Menée in vitro et à l'aide de modèles murins, cette étude met en évidence un mécanisme par lequel l'amiante, via l'autophagie induite par la protéine HMGB1, favorise la transformation des cellules mésothéliales

Asbestos induces mesothelial cell transformation via HMGB1-driven autophagy

Xue, Jiaming ; Patergnani, Simone ; Giorgi, Carlotta ; Suarez, Joelle ; Goto, Keisuke ; Bononi, Angela ; Tanji, Mika ; Novelli, Flavia ; Pastorino, Sandra ; Xu, Ronghui ; Caroccia, Natascia ; Dogan, A. Umran ; Pass, Harvey I. ; Tognon, Mauro ; Pinton, Paolo ; Gaudino, Giovanni ; Mak, Tak W. ; Carbone, Michele ; Yang, Haining

Millions of people have been exposed to asbestos and are at increased risk of developing mesothelioma, an aggressive malignancy resistant to current therapies. Here, we elucidate critical steps in asbestos carcinogenesis: asbestos induces the release of high mobility group box 1 that triggers autophagy. Autophagy activation constitutes a key biological process that allows some mesothelial cells to survive asbestos cytotoxicity and consequently increases the fraction of DNA-damaged human [...]

Menée à partir de l'analyse génétique de cellules de tissus mammaires pré-cancéreux et cancéreux de souris et d'humains présentant une déficience du gène BRCA1, cette étude met en évidence le rôle de la protéine Plekha5 dans la suppression des métastases

Characterization of BRCA1-deficient premalignant tissues and cancers identifies Plekha5 as a tumor metastasis suppressor

Liu, Jianlin ; Adhav, Ragini ; Miao, Kai ; Su, Sek Man ; Mo, Lihua ; Chan, Un In ; Zhang, Xin ; Xu, Jun ; Li, Jianjie ; Shu, Xiaodong ; Zeng, Jianming ; Zhang, Xu ; Lyu, Xueying ; Pardeshi, Lakhansing ; Tan, Kaeling ; Sun, Heng ; Wong, Koon Ho ; Deng, Chuxia ; Xu, Xiaoling

Single-cell whole-exome sequencing (scWES) is a powerful approach for deciphering intratumor heterogeneity and identifying cancer drivers. So far, however, simultaneous analysis of single nucleotide variants (SNVs) and copy number variations (CNVs) of a single cell has been challenging. By analyzing SNVs and CNVs simultaneously in bulk and single cells of premalignant tissues and tumors from mouse and human BRCA1-associated breast cancers, we discover an evolution process through which the [...]

A partir du séquençage de petits ARNs cytoplasmiques de plus de 200 000 cellules représentant divers types de cellules hépatiques (normales, cancéreuses, f

Onco-fetal Reprogramming of Endothelial Cells Drives Immunosuppressive Macrophages in Hepatocellular Carcinoma

Sharma, Ankur ; Seow, Justine Jia Wen ; Dutertre, Charles-Antoine ; Pai, Rhea ; Blériot, Camille ; Mishra, Archita ; Wong, Regina Men Men ; Singh, Gurmit Singh Naranjan ; Sudhagar, Samydurai ; Khalilnezhad, Shabnam ; Erdal, Sergio ; Teo, Hui Min ; Khalilnezhad, Ahad ; Chakarov, Svetoslav ; Lim, Tony Kiat Hon ; Fui, Alexander Chung Yaw ; Chieh, Alfred Kow Wei ; Chung, Cheow Peng ; Bonney, Glenn Kunnath ; Poh, Brian Goh Kim ; Chan, Jerry K. Y. ; Chow, Pierce K. H. ; Ginhoux, Florent ; DasGupta, Ramanuj

We employed scRNA sequencing to extensively characterize the cellular landscape of human liver from development to disease. Analysis of ∼212,000 cells representing human fetal, hepatocellular carcinoma (HCC), and mouse liver revealed remarkable fetal-like reprogramming of the tumor microenvironment. Specifically, the HCC ecosystem displayed features reminiscent of fetal development, including re-emergence of fetal-associated endothelial cells (PLVAP/VEGFR2) and fetal-like (FOLR2) [...]

A partir notamment de données du projet "The Cancer Genome Atlas" portant sur plus de 9 000 tumeurs représentant 32 types différents de cancer et à l'aide de modélisations, cette étude identifie des altérations génétiques fonctionnelles qui surviennent de manière concomitante au cours de l'évolution tumorale et qui possèdent des effets combinatoires sur les caractéristiques des cellules cancéreuses

Discovering functional evolutionary dependencies in human cancers

Mina, Marco ; Iyer, Arvind ; Tavernari, Daniele ; Raynaud, Franck ; Ciriello, Giovanni

Cancer cells retain genomic alterations that provide a selective advantage. The prediction and validation of advantageous alterations are major challenges in cancer genomics. Moreover, it is crucial to understand how the coexistence of specific alterations alters response to genetic and therapeutic perturbations. In the present study, we inferred functional alterations and preferentially selected combinations of events in >9,000 human tumors. Using a Bayesian inference framework, we validated [...]

Menée à l'aide de modèles murins de cancer du sein et de cancer du poumon, cette étude met en évidence un mécanisme par lequel les cellules cancéreuses, en activant l'axe récepteur TLR3–protéine SLIT2 dans l'endothélium, favorisent le processus métastatique

Tumoural activation of TLR3–SLIT2 axis in endothelium drives metastasis

Tavora, Bernardo ; Mederer, Tobias ; Wessel, Kai J. ; Ruffing, Simon ; Sadjadi, Mahan ; Missmahl, Marc ; Ostendorf, Benjamin N. ; Liu, Xuhang ; Kim, Ji-Young ; Olsen, Olav ; Welm, Alana L. ; Goodarzi, Hani ; Tavazoie, Sohail F.

Blood vessels support tumours by providing nutrients and oxygen, while also acting as conduits for the dissemination of cancer1. Here we use mouse models of breast and lung cancer to investigate whether endothelial cells also have active ‘instructive’ roles in the dissemination of cancer. We purified genetically tagged endothelial ribosomes and their associated transcripts from highly and poorly metastatic tumours. Deep sequencing revealed that metastatic tumours induced expression of the [...]

Menée à l'aide de modèles murins et d'échantillons sanguins et tumoraux de patients atteints d'un cancer du pancréas, cette étude met en évidence un mécanisme par lequel le métabolisme du cholestérol contrôle le développement et la différenciation des cellules cancéreuses

Cholesterol Pathway Inhibition Induces TGF-bêta

Gabitova-Cornell, Linara ; Surumbayeva, Aizhan ; Peri, Suraj ; Franco-Barraza, Janusz ; Restifo, Diana ; Weitz, Nicole ; Ogier, Charline ; Goldman, Aaron R. ; Hartman, Tiffiney R. ; Francescone, Ralph ; Tan, Yinfei ; Nicolas, Emmanuelle ; Shah, Neelima ; Handorf, Elizabeth A. ; Cai, Kathy Q. ; O'Reilly, Alana M. ; Sloma, Ido ; Chiaverelli, Rachel ; Moffitt, Richard A. ; Khazak, Vladimir ; Fang, Carolyn Y. ; Golemis, Erica A. ; Cukierman, Edna ; Astsaturov, Igor

Oncogenic transformation alters lipid metabolism to sustain tumor growth. We define a mechanism by which cholesterol metabolism controls the development and differentiation of pancreatic ductal adenocarcinoma (PDAC). Disruption of distal cholesterol biosynthesis by conditional inactivation of the rate-limiting enzyme Nsdhl or treatment with cholesterol-lowering statins switches glandular pancreatic carcinomas to a basal (mesenchymal) phenotype in mouse models driven by KrasG12D expression and [...]

Menée à partir de l'analyse immunohistochimique d'échantillons tumoraux prélevés sur des patients atteints d'un carcinome épidermoïde de la cavité buccale et à partir de cultures tridimensionnelles et de cultures en suspension, cette étude met en évidence un mécanisme par lequel la signalisation de la protéine YAP, en induisant l'expression de la protéine PIEZO1, favorise la prolifération des cellules cancéreuses

YAP signaling induces PIEZO1 to promote oral squamous cell carcinoma cell proliferation

Hasegawa, Kana ; Fujii, Shinsuke ; Matsumoto, Shinji ; Tajiri, Yudai ; Kikuchi, Akira ; Kiyoshima, Tamotsu

Most cancer cells are exposed to altered extracellular environments, such as an increase in extracellular matrix (ECM) stiffness and soluble signals consisting of growth factors and cytokines. It is therefore conceivable that changes in tumor extracellular environments affect tumor cell behavior. The Hippo pathway reportedly responds to the extracellular environment and regulates the nuclear localization of the transcription co‐activator, yes‐associated protein (YAP)/transcriptional [...]

Menée à partir de 34 échantillons de tissus gastriques cancéreux et de 21 échantillons de tissus gastriques sains, cette étude compare les caractéristiques génétiques du carcinome mixte adéno-neuroendocrine et du carcinome neuroendocrine pur

Comprehensive genetic features of gastric mixed adenoneuroendocrine carcinomas and pure neuroendocrine carcinomas

Koh, Jiwon ; Nam, Soo Kyung ; Kwak, Yoonjin ; Kim, Gilhyang ; Kim, Ka-Kyung ; Lee, Byung-Chul ; Ahn, Sang-Hoon ; Park, Do Joong ; Kim, Hyung-Ho ; Park, Kyoung Un ; Kim, Woo Ho ; Lee, Hye Seung

We aimed to determine the pathogenesis of gastric mixed adenoneuroendocrine carcinoma (MANEC) and pure neuroendocrine carcinoma (NEC) which is largely unknown. Targeted DNA sequencing was performed on 34 tumor samples from 21 patients ? 13 adenocarcinoma (ADC)/NEC components from MANECs and eight pure NECs ? and 21 matched non-neoplastic gastric tissue. Mutational profiles of MANEC/NEC were compared with those of other tumors using public databases. The majority (64.1%; 59/92) of mutations in [...]

Menée à l'aide de lignées cellulaires et de modèles murins, cette étude identifie un ensemble de gènes impliqués dans l'échappement des cellules cancéreuses à la cytotoxicité des lymphocytes T

Functional genomic landscape of cancer-intrinsic evasion of killing by T cells

Lawson, Keith A. ; Sousa, Cristovão M. ; Zhang, Xiaoyu ; Kim, Eiru ; Akthar, Rummy ; Caumanns, Joseph J. ; Yao, Yuxi ; Mikolajewicz, Nicholas ; Ross, Catherine ; Brown, Kevin R. ; Zid, Abdelrahman Abou ; Fan, Zi Peng ; Hui, Shirley ; Krall, Jordan A. ; Simons, Donald M. ; Slater, Chloe J. ; De Jesus, Victor ; Tang, Lujia ; Singh, Richa ; Goldford, Joshua E. ; Martin, Sarah ; Huang, Qian ; Francis, Elizabeth A. ; Habsid, Andrea ; Climie, Ryan ; Tieu, David ; Wei, Jiarun ; Li, Ren ; Tong, Amy Hin Yan ; Aregger, Michael ; Chan, Katherine S. ; Han, Hong ; Wang, Xiaowei ; Mero, Patricia ; Brumell, John H. ; Finelli, Antonio ; Ailles, Laurie ; Bader, Gary ; Smolen, Gromoslaw A. ; Kingsbury, Gillian A. ; Hart, Traver ; Kung, Charles ; Moffat, Jason

The genetic circuits that allow cancer cells to evade destruction by the host immune system remain poorly understood1–3. Here, to identify a phenotypically robust core set of genes and pathways that enable cancer cells to evade killing mediated by cytotoxic T lymphocytes (CTLs), we performed genome-wide CRISPR screens across a panel of genetically diverse mouse cancer cell lines that were cultured in the presence of CTLs. We identify a core set of 182 genes across these mouse cancer models, the [...]

Menée in vitro et à l'aide de modèles murins de leucémie lymphoblastique aiguë, cette étude met en évidence le rôle de la stéaroyl-coenzyme A désaturase dans l'adaptation du métabolisme des cellules leucémiques au microenvironnement du système nerveux central

Metabolic adaptation of acute lymphoblastic leukemia to the central nervous system microenvironment depends on stearoyl-CoA desaturase

Savino, Angela Maria ; Fernandes, Sara Isabel ; Olivares, Orianne ; Zemlyansky, Anna ; Cousins, Antony ; Markert, Elke K. ; Barel, Shani ; Geron, Ifat ; Frishman, Liron ; Birger, Yehudit ; Eckert, Cornelia ; Tumanov, Sergey ; Mackay, Gillian ; Kamphorst, Jurre J. ; Herzyk, Pawel ; Fernández-García, Jonatan ; Abramovich, Ifat ; Mor, Inbal ; Bardini, Michela ; Barin, Ersilia ; Janaki-Raman, Sudha ; Cross, Justin R. ; Kharas, Michael G. ; Gottlieb, Eyal ; Izraeli, Shai ; Halsey, Christina

Metabolic reprogramming is a key hallmark of cancer, but less is known about metabolic plasticity of the same tumor at different sites. Here, we investigated the metabolic adaptation of leukemia in two different microenvironments, the bone marrow and the central nervous system (CNS). We identified a metabolic signature of fatty acid synthesis in CNS leukemia, highlighting stearoyl-CoA desaturase (SCD) as a key player. In vivo SCD overexpression increases CNS disease, whereas genetic or [...]