Menée à l'aide de lignées cellulaires d'ostéosarcome, d'un modèle murin et d'échantillons tumoraux issus de patients, cette étude met en évidence un mécanisme par lequel une fusion de gènes, issue de translocations chromosomiques, altère la protéine Rab22a et favorise le processus métastatique

Chromosomal translocation-derived aberrant Rab22a drives metastasis of osteosarcoma

Liao, Dan ; Zhong, Li ; Yin, Junqiang ; Zeng, Cuiling ; Wang, Xin ; Huang, Xingchuan ; Chen, Jinna ; Zhang, Hong ; Zhang, Ruhua ; Guan, Xin-Yuan ; Shuai, Xintao ; Sui, Jianhua ; Gao, Song ; Deng, Wuguo ; Zeng, Yi-Xin ; Shen, Jing-Nan ; Chen, Jian ; Kang, Tiebang

Osteosarcoma is a type of aggressive malignant bone tumour that frequently metastasizes to lungs, resulting in poor prognosis. However, the molecular mechanisms of lung metastasis of osteosarcoma remain poorly understood. Here we identify exon–intron fusion genes in osteosarcoma cell lines and tissues. These fusion genes are derived from chromosomal translocations that juxtapose the coding region for amino acids 1–38 of Rab22a (Rab22a1–38) with multiple inverted introns and untranslated regions [...]

Menée in vitro, cette étude met en évidence le rôle de la sérine extracellulaire dans le contrôle du devenir des cellules souches épidermiques et dans le développement initial de la tumeur

Extracellular serine controls epidermal stem cell fate and tumour initiation

Baksh, Sanjeethan C. ; Todorova, Pavlina K. ; Gur-Cohen, Shiri ; Hurwitz, Brian ; Ge, Yejing ; Novak, Jesse S. S. ; Tierney, Matthew T. ; dela Cruz-Racelis, June ; Fuchs, Elaine ; Finley, Lydia W. S.

Tissue stem cells are the cell of origin for many malignancies. Metabolites regulate the balance between self-renewal and differentiation, but whether endogenous metabolic pathways or nutrient availability predispose stem cells towards transformation remains unknown. Here, we address this question in epidermal stem cells (EpdSCs), which are a cell of origin for squamous cell carcinoma. We find that oncogenic EpdSCs are serine auxotrophs whose growth and self-renewal require abundant exogenous [...]

Menée à l'aide d'un modèle cellulaire de cancer du poumon à petites cellules et d'un modèle murin, cette étude met en évidence le rôle de la protéine MAX dans la suppression tumorale et le métabolisme des cellules cancéreuses

MAX Functions as a Tumor Suppressor and Rewires Metabolism in Small Cell Lung Cancer

Augert, Arnaud ; Mathsyaraja, Haritha ; Ibrahim, Ali H. ; Freie, Brian ; Geuenich, Michael J. ; Cheng, Pei-Feng ; Alibeckoff, Sydney P. ; Wu, Nan ; Hiatt, Joseph B. ; Basom, Ryan ; Gazdar, Adi ; Sullivan, Lucas B. ; Eisenman, Robert N. ; MacPherson, David

Small cell lung cancer (SCLC) is a highly aggressive and lethal neoplasm. To identify candidate tumor suppressors we applied CRISPR/Cas9 gene inactivation screens to a cellular model of early-stage SCLC. Among the top hits was MAX, the obligate heterodimerization partner for MYC family proteins that is mutated in human SCLC. Max deletion increases growth and transformation in cells and dramatically accelerates SCLC progression in an Rb1/Trp53-deleted mouse model. In contrast, deletion of Max [...]

Menée à l'aide de données du projet "The Cancer Genome Atlas", de lignées cellulaires de cancers du sein et d'échantillons tumoraux, cette étude met en évidence un mécanisme par lequel la protéine SLFN5 régule les transitions épithélio-mésenchymateuses réversibles et inhibe le processus métastatique en supprimant la transcription du gène ZEB1

Human Schlafen 5 regulates reversible epithelial and mesenchymal transitions in breast cancer by suppression of ZEB1 transcription

Wan, Guoqing ; Zhu, Jiang ; Gu, Xuefeng ; Yang, Yue ; Liu, Yihao ; Wang, Zhizheng ; Zhao, Yuxia ; Wu, Hailong ; Huang, Gang ; Lu, Changlian

Background : Human Schlafen 5 (SLFN5) has been reported to inhibit or promote cell invasion in tumours depending on their origin. However, its role in breast cancer (BRCA) is undetermined. Methods : Differential expression analyses using The Cancer Genome Atlas (TCGA) data, clinical samples and cell lines were performed. Lentiviral knockdown and overexpression experiments were performed to detect changes in cell morphology, molecular markers and invasion. Chromatin [...]

Menée in vitro puis à l'aide de modèles murins et d'échantillons urinaires prélevés sur des patients atteints d'un cancer gastrique, cette étude met en évidence un mécanisme par lequel les adipocytes de l'omentum favorisent le développement de métastases péritonéales via l'axe CXCL2 - VEGFA

Omental adipocytes promote peritoneal metastasis of gastric cancer through the CXCL2–VEGFA axis

Natsume, Makoto ; Shimura, Takaya ; Iwasaki, Hiroyasu ; Okuda, Yusuke ; Hayashi, Kazuki ; Takahashi, Satoru ; Kataoka, Hiromi

Background : Gastric cancer (GC) patients frequently develop peritoneal metastasis; however, the underlying mechanism remains unknown. We hypothesised that omental adipocytes (OmAd) trigger GC cells towards malignant activity to induce peritoneal metastasis. Methods : We analysed interactions among human GC cells, endothelial cells and OmAd using a 3D co-culture system. We also employed a multipronged animal study, including subcutaneous and orthotopic tumours, and humanised omental adipose [...]

Menée sur des lignées de cellules cancéreuses, cette étude met en évidence un mécanisme par lequel, lors de la formation de nouvelles adhésions cellulaires, la phosphorylation des tyrosines 1250 et 1251 du récepteur IGF-1R de l'appareil de Golgi favorise la migration des cellules tumorales

IGF-1 receptor activity in the Golgi of migratory cancer cells depends on adhesion-dependent phosphorylation of Tyr 1250 and Tyr 1251

Rieger, Leonie ; O’Shea, Sandra ; Godsmark, Grant ; Stanicka, Joanna ; Kelly, Geraldine ; O’Connor, Rosemary

Signaling through the insulin-like growth factor 1 receptor (IGF-1R) promotes cancer progression, but therapies that limit IGF-1R signaling have performed poorly. Rieger et al. found that the residues Tyr1250 and Tyr1251, which are required for IGF-1R to support cancer cell growth (see the Focus by Crudden and Girnita), underwent autophosphorylation when cells were adherent. Experiments with IGF-1Rs containing phosphomimetic or nonphosphorylatable substitutions at these sites demonstrated that [...]

Menée à l'aide de modèles murins puis de données génétiques et cliniques portant sur des patients atteints d'un mélanome, cette étude met en évidence le rôle de variants génétiques constitutionnels du gène de l'apolipoprotéine E dans la progression tumorale et la survie des patients

Common germline variants of the human APOE gene modulate melanoma progression and survival

Ostendorf, Benjamin N. ; Bilanovic, Jana ; Adaku, Nneoma ; Tafreshian, Kimia N. ; Tavora, Bernardo ; Vaughan, Roger D. ; Tavazoie, Sohail F.

Common germline variants of the APOE gene are major risk modifiers of neurodegenerative and atherosclerotic diseases1–3, but their effect on cancer outcome is poorly defined. Here we report that, in a reversal of their effect on Alzheimer’s disease, the APOE4 and APOE2 variants confer favorable and poor outcomes in melanoma, respectively. Mice expressing the human APOE4 allele exhibited reduced melanoma progression and metastasis relative to APOE2 mice. APOE4 mice exhibited enhanced anti-tumor [...]

Menée à partir de données moléculaires portant sur des échantillons tumoraux de 1 070 patients atteints d'un cancer du poumon et à partir d'une cartographie des régions tumorales réalisée à l'aide d'un algorithme d'apprentissage automatique, cette étude met en évidence des différences intratumorales d'immunogénicité qui conditionnent l'évolution de la maladie

Geospatial immune variability illuminates differential evolution of lung adenocarcinoma

AbdulJabbar, Khalid ; Raza, Shan E. Ahmed ; Rosenthal, Rachel ; Jamal-Hanjani, Mariam ; Veeriah, Selvaraju ; Akarca, Ayse ; Lund, Tom ; Moore, David A. ; Salgado, Roberto ; Al Bakir, Maise ; Zapata, Luis ; Hiley, Crispin T. ; Officer, Leah ; Sereno, Marco ; Smith, Claire Rachel ; Loi, Sherene ; Hackshaw, Allan ; Marafioti, Teresa ; Quezada, Sergio A. ; McGranahan, Nicholas ; Le Quesne, John ; Swanton, Charles ; Bakir, Maise Al ; Ngai, Yenting ; Sharp, Abigail ; Rodrigues, Cristina ; Pressey, Oliver ; Smith, Sean ; Gower, Nicole ; Dhanda, Harjot ; Riley, Joan ; Primrose, Lindsay ; Martinson, Luke ; Carey, Nicolas ; Shaw, Jacqui A. ; Fennell, Dean ; Wilson, Gareth A. ; Birkbak, Nicolai J. ; Watkins, Thomas B. K. ; Escudero, Mickael ; Stewart, Aengus ; Rowan, Andrew ; Goldman, Jacki ; Van Loo, Peter ; Stone, Richard Kevin ; Denner, Tamara ; Nye, Emma ; Ward, Sophia ; Lim, Emilia L. ; Boeing, Stefan ; Greco, Maria ; Litchfield, Kevin ; Nicod, Jerome ; Puttick, Clare ; Enfield, Katey ; Colliver, Emma ; Campbell, Brittany ; Abbosh, Christopher ; Wu, Yin ; Skrzypski, Marcin ; Hynds, Robert E. ; Georgiou, Andrew ; Sunderland, Mariana Werner ; Reading, James L. ; Peggs, Karl S. ; Hartley, John A. ; Gorman, Pat ; Lowe, Helen L. ; Ensell, Leah ; Spanswick, Victoria ; Karamani, Angeliki ; Biswas, Dhruva ; Razaq, Maryam ; Beck, Stephan ; Huebner, Ariana ; Dietzen, Michelle ; Naceur-Lombardelli, Cristina ; Akther, Mita Afroza ; Zhai, Haoran ; Kannu, Nnennaya ; Manzano, Elizabeth ; Bola, Supreet Kaur ; Ghorani, Ehsan ; de Massy, Marc Robert ; Hoxha, Elena ; Hatipoglu, Emine ; Ogwuru, Stephanie ; Chain, Benny ; Price, Gillian ; Dubois-Marshall, Sylvie ; Kerr, Keith ; Palmer, Shirley ; Cheyne, Heather ; Miller, Joy ; Buchan, Keith ; Chetty, Mahendran ; Khalil, Mohammed ; Ezhil, Veni ; Prakash, Vineet ; Anand, Girija ; Khan, Sajid ; Lau, Kelvin ; Sheaff, Michael ; Schmid, Peter ; Lim, Louise ; Conibear, John ; Schwarz, Roland ; Tugwood, Jonathan ; Pierce, Jackie ; Dive, Caroline ; Brady, Ged ; Rothwell, Dominic G. ; Chemi, Francesca ; Kilgour, Elaine ; Blackhall, Fiona ; Priest, Lynsey ; Krebs, Matthew G. ; Crosbie, Philip ; Nakas, Apostolos ; Rathinam, Sridhar ; Nelson, Louise ; Ryanna, Kim ; Tuffail, Mohamad ; Bajaj, Amrita ; Brozik, Jan ; Morgan, Fiona ; Kornaszewska, Malgorzata ; Attanoos, Richard ; Adams, Haydn ; Davies, Helen ; Carter, Mathew ; Lindsay, C. R. ; Gomes, Fabio ; Szallasi, Zoltan ; Csabai, Istvan ; Diossy, Miklos ; Aerts, Hugo ; Kirk, Alan ; Asif, Mo ; Butler, John ; Bilanca, Rocco ; Kostoulas, Nikos ; MacKenzie, Mairead ; Wilcox, Maggie ; Busacca, Sara ; Dawson, Alan ; Lovett, Mark R. ; Shackcloth, Michael ; Feeney, Sarah ; Asante-Siaw, Julius ; Gosney, John ; Leek, Angela ; Totten, Nicola ; Hodgkinson, Jack Davies ; Waddington, Rachael ; Rogan, Jane ; Moore, Katrina ; Monteiro, William ; Marshall, Hilary ; Blyth, Kevin G. ; Dick, Craig ; Kidd, Andrew ; Lim, Eric ; De Sousa, Paulo ; Jordan, Simon ; Rice, Alexandra ; Raubenheimer, Hilgardt ; Bhayani, Harshil ; Hamilton, Morag ; Ambrose, Lyn ; Devaraj, Anand ; Chavan, Hema ; Begum, Sofina ; Mani, Aleksander ; Kaniu, Daniel ; Malima, Mpho ; Booth, Sarah ; Nicholson, Andrew G. ; Fernandes, Nadia ; Wallen, Jessica E. ; Shah, Pratibha ; Danson, Sarah ; Bury, Jonathan ; Edwards, John ; Hill, Jennifer ; Matthews, Sue ; Kitsanta, Yota ; Rao, Jagan ; Tenconi, Sara ; Socci, Laura ; Suvarna, Kim ; Kibutu, Faith ; Fisher, Patricia ; Young, Robin ; Barker, Joann ; Taylor, Fiona ; Lloyd, Kirsty ; Light, Teresa ; Horey, Tracey ; Papadatos-Pastos, Dionysis ; Russell, Peter ; Lock, Sara ; Gilbert, Kayleigh ; Lawrence, David ; Hayward, Martin ; Panagiotopoulos, Nikolaos ; George, Robert ; Patrini, Davide ; Falzon, Mary ; Borg, Elaine ; Khiroya, Reena ; Ahmed, Asia ; Taylor, Magali ; Choudhary, Junaid ; Shaw, Penny ; Janes, Sam M. ; Forster, Martin ; Ahmad, Tanya ; Lee, Siow Ming ; Herrero, Javier ; Carnell, Dawn ; Mendes, Ruheena ; George, Jeremy ; Navani, Neal ; Scarci, Marco ; Bertoja, Elisa ; Stephens, Robert C. M. ; Hoogenboom, Emilie Martinoni ; Holding, James W. ; Bandula, Steve ; Naidu, Babu ; Langman, Gerald ; Robinson, Andrew ; Bancroft, Hollie ; Kerr, Amy ; Kadiri, Salma ; Ferris, Charlotte ; Middleton, Gary ; Djearaman, Madava ; Patel, Akshay ; Ottensmeier, Christian ; Chee, Serena ; Johnson, Benjamin ; Alzetani, Aiman ; Shaw, Emily ; Lester, Jason ; Summers, Yvonne ; Califano, Raffaele ; Taylor, Paul ; Shah, Rajesh ; Krysiak, Piotr ; Rammohan, Kendadai ; Fontaine, Eustace ; Booton, Richard ; Evison, Matthew ; Moss, Stuart ; Novasio, Juliette ; Joseph, Leena ; Bishop, Paul ; Chaturvedi, Anshuman ; Doran, Helen ; Granato, Felice ; Joshi, Vijay ; Smith, Elaine ; Montero, Angeles ; Yuan, Yinyin ; T. RACERx Consortium

Remarkable progress in molecular analyses has improved our understanding of the evolution of cancer cells toward immune escape1–5. However, the spatial configurations of immune and stromal cells, which may shed light on the evolution of immune escape across tumor geographical locations, remain unaddressed. We integrated multiregion exome and RNA-sequencing (RNA-seq) data with spatial histology mapped by deep learning in 100 patients with non-small cell lung cancer from the TRACERx cohort6. [...]

Menée notamment à l'aide de l'analyse de 317 échantillons biopsiques provenant de 20 patients atteints d'un cancer colorectal métastatique et menée à l'aide d'un modèle mathématique, cette étude met en évidence une plus grande hétérogénéité au niveau des métastases ganglionnaires qu'au niveau des métastases distantes ainsi que des processus évolutifs différents entre les deux types de métastases

Lymph node metastases develop through a wider evolutionary bottleneck than distant metastases

Reiter, Johannes G. ; Hung, Wei-Ting ; Lee, I. Hsiu ; Nagpal, Shriya ; Giunta, Peter ; Degner, Sebastian ; Liu, Gang ; Wassenaar, Emma C. E. ; Jeck, William R. ; Taylor, Martin S. ; Farahani, Alexander A. ; Marble, Hetal D. ; Knott, Simon ; Kranenburg, Onno ; Lennerz, Jochen K. ; Naxerova, Kamila

Genetic diversity among metastases is poorly understood but contains important information about disease evolution at secondary sites. Here we investigate inter- and intra-lesion heterogeneity for two types of metastases that associate with different clinical outcomes: lymph node and distant organ metastases in human colorectal cancer. We develop a rigorous mathematical framework for quantifying metastatic phylogenetic diversity. Distant metastases are typically monophyletic and genetically [...]

Menée à partir de l'analyse de tissus mammaires cancéreux ou sains et menée à l'aide de modèles murins, cette étude met en évidence un mécanisme par lequel l'activation sélective (induite par la kinase ROCK) de la voie de signalisation de la kinase PERK favorise la modification des fibroblastes et la progression tumorale via un processus dépendant de la protéine CRELD2

ROCK-mediated selective activation of PERK signalling causes fibroblast reprogramming and tumour progression through a CRELD2-dependent mechanism

Boyle, Sarah Theresa ; Poltavets, Valentina ; Kular, Jasreen ; Pyne, Natasha Theresa ; Sandow, Jarrod John ; Lewis, Alexander Charles ; Murphy, Kendelle Joan ; Kolesnikoff, Natasha ; Moretti, Paul Andre Bartholomew ; Tea, Melinda Nay ; Tergaonkar, Vinay ; Timpson, Paul ; Pitson, Stuart Maxwell ; Webb, Andrew Ian ; Whitfield, Robert John ; Lopez, Angel Francisco ; Kochetkova, Marina ; Samuel, Michael Susithiran

It is well accepted that cancers co-opt the microenvironment for their growth. However, the molecular mechanisms that underlie cancer–microenvironment interactions are still poorly defined. Here, we show that Rho-associated kinase (ROCK) in the mammary tumour epithelium selectively actuates protein-kinase-R-like endoplasmic reticulum kinase (PERK), causing the recruitment and persistent education of tumour-promoting cancer-associated fibroblasts (CAFs), which are part of the cancer [...]

Menée à partir de l'analyse par cytométrie de masse de 5 types d'échantillons tissulaires (sang, moelle osseuse, rate, tumeur et ganglions lymphatiques) prélevés sur huit modèles murins de tumeur, cette étude met en évidence l'influence du développement tumoral sur la composition et la fonction du macro-environnement immunitaire

Systemic dysfunction and plasticity of the immune macroenvironment in cancer models

Allen, Breanna M. ; Hiam, Kamir J. ; Burnett, Cassandra E. ; Venida, Anthony ; DeBarge, Rachel ; Tenvooren, Iliana ; Marquez, Diana M. ; Cho, Nam Woo ; Carmi, Yaron ; Spitzer, Matthew H.

Understanding of the factors governing immune responses in cancer remains incomplete, limiting patient benefit. In this study, we used mass cytometry to define the systemic immune landscape in response to tumor development across five tissues in eight mouse tumor models. Systemic immunity was dramatically altered across models and time, with consistent findings in the peripheral blood of patients with breast cancer. Changes in peripheral tissues differed from those in the tumor [...]

Menée à partir de données génétiques portant sur des échantillons sanguins et tumoraux provenant de 31 359 patients atteints d'un cancer, cette étude analyse la fréquence, les caractéristiques et l'évolution des mutations composites oncogènes (présence de plusieurs mutations somatiques distinctes dans le même gène ou le même échantillon tumoral)

Phase and context shape the function of composite oncogenic mutations

Gorelick, Alexander N. ; Sanchez-Rivera, Francisco J. ; Cai, Yanyan ; Bielski, Craig M. ; Biederstedt, Evan ; Jonsson, Philip ; Richards, Allison L. ; Vasan, Neil ; Penson, Alexander V. ; Friedman, Noah D. ; Ho, Yu-Jui ; Baslan, Timour ; Bandlamudi, Chaitanya ; Scaltriti, Maurizio ; Schultz, Nikolaus ; Lowe, Scott W. ; Reznik, Ed ; Taylor, Barry S.

Cancers develop as a result of driver mutations1,2 that lead to clonal outgrowth and the evolution of disease3,4. The discovery and functional characterization of individual driver mutations are central aims of cancer research, and have elucidated myriad phenotypes5 and therapeutic vulnerabilities6. However, the serial genetic evolution of mutant cancer genes7,8 and the allelic context in which they arise is poorly understood in both common and rare cancer genes and tumour types. Here we find [...]

A partir de l'analyse de 1 526 tumeurs issues de 7 types de cancer et à partir de l'analyse de tissus adjacents normaux, cette étude démontre que le microbiome tumoral humain est composé de bactéries intracellulaires spécifiques du type tumoral

The human tumor microbiome is composed of tumor type–specific intracellular bacteria

Nejman, Deborah ; Livyatan, Ilana ; Fuks, Garold ; Gavert, Nancy ; Zwang, Yaara ; Geller, Leore T. ; Rotter-Maskowitz, Aviva ; Weiser, Roi ; Mallel, Giuseppe ; Gigi, Elinor ; Meltser, Arnon ; Douglas, Gavin M. ; Kamer, Iris ; Gopalakrishnan, Vancheswaran ; Dadosh, Tali ; Levin-Zaidman, Smadar ; Avnet, Sofia ; Atlan, Tehila ; Cooper, Zachary A. ; Arora, Reetakshi ; Cogdill, Alexandria P. ; Khan, Md Abdul Wadud ; Ologun, Gabriel ; Bussi, Yuval ; Weinberger, Adina ; Lotan-Pompan, Maya ; Golani, Ofra ; Perry, Gili ; Rokah, Merav ; Bahar-Shany, Keren ; Rozeman, Elisa A. ; Blank, Christian U. ; Ronai, Anat ; Shaoul, Ron ; Amit, Amnon ; Dorfman, Tatiana ; Kremer, Ran ; Cohen, Zvi R. ; Harnof, Sagi ; Siegal, Tali ; Yehuda-Shnaidman, Einav ; Gal-Yam, Einav Nili ; Shapira, Hagit ; Baldini, Nicola ; Langille, Morgan G. I. ; Ben-Nun, Alon ; Kaufman, Bella ; Nissan, Aviram ; Golan, Talia ; Dadiani, Maya ; Levanon, Keren ; Bar, Jair ; Yust-Katz, Shlomit ; Barshack, Iris ; Peeper, Daniel S. ; Raz, Dan J. ; Segal, Eran ; Wargo, Jennifer A. ; Sandbank, Judith ; Shental, Noam ; Straussman, Ravid

Bacteria are well-known residents in human tumors, but whether their presence is advantageous to the tumors or to the bacteria themselves has been unclear. As an initial step toward addressing this question, Nejman et al. produced an exhaustive catalog of the bacteria present in more than 1500 human tumors representing seven different tumor types (see the Perspective by Atreya and Turnbaugh). They found that the bacteria within tumors were localized within both cancer cells and immune cells and [...]

Menée à l'aide d'échantillons de moelle osseuse prélevés sur des patients pédiatriques atteints d'une leucémie lymphoblastique aiguë à cellules B et menée à l'aide de modèles murins, cette étude met en évidence une modification étendue de la composition cellulaire du micro-environnement immunitaire de la moelle osseuse durant la progression de la maladie

Extensive Remodeling of the Immune Microenvironment in B Cell Acute Lymphoblastic Leukemia

Witkowski, Matthew T. ; Dolgalev, Igor ; Evensen, Nikki A. ; Ma, Chao ; Chambers, Tiffany ; Roberts, Kathryn G. ; Sreeram, Sheetal ; Dai, Yuling ; Tikhonova, Anastasia N. ; Lasry, Audrey ; Qu, Chunxu ; Pei, Deqing ; Cheng, Cheng ; Robbins, Gabriel A. ; Pierro, Joanna ; Selvaraj, Shanmugapriya ; Mezzano, Valeria ; Daves, Marla ; Lupo, Philip J. ; Scheurer, Michael E. ; Loomis, Cynthia A. ; Mullighan, Charles G. ; Chen, Weiqiang ; Rabin, Karen R. ; Tsirigos, Aristotelis ; Carroll, William L. ; Aifantis, Iannis

A subset of B cell acute lymphoblastic leukemia (B-ALL) patients will relapse and succumb to therapy-resistant disease. The bone marrow microenvironment may support B-ALL progression and treatment evasion. Utilizing single-cell approaches, we demonstrate B-ALL bone marrow immune microenvironment remodeling upon disease initiation and subsequent re-emergence during conventional chemotherapy. We uncover a role for non-classical monocytes in B-ALL survival, and demonstrate monocyte abundance at [...]

Menée in vitro et à l'aide d'un modèle murin, cette étude met en évidence un mécanisme par lequel les cellules de myélome, en inhibant l'ubiquitine ligase MURF1 des cellules souches mésenchymateuses, contraignent ces dernières à privilégier l'adipogenèse plutôt que l'ostéogenèse et favorisent ainsi la perte osseuse

Myeloma cells shift osteoblastogenesis to adipogenesis by inhibiting the ubiquitin ligase MURF1 in mesenchymal stem cells

Liu, Zhiqiang ; Liu, Huan ; He, Jin ; Lin, Pei ; Tong, Qiang ; Yang, Jing

Multiple myeloma can lead to bone loss by reducing the differentiation of mesenchymal stem cells (MSCs) into osteoblasts. Using a combination of single-cell RNA sequencing, in vitro coculture, and experiments with human myeloma cells and MSCs in mice, Liu et al. demonstrated how direct contact between myeloma cells and MSCs shifted the balance of MSC differentiation to favor adipogenesis over osteoblastogenesis. Integrin α4 on the surface of myeloma cells activated the adhesion molecule VCAM1 [...]

Menée à partir de l'analyse génétique d'échantillons de cancer du poumon non à petites cellules, cette étude met en évidence l'effet des mutations intratumorales sur la différenciation des lymphocytes T

The T cell differentiation landscape is shaped by tumour mutations in lung cancer

Ghorani, Ehsan ; Reading, James L. ; Henry, Jake Y. ; Massy, Marc Robert de ; Rosenthal, Rachel ; Turati, Virginia ; Joshi, Kroopa ; Furness, Andrew J. S. ; Ben Aissa, Assma ; Saini, Sunil Kumar ; Ramskov, Sofie ; Georgiou, Andrew ; Sunderland, Mariana Werner ; Wong, Yien Ning Sophia ; Mucha, Maria Vila De ; Day, William ; Galvez-Cancino, Felipe ; Becker, Pablo D. ; Uddin, Imran ; Oakes, Theres ; Ismail, Mazlina ; Ronel, Tahel ; Woolston, Annemarie ; Jamal-Hanjani, Mariam ; Veeriah, Selvaraju ; Birkbak, Nicolai J. ; Wilson, Gareth A. ; Litchfield, Kevin ; Conde, Lucia ; Guerra-Assunção, José Afonso ; Blighe, Kevin ; Biswas, Dhruva ; Salgado, Roberto ; Lund, Tom ; Bakir, Maise Al ; Moore, David A. ; Hiley, Crispin T. ; Loi, Sherene ; Sun, Yuxin ; Yuan, Yinyin ; AbdulJabbar, Khalid ; Turajilic, Samra ; Herrero, Javier ; Enver, Tariq ; Hadrup, Sine R. ; Hackshaw, Allan ; Peggs, Karl S. ; McGranahan, Nicholas ; Chain, Benny ; Swanton, Charles ; Quezada, Sergio A. ; Ngai, Yenting ; Sharp, Abigail ; Rodrigues, Cristina ; Pressey, Oliver ; Smith, Sean ; Gower, Nicole ; Dhanda, Harjot ; Lawrence, David ; Hayward, Martin ; Panagiotopoulos, Nikolaos ; George, Robert ; Patrini, Davide ; Falzon, Mary ; Borg, Elaine ; Khiroya, Reena ; Ahmed, Asia ; Taylor, Magali ; Choudhary, Junaid ; Shaw, Penny ; Janes, Sam M. ; Forster, Martin ; Ahmad, Tanya ; Lee, Siow Ming ; Carnell, Dawn ; Mendes, Ruheena ; George, Jeremy ; Navani, Neal ; Scarci, Marco ; Bertoja, Elisa ; Stephens, Robert C. M. ; Hoogenboom, Emilie Martinoni ; Holding, James W. ; Bandula, Steve ; Watkins, Thomas B. K. ; Escudero, Mickael ; Stewart, Aengus ; Rowan, Andrew ; Goldman, Jacki ; Van Loo, Peter ; Stone, Richard Kevin ; Denner, Tamara ; Nye, Emma ; Ward, Sophia ; Lim, Emilia L. ; Boeing, Stefan ; Greco, Maria ; Nicod, Jerome ; Puttick, Clare ; Enfield, Katey ; Colliver, Emma ; Campbell, Brittany ; Abbosh, Christopher ; Wu, Yin ; Skrzypski, Marcin ; Hynds, Robert E. ; Marafioti, Teresa ; Hartley, John A. ; Gorman, Pat ; Lowe, Helen L. ; Ensell, Leah ; Spanswick, Victoria ; Karamani, Angeliki ; Razaq, Maryam ; Beck, Stephan ; Huebner, Ariana ; Dietzen, Michelle ; Naceur-Lombardelli, Cristina ; Akther, Mita Afroza ; Zhai, Haoran ; Kannu, Nnennaya ; Manzano, Elizabeth ; Bola, Supreet Kaur ; Hoxha, Elena ; Hatipoglu, Emine ; Ogwuru, Stephanie ; Price, Gillian ; Dubois-Marshall, Sylvie ; Kerr, Keith ; Palmer, Shirley ; Cheyne, Heather ; Miller, Joy ; Buchan, Keith ; Chetty, Mahendran ; Khalil, Mohammed ; Ezhil, Veni ; Prakash, Vineet ; Anand, Girija ; Khan, Sajid ; Lau, Kelvin ; Sheaff, Michael ; Schmid, Peter ; Lim, Louise ; Conibear, John ; Schwarz, Roland ; Tugwood, Jonathan ; Pierce, Jackie ; Dive, Caroline ; Brady, Ged ; Rothwell, Dominic G. ; Chemi, Francesca ; Kilgour, Elaine ; Blackhall, Fiona ; Priest, Lynsey ; Krebs, Matthew G. ; Crosbie, Philip ; Le Quesne, John ; Riley, Joan ; Primrose, Lindsay ; Martinson, Luke ; Carey, Nicolas ; Shaw, Jacqui A. ; Fennell, Dean ; Nakas, Apostolos ; Rathinam, Sridhar ; Nelson, Louise ; Ryanna, Kim ; Tuffail, Mohamad ; Bajaj, Amrita ; Morgan, Fiona ; Kornaszewska, Malgorzata ; Attanoos, Richard ; Adams, Haydn ; Davies, Helen ; Carter, Mathew ; Lindsay, C. R. ; Gomes, Fabio ; Szallasi, Zoltan ; Csabai, Istvan ; Diossy, Miklos ; Aerts, Hugo ; Kirk, Alan ; Asif, Mo ; Butler, John ; Bilanca, Rocco ; Kostoulas, Nikos ; MacKenzie, Mairead ; Wilcox, Maggie ; Busacca, Sara ; Dawson, Alan ; Lovett, Mark R. ; Shackcloth, Michael ; Feeney, Sarah ; Asante-Siaw, Julius ; Gosney, John ; Leek, Angela ; Totten, Nicola ; Hodgkinson, Jack Davies ; Waddington, Rachael ; Rogan, Jane ; Moore, Katrina ; Monteiro, William ; Marshall, Hilary ; Blyth, Kevin G. ; Dick, Craig ; Kidd, Andrew ; Lim, Eric ; Sousa, Paulo De ; Jordan, Simon ; Rice, Alexandra ; Raubenheimer, Hilgardt ; Bhayani, Harshil ; Hamilton, Morag ; Ambrose, Lyn ; Devaraj, Anand ; Chavan, Hema ; Begum, Sofina ; Mani, Aleksander ; Kaniu, Daniel ; Malima, Mpho ; Booth, Sarah ; Nicholson, Andrew G. ; Fernandes, Nadia ; Wallen, Jessica E. ; Shah, Pratibha ; Danson, Sarah ; Bury, Jonathan ; Edwards, John ; Hill, Jennifer ; Matthews, Sue ; Kitsanta, Yota ; Rao, Jagan ; Tenconi, Sara ; Socci, Laura ; Suvarna, Kim ; Kibutu, Faith ; Fisher, Patricia ; Young, Robin ; Barker, Joann ; Taylor, Fiona ; Lloyd, Kirsty ; Light, Teresa ; Horey, Tracey ; Papadatos-Pastos, Dionysis ; Russell, Peter ; Lock, Sara ; Gilbert, Kayleigh ; Naidu, Babu ; Langman, Gerald ; Robinson, Andrew ; Bancroft, Hollie ; Kerr, Amy ; Kadiri, Salma ; Ferris, Charlotte ; Middleton, Gary ; Djearaman, Madava ; Patel, Akshay ; Ottensmeier, Christian ; Chee, Serena ; Johnson, Benjamin ; Alzetani, Aiman ; Shaw, Emily ; Lester, Jason ; Summers, Yvonne ; Califano, Raffaele ; Taylor, Paul ; Shah, Rajesh ; Krysiak, Piotr ; Rammohan, Kendadai ; Fontaine, Eustace ; Booton, Richard ; Evison, Matthew ; Moss, Stuart ; Novasio, Juliette ; Joseph, Leena ; Bishop, Paul ; Chaturvedi, Anshuman ; Doran, Helen ; T. RACERx Consortium

Tumour mutational burden (TMB) predicts immunotherapy outcome in non-small cell lung cancer (NSCLC), consistent with immune recognition of tumour neoantigens. However, persistent antigen exposure is detrimental for T cell function. How TMB affects CD4 and CD8 T cell differentiation in untreated tumours and whether this affects patient outcomes is unknown. Here, we paired high-dimensional flow cytometry, exome, single-cell and bulk RNA sequencing from patients with resected, untreated NSCLC to [...]

Menée à partir de l'analyse du transcriptome de 91 103 cellules cancéreuses issues de 23 patients coréens et de 6 patients belges atteints d'un cancer colorectal, cette étude met en évidence une association entre les caractéristiques génétiques des cellules cancéreuses et les caractéristiques du micro-environnement immunitaire

Lineage-dependent gene expression programs influence the immune landscape of colorectal cancer

Lee, Hae-Ock ; Hong, Yourae ; Etlioglu, Hakki Emre ; Cho, Yong Beom ; Pomella, Valentina ; Van den Bosch, Ben ; Vanhecke, Jasper ; Verbandt, Sara ; Hong, Hyekyung ; Min, Jae-Woong ; Kim, Nayoung ; Eum, Hye Hyeon ; Qian, Junbin ; Boeckx, Bram ; Lambrechts, Diether ; Tsantoulis, Petros ; De Hertogh, Gert ; Chung, Woosung ; Lee, Taeseob ; An, Minae ; Shin, Hyun-Tae ; Joung, Je-Gun ; Jung, Min-Hyeok ; Ko, Gunhwan ; Wirapati, Pratyaksha ; Kim, Seok Hyung ; Kim, Hee Cheol ; Yun, Seong Hyeon ; Tan, Iain Bee Huat ; Ranjan, Bobby ; Lee, Woo Yong ; Kim, Tae-You ; Choi, Jung Kyoon ; Kim, Young-Joon ; Prabhakar, Shyam ; Tejpar, Sabine ; Park, Woong-Yang

Immunotherapy for metastatic colorectal cancer is effective only for mismatch repair-deficient tumors with high microsatellite instability that demonstrate immune infiltration, suggesting that tumor cells can determine their immune microenvironment. To understand this cross-talk, we analyzed the transcriptome of 91,103 unsorted single cells from 23 Korean and 6 Belgian patients. Cancer cells displayed transcriptional features reminiscent of normal differentiation programs, and genetic [...]

Menée à l'aide de modèles murins mâles et femelles de cancer colorectal métastatique, cette étude analyse, en fonction du sexe, les caractéristiques immunitaires du microenvironnement tumoral

The role of sex in the innate and adaptive immune environment of metastatic colorectal cancer

Ray, Anita L. ; Nofchissey, Robert A. ; Khan, Maaz A. ; Reidy, Megan A. ; Lerner, Megan R. ; Wu, Xiangyan ; Guo, Shaoxuan ; Hill, Spencer L. ; Weygant, Nathaniel ; Adams, Sarah F. ; Castillo, Eliseo F. ; Berry, William L. ; Stout, Michael B. ; Morris, Katherine T.

Background : Women with colorectal cancer (CRC) have a significant survival advantage over men. Sex influences on the tumour microenvironment (TME) are not well characterised, despite the importance of immune response in CRC. We hypothesised that sex-divergent immune responses could contribute to survival. Methods : Using a murine model of metastatic CRC, we examined T cells, macrophages, and cytokines locally and systemically. TME and serum cytokines were measured by multiplex bead-based [...]