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Sommaire du n° 449 du 7 mai 2020
Oncogènes et suppresseurs de tumeurs (3)
Menée in vitro et à l'aide de modèles murins, cette étude met en évidence un mécanisme par lequel la perte de l'expression de la fructose-1,6-bisphosphatase perturbe le métabolisme hépatique et favorise la tumorigenèse via l'activation puis la sénescence des cellules étoilées du foie
FBP1 loss disrupts liver metabolism and promotes tumorigenesis through a hepatic stellate cell senescence secretome
Menée in vitro et à l'aide de modèles murins, cette étude met en évidence un mécanisme par lequel la perte de l'expression de la fructose-1,6-bisphosphatase perturbe le métabolisme hépatique et favorise la tumorigenèse via l'activation puis la sénescence des cellules étoilées du foie
FBP1 loss disrupts liver metabolism and promotes tumorigenesis through a hepatic stellate cell senescence secretome
Li, Fuming ; Huangyang, Peiwei ; Burrows, Michelle ; Guo, Kathy ; Riscal, Romain ; Godfrey, Jason ; Lee, Kyoung Eun ; Lin, Nan ; Lee, Pearl ; Blair, Ian A. ; Keith, Brian ; Li, Bo ; Simon, M. Celeste
The crosstalk between deregulated hepatocyte metabolism and cells within the tumour microenvironment, as well as the consequent effects on liver tumorigenesis, are not completely understood. We show here that hepatocyte-specific loss of the gluconeogenic enzyme fructose 1,6-bisphosphatase 1 (FBP1) disrupts liver metabolic homeostasis and promotes tumour progression. FBP1 is universally silenced in both human and murine liver tumours. Hepatocyte-specific Fbp1 deletion results in steatosis, [...]
Menée à l'aide de données génétiques issues du projet "The Cancer Genome Atlas Program" et menée in vitro, cette étude met en évidence, au niveau du gène du facteur d'épissage SUGP1, des mutations pouvant altérer l'épissage de l'ARN messager d'une manière analogue à celles observées dans les cancers présentant une mutation du gène du facteur d'épissage SF3B1
Pan-cancer analysis identifies mutations in SUGP1 that recapitulate mutant SF3B1 splicing dysregulation
Menée à l'aide de données génétiques issues du projet "The Cancer Genome Atlas Program" et menée in vitro, cette étude met en évidence, au niveau du gène du facteur d'épissage SUGP1, des mutations pouvant altérer l'épissage de l'ARN messager d'une manière analogue à celles observées dans les cancers présentant une mutation du gène du facteur d'épissage SF3B1
Pan-cancer analysis identifies mutations in SUGP1 that recapitulate mutant SF3B1 splicing dysregulation
Liu, Zhaoqi ; Zhang, Jian ; Sun, Yiwei ; Perea-Chamblee, Tomin E. ; Manley, James L. ; Rabadan, Raul
SF3B1 is the most commonly mutated splicing factor in cancers, and SF3B1 mutations result in aberrant 3′ splice site usage during splicing of a subset of introns. Here, we utilized an unbiased computational biology approach to determine whether cancer-associated mutations in any other genes produce the same pattern of aberrant splicing as do SF3B1 mutations. We found that, while rare, the most frequently mutated gene that causes such splicing defects is SUGP1. This is striking because previous [...]
Menée à l'aide de trois modèles murins de cancer du côlon, de cellules coliques, d'une xénogreffe sur un modèle de poisson-zèbre et d'échantillons tumoraux de patients atteints d'un cancer colorectal, cette étude met en évidence le rôle du récepteur des estrogènes
Tumour-suppressive effect of oestrogen receptor β in colorectal cancer patients, colon cancer cells, and a zebrafish model
Menée à l'aide de trois modèles murins de cancer du côlon, de cellules coliques, d'une xénogreffe sur un modèle de poisson-zèbre et d'échantillons tumoraux de patients atteints d'un cancer colorectal, cette étude met en évidence le rôle du récepteur des estrogènes
Tumour-suppressive effect of oestrogen receptor β in colorectal cancer patients, colon cancer cells, and a zebrafish model
Topi, Geriolda ; Satapathy, Shakti Ranjan ; Dash, Pujarini ; Fred Mehrabi, Syrina ; Ehrnström, Roy ; Olsson, Roger ; Lydrup, Marie-Louise ; Sjölander, Anita
Oestrogen receptor
Progression et métastases (4)
Menée in vitro et à l'aide de modèles murins, cette étude met en évidence un mécanisme par lequel la stéaryl-CoA-désaturase-1 favorise l'accroissement de la population des cellules souches cancéreuses des tumeurs gastriques primitives et le développement de métastases via la voie de signalisation Hippo/YAP
Stearoyl-CoA-desaturase-1 regulates gastric cancer stem-like properties and promotes tumour metastasis via Hippo/YAP pathway
Menée in vitro et à l'aide de modèles murins, cette étude met en évidence un mécanisme par lequel la stéaryl-CoA-désaturase-1 favorise l'accroissement de la population des cellules souches cancéreuses des tumeurs gastriques primitives et le développement de métastases via la voie de signalisation Hippo/YAP
Stearoyl-CoA-desaturase-1 regulates gastric cancer stem-like properties and promotes tumour metastasis via Hippo/YAP pathway
Gao, Yunhe ; Li, Jiyang ; Xi, Hongqing ; Cui, Jianxin ; Zhang, Kecheng ; Zhang, Jiabing ; Zhang, Yanmei ; Xu, Wei ; Liang, Wenquan ; Zhuang, Ziwei ; Wang, Pengpeng ; Qiao, Zhi ; Wei, Bo ; Chen, Lin
Background : Stearoyl-CoA desaturase-1 (SCD1) is reported to play essential roles in cancer stemness among several cancers. Our previous research revealed significant overexpression of SCD1 in primary gastric cancer stem cells (GCSCs), with its functional role still unknown. Methods : We stably established three primary GCSCs by sphere-forming assays and flow cytometry. Protein quantification and bioinformatics analysis were performed to reveal the differential protein pattern. Lentivirus-based [...]
Menée notamment à l'aide de lignées cellulaires de mélanome, de cancer du sein et de cancer du poumon, cette étude identifie des voies de signalisation oncogènes régulant l'expression de l'ADN polymérase Pol kappa, une enzyme impliquée dans la synthèse translésionnelle (mécanisme de réplication pouvant être insensible à certaines mutations), puis analyse le rôle de cette enzyme dans la résistance thérapeutique
Regulation of the error-prone DNA polymerase Polκ by oncogenic signaling and its contribution to drug resistance
Menée notamment à l'aide de lignées cellulaires de mélanome, de cancer du sein et de cancer du poumon, cette étude identifie des voies de signalisation oncogènes régulant l'expression de l'ADN polymérase Pol kappa, une enzyme impliquée dans la synthèse translésionnelle (mécanisme de réplication pouvant être insensible à certaines mutations), puis analyse le rôle de cette enzyme dans la résistance thérapeutique
Regulation of the error-prone DNA polymerase Polκ by oncogenic signaling and its contribution to drug resistance
Temprine, Kelsey ; Campbell, Nathaniel R. ; Huang, Richard ; Langdon, Erin M. ; Simon-Vermot, Theresa ; Mehta, Krisha ; Clapp, Averill ; Chipman, Mollie ; White, Richard M
DNA polymerase κ (Polκ) is a traditionally error-prone polymerase that is overexpressed in some tumors. Temprine et al. found that Polκ facilitates tumor cell survival in response to oncogenic mutations (such as those in the kinases BRAF or EGFR), targeted kinase inhibition, oxidative stress, or starvation. These cellular stresses shifted Polκ from its largely cytoplasmic distribution to a nuclear localization in various tumor cell types, but without increasing mutagenesis. Knocking down Polκ [...]
A partir du séquençage à l'échelle d'une seule cellule de l'ARN de cellules de moelle osseuse issue de patients présentant un myélome multiple ou un stade précurseur de la maladie (gammapathie monoclonale de signification inconnue ou myélome asymptomatique), cette étude analyse l'évolution des caractéristiques du microenvironnement immunitaire au cours de la progression de la maladie
Single-cell RNA sequencing reveals compromised immune microenvironment in precursor stages of multiple myeloma
A partir du séquençage à l'échelle d'une seule cellule de l'ARN de cellules de moelle osseuse issue de patients présentant un myélome multiple ou un stade précurseur de la maladie (gammapathie monoclonale de signification inconnue ou myélome asymptomatique), cette étude analyse l'évolution des caractéristiques du microenvironnement immunitaire au cours de la progression de la maladie
Single-cell RNA sequencing reveals compromised immune microenvironment in precursor stages of multiple myeloma
Zavidij, Oksana ; Haradhvala, Nicholas J. ; Mouhieddine, Tarek H. ; Sklavenitis-Pistofidis, Romanos ; Cai, Songjie ; Reidy, Mairead ; Rahmat, Mahshid ; Flaifel, Abdallah ; Ferland, Benjamin ; Su, Nang K. ; Agius, Michael P. ; Park, Jihye ; Manier, Salomon ; Bustoros, Mark ; Huynh, Daisy ; Capelletti, Marzia ; Berrios, Brianna ; Liu, Chia-Jen ; He, Meng Xiao ; Braggio, Esteban ; Fonseca, Rafael ; Maruvka, Yosef E. ; Guerriero, Jennifer L. ; Goldman, Melissa ; Van Allen, Eliezer M. ; McCarroll, Steven A. ; Azzi, Jamil ; Getz, Gad ; Ghobrial, Irene M.
Precursor states of multiple myeloma (MM) and its native tumor microenvironment need in-depth molecular characterization to better stratify and treat patients at risk. Using single-cell RNA sequencing of bone marrow cells from precursor stages, monoclonal gammopathy of unknown significance and smoldering MM, to full-blown MM alongside healthy donors, we demonstrate early immune changes during patient progression. We find that natural killer cell abundance is frequently increased in the early [...]
Menée in vitro et à l'aide d'une xénogreffe sur un modèle murin, cette étude met en évidence un mécanisme par lequel les vésicules extracellulaires dérivées des macrophages, en transférant certains microARNs aux cellules souches de gliome, favorisent l'évolution d'un gliome proneural vers une forme mésenchymateuse
Transfer of microRNA via Macrophage-Derived Extracellular Vesicles Promotes Proneural-to-Mesenchymal Transition in Glioma Stem Cells
Menée in vitro et à l'aide d'une xénogreffe sur un modèle murin, cette étude met en évidence un mécanisme par lequel les vésicules extracellulaires dérivées des macrophages, en transférant certains microARNs aux cellules souches de gliome, favorisent l'évolution d'un gliome proneural vers une forme mésenchymateuse
Transfer of microRNA via Macrophage-Derived Extracellular Vesicles Promotes Proneural-to-Mesenchymal Transition in Glioma Stem Cells
Zhang, Zongpu ; Xu, Jianye ; Chen, Zihang ; Wang, Huizhi ; Xue, Hao ; Yang, Chunlei ; Guo, Qindong ; Qi, Yanhua ; Guo, Xiaofan ; Qian, Mingyu ; Wang, Shaobo ; Qiu, Wei ; Gao, Xiao ; Zhao, Rongrong ; Guo, Xing ; Li, Gang
Proneural-to-mesenchymal transition (PMT) is a common process in glioblastoma (GBM) progression that leads to increased radiotherapy resistance. However, the mechanism underlying PMT is poorly understood. Here, we found that tumor-associated macrophages (TAMs) triggered PMT in glioma stem cells (GSCs) via small extracellular vesicles (sEVs). sEVs from monocyte-derived macrophages transferred miR-27a-3p, miR-22-3p and miR-221-3p to GSCs, and these microRNAs (miRs) promoted several mesenchymal [...]
Ressources et infrastructures (Biologie) (2)
Menée in vitro, sur des souris et à l'aide d'une nouvelle méthode destinée à identifier les cibles des protéines de liaison à l'ARN, cette étude met en évidence, par rapport aux cellules souches hématopoïétiques normales et aux cellules progénitrices, une augmentation et une régulation différentielle de l'activité de liaison à l'ARN de la protéine MUSASHI-2 dans les cellules souches leucémiques
HyperTRIBE uncovers increased MUSASHI-2 RNA binding activity and differential regulation in leukemic stem cells
Menée in vitro, sur des souris et à l'aide d'une nouvelle méthode destinée à identifier les cibles des protéines de liaison à l'ARN, cette étude met en évidence, par rapport aux cellules souches hématopoïétiques normales et aux cellules progénitrices, une augmentation et une régulation différentielle de l'activité de liaison à l'ARN de la protéine MUSASHI-2 dans les cellules souches leucémiques
HyperTRIBE uncovers increased MUSASHI-2 RNA binding activity and differential regulation in leukemic stem cells
Nguyen, Diu T. T. ; Lu, Yuheng ; Chu, Karen L. ; Yang, Xuejing ; Park, Sun-Mi ; Choo, Zi-Ning ; Chin, Christopher R. ; Prieto, Camila ; Schurer, Alexandra ; Barin, Ersilia ; Savino, Angela M. ; Gourkanti, Saroj ; Patel, Payal ; Vu, Ly P. ; Leslie, Christina S. ; Kharas, Michael G.
The cell-context dependency for RNA binding proteins (RBPs) mediated control of stem cell fate remains to be defined. Here we adapt the HyperTRIBE method using an RBP fused to a Drosophila RNA editing enzyme (ADAR) to globally map the mRNA targets of the RBP MSI2 in mammalian adult normal and malignant stem cells. We reveal a unique MUSASHI-2 (MSI2) mRNA binding network in hematopoietic stem cells that changes during transition to multipotent progenitors. Additionally, we discover a significant [...]
Menée à l'aide d'une lignée cellulaire de cancer métastatique de la prostate et à l'aide d'un modèle murin, cette étude met en évidence un mécanisme par lequel le microARN miR-26a régule la sécrétion des vésicules extracellulaires par les cellules cancéreuses en ciblant les gènes SHC4, PFDN4 et CHORDC1
miR-26a regulates extracellular vesicle secretion from prostate cancer cells via targeting SHC4, PFDN4, and CHORDC1
Menée à l'aide d'une lignée cellulaire de cancer métastatique de la prostate et à l'aide d'un modèle murin, cette étude met en évidence un mécanisme par lequel le microARN miR-26a régule la sécrétion des vésicules extracellulaires par les cellules cancéreuses en ciblant les gènes SHC4, PFDN4 et CHORDC1
miR-26a regulates extracellular vesicle secretion from prostate cancer cells via targeting SHC4, PFDN4, and CHORDC1
Urabe, Fumihiko ; Kosaka, Nobuyoshi ; Sawa, Yurika ; Yamamoto, Yusuke ; Ito, Kagenori ; Yamamoto, Tomofumi ; Kimura, Takahiro ; Egawa, Shin ; Ochiya, Takahiro
Extracellular vesicles (EVs) are involved in intercellular communication during cancer progression; thus, elucidating the mechanism of EV secretion in cancer cells will contribute to the development of an EV-targeted cancer treatment. However, the biogenesis of EVs in cancer cells is not fully understood. MicroRNAs (miRNAs) regulate a variety of biological phenomena; thus, miRNAs could regulate EV secretion. Here, we performed high-throughput miRNA-based screening to identify the regulators of [...]