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Sommaire du n° 442 du 6 mars 2020
Oncogènes et suppresseurs de tumeurs (2)
Menée à l'aide d'organoïdes d'intestins humains exposés à une souche de bactéries Escherichia Coli (E. Coli) présentant l'opéron pks responsable de la production de la colibactine (une génotoxine) et menée à partir de l'analyse de 5 876 génomes tumoraux humains, cette étude identifie dans les tumeurs colorectales un ensemble de mutations génétiques liées à une exposition à ce type de bactéries
Mutational signature in colorectal cancer caused by genotoxic pks+ E. coli
Menée à l'aide d'organoïdes d'intestins humains exposés à une souche de bactéries Escherichia Coli (E. Coli) présentant l'opéron pks responsable de la production de la colibactine (une génotoxine) et menée à partir de l'analyse de 5 876 génomes tumoraux humains, cette étude identifie dans les tumeurs colorectales un ensemble de mutations génétiques liées à une exposition à ce type de bactéries
Mutational signature in colorectal cancer caused by genotoxic pks+ E. coli
Pleguezuelos-Manzano, Cayetano ; Puschhof, Jens ; Huber, Axel Rosendahl ; van Hoeck, Arne ; Wood, Henry M. ; Nomburg, Jason ; Gurjao, Carino ; Manders, Freek ; Dalmasso, Guillaume ; Stege, Paul B. ; Paganelli, Fernanda L. ; Geurts, Maarten H. ; Beumer, Joep ; Mizutani, Tomohiro ; van der Linden, Reinier ; van Elst, Stefan ; Ambrose, J. C. ; Arumugam, P. ; Baple, E. L. ; Bleda, M. ; Boardman-Pretty, F. ; Boissiere, J. M. ; Boustred, C. R. ; Brittain, H. ; Caulfield, M. J. ; Chan, G. C. ; Craig, C. E. H. ; Daugherty, L. C. ; de Burca, A. ; Devereau, A. ; Elgar, G. ; Foulger, R. E. ; Fowler, T. ; Furió-Tarí, P. ; Hackett, J. M. ; Halai, D. ; Hamblin, A. ; Henderson, S. ; Holman, J. E. ; Hubbard, T. J. P. ; Ibáñez, K. ; Jackson, R. ; Jones, L. J. ; Kasperaviciute, D. ; Kayikci, M. ; Lahnstein, L. ; Lawson, K. ; Leigh, S. E. A. ; Leong, I. U. S. ; Lopez, F. J. ; Maleady-Crowe, F. ; Mason, J. ; McDonagh, E. M. ; Moutsianas, L. ; Mueller, M. ; Murugaesu, N. ; Need, A. C. ; Odhams, C. A. ; Patch, C. ; Perez-Gil, D. ; Polychronopoulos, D. ; Pullinger, J. ; Rahim, T. ; Rendon, A. ; Riesgo-Ferreiro, P. ; Rogers, T. ; Ryten, M. ; Savage, K. ; Sawant, K. ; Scott, R. H. ; Siddiq, A. ; Sieghart, A. ; Smedley, D. ; Smith, K. R. ; Sosinsky, A. ; Spooner, W. ; Stevens, H. E. ; Stuckey, A. ; Sultana, R. ; Thomas, E. R. A. ; Thompson, S. R. ; Tregidgo, C. ; Tucci, A. ; Walsh, E. ; Watters, S. A. ; Welland, M. J. ; Williams, E. ; Witkowska, K. ; Wood, S. M. ; Zarowiecki, M. ; Top, Janetta ; Willems, Rob J. L. ; Giannakis, Marios ; Bonnet, Richard ; Quirke, Phil ; Meyerson, Matthew ; Cuppen, Edwin ; van Boxtel, Ruben ; Clevers, Hans ; Genomics England Research, Consortium
Various species of the intestinal microbiota have been associated with the development of colorectal cancer (CRC)1,2, yet a direct role of bacteria in the occurrence of oncogenic mutations has not been established. Escherichia coli can carry the pathogenicity island pks, which encodes a set of enzymes that synthesize colibactin3. This compound is believed to alkylate DNA on adenine residues4,5 and induces double-strand breaks in cultured cells3. Here, we expose human intestinal organoids to [...]
Menée sur des cellules de glioblastome humain, cette étude met en évidence un mécanisme par lequel la répression, induite par le facteur de transcription SOX4, de l'expression d'ARNs de transfert spécifiques inhibe la prolifération des cellules cancéreuses
SOX4-mediated repression of specific tRNAs inhibits proliferation of human glioblastoma cells
Menée sur des cellules de glioblastome humain, cette étude met en évidence un mécanisme par lequel la répression, induite par le facteur de transcription SOX4, de l'expression d'ARNs de transfert spécifiques inhibe la prolifération des cellules cancéreuses
SOX4-mediated repression of specific tRNAs inhibits proliferation of human glioblastoma cells
Yang, Jianjing ; Smith, Derek K. ; Ni, Haoqi ; Wu, Ke ; Huang, Dongdong ; Pan, Sishi ; Sathe, Adwait A. ; Tang, Yu ; Liu, Meng-Lu ; Xing, Chao ; Zhang, Chun-Li ; Zhuge, Qichuan
Transfer RNAs (tRNAs) are essential for mRNA translation and protein synthesis. Their expression is tightly associated with cell states and is broadly controlled by the recruitment of Pol III through intragenic elements. Whether and how tRNA genes could also be individually regulated is not known. In this study, our results reveal that a polymerase II-dependent DNA-binding transcription factor can also regulate the expression of specific tRNAs through direct binding to DNA elements surrounding [...]
Progression et métastases (3)
Menée sur des poissons-zèbres et à l'aide d'échantillons tomoraux prélevés sur des patients atteints d'un mélanome primitif, cette étude met en évidence le rôle de la phosphorylation oxydative dans le processus d'invasion des cellules cancéreuses
Oxidative phosphorylation promotes primary melanoma invasion
Menée sur des poissons-zèbres et à l'aide d'échantillons tomoraux prélevés sur des patients atteints d'un mélanome primitif, cette étude met en évidence le rôle de la phosphorylation oxydative dans le processus d'invasion des cellules cancéreuses
Oxidative phosphorylation promotes primary melanoma invasion
Salhi, Amel ; Jordan, Alexander C. ; Bochaca, Irineu Illa ; Izsak, Allison ; Darvishian, Farbod ; Houvras, Yariv ; Giles, Keith M. ; Osman, Iman
Dermal invasion is a hallmark of malignant melanoma. Thought the molecular alterations driving the progression of primary melanoma to metastatic disease have been studied extensively, the early progression of non-invasive primary melanoma to an invasive state is poorly understood. To elucidate the mechanisms underlying the transition from radial to vertical growth, the first step in melanoma invasion, we developed a zebrafish melanoma model in which constitutive activation of ribosomal protein [...]
Menée sur des lignées cellulaires de cancer colorectal et à l'aide d'un modèle murin, puis menée in silico, cette étude met en évidence le rôle du microARN miR-27a dans la régulation du métabolisme des cellules cancéreuses et la chimiorésistance de ces dernières
miR-27a is a master regulator of metabolic reprogramming and chemoresistance in colorectal cancer
Menée sur des lignées cellulaires de cancer colorectal et à l'aide d'un modèle murin, puis menée in silico, cette étude met en évidence le rôle du microARN miR-27a dans la régulation du métabolisme des cellules cancéreuses et la chimiorésistance de ces dernières
miR-27a is a master regulator of metabolic reprogramming and chemoresistance in colorectal cancer
Barisciano, Giovannina ; Colangelo, Tommaso ; Rosato, Valeria ; Muccillo, Livio ; Letizia Taddei, Maria ; Ippolito, Luigi ; Chiarugi, Paola ; Galgani, Mario ; Bruzzaniti, Sara ; Matarese, Giuseppe ; Fassan, Matteo ; Agostini, Marco ; Bergamo, Francesca ; Pucciarelli, Salvatore ; Carbone, Annalucia ; Mazzoccoli, Gianluigi ; Colantuoni, Vittorio ; Bianchi, Fabrizio ; Sabatino, Lina
Background : Metabolic reprogramming towards aerobic glycolysis in cancer supports unrestricted cell proliferation, survival and chemoresistance. The molecular bases of these processes are still undefined. Recent reports suggest crucial roles for microRNAs. Here, we provide new evidence of the implication of miR-27a in modulating colorectal cancer (CRC) metabolism and chemoresistance. Methods : A survey of miR-27a expression profile in TCGA-COAD dataset revealed that miR-27a-overexpressing CRCs [...]
Menée sur des lignées cellulaires de cancer du sein, cette étude met en évidence le rôle de la méthylcytosine dioxygénase TET et de l'hydroxyméthylation de l’ADN dans la prolifération des cellules cancéreuses liée aux bisphénols
Role of TET Dioxygenases and DNA Hydroxymethylation in Bisphenols-Stimulated Proliferation of Breast Cancer Cells
Menée sur des lignées cellulaires de cancer du sein, cette étude met en évidence le rôle de la méthylcytosine dioxygénase TET et de l'hydroxyméthylation de l’ADN dans la prolifération des cellules cancéreuses liée aux bisphénols
Role of TET Dioxygenases and DNA Hydroxymethylation in Bisphenols-Stimulated Proliferation of Breast Cancer Cells
Li, Zhe ; Lyu, Cong ; Ren, Yun ; Wang, Hailin
Background: Bisphenol A (BPA), a ubiquitous environmental endocrine disruptor targeting estrogen receptors (ERs), has been implicated in the promotion of breast cancer. Perinatal exposure of BPA could induce longitudinal alteration of DNA hydroxymethylation in imprinted loci of mouse blood cells. To date, no data has been reported on the effects of BPA on DNA hydroxymethylation in breast cells. Therefore, we asked whether BPA can induce DNA hydroxymethylation change in human breast cells. Given [...]
Ressources et infrastructures (Biologie) (1)
Menée à partir de l'analyse de modèles de tumeurs de l'ovaire dérivés d'ascites ou d'échantillons biopsiques, cette étude met en évidence une très forte hétérogénéité intercellulaire au niveau des anomalies mitotiques
A living biobank of ovarian cancer ex vivo models reveals profound mitotic heterogeneity
Menée à partir de l'analyse de modèles de tumeurs de l'ovaire dérivés d'ascites ou d'échantillons biopsiques, cette étude met en évidence une très forte hétérogénéité intercellulaire au niveau des anomalies mitotiques
A living biobank of ovarian cancer ex vivo models reveals profound mitotic heterogeneity
Nelson, Louisa ; Tighe, Anthony ; Golder, Anya ; Littler, Samantha ; Bakker, Bjorn ; Moralli, Daniela ; Murtuza Baker, Syed ; Donaldson, Ian J. ; Spierings, Diana C. J. ; Wardenaar, René ; Neale, Bethanie ; Burghel, George J. ; Winter-Roach, Brett ; Edmondson, Richard ; Clamp, Andrew R. ; Jayson, Gordon C. ; Desai, Sudha ; Green, Catherine M. ; Hayes, Andy ; Foijer, Floris ; Morgan, Robert D. ; Taylor, Stephen S.
High-grade serous ovarian carcinoma is characterised by TP53 mutation and extensive chromosome instability (CIN). Because our understanding of CIN mechanisms is based largely on analysing established cell lines, we developed a workflow for generating ex vivo cultures from patient biopsies to provide models that support interrogation of CIN mechanisms in cells not extensively cultured in vitro. Here, we describe a “living biobank” of ovarian cancer models with extensive replicative capacity, [...]