Nota Bene Cancer
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Sommaire du n° 473 du 8 janvier 2021
Oncogènes et suppresseurs de tumeurs (1)
Menée à partir d'échantillons de tissus hépatiques issus de 217 patients atteints d'une stéatose hépatique non alcoolique et menée à l'aide de modèles murins, cette étude met en évidence le rôle de la kinase RIPK3 dans la régulation du métabolisme lipidique, le processus inflammatoire et la carcinogenèse
RIPK3 acts as a lipid metabolism regulator contributing to inflammation and carcinogenesis in non-alcoholic fatty liver disease
Menée à partir d'échantillons de tissus hépatiques issus de 217 patients atteints d'une stéatose hépatique non alcoolique et menée à l'aide de modèles murins, cette étude met en évidence le rôle de la kinase RIPK3 dans la régulation du métabolisme lipidique, le processus inflammatoire et la carcinogenèse
RIPK3 acts as a lipid metabolism regulator contributing to inflammation and carcinogenesis in non-alcoholic fatty liver disease
Afonso, Marta B. ; Rodrigues, Pedro M. ; Mateus-Pinheiro, Miguel ; Simão, André L. ; Gaspar, Maria M. ; Majdi, Amie ; Arretxe, Enara ; Alonso, Cristina ; Santos, Alvaro ; Jimenez-Agüero, Raul ; Eizaguirre, Emma ; Bujanda, Luis ; Pareja, Maria Jesus ; Banales, Jesus ; Ratziu, Vlad ; Gautheron, Jérémie ; Castro, Rui E. ; Rodrigues, Cecilia M. P.
Objective : Receptor-interacting protein kinase 3 (RIPK3) is a key player in necroptosis execution and an emerging metabolic regulator, whose contribution to non-alcoholic fatty liver disease (NAFLD) is controversial. We aimed to clarify the impact of RIPK3 signalling in the pathogenesis of human and experimental NAFLD. Design : RIPK3 levels were evaluated in two large independent cohorts of patients with biopsy proven NAFLD diagnosis and correlated with clinical and biochemical parameters. [...]
Progression et métastases (2)
Menée à l'aide d'un modèle murin de tumeur, cette étude met en évidence un mécanisme par lequel l'autophagie, en inhibant l'apoptose liée au TNFalpha, protège les cellules cancéreuses de la cytotoxicité induite par les lymphocytes T
Autophagy protects tumors from T cell–mediated cytotoxicity via inhibition of TNFalpha-induced apoptosis
Menée à l'aide d'un modèle murin de tumeur, cette étude met en évidence un mécanisme par lequel l'autophagie, en inhibant l'apoptose liée au TNFalpha, protège les cellules cancéreuses de la cytotoxicité induite par les lymphocytes T
Autophagy protects tumors from T cell–mediated cytotoxicity via inhibition of TNFalpha-induced apoptosis
Young, Tara M. ; Reyes, Claudia ; Pasnikowski, Elizabeth ; Castanaro, Carla ; Wong, Chung ; Decker, Corinne E. ; Chiu, Joyce ; Song, Hang ; Wei, Yi ; Bai, Yu ; Zambrowicz, Brian ; Thurston, Gavin ; Daly, Christopher
Tumors evade antitumor T cells by various mechanisms. Young et al. used a CRISPR screen to identify that TNFα and autophagy play a role in T cell–mediated killing of tumor cells. Pharmacologic or genetic (CRISPR knockout of Rb1cc1) inhibition of autophagy in tumor cells increased TNFα-mediated T cell killing of tumor cells. Rb1cc1 knockout in tumor cells improved the efficacy of immune checkpoint blockade in a mouse tumor model. However, CRISPR knockout of the TNFα receptor in tumor cells [...]
Menée à l'aide de lignées cellulaires et d'échantillons tumoraux issus de patients atteints d'un carcinome à cellules rénales, cette étude met en évidence un mécanisme par lequel des altérations de l'ADN mitochondrial favorisent de manière irréversible la glycolyse aérobique dans les cellules cancéreuses présentant une déficience de la fumarate hydratase
Mitochondrial DNA alterations underlie an irreversible shift to aerobic glycolysis in fumarate hydratase–deficient renal cancer
Menée à l'aide de lignées cellulaires et d'échantillons tumoraux issus de patients atteints d'un carcinome à cellules rénales, cette étude met en évidence un mécanisme par lequel des altérations de l'ADN mitochondrial favorisent de manière irréversible la glycolyse aérobique dans les cellules cancéreuses présentant une déficience de la fumarate hydratase
Mitochondrial DNA alterations underlie an irreversible shift to aerobic glycolysis in fumarate hydratase–deficient renal cancer
Crooks, Daniel R. ; Maio, Nunziata ; Lang, Martin ; Ricketts, Christopher J. ; Vocke, Cathy D. ; Gurram, Sandeep ; Turan, Sevilay ; Kim, Yun-Young ; Cawthon, G. Mariah ; Sohelian, Ferri ; De Val, Natalia ; Pfeiffer, Ruth M. ; Jailwala, Parthav ; Tandon, Mayank ; Tran, Bao ; Fan, Teresa W. M. ; Lane, Andrew N. ; Ried, Thomas ; Wangsa, Darawalee ; Malayeri, Ashkan A. ; Merino, Maria J. ; Yang, Youfeng ; Meier, Jordan L. ; Ball, Mark W. ; Rouault, Tracey A. ; Srinivasan, Ramaprasad ; Linehan, W. Marston
Deficiency in the metabolic enzyme fumarate hydratase distinguishes an aggressive and lethal form of kidney cancer called hereditary leiomyomatosis and renal cell carcinoma (HLRCC). Crooks et al. investigated the molecular basis for why HLRCC tumors rapidly grow and metastasize. Deficiency in fumarate hydratase led to the accumulation of the metabolite fumarate, resulting in the modification and inactivation of factors involved in mitochondrial DNA replication and proofreading. Subsequently, [...]
Ressources et infrastructures (Biologie) (6)
Menée à partir d'échantillons d'ascites péritonéales prélevés sur 15 patients atteints d'un adénocarcinome gastrique, cette étude analyse le profil transcriptomique de plus de 45 000 métastases péritonéales, examine la contribution de la diversité des lignées cellulaires dans l'hétérogénéité intratumorale et identifie une signature, basée sur l'expression de 12 gènes, permettant d'établir un pronostic
Single-cell dissection of intratumoral heterogeneity and lineage diversity in metastatic gastric adenocarcinoma
Menée à partir d'échantillons d'ascites péritonéales prélevés sur 15 patients atteints d'un adénocarcinome gastrique, cette étude analyse le profil transcriptomique de plus de 45 000 métastases péritonéales, examine la contribution de la diversité des lignées cellulaires dans l'hétérogénéité intratumorale et identifie une signature, basée sur l'expression de 12 gènes, permettant d'établir un pronostic
Single-cell dissection of intratumoral heterogeneity and lineage diversity in metastatic gastric adenocarcinoma
Wang, Ruiping ; Dang, Minghao ; Harada, Kazuto ; Han, Guangchun ; Wang, Fang ; Pool Pizzi, Melissa ; Zhao, Meina ; Tatlonghari, Ghia ; Zhang, Shaojun ; Hao, Dapeng ; Lu, Yang ; Zhao, Shuangtao ; Badgwell, Brian D. ; Blum Murphy, Mariela ; Shanbhag, Namita ; Estrella, Jeannelyn S. ; Roy-Chowdhuri, Sinchita ; Abdelhakeem, Ahmed Adel Fouad ; Wang, Yuanxin ; Peng, Guang ; Hanash, Samir ; Calin, George A. ; Song, Xingzhi ; Chu, Yanshuo ; Zhang, Jianhua ; Li, Mingyao ; Chen, Ken ; Lazar, Alexander J. ; Futreal, Andrew ; Song, Shumei ; Ajani, Jaffer A. ; Wang, Linghua
Intratumoral heterogeneity (ITH) is a fundamental property of cancer; however, the origins of ITH remain poorly understood. We performed single-cell transcriptome profiling of peritoneal carcinomatosis (PC) from 15 patients with gastric adenocarcinoma (GAC), constructed a map of 45,048 PC cells, profiled the transcriptome states of tumor cell populations, incisively explored ITH of malignant PC cells and identified significant correlates with patient survival. The links between tumor cell [...]
Cet article passe en revue les différents modes de régulation métabolique des cellules cancéreuses et analyse comment différents types cellulaires contribuent à la composition en métabolites du microenvironnement tumoral
Metabolites and the tumour microenvironment: from cellular mechanisms to systemic metabolism
Cet article passe en revue les différents modes de régulation métabolique des cellules cancéreuses et analyse comment différents types cellulaires contribuent à la composition en métabolites du microenvironnement tumoral
Metabolites and the tumour microenvironment: from cellular mechanisms to systemic metabolism
Elia, Ilaria ; Haigis, Marcia C.
Metabolic transformation is a hallmark of cancer and a critical target for cancer therapy. Cancer metabolism and behaviour are regulated by cell-intrinsic factors as well as metabolite availability in the tumour microenvironment (TME). This metabolic niche within the TME is shaped by four tiers of regulation: (1) intrinsic tumour cell metabolism, (2) interactions between cancer cells and non-cancerous cells, (3) tumour location and heterogeneity and (4) whole-body metabolic homeostasis. Here, [...]
Cet article présente deux cas de transmission vaginale de cancer du poumon par des mères atteintes d'un cancer du col de l'utérus
Vaginal Transmission of Cancer from Mothers with Cervical Cancer to Infants
Cet article présente deux cas de transmission vaginale de cancer du poumon par des mères atteintes d'un cancer du col de l'utérus
Vaginal Transmission of Cancer from Mothers with Cervical Cancer to Infants
Arakawa, Ayumu ; Ichikawa, Hitoshi ; Kubo, Takashi ; Motoi, Noriko ; Kumamoto, Tadashi ; Nakajima, Miho ; Yonemori, Kan ; Noguchi, Emi ; Sunami, Kuniko ; Shiraishi, Kouya ; Kakishima, Hiroki ; Yoshida, Hiroshi ; Hishiki, Tomoro ; Kawakubo, Naonori ; Kuroda, Takafumi ; Kiyokawa, Takako ; Yamada, Kyosuke ; Yanaihara, Nozomu ; Takahashi, Kazuaki ; Okamoto, Aikou ; Hirabayashi, Shinsuke ; Hasegawa, Daisuke ; Manabe, Atsushi ; Ono, Kentaro ; Matsuoka, Masaki ; Arai, Yasuhito ; Togashi, Yosuke ; Shibata, Tatsuhiro ; Nishikawa, Hiroyoshi ; Aoki, Kazunori ; Yamamoto, Noboru ; Kohno, Takashi ; Ogawa, Chitose
Two cases of pediatric lung cancer (in 23-month-old and 6-year-old boys) resulting from mother-to-infant transmission of uterine cervical tumors were incidentally detected during routine next-generation sequencing of paired samples of tumor and normal tissue. Spontaneous regression of some lesions in the first child and slow growth of the tumor mass in the second child suggested the existence of alloimmune responses against the transmitted tumors. Immune checkpoint inhibitor therapy with [...]
Menée à partir de l'analyse du niveau de méthylation de l'ADN d'échantillons de tissus coliques de 128 personnes saines, cette étude examine, en fonction de l'origine ethnique (européenne ou africaine), la différence d'âge épigénétique entre le côlon droit et le côlon gauche
Racial Disparities in Epigenetic Aging of the Right vs Left Colon
Menée à partir de l'analyse du niveau de méthylation de l'ADN d'échantillons de tissus coliques de 128 personnes saines, cette étude examine, en fonction de l'origine ethnique (européenne ou africaine), la différence d'âge épigénétique entre le côlon droit et le côlon gauche
Racial Disparities in Epigenetic Aging of the Right vs Left Colon
Devall, Matthew ; Sun, Xiangqing ; Yuan, Fangcheng ; Cooper, Gregory S. ; Willis, Joseph ; Weisenberger, Daniel J. ; Casey, Graham ; Li, Li
There are well-documented racial differences in age-of-onset and laterality of colorectal cancer. Epigenetic age acceleration is postulated to be an underlying factor. However, comparative studies of side-specific colonic tissue epigenetic aging are lacking. Here, we performed DNA methylation analysis of matched right and left biopsies of normal colon from 128 individuals. Among African Americans (n = 88), the right colon showed accelerated epigenetic aging as compared to individual-matched [...]
Racial differences in epigenetic aging of the colon: Implications for colorectal cancer
Menée à partir de l'analyse du niveau de méthylation de l'ADN d'échantillons de tissus coliques de 128 personnes saines, cette étude examine, en fonction de l'origine ethnique (européenne ou africaine), la différence d'âge épigénétique entre le côlon droit et le côlon gauche
Racial differences in epigenetic aging of the colon: Implications for colorectal cancer
Joshi, Amit D. ; Chan, Andrew T.
Epigenetic processes are implicated in field cancerization of the colorectum with global hypomethylation increasing sequentially in the stepwise progression of normal colorectal tissue to adenomas, adenocarcinomas, and metastatic disease.1–3The heritability of the epigenome4gradually decreases with age as potentially reversible epigenetic modifications capturing the cumulative tissue-specific response to a range of environmental exposures accrue.5–9With aging, there is an overall non-specific [...]
Menée à partir de données clinicopathologiques portant sur 1 315 patientes atteintes d'un cancer du sein et à l'aide d'échantillons tumoraux, cette étude met en évidence, chez les patientes d'origine africaine, la présence intratumorale d'une proportion importante de lymphocytes T CD8+ incapables d'exercer leur activité cytotoxique
Breast Tumor Microenvironment in Black Women: A Distinct Signature of CD8+ T Cell Exhaustion
Menée à partir de données clinicopathologiques portant sur 1 315 patientes atteintes d'un cancer du sein et à l'aide d'échantillons tumoraux, cette étude met en évidence, chez les patientes d'origine africaine, la présence intratumorale d'une proportion importante de lymphocytes T CD8+ incapables d'exercer leur activité cytotoxique
Breast Tumor Microenvironment in Black Women: A Distinct Signature of CD8+ T Cell Exhaustion
Yao, Song ; Cheng, Ting-Yuan David ; Elkhanany, Ahmed ; Yan, Li ; Omilian, Angela ; Abrams, Scott I. ; Evans, Sharon ; Hong, Chi-Chen ; Qi, Qianya ; Davis, Warren ; Liu, Song ; Bandera, Elisa V. ; Odunsi, Kunle ; Takabe, Kazuaki ; Khoury, Thaer ; Ambrosone, Christine B.
Background : Blacks tend to have a stronger inflammatory immune response than Whites. We hypothesized that racial differences in host immunity also manifest in the tumor microenvironment (TME), constituting part of a distinct aggressive tumor biology underlying higher mortality in Black women. Methods : Pathological and gene expression profiling approaches were used for characterizing infiltrating immune cells in breast TME from 1,315 patients from the Women’s Circle of Health Study. Racial [...]
Menée à partir du séquençage de l'ARN de cellules souches provenant de glioblastomes humains, cette étude analyse l'hétérogénéité transcriptionnelle de ce type de cellules
Gradient of Developmental and Injury Response transcriptional states defines functional vulnerabilities underpinning glioblastoma heterogeneity
Menée à partir du séquençage de l'ARN de cellules souches provenant de glioblastomes humains, cette étude analyse l'hétérogénéité transcriptionnelle de ce type de cellules
Gradient of Developmental and Injury Response transcriptional states defines functional vulnerabilities underpinning glioblastoma heterogeneity
Richards, Laura M. ; Whitley, Owen K. N. ; MacLeod, Graham ; Cavalli, Florence M. G. ; Coutinho, Fiona J. ; Jaramillo, Julia E. ; Svergun, Nataliia ; Riverin, Mazdak ; Croucher, Danielle C. ; Kushida, Michelle ; Yu, Kenny ; Guilhamon, Paul ; Rastegar, Naghmeh ; Ahmadi, Moloud ; Bhatti, Jasmine K. ; Bozek, Danielle A. ; Li, Naijin ; Lee, Lilian ; Che, Clare ; Luis, Erika ; Park, Nicole I. ; Xu, Zhiyu ; Ketela, Troy ; Moore, Richard A. ; Marra, Marco A. ; Spears, Julian ; Cusimano, Michael D. ; Das, Sunit ; Bernstein, Mark ; Haibe-Kains, Benjamin ; Lupien, Mathieu ; Luchman, H. Artee ; Weiss, Samuel ; Angers, Stephane ; Dirks, Peter B. ; Bader, Gary D. ; Pugh, Trevor J.
Glioblastomas harbor diverse cell populations, including rare glioblastoma stem cells (GSCs) that drive tumorigenesis. To characterize functional diversity within this population, we performed single-cell RNA sequencing on >69,000 GSCs cultured from the tumors of 26 patients. We observed a high degree of inter- and intra-GSC transcriptional heterogeneity that could not be fully explained by DNA somatic alterations. Instead, we found that GSCs mapped along a transcriptional gradient spanning two [...]