Menée in vitro et à l'aide d'un modèle murin, cette étude met en évidence un mécanisme par lequel l'aldolase B supprime la carcinogenèse hépatocellulaire en inhibant la glucose-6-phosphate déshydrogénase et la voie des pentoses phosphates

Aldolase B suppresses hepatocellular carcinogenesis by inhibiting G6PD and pentose phosphate pathways

Li, Min ; He, Xuxiao ; Guo, Weixing ; Yu, Hongming ; Zhang, Shicheng ; Wang, Ningning ; Liu, Guijun ; Sa, Rina ; Shen, Xia ; Jiang, Yabo ; Tang, Yufu ; Zhuo, Yujuan ; Yin, Chunzhao ; Tu, Qiaochu ; Li, Nan ; Nie, Xiaoqun ; Li, Yu ; Hu, Zhimin ; Zhu, Hanwen ; Ding, Jianping ; Li, Zi ; Liu, Te ; Zhang, Fan ; Zhou, He ; Li, Shengxian ; Yue, Jiang ; Yan, Zheng ; Cheng, Shuqun ; Tao, Yongzhen ; Yin, Huiyong

Metabolic reprogramming is a core hallmark of cancer but it remains poorly defined in hepatocellular carcinogenesis (HCC). Here we show that hepatic aldolase B (Aldob) suppresses HCC by directly binding and inhibiting the rate-limiting enzyme in the pentose phosphate pathway, glucose-6-phosphate dehydrogenase (G6PD). A stage-dependent decrease of Aldob and increase of G6PD in human tumors are correlated with poor prognosis for patients with HCC. Global or liver-specific Aldob knockout promotes [...]

Menée in vitro et à l'aide d'un modèle murin, cette étude met en évidence le rôle de la déubiquitinase USP25 dans l'inflammation colique, l'infection bactérienne et la carcinogenèse colorectale

The deubiquitinase USP25 supports colonic inflammation and bacterial infection and promotes colorectal cancer

Wang, Xiao-Meng ; Yang, Ci ; Zhao, Yin ; Xu, Zhi-Gao ; Yang, Wei ; Wang, Peng ; Lin, Dandan ; Xiong, Bin ; Fang, Jing-Yuan ; Dong, Chen ; Zhong, Bo

Bacterial infection or abnormal colonization in the gastrointestinal system is associated with subsets of inflammatory bowel disease and colorectal cancer. Here we demonstrated essential roles of ubiquitin-specific protease 25 (USP25) in experimental colitis, bacterial infections and colon cancer. Knockout or pharmacologic inhibition of USP25 potentiated immune responses after induction of experimental colitis or bacterial infections that promoted clearance of infected bacteria and resolution [...]

Menée in vitro et à l'aide de xénogreffes, cette étude met en évidence un mécanisme par lequel la protéine M2BPGi, en activant la voie de signalisation de l'enzyme mTOR, augmente la progression d'un carcinome hépatocellulaire

Mac-2-binding protein glycan isomer enhances the aggressiveness of hepatocellular carcinoma by activating mTOR signaling

Dolgormaa, Gantumur ; Harimoto, Norifumi ; Ishii, Norihiro ; Yamanaka, Takahiro ; Hagiwara, Kei ; Tsukagoshi, Mariko ; Igarashi, Takamichi ; Watanabe, Akira ; Kubo, Norio ; Araki, Kenichiro ; Handa, Tadashi ; Yokobori, Takehiko ; Oyama, Tetsunari ; Kuwano, Hiroyuki ; Shirabe, Ken

Background : Wisteria floribunda agglutinin (WFA)+ Mac-2-binding protein (M2BPGi) is a novel serum marker for liver fibrosis. Although an elevated serum level of M2BPGi can predict development of hepatocellular carcinoma (HCC), the effect of M2BPGi on HCC remains unclear. There are no reports about the association of M2BPGi with HCC aggressiveness. We aimed to clarify the significance of M2BPGi in HCC. Methods : The protein expression of M2BPGi and galectin-3, a ligand of M2BP, and the mRNA [...]

Menée sur des lignées cellulaires et à partir notamment de l'analyse immunohistochimique d'échantillons tumoraux prélevés sur des patients atteints d'un carcinome hépatocellulaire, cette étude met en évidence un mécanisme par lequel la protéine IQGAP1, via l'accumulation d'espèces réactives de l'oxygène dépendante de Rac-1 et l'activation de la signalisation des kinases Src/FAK, favorise l'anoïkose et le processus métastatique

IQGAP1 promotes anoikis resistance and metastasis through Rac1-dependent ROS accumulation and activation of Src/FAK signalling in hepatocellular carcinoma

Mo, Chun-fen ; Li, Jun ; Yang, Shu-xia ; Guo, Hui-jie ; Liu, Yang ; Luo, Xing-yan ; Wang, Yan-tang ; Li, Min-hui ; Li, Jing-yi ; Zou, Qiang

Background : Hepatitis B virus (HBV) has a crucial role in the progression of hepatocellular carcinoma (HCC). Tumour cells must develop anoikis resistance in order to survive before metastasis. This study aimed to investigate the mechanism of IQGAP1 in HBV-mediated anoikis evasion and metastasis in HCC cells. Methods : IQGAP1 expression was detected by immunohistochemistry, real-time PCR and immunoblot analysis. Lentiviral-mediated stable upregulation or knockdown of IGAQP1, [...]

Menée à partir de l'analyse systématique de données du projet "The cancer Genome Atlas" portant sur 37 types tumoraux et menée in vitro, cette étude met en évidence le rôle de la protéine STAMBPL1 dans la transition épithélio-mésenchymateuse de plusieurs carcinomes

Systematic analysis reveals a functional role for STAMBPL1 in the epithelial–mesenchymal transition process across multiple carcinomas

Ambroise, Gorbatchev ; Yu, Ting-ting ; Zhang, Boxi ; Kacal, Merve ; Hao, Yuqing ; Queiroz, Andre L. ; Ouchida, Amanda T. ; Lindskog, Cecilia ; Norberg, Erik ; Vakifahmetoglu-Norberg, Helin

Background : Deubiquitinating enzymes (DUBs) are linked to cancer progression and dissemination, yet less is known about their regulation and impact on epithelial–mesenchymal transition (EMT). Methods : An integrative translational approach combining systematic computational analyses of The Cancer Genome Atlas cancer cohorts with CRISPR genetics, biochemistry and immunohistochemistry methodologies to identify and assess the role of human DUBs in EMT. Results : We identify a previously [...]

Menée à l'aide de lignées cellulaires, de xénogreffes orthotopiques sur des modèles murins et d'échantillons tumoraux issus de patientes atteintes d'un cancer du sein, cette étude démontre que la détoxification du sélénium est nécessaire à la survie des cellules cancéreuses

Selenium detoxification is required for cancer-cell survival

Carlisle, Anne E. ; Lee, Namgyu ; Matthew-Onabanjo, Asia N. ; Spears, Meghan E. ; Park, Sung Jin ; Youkana, Daniel ; Doshi, Mihir B. ; Peppers, Austin ; Li, Rui ; Joseph, Alexander B. ; Smith, Miles ; Simin, Karl ; Zhu, Lihua Julie ; Greer, Paul L. ; Shaw, Leslie M. ; Kim, Dohoon

The micronutrient selenium is incorporated via the selenocysteine biosynthesis pathway into the rare amino acid selenocysteine, which is required in selenoproteins such as glutathione peroxidases and thioredoxin reductases1,2. Here, we show that selenophosphate synthetase 2 (SEPHS2), an enzyme in the selenocysteine biosynthesis pathway, is essential for survival of cancer, but not normal, cells. SEPHS2 is required in cancer cells to detoxify selenide, an intermediate that is formed during [...]

Menée à l'aide d'un nouveau système de cartographie des interactions protéiques basé sur la fusion de protéines cibles et de protéines fluorescentes, cette étude démontre que, dans les cancers liés à une prédisposition génétique, les mécanismes d'échappement immunitaire ont été conservés au cours de l'évolution des espèces

A novel system to map protein interactions reveals evolutionarily conserved immune evasion pathways on transmissible cancers

Flies, Andrew S. ; Darby, Jocelyn M. ; Lennard, Patrick R. ; Murphy, Peter R. ; Ong, Chrissie E. B. ; Pinfold, Terry L. ; De Luca, Alana ; Lyons, A. Bruce ; Woods, Gregory M. ; Patchett, Amanda L.

Around 40% of humans and Tasmanian devils (Sarcophilus harrisii) develop cancer in their lifetime, compared to less than 10% for most species. In addition, devils are affected by two of the three known transmissible cancers in mammals. Immune checkpoint immunotherapy has transformed human medicine, but a lack of species-specific reagents has limited checkpoint immunology in most species. We developed a cut-and-paste reagent development system and used the fluorescent fusion protein system to [...]

Cet article présente une méthode informatique pour découvrir des variants génétiques non codants régulateurs à partir des données de séquençage du génome et du transcriptome d'une tumeur

Discovery of regulatory noncoding variants in individual cancer genomes by using cis-X

Liu, Yu ; Li, Chunliang ; Shen, Shuhong ; Chen, Xiaolong ; Szlachta, Karol ; Edmonson, Michael N. ; Shao, Ying ; Ma, Xiaotu ; Hyle, Judith ; Wright, Shaela ; Ju, Bensheng ; Rusch, Michael C. ; Liu, Yanling ; Li, Benshang ; Macias, Michael ; Tian, Liqing ; Easton, John ; Qian, Maoxiang ; Yang, Jun J. ; Hu, Shaoyan ; Look, A. Thomas ; Zhang, Jinghui

We developed cis-X, a computational method for discovering regulatory noncoding variants in cancer by integrating whole-genome and transcriptome sequencing data from a single cancer sample. cis-X first finds aberrantly cis-activated genes that exhibit allele-specific expression accompanied by an elevated outlier expression. It then searches for causal noncoding variants that may introduce aberrant transcription factor binding motifs or enhancer hijacking by structural variations. Analysis of 13 [...]

Menée à partir de l'analyse à l'échelle d'une seule cellule de la transcription et de la méthylation de l'ADN de différents types de cellules cancéreuses, cette étude examine la stabilité clonale des mécanismes épigénétiques et la manière dont ces mécanismes peuvent conduire à une structure génétique sous-clonale diversifiée

Single-cell analysis of clonal maintenance of transcriptional and epigenetic states in cancer cells

Meir, Zohar ; Mukamel, Zohar ; Chomsky, Elad ; Lifshitz, Aviezer ; Tanay, Amos

Propagation of clonal regulatory programs contributes to cancer development. It is poorly understood how epigenetic mechanisms interact with genetic drivers to shape this process. Here, we combine single-cell analysis of transcription and DNA methylation with a Luria–Delbrück experimental design to demonstrate the existence of clonally stable epigenetic memory in multiple types of cancer cells. Longitudinal transcriptional and genetic analysis of clonal colon cancer cell populations reveals a [...]

Menée in vitro et à l'aide de modèles murins, cette étude identifie une sous-population de lymphocytes T CD4+ présentant des propriétés moléculaires et antitumorales particulières

Identification of human CD4+ T cell populations with distinct antitumor activity

Nelson, Michelle H. ; Knochelmann, Hannah M. ; Bailey, Stefanie R. ; Huff, Logan W. ; Bowers, Jacob S. ; Majchrzak-Kuligowska, Kinga ; Wyatt, Megan M. ; Rubinstein, Mark P. ; Mehrotra, Shikhar ; Nishimura, Michael I. ; Armeson, Kent E. ; Giresi, Paul G. ; Zilliox, Michael J. ; Broxmeyer, Hal E. ; Paulos, Chrystal M.

How naturally arising human CD4+ T helper subsets affect cancer immunotherapy is unclear. We reported that human CD4+CD26high T cells elicit potent immunity against solid tumors. As CD26high T cells are often categorized as TH17 cells for their IL-17 production and high CD26 expression, we posited these populations would have similar molecular properties. Here, we reveal that CD26high T cells are epigenetically and transcriptionally distinct from TH17 cells. Of clinical importance, CD26high and [...]

Cet article passe en revue les connaissances récentes sur la dormance des cellules tumorales déssiminées et analyse la façon dont ces découvertes peuvent conduire à de nouvelles stratégies pour surveiller et cibler ce type de cellules cancéreuses

The current paradigm and challenges ahead for the dormancy of disseminated tumor cells

Risson, Emma ; Nobre, Ana Rita ; Maguer-Satta, Véronique ; Aguirre-Ghiso, Julio A.

Disseminated tumor cells (DTCs) are known to enter a state of dormancy that is achieved via growth arrest of DTCs and/or a form of population equilibrium state, strongly influenced by the organ microenvironment. During this time, expansion of residual disseminated cancer is paused and DTCs survive to fuel relapse, sometimes decades later. This notion has opened a new window of opportunity for intervening and preventing relapse. Here we review recent data that have further augmented the [...]

Menée notamment à partir d'échantillons de tissus sains prélevés sur 669 patients atteints d'un cancer de stade avancé, cette étude met en évidence l'utilité de la technique de séquençage à lecture longue pour déterminer le caractère oncogène de variants structurels constitutionnels détectés par séquençage génomique à lecture courte

Improved structural variant interpretation for hereditary cancer susceptibility using long-read sequencing

Thibodeau, My Linh ; O’Neill, Kieran ; Dixon, Katherine ; Reisle, Caralyn ; Mungall, Karen L. ; Krzywinski, Martin ; Shen, Yaoqing ; Lim, Howard J. ; Cheng, Dean ; Tse, Kane ; Wong, Tina ; Chuah, Eric ; Fok, Alexandra ; Sun, Sophie ; Renouf, Daniel ; Schaeffer, David F. ; Cremin, Carol ; Chia, Stephen ; Young, Sean ; Pandoh, Pawan ; Pleasance, Stephen ; Pleasance, Erin ; Mungall, Andrew J. ; Moore, Richard ; Yip, Stephen ; Karsan, Aly ; Laskin, Janessa ; Marra, Marco A. ; Schrader, Kasmintan A. ; Jones, Steven J. M.

Structural variants (SVs) may be an underestimated cause of hereditary cancer syndromes given the current limitations of short-read next-generation sequencing. Here we investigated the utility of long-read sequencing in resolving germline SVs in cancer susceptibility genes detected through short-read genome sequencing.

Menée à l'aide de cellules tumorales circulantes, de fibroblastes associés au cancer (CAFs) et d'échantillons tumoraux issus de patients atteints d'un adénocarcinome canalaire du pancréas, cette étude met en évidence dans les tumeurs riches en stroma une dépendance des cellules cancéreuses aux cétoacides alpha sécrétés par les CAFs et démontre le rôle de la transaminase BCAT1 dans cette dépendance

Tumour-reprogrammed stromal BCAT1 fuels branched-chain ketoacid dependency in stromal-rich PDAC tumours

Zhu, Ziwen ; Achreja, Abhinav ; Meurs, Noah ; Animasahun, Olamide ; Owen, Sarah ; Mittal, Anjali ; Parikh, Pooja ; Lo, Ting-Wen ; Franco-Barraza, Janusz ; Shi, Jiaqi ; Gunchick, Valerie ; Sherman, Mara H. ; Cukierman, Edna ; Pickering, Andrew M. ; Maitra, Anirban ; Sahai, Vaibhav ; Morgan, Meredith A. ; Nagrath, Sunitha ; Lawrence, Theodore S. ; Nagrath, Deepak

Branched-chain amino acids (BCAAs) supply both carbon and nitrogen in pancreatic cancers, and increased levels of BCAAs have been associated with increased risk of pancreatic ductal adenocarcinomas (PDACs). It remains unclear, however, how stromal cells regulate BCAA metabolism in PDAC cells and how mutualistic determinants control BCAA metabolism in the tumour milieu. Here, we show distinct catabolic, oxidative and protein turnover fluxes between cancer-associated fibroblasts (CAFs) and cancer [...]