcinome humain
Cancer Cell, sous presse, 2021, commentaire
Résumé en anglais
Diffuse large B cell lymphoma (DLBCL) is a markedly phenotypically heterogenous disease, frequently assessed using bulk genomic techniques that blur the intrinsic heterogeneity of each tumor. In this issue of Cancer Cell, Steen et al. have utilized a computational framework called EcoTyper to skillfully dissect bulk transcriptomic tumor profiles into different cell type components in an unsupervised manner.