Menée in vitro, cette étude met en évidence un mécanisme par lequel la protéine E7 des papillomavirus humains à haut risque, en favorisant la dégradation de la tyrosine phosphatase PTPN14, limite la différenciation des kératinocytes et participe à la carcinogenèse

PTPN14 degradation by high-risk human papillomavirus E7 limits keratinocyte differentiation and contributes to HPV-mediated oncogenesis

Hatterschide, Joshua ; Bohidar, Amelia E. ; Grace, Miranda ; Nulton, Tara J. ; Kim, Hee Won ; Windle, Brad ; Morgan, Iain M. ; Münger, Karl ; White, Elizabeth A.

Human papillomaviruses (HPV) uncouple proliferation from differentiation to enable virus replication in epithelial cells. HPV E7 proteins are well established to promote proliferation by binding to and inactivating retinoblastoma family proteins and other cell cycle inhibitors. However, mechanisms by which high-risk HPV oncoproteins inhibit differentiation have not been defined. This paper identifies a mechanism by which high-risk HPV E7 inhibit keratinocyte differentiation. The inhibition of [...]

Menée à l'aide d'un modèle de transformation de cellules mammaires, cette étude identifie un réseau de régulation génique favorisé par l'action conjointe des facteurs de transcription pro-inflammatoires NF-kB, STAT3 et AP-1 et impliqué dans le développement de nombreux cancers

Inflammatory regulatory network mediated by the joint action of NF-kB, STAT3, and AP-1 factors is involved in many human cancers

Ji, Zhe ; He, Lizhi ; Regev, Aviv ; Struhl, Kevin

In a breast cellular transformation model, we describe the gene regulatory network that is mediated by joint and direct action of three inflammatory transcription factors on hundreds of target genes in various oncogenic pathways. This inflammatory feedback loop and associated network functions in many types of cancer cells and patient tumors. It forms the basis for a “cancer inflammation index” that defines cancer types by functional criteria, and that may be useful for choosing drugs for [...]

Menée à partir de l'analyse génomique de cellules leucémiques issues de 76 patients, cette étude identifie un panel de gènes immunitaires dont l'expression ou l'absence d'expression favorise l'échappement immunitaire et la récidice après une greffe de cellules souches hématopoïétiques

Immune signature drives leukemia escape and relapse after hematopoietic cell transplantation

Toffalori, Cristina ; Zito, Laura ; Gambacorta, Valentina ; Riba, Michela ; Oliveira, Giacomo ; Bucci, Gabriele ; Barcella, Matteo ; Spinelli, Orietta ; Greco, Raffaella ; Crucitti, Lara ; Cieri, Nicoletta ; Noviello, Maddalena ; Manfredi, Francesco ; Montaldo, Elisa ; Ostuni, Renato ; Naldini, Matteo M. ; Gentner, Bernhard ; Waterhouse, Miguel ; Zeiser, Robert ; Finke, Jürgen ; Hanoun, Maher ; Beelen, Dietrich W. ; Gojo, Ivana ; Luznik, Leo ; Onozawa, Masahiro ; Teshima, Takanori ; Devillier, Raynier ; Blaise, Didier ; Halkes, Constantijn J. M. ; Griffioen, Marieke ; Carrabba, Matteo G. ; Bernardi, Massimo ; Peccatori, Jacopo ; Barlassina, Cristina ; Stupka, Elia ; Lazarevic, Dejan ; Tonon, Giovanni ; Rambaldi, Alessandro ; Cittaro, Davide ; Bonini, Chiara ; Fleischhauer, Katharina ; Ciceri, Fabio ; Vago, Luca

Transplantation of hematopoietic cells from a healthy individual (allogeneic hematopoietic cell transplantation (allo-HCT)) demonstrates that adoptive immunotherapy can cure blood cancers: still, post-transplantation relapses remain frequent. To explain their drivers, we analyzed the genomic and gene expression profiles of acute myeloid leukemia (AML) blasts purified from patients at serial time-points during their disease history. We identified a transcriptional signature specific for [...]

A partir de l'analyse de 258 régions de 88 tumeurs pulmonaires non à petites cellules, de stade précoce et non traitées, cette étude examine la relation entre le micro-environnement immunitaire, l'évolution génomique de la tumeur et son échappement immunitaire

Neoantigen-directed immune escape in lung cancer evolution

Rosenthal, Rachel ; Cadieux, Elizabeth Larose ; Salgado, Roberto ; Bakir, Maise Al ; Moore, David A. ; Hiley, Crispin T. ; Lund, Tom ; Tanić, Miljana ; Reading, James L. ; Joshi, Kroopa ; Henry, Jake Y. ; Ghorani, Ehsan ; Wilson, Gareth A. ; Birkbak, Nicolai J. ; Jamal-Hanjani, Mariam ; Veeriah, Selvaraju ; Szallasi, Zoltan ; Loi, Sherene ; Hellmann, Matthew D. ; Feber, Andrew ; Chain, Benny ; Herrero, Javier ; Quezada, Sergio A. ; Demeulemeester, Jonas ; Van Loo, Peter ; Beck, Stephan ; McGranahan, Nicholas ; Swanton, Charles ; Czyzewska-Khan, Justyna ; Johnson, Diana ; Laycock, Joanne ; Gorman, Pat ; Hynds, Robert E. ; Wilson, Gareth ; Watkins, Thomas B. K. ; Escudero, Mickael ; Stewart, Aengus ; Rowan, Andrew ; Hiley, Crispin ; Abbosh, Christopher ; Goldman, Jacki ; Stone, Richard Kevin ; Denner, Tamara ; Ward, Sophia ; Nye, Emma ; Ben Aissa, Assma ; Wong, Yien Ning Sophia ; Georgiou, Andy ; Quezada, Sergio ; Hartley, John A. ; Lowe, Helen L. ; Lawrence, David ; Hayward, Martin ; Panagiotopoulos, Nikolaos ; Falzon, Mary ; Borg, Elaine ; Marafioti, Teresa ; Janes, Sam M. ; Forster, Martin ; Ahmad, Tanya ; Lee, Siow Ming ; Papadatos-Pastos, Dionysis ; Carnell, Dawn ; Mendes, Ruheena ; George, Jeremy ; Ahmed, Asia ; Taylor, Magali ; Choudhary, Junaid ; Summers, Yvonne ; Califano, Raffaele ; Taylor, Paul ; Shah, Rajesh ; Krysiak, Piotr ; Rammohan, Kendadai ; Fontaine, Eustace ; Booton, Richard ; Evison, Matthew ; Crosbie, Phil ; Moss, Stuart ; Joseph, Leena ; Bishop, Paul ; Quinn, Anne Marie ; Doran, Helen ; Leek, Angela ; Harrison, Phil ; Moore, Katrina ; Waddington, Rachael ; Novasio, Juliette ; Blackhall, Fiona ; Rogan, Jane ; Smith, Elaine ; Dive, Caroline ; Tugwood, Jonathan ; Brady, Ged ; Rothwell, Dominic G. ; Pierce, Jackie ; Gulati, Sakshi ; Naidu, Babu ; Langman, Gerald ; Trotter, Simon ; Bancroft, Hollie ; Kerr, Amy ; Kadiri, Salma ; Middleton, Gary ; Djearaman, Madava ; Fennell, Dean ; Shaw, Jacqui A. ; Le Quesne, John ; Nakas, Apostolos ; Rathinam, Sridhar ; Monteiro, William ; Marshall, Hilary ; Nelson, Louise ; Riley, Joan ; Primrose, Lindsay ; Martinson, Luke ; Anand, Girija ; Khan, Sajid ; Nicolson, Marianne ; Kerr, Keith ; Palmer, Shirley ; Remmen, Hardy ; Miller, Joy ; Buchan, Keith ; Chetty, Mahendran ; Gomersall, Lesley ; Lester, Jason ; Morgan, Fiona ; Adams, Haydn ; Davies, Helen ; Kornaszewska, Malgorzata ; Attanoos, Richard ; Lock, Sara ; MacKenzie, Mairead ; Wilcox, Maggie ; Bell, Harriet ; Hackshaw, Allan ; Ngai, Yenting ; Smith, Sean ; Gower, Nicole ; Ottensmeier, Christian ; Chee, Serena ; Johnson, Benjamin ; Alzetani, Aiman ; Shaw, Emily ; Lim, Eric ; De Sousa, Paulo ; Barbosa, Monica Tavares ; Bowman, Alex ; Jordan, Simon ; Rice, Alexandra ; Raubenheimer, Hilgardt ; Bhayani, Harshil ; Hamilton, Morag ; Mensah, Natalie ; Ambrose, Lyn ; Devaraj, Anand ; Chavan, Hema ; Nicholson, Andrew G. ; Lau, Kelvin ; Sheaff, Michael ; Schmid, Peter ; Conibear, John ; Ezhil, Veni ; Prakash, Vineet ; Russell, Peter ; Light, Teresa ; Horey, Tracey ; Danson, Sarah ; Bury, Jonathan ; Edwards, John ; Hill, Jennifer ; Matthews, Sue ; Kitsanta, Yota ; Suvarna, Kim ; Fisher, Patricia ; Shackcloth, Michael ; Gosney, John ; Feeney, Sarah ; Asante-Siaw, Julius ; Ryanna, Kim ; Dawson, Alan ; Tuffail, Mohamad ; Bajaj, Amrita ; Brozik, Jan ; Walter, Harriet ; Carey, Nicolas ; Price, Gillian ; Gilbert, Kayleigh ; Webb, Joanne ; Patel, Akshay ; Chaturvedi, Anshuman ; Granato, Felice ; Baker, Katie ; Carter, Mathew ; Priest, Lynsey ; Krebs, Matthew G. ; Lindsay, Colin ; Gomes, Fabio ; Chemie, Francesca ; George, Robert ; Patrini, Davide ; Khiroya, Reena ; Shaw, Penny ; Skrzypski, Marcin ; Sunderland, Mariana Werner ; Reading, James L ; Beastall, Carmella ; Mangal, Nagina ; Peggs, Karl ; Lim, Emilia ; Al-Bakir, Maise ; Navani, Neal ; Scarci, Marco ; Ensell, Leah ; Biswas, Dhruva ; Razaq, Maryam ; Nicod, Jerome ; Lopez, Saioa ; Huebner, Ariana ; Dietzen, Michelle ; Mourikis, Thanos ; Adefila-Ideozu, Toyin ; Begum, Sofina ; Klein, Henriette ; Mani, Aleksander ; Carvalho, Soraia ; Kaniu, Daniel ; Realingo, Cristina ; Malima, Mpho ; Booth, Sarah ; Lim, Louise ; Rao, Jagan ; Tenconi, Sara ; Socci, Laura ; Kibutu, Faith ; Agyemang, Michael ; Young, Robin ; Blyth, Kevin G. ; Dick, Craig ; Kirk, Alan ; Kidd, Andrew ; the, TRACERx consortium

The interplay between an evolving cancer and a dynamic immune microenvironment remains unclear. Here we analyse 258 regions from 88 early-stage, untreated non-small-cell lung cancers using RNA sequencing and histopathology-assessed tumour-infiltrating lymphocyte estimates. Immune infiltration varied both between and within tumours, with different mechanisms of neoantigen presentation dysfunction enriched in distinct immune microenvironments. Sparsely infiltrated tumours exhibited a waning of [...]

Menée à l'aide d'échantillons de carcinome épidermoïde de la tête et du cou et à l'aide de xénogreffes sur un modèle murin, cette étude met en évidence un mécanisme par lequel la perte de l'expression du gène TP53, en activant les voies de signalisation MAPK et STAT3, favorise le développement de métastases

Loss of TP63 promotes the metastasis of head and neck squamous cell carcinoma by activating MAPK and STAT3 signaling

Koster, Maranke I. ; Lakshmanachetty, Senthilnath ; Balaiya, Velmurugan ; High, Whitney A.

TP63 is frequently amplified or overexpressed in primary Head and Neck Squamous Cell Carcinomas (HNSCCs). Nevertheless, the role of TP63 in the initiation and progression of HNSCCs is not known. Using archival HNSCC tissue sections, we found that TP63 expression is often downregulated in late-stage human HNSCCs. To establish a causal link between TP63 loss and HNSCC tumorigenesis, we developed a genetically engineered mouse model in which Trp63 (the mouse homologue of human TP63) was ablated [...]

A partir du séquençage de l'exome et de l'ARN de 34 échantillons tumoraux et de 6 échantillons de tissu adjacent prélevés sur 6 patients atteints d'un carcinome hépatocellulaire multifocal, cette étude met en évidence une hétérogénéité génomique et transcriptionnelle de la tumeur

Genomic and transcriptional heterogeneity of multifocal hepatocellular carcinoma

Xu, L X ; Peng, S ; He, M H ; Su, T H ; Guo, Y ; Chen, Z B ; Dai, Z H ; Kuang, M ; Yu, J ; Jiang, B B ; Wang, J G ; Li, X C ; Ke, Z F ; Peng, Z W ; Chen, S L

Background : Hepatocellular carcinoma (HCC) often presents with multiple nodules within the liver, with limited effective interventions. The high genetic heterogeneity of HCC might be the major cause of treatment failure. We aimed to characterize genomic heterogeneity, infer clonal evolution, investigate RNA expression pattern and explore tumour immune microenvironment profile of multifocal HCC. Patients and methods : Whole-exome sequencing and RNA sequencing were carried out in 34 tumours and [...]

Cet article analyse le rôle des facteurs de transcription de la famille des protéines SOX dans le développement de certaines tumeurs (sein, prostate, rein, thyroïde, cerveau, estomac, intestin et poumon) et la formation de métastases

The role of SOX family members in solid tumours and metastasis

Grimm, Daniela ; Bauer, Johann ; Wise, Petra ; Krüger, Marcus ; Simonsen, Ulf ; Wehland, Markus ; Infanger, Manfred ; Corydon, Thomas J.

Cancer is a heavy burden for humans across the world with high morbidity and mortality. Transcription factors including sex determining region Y (SRY)-related high-mobility group (HMG) box (SOX) proteins are thought to be involved in the regulation of specific biological processes. The deregulation of gene expression programs can lead to cancer development. Here, we review the role of the SOX family in breast cancer, prostate cancer, renal cell carcinoma, thyroid cancer, brain tumours, [...]

A partir de données de la base "cBioPortal" et de données issues de la cohorte MSK-IMPACT, cette étude analyse d'une part la prévalence, dans différents types de tumeurs, de mutations somatiques au niveau des gènes codant pour les histones et, d'autre part, l'impact de ces mutations sur la fonction de la chromatine

The expanding landscape of ‘oncohistone’ mutations in human cancers

Nacev, Benjamin A. ; Feng, Lijuan ; Bagert, John D. ; Lemiesz, Agata E. ; Gao, JianJiong ; Soshnev, Alexey A. ; Kundra, Ritika ; Schultz, Nikolaus ; Muir, Tom W. ; Allis, C. David

Mutations in epigenetic pathways are common oncogenic drivers. Histones, the fundamental substrates for chromatin-modifying and remodelling enzymes, are mutated in tumours including gliomas, sarcomas, head and neck cancers, and carcinosarcomas. Classical ‘oncohistone’ mutations occur in the N-terminal tail of histone H3 and affect the function of polycomb repressor complexes 1 and 2 (PRC1 and PRC2). However, the prevalence and function of histone mutations in other tumour contexts is unknown. [...]